ChIP-Atlas: Colocalization analysis

Colocalization analysis for CTCF

Query protein: CTCF
Cell class: Lung
Sort key: SRX212197 | Lung fibroblasts
 
Color legends
ChIP-seq data:  H-H H-M M-M H-L M-L L-L N.D. Same  (Peak intensities are High, Middle or Low)

STRING data:  1000 750 500 250 0 N.D.  (Values = STRING's binding scores)

Downloads: TSV (text), GML (Cytoscape)
Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Colocalization
Cell types  Exp. IDs CTCF's Colocalization partners

◢ CTCF: Average

◢ ERX2868710: A549

◢ ERX2869656: A549

◢ ERX2869660: A549

◢ SRX100498: A549

◢ SRX100501: A549

◢ SRX102988: A549

◢ SRX186611: A549

◢ SRX186777: A549

◢ SRX186778: A549

◢ SRX199867: A549

◢ SRX199868: A549

◢ SRX080432: AG04450

◢ SRX199863: AG04450

◢ ERX2868711: BEAS-2B

◢ ERX2868712: BEAS-2B

◢ ERX2869664: BEAS-2B

◢ ERX2869668: BEAS-2B

◢ SRX497255: BEAS-2B

◢ SRX497256: BEAS-2B

◢ SRX080362: HPF

◢ SRX080380: HPF

◢ SRX150484: IMR-90

◢ SRX5290911: IMR-90

◢ SRX5290912: IMR-90

◢ SRX5290913: IMR-90

◢ SRX5290914: IMR-90

◢ SRX6878423: IMR-90

◢ SRX6878424: IMR-90

◢ SRX6878425: IMR-90

◢ SRX6878426: IMR-90

◢ SRX188959: Lung

◣ SRX212197: Lung fibroblasts

◢ SRX038664: NHLF

◢ SRX038665: NHLF

◢ SRX067446: NHLF

◢ SRX199854: NHLF

◢ SRX080347: SAEC

◢ SRX080442: SAEC

◢ SRX189083: WI-38

◢ SRX189084: WI-38

◢ SRX199862: WI-38

◢ SRX199865: WI-38

◢ CTCF: STRING

Lung fibroblasts
 SRX212197
CTCF
A549
 SRX199868
CTCF
WI-38
 SRX199865
CTCF
WI-38
 SRX199862
CTCF
NHLF
 SRX038664
CTCF
IMR-90
 SRX5290912
CTCF
Lung
 SRX188959
CTCF
A549
 SRX100501
CTCF
SAEC
 SRX080347
CTCF
NHLF
 SRX067446
CTCF
NHLF
 SRX038665
CTCF
A549
 ERX2869656
CTCF
BEAS-2B
 ERX2868712
CTCF
BEAS-2B
 ERX2868711
CTCF
A549
 ERX2868710
CTCF
IMR-90
 SRX5290913
CTCF
BEAS-2B
 SRX497256
CTCF
AG04450
 SRX199863
CTCF
NHLF
 SRX199854
CTCF
IMR-90
 SRX5290911
CTCF
A549
 SRX150380
RAD21
A549
 SRX199867
CTCF
SAEC
 SRX080442
CTCF
AG04450
 SRX080432
CTCF
HPF
 SRX080380
CTCF
HPF
 SRX080362
CTCF
WI-38
 SRX204163
SUMO1
A549
 SRX1531786
SMC1A
A549
 SRX1531782
SMC1A
IMR-90
 SRX150703
RAD21
A549
 SRX186778
CTCF
A549
 SRX186777
CTCF
A549
 SRX186611
CTCF
IMR-90
 SRX150484
CTCF
A549
 SRX100498
CTCF
A549
 SRX102988
CTCF
A549
 SRX190217
RAD21
IMR-90
 SRX5290914
CTCF
BEAS-2B
 SRX497255
CTCF
NCI-H1299
 ERX1974189
TP53
NCI-H1299
 ERX1974188
TP53
WI-38
 SRX189083
CTCF
WI-38
 SRX189084
CTCF
IMR-90
 SRX208485
TP53
IMR-90
 SRX016036
RBL2
IMR-90
 SRX016032
RB1
IMR-90
 SRX016030
RB1
IMR-90
 SRX016029
RB1
IMR-90
 SRX016028
RB1
IMR-90
 SRX016034
RBL2
IMR-90
 SRX016033
RB1
IMR-90
 SRX016031
RBL2
IMR-90
 SRX208486
TP53
IMR-90
 SRX016038
RBL2
BEAS-2B
 ERX2869668
CTCF
BEAS-2B
 ERX2869664
CTCF
A549
 SRX7451121
EZH2
WI-38
 SRX204162
SUMO1
WI-38
 SRX204172
SUMO1
IMR-90
 SRX016037
RB1
A549
 ERX2869660
CTCF
BEAS-2B
 SRX5289991
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289990
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289988
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289987
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289979
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289978
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289976
NR3C1
LK-2
 ERX2696549
BCL11A
LK-2
 ERX2696548
BCL11A
LK-2
 ERX2260037
BCL11A
A549
 SRX5576989
CREB1
SW 1271
 SRX3873726
MYC
IMR-90
 SRX208484
TP53
WI-38
 SRX204180
PIAS4
IMR-90
 SRX186618
MAZ
A549
 SRX7451120
EZH2
LK-2
 ERX2260044
SOX2
A549
 SRX5576992
CREB1
A549
 SRX5576990
CRTC2
IMR-90
 SRX3324964
EP300
IMR-90
 SRX3324963
EP300
IMR-90
 SRX3324962
EP300
IMR-90
 SRX3324961
EP300
24335
 SRX2652428
EP300
24335
 SRX2652427
EP300
Lung fibroblasts
 SRX212185
EP300
Lung fibroblasts
 SRX212184
EP300
A549
 SRX190283
EP300
IMR-90
 SRX147007
EP300
HBEC3-KT
 SRX3148653
EZH2
HBEC3-KT
 SRX3148648
EZH2
HBEC3-KT
 SRX3148643
EZH2
HBEC3-KT
 SRX3148638
EZH2
Lu-130
 SRX2858201
SUZ12
NHLF
 SRX186725
EZH2
A549
 SRX190250
YY1
MRC-5
 SRX2732209
POU5F1
MRC-5
 SRX2732208
POU5F1
MRC-5
 SRX1813577
POU5F1
MRC-5
 SRX1813576
POU5F1
MRC-5
 SRX1813575
POU5F1
MRC-5
 SRX1813574
POU5F1
MRC-5
 SRX1813573
POU5F1
MRC-5
 SRX1813572
POU5F1
HBEC3-KT
 SRX3148652
DNMT1
HBEC3-KT
 SRX3148647
DNMT1
HBEC3-KT
 SRX3148642
DNMT1
HBEC3-KT
 SRX3148637
DNMT1
A549
 SRX190338
SIN3A
A549
 SRX366175
SMAD3
NCI-H441
 SRX366168
SMAD3
NCI-H441
 SRX366167
SMAD3
NCI-H526
 SRX890396
KDM1A
NCI-H526
 SRX890395
KDM1A
NCI-H1299
 SRX8400471
YAP1
NCI-H1299
 SRX8400470
YAP1
NCI-H1963
 SRX8333286
BAP1
NCI-H1963
 SRX8333285
BAP1
BEAS-2B
 SRX7794488
HIF1A
BEAS-2B
 SRX7794487
HIF1A
BEAS-2B
 SRX7794486
NFE2L2
BEAS-2B
 SRX7794485
NFE2L2
NCI-H1963
 SRX7701215
BRD4
NCI-H1963
 SRX7701214
BRD4
NCI-H1963
 SRX7701213
BRD4
NCI-H1963
 SRX7701212
BRD4
NCI-H1963
 SRX7701204
BRD4
NCI-H1963
 SRX7701201
ASXL3
NCI-H1963
 SRX7701200
ASXL3
Calu-3
 SRX761563
EHF
Calu-3
 SRX761562
EHF
H2052
 SRX757326
YAP1
H2052
 SRX757325
YAP1
NCI-H69
 SRX731143
TEAD1
NCI-H69
 SRX731142
YAP1
NCI-H69
 SRX731141
YAP1
A549
 SRX7268483
NFE2L2
IMR-90
 SRX6878426
CTCF
IMR-90
 SRX6878425
CTCF
IMR-90
 SRX6878424
CTCF
IMR-90
 SRX6878423
CTCF
NCI-H520
 SRX6852821
POU3F2
LK-2
 SRX6852820
POU3F2
LK-2
 SRX6852815
TP63
LK-2
 SRX6852814
SOX2
LK-2
 SRX6852813
SOX2
HCC2814
 SRX6852812
SOX2
KNS-62
 SRX6852811
SOX2
HCC95
 SRX6852810
SOX2
NCI-H520
 SRX6852809
SOX2
LK-2
 SRX6852808
SOX2
A549
 SRX6778344
ELF1
A549
 SRX6778343
ELF1
BEAS-2B
 SRX6616802
NR3C1
BEAS-2B
 SRX6616801
NR3C1
BEAS-2B
 SRX6616800
NR3C1
BEAS-2B
 SRX6616799
NR3C1
IMR-90
 SRX620747
TP53
IMR-90
 SRX620746
TP53
A549
 SRX5982364
SMARCA4
A549
 SRX5982363
SMARCA2
A549
 SRX5982362
SMARCA2
A549
 SRX5982361
SMARCA2
A549
 SRX5982360
SMARCA2
A549
 SRX5982359
SMARCA2
A549
 SRX5982343
SMARCA4
A549
 SRX5982342
SMARCA4
A549
 SRX5982341
SMARCA4
A549
 SRX5982340
SMARCA4
PC-9
 SRX5887623
SNAI2
PC-9
 SRX5887621
YAP1
PC-9
 SRX5887620
TEAD4
PC-9
 SRX5887619
SNAI2
PC-9
 SRX5887618
YAP1
PC-9
 SRX5887617
TEAD4
PC-9
 SRX5887616
SNAI2
PC-9
 SRX5887614
YAP1
PC-9
 SRX5887613
TEAD4
PC-9
 SRX5887611
YAP1
PC-9
 SRX5887610
TEAD4
PC-9
 SRX5887609
SNAI2
A549
 SRX5849927
TP53
A549
 SRX5849926
TP53
A549
 SRX5849925
TP53
A549
 SRX5849924
TP53
A549
 SRX5725262
MGA
A549
 SRX5725261
MGA
A549
 SRX5725260
MGA
A549
 SRX5725259
MGA
A549
 SRX5725258
MYC
A549
 SRX5598318
MYOCD
A549
 SRX5576993
CRTC2
Calu-1
 SRX5552347
TP53
Calu-1
 SRX5552346
TP53
Calu-1
 SRX5552345
TP53
Calu-1
 SRX5552344
TP53
BEAS-2B
 SRX5289989
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289986
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289985
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289984
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289983
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289982
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289981
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289980
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289977
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289975
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289974
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289973
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289972
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289971
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289970
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289969
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289968
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289967
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289966
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289965
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289964
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289963
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289962
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289961
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289960
NR3C1
IMR-90
 SRX502814
HIRA
IMR-90
 SRX502812
HIRA
IMR-90
 SRX502810
HIRA
IMR-90
 SRX502808
HIRA
IMR-90
 SRX4714473
GTF3C2
IMR-90
 SRX4714471
GTF3C2
A549
 SRX4673795
BRD3
A549
 SRX4673794
BCL6
A549
 SRX4673793
BCL6
A549
 SRX4672371
ARNT
A549
 SRX4672370
ARNT
A549
 SRX4672369
ARNT
Bronchial tracheal epithelial cells
 SRX4367442
TBP
Bronchial tracheal epithelial cells
 SRX4367441
TBP
Bronchial tracheal epithelial cells
 SRX4367432
TBP
Bronchial tracheal epithelial cells
 SRX4367431
TBP
Bronchial tracheal epithelial cells
 SRX4367422
TBP
Bronchial tracheal epithelial cells
 SRX4367421
TBP
IMR-90
 SRX4230307
TP53
NCI-H1048
 SRX4143035
POU2F3
NCI-H23
 SRX4001483
BRD2
NCI-H23
 SRX4001482
BRD2
NCI-H23
 SRX4001479
BRD2
NCI-H23
 SRX4001478
BRD2
A549
 SRX3985128
NFE2L2
IMR-90
 SRX392040
LMNB1
SW 1271
 SRX3873725
MYC
SW 1271
 SRX3873717
ELL2
SW 1271
 SRX3873716
ELL2
NCI-H2171
 SRX3873715
ELL2
NCI-H2171
 SRX3873714
ELL2
SW 1271
 SRX3873713
AFF4
SW 1271
 SRX3873712
AFF4
NCI-H2171
 SRX3873711
AFF4
NCI-H2171
 SRX3873710
AFF4
SW 1271
 SRX3873709
AFF1
SW 1271
 SRX3873708
AFF1
NCI-H2171
 SRX3873707
AFF1
NCI-H2171
 SRX3873706
AFF1
A549
 SRX386240
SETX
A549
 SRX386239
SETX
A549
 SRX3829962
MGA
A549
 SRX3829961
MGA
IMR-90
 SRX3791762
HMGA1
IMR-90
 SRX3791761
HMGA1
NCI-H441
 SRX366173
SMAD4
NCI-H441
 SRX366172
SMAD4
NCI-H441
 SRX366170
NKX2-1
NCI-H441
 SRX366169
NKX2-1
Lung fibroblasts
 SRX3585704
HMGB1
NCI-H1299
 SRX3548668
SMARCA4
NCI-H1299
 SRX3548667
SMARCA4
HS-SY-II
 SRX3542504
SMARCA4
HS-SY-II
 SRX3542480
KDM2B
NCI-H1975
 SRX3392334
ZEB1
NCI-H1975
 SRX3392333
ZEB1
IMR-90
 SRX3324960
CREBBP
IMR-90
 SRX3324959
CREBBP
IMR-90
 SRX3324958
CREBBP
IMR-90
 SRX3324957
CREBBP
IMR-90
 SRX329086
BCL10
IMR-90
 SRX329085
BCL10
IMR-90
 SRX329084
BCL10
IMR-90
 SRX329083
BCL10
IMR-90
 SRX329082
BCL10
IMR-90
 SRX329081
BCL10
Bronchial tracheal epithelial cells
 SRX3288981
IRF3
Bronchial tracheal epithelial cells
 SRX3288980
IRF3
Bronchial tracheal epithelial cells
 SRX3288979
IRF3
Bronchial tracheal epithelial cells
 SRX3288978
IRF3
Bronchial tracheal epithelial cells