ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for SPDEF

Query protein: SPDEF
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SPDEF | STRING
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
SPDEF's Target genes

◢ SPDEF: Average

◢ SRX2164790: A549

◢ SRX2164792: A549

◢ SRX323401: MCF-7

◢ SRX323402: MCF-7

◢ SRX323403: MCF-7

◣ SPDEF: STRING

LRATD2 ↻ ≫
SMARCD2 ↻ ≫
TRIM3 ↻ ≫
PGK1 ↻ ≫
ZDHHC1 ↻ ≫
POLR3B ↻ ≫
REXO4 ↻ ≫
ADAMTS13 ↻ ≫
PLCB4 ↻ ≫
ADNP ↻ ≫
VMP1 ↻ ≫
PTRH2 ↻ ≫
MTRNR2L2 ↻ ≫
MSH3 ↻ ≫
DHFR ↻ ≫
MTRNR2L8 ↻ ≫
COL23A1 ↻ ≫
CCDC200 ↻ ≫
TRIB3 ↻ ≫
ZNF655 ↻ ≫
CST3 ↻ ≫
EEF2K ↻ ≫
PCCA ↻ ≫
S100A16 ↻ ≫
ARHGAP40 ↻ ≫
RTBDN ↻ ≫
MAST1 ↻ ≫
MADD ↻ ≫
AFF4 ↻ ≫
MZB1 ↻ ≫
OPRL1 ↻ ≫
LKAAEAR1 ↻ ≫
MYADM ↻ ≫
MRPL44 ↻ ≫
NOL11 ↻ ≫
MAMDC2 ↻ ≫
KMT2C ↻ ≫
PMF1-BGLAP ↻ ≫
PMF1 ↻ ≫
KMT5A ↻ ≫
CST4 ↻ ≫
PCYT1A ↻ ≫
PSMD6 ↻ ≫
DEDD ↻ ≫
MOB4 ↻ ≫
DMTF1 ↻ ≫
NOTCH2NLC ↻ ≫
NOTCH2NLB ↻ ≫
NOTCH2NLA ↻ ≫
SYT5 ↻ ≫
WDR74 ↻ ≫
ARL14EP ↻ ≫
SLC16A5 ↻ ≫
ZNF609 ↻ ≫
STMN3 ↻ ≫
RTEL1 ↻ ≫
TMEM87B ↻ ≫
REXO5 ↻ ≫
ERI2 ↻ ≫
METTL25 ↻ ≫
CCDC59 ↻ ≫
MISP3 ↻ ≫
ZNF500 ↻ ≫
ADPRHL1 ↻ ≫
ZBED8 ↻ ≫
STX16 ↻ ≫
C9orf152 ↻ ≫
DNAJC10 ↻ ≫
PLEKHG2 ↻ ≫
EXOC2 ↻ ≫
BMP7 ↻ ≫
CST1 ↻ ≫
ALG8 ↻ ≫
SPRYD3 ↻ ≫
GGPS1 ↻ ≫
ARID4B ↻ ≫
FRG2 ↻ ≫
FFAR2 ↻ ≫
ZNF408 ↻ ≫
ARHGAP1 ↻ ≫
DUX4 ↻ ≫
ERGIC1 ↻ ≫
TRIM37 ↻ ≫
RPL32 ↻ ≫
INKA2 ↻ ≫
FRG2C ↻ ≫
DDX20 ↻ ≫
POLR3F ↻ ≫
DZANK1 ↻ ≫
DPF1 ↻ ≫
SNRPB ↻ ≫
CUEDC1 ↻ ≫
WDR11 ↻ ≫
RAPGEF6 ↻ ≫
SCYL3 ↻ ≫
AP3B1 ↻ ≫
CYREN ↻ ≫
GNPNAT1 ↻ ≫
MICA ↻ ≫
CRNKL1 ↻ ≫
CFAP61 ↻ ≫
EIF1AD ↻ ≫
BANF1 ↻ ≫
CNOT3 ↻ ≫
RPS26 ↻ ≫
ANAPC15 ↻ ≫
SLC25A40 ↻ ≫
DBF4 ↻ ≫
SKA2 ↻ ≫
PRR11 ↻ ≫
SPTBN4 ↻ ≫
BLVRB ↻ ≫
MUC3A ↻ ≫
NOTCH2 ↻ ≫
SLC23A1 ↻ ≫
PHC2 ↻ ≫
SGO2 ↻ ≫
GORAB ↻ ≫
TMEM251 ↻ ≫
SNX1 ↻ ≫
MOAP1 ↻ ≫
CIAO2A ↻ ≫
MTRNR2L1 ↻ ≫
CYRIB ↻ ≫
CYBC1 ↻ ≫
NKX2-8 ↻ ≫
C6orf89 ↻ ≫
NDUFS3 ↻ ≫
KBTBD4 ↻ ≫
SLC1A5 ↻ ≫
TNS4 ↻ ≫
MTOR ↻ ≫
FAM72D ↻ ≫
FAM72C ↻ ≫
ODC1 ↻ ≫
COX6B1 ↻ ≫
CD63 ↻ ≫
CCDC97 ↻ ≫
ZFP37 ↻ ≫
RMND1 ↻ ≫
ARMT1 ↻ ≫
UBE2K ↻ ≫
MON1B ↻ ≫
APPBP2 ↻ ≫
PAQR4 ↻ ≫
KREMEN2 ↻ ≫
DGKA ↻ ≫
MUC2 ↻ ≫
ZNF217 ↻ ≫
UNC45B ↻ ≫
HARS2 ↻ ≫
HARS1 ↻ ≫
BCL2L13 ↻ ≫
WDR55 ↻ ≫
MUC5B ↻ ≫
NAPSA ↻ ≫
UCHL5 ↻ ≫
TOP3A ↻ ≫
SMCR8 ↻ ≫
RO60 ↻ ≫
TEP1 ↻ ≫
KRT8 ↻ ≫
KRT18 ↻ ≫
ASNSD1 ↻ ≫
ASDURF ↻ ≫
SULF2 ↻ ≫
FAM221A ↻ ≫
SCAMP1 ↻ ≫
ZNF576 ↻ ≫
IRGQ ↻ ≫
NCOA3 ↻ ≫
CCPG1 ↻ ≫
C15orf65 ↻ ≫
RAC3 ↻ ≫
TRIM59 ↻ ≫
ZNF106 ↻ ≫
TACO1 ↻ ≫
SNAP23 ↻ ≫
SLC51B ↻ ≫
SDHA ↻ ≫
CCDC127 ↻ ≫
FAM72A ↻ ≫
HIPK1 ↻ ≫
DPY19L4 ↻ ≫
TPCN1 ↻ ≫
C3orf35 ↻ ≫
RPEL1 ↻ ≫
IMPA1 ↻ ≫
CIAO3 ↻ ≫
PPM1D ↻ ≫
LDAH ↻ ≫
AP2S1 ↻ ≫
PRORP ↻ ≫
PPP2R3C ↻ ≫
REPS1 ↻ ≫
ESM1 ↻ ≫
MED23 ↻ ≫
GLYATL1 ↻ ≫
SHKBP1 ↻ ≫
RPS6KB2 ↻ ≫
MDFI ↻ ≫
EIF4A2 ↻ ≫
ZNF335 ↻ ≫
CEP63 ↻ ≫
ANAPC13 ↻ ≫
FLYWCH2 ↻ ≫
ING4 ↻ ≫
RUVBL1 ↻ ≫
LRP6 ↻ ≫
UTP25 ↻ ≫
SCIMP ↻ ≫
B3GNT2 ↻ ≫
DHX8 ↻ ≫
ATP5MC2 ↻ ≫
ACY1 ↻ ≫
TTC9B ↻ ≫
TLNRD1 ↻ ≫
CLDN23 ↻ ≫
UEVLD ↻ ≫
TARS2 ↻ ≫
PSMD14 ↻ ≫
NQO1 ↻ ≫
VPS13B ↻ ≫
BCL3 ↻ ≫
RABEPK ↻ ≫
INTS12 ↻ ≫
GSTCD ↻ ≫
CXXC5 ↻ ≫
KMT2A ↻ ≫
TEN1 ↻ ≫
ACOX1 ↻ ≫
BAZ2A ↻ ≫
TTC39A ↻ ≫
MPEG1 ↻ ≫
ZHX3 ↻ ≫
RBSN ↻ ≫
COMMD1 ↻ ≫
CCT4 ↻ ≫
ACTN4 ↻ ≫
PMEPA1 ↻ ≫
SMG8 ↻ ≫
UBR7 ↻ ≫
PLXNB2 ↻ ≫
GON7 ↻ ≫
EMSY ↻ ≫
BLOC1S5 ↻ ≫
IQANK1 ↻ ≫
GABPB1 ↻ ≫
FAM83H ↻ ≫
TPTE ↻ ≫
PMVK ↻ ≫
ARHGAP39 ↻ ≫
METTL3 ↻ ≫
ECT2 ↻ ≫
CLTC ↻ ≫
UBL7 ↻ ≫
TMEM199 ↻ ≫
POLDIP2 ↻ ≫
N4BP3 ↻ ≫
ZMYND8 ↻ ≫
TNNI3 ↻ ≫
NME6 ↻ ≫
SMIM14 ↻ ≫
KANSL3 ↻ ≫
FUT10 ↻ ≫
FER1L5 ↻ ≫
BRIP1 ↻ ≫
MLPH ↻ ≫
ZNF546 ↻ ≫
OTUD7B ↻ ≫
GRPEL2 ↻ ≫
NOS1AP ↻ ≫
TVP23B ↻ ≫
TBATA ↻ ≫
FAM227B ↻ ≫
DTWD1 ↻ ≫
TSC2 ↻ ≫
NTHL1 ↻ ≫
BHLHA9 ↻ ≫
PFKP ↻ ≫
KAZALD1 ↻ ≫
FAM20B ↻ ≫
ZNF446 ↻ ≫
VAMP2 ↻ ≫
TANC2 ↻ ≫
USPL1 ↻ ≫
SPHK2 ↻ ≫
RPL18 ↻ ≫
HMGB1 ↻ ≫
FAM83E ↻ ≫
TEX14 ↻ ≫
RIC3 ↻ ≫
RAD51C ↻ ≫
GTSE1 ↻ ≫
PARD6B ↻ ≫
CCDC61 ↻ ≫
SNAP29 ↻ ≫
PI4KA ↻ ≫
RPS16 ↻ ≫
ZNF512 ↻ ≫
SLC24A1 ↻ ≫
EIF2S1 ↻ ≫
ATP6V1D ↻ ≫
PDE4DIP ↻ ≫
RARA ↻ ≫
NUDCD3 ↻ ≫
ZNF197 ↻ ≫
GNAQ ↻ ≫
DYNC1LI1 ↻ ≫
EMB ↻ ≫
DSTYK ↻ ≫
MAPK13 ↻ ≫
BCAS3 ↻ ≫
ETFA ↻ ≫
SDSL ↻ ≫
PSMA5 ↻ ≫
IPPK ↻ ≫
NEU2 ↻ ≫
GRK6 ↻ ≫
TRIM11 ↻ ≫
EED ↻ ≫
CEACAM3 ↻ ≫
TTC14 ↻ ≫
SCARB2 ↻ ≫
RGPD2 ↻ ≫
RGPD1 ↻ ≫
FAM47E ↻ ≫
SFTPB ↻ ≫
SEC16A ↻ ≫
EYA3 ↻ ≫
C9orf163 ↻ ≫
ZNF860 ↻ ≫
OSBPL10 ↻ ≫
MARCHF7 ↻ ≫
TPD52 ↻ ≫
GJC3 ↻ ≫
MTRNR2L9 ↻ ≫
MTRNR2L10 ↻ ≫
BCAS2 ↻ ≫
ANKLE1 ↻ ≫
DUSP6 ↻ ≫
EDN1 ↻ ≫
CFAP58 ↻ ≫
ZG16B ↻ ≫
SNRPB2 ↻ ≫
LEMD2 ↻ ≫
TRIM48 ↻ ≫
SCAND1 ↻ ≫
RB1 ↻ ≫
FAM207A ↻ ≫
VPS26A ↻ ≫
SPOP ↻ ≫
CPNE8 ↻ ≫
ZNF518A ↻ ≫
RPS7 ↻ ≫
SLBP ↻ ≫
MRGBP ↻ ≫
RUSC1 ↻ ≫
FLNA ↻ ≫
ZC3HC1 ↻ ≫
WDR24 ↻ ≫
RBBP5 ↻ ≫
USP32 ↻ ≫
SPOPL ↻ ≫
RAPGEF3 ↻ ≫
PSMB7 ↻ ≫
EIF2AK1 ↻ ≫
TIPRL ↻ ≫
LSG1 ↻ ≫
KATNIP ↻ ≫
GTF3C1 ↻ ≫
TBC1D30 ↻ ≫
SLC25A32 ↻ ≫
DCAF13 ↻ ≫
F2RL1 ↻ ≫
RPH3AL ↻ ≫
PLAUR ↻ ≫
FAM72B ↻ ≫
DCAF10 ↻ ≫
THEM4 ↻ ≫
SLC25A36 ↻ ≫
PTER ↻ ≫
BCAS4 ↻ ≫
TOB2 ↻ ≫
PDE11A ↻ ≫
TOR1AIP2 ↻ ≫
TOR1AIP1 ↻ ≫
NEK5 ↻ ≫
NACA2 ↻ ≫
USP38 ↻ ≫
PRKAB1 ↻ ≫
GSE1 ↻ ≫
TMTC3 ↻ ≫
FNBP4 ↻ ≫
CEP290 ↻ ≫
TKFC ↻ ≫
NFKBIZ ↻ ≫
NECTIN1 ↻ ≫
ID1 ↻ ≫
FUT4 ↻ ≫
DDB1 ↻ ≫
MYEOV ↻ ≫
MRPL33 ↻ ≫
CNBP ↻ ≫
ADORA2B ↻ ≫
TRIM35 ↻ ≫
PTK2B ↻ ≫
CARMIL1 ↻ ≫
AP1M1 ↻ ≫
RAD51AP1 ↻ ≫
CLDN2 ↻ ≫
C12orf4 ↻ ≫
TAFA3 ↻ ≫
PPM1J ↻ ≫
PPM1H ↻ ≫
PLA2R1 ↻ ≫
PMPCB ↻ ≫
NPDC1 ↻ ≫
EXOSC5 ↻ ≫
BCKDHA ↻ ≫
RWDD1 ↻ ≫
TAT ↻ ≫
PRRC2B ↻ ≫
TFF3 ↻ ≫
WDR97 ↻ ≫
MAF1 ↻ ≫
HMG20B ↻ ≫
MEF2A ↻ ≫
SRP19 ↻ ≫
PGBD4 ↻ ≫
EMC7 ↻ ≫
UNC45A ↻ ≫
TMEM210 ↻ ≫
SPAG9 ↻ ≫
LRRC26 ↻ ≫
HDDC3 ↻ ≫
NOXA1 ↻ ≫
IFRD1 ↻ ≫
DCP2 ↻ ≫
COMMD2 ↻ ≫
CHD8 ↻ ≫
TRIM33 ↻ ≫
SNRPA ↻ ≫
PMP22 ↻ ≫
KCNAB3 ↻ ≫
CNTROB ↻ ≫
C19orf54 ↻ ≫
SPEF1 ↻ ≫
MID1 ↻ ≫
DNAJC25-GNG10 ↻ ≫
DNAJC25 ↻ ≫
DISP1 ↻ ≫
SWSAP1 ↻ ≫
SAPCD2 ↻ ≫
PRMT6 ↻ ≫
PCM1 ↻ ≫
GSPT1 ↻ ≫
ALOXE3 ↻ ≫
UNK ↻ ≫
UBE2L3 ↻ ≫
RIMBP3C ↻ ≫
RIMBP3B ↻ ≫
H3-3B ↻ ≫
CPOX ↻ ≫
TUBD1 ↻ ≫
TMEM87A ↻ ≫
SLC39A6 ↻ ≫
RPS6KB1 ↻ ≫
GANC ↻ ≫
ELP2 ↻ ≫
ARL8B ↻ ≫
TMBIM4 ↻ ≫
STAM2 ↻ ≫
PHF14 ↻ ≫
SLC34A3 ↻ ≫
SCNM1 ↻ ≫
RNF224 ↻ ≫
LYSMD1 ↻ ≫
VAMP1 ↻ ≫
VAC14 ↻ ≫
UST ↻ ≫
PLA2G15 ↻ ≫
C9orf64 ↻ ≫
ALDH3A1 ↻ ≫
SH3YL1 ↻ ≫
MRPL1 ↻ ≫
CALR ↻ ≫
ACP1 ↻ ≫
RBM19 ↻ ≫
RASEF ↻ ≫
RALGPS1 ↻ ≫
KRR1 ↻ ≫
RABEP2 ↻ ≫
HIF1AN ↻ ≫
HDAC8 ↻ ≫
H4C8 ↻ ≫
ARG2 ↻ ≫
SYNGR2 ↻ ≫
SECISBP2 ↻ ≫
RPS19 ↻ ≫
MRPS33 ↻ ≫
BIN2 ↻ ≫
TTC6 ↻ ≫
PPIP5K1 ↻ ≫
PDE8A ↻ ≫
H2BC21 ↻ ≫
H2AC21 ↻ ≫
H2AC20 ↻ ≫
FOXA1 ↻ ≫
CKMT1B ↻ ≫
DEXI ↻ ≫
CLEC16A ↻ ≫
CCDC22 ↻ ≫
CACNA1F ↻ ≫
ARL13B ↻ ≫
TSPAN13 ↻ ≫
TMEM183A ↻ ≫
SLC33A1 ↻ ≫
NRAS ↻ ≫
LNPEP ↻ ≫
TOP3B ↻ ≫
TCAF1 ↻ ≫
MPPE1 ↻ ≫
CLMN ↻ ≫
USP9X ↻ ≫
SETD9 ↻ ≫
LUC7L2 ↻ ≫
ANKRD13D ↻ ≫
ALG10 ↻ ≫
ATAD2 ↻ ≫
ZNF366 ↻ ≫
ZNF165 ↻ ≫
ZFP62 ↻ ≫
EPHB3 ↻ ≫
C11orf49 ↻ ≫
SOAT1 ↻ ≫
PRKAG3 ↻ ≫
NBEAL2 ↻ ≫
ESCO1 ↻ ≫
CCDC12 ↻ ≫
USP43 ↻ ≫
SYT12 ↻ ≫
SLC35B1 ↻ ≫
CLCN4 ↻ ≫
TSEN54 ↻ ≫
TRMT6 ↻ ≫
MCM8 ↻ ≫
CASKIN2 ↻ ≫
ALG10B ↻ ≫
DDX59 ↻ ≫
ZNF410 ↻ ≫
TJP2 ↻ ≫
PPP2R5E ↻ ≫
INTS2 ↻ ≫
SMARCC2 ↻ ≫
PIGM ↻ ≫
BRINP3 ↻ ≫
KLHL9 ↻ ≫
HLTF ↻ ≫
EIF4B ↻ ≫
EGR1 ↻ ≫
DGKD ↻ ≫
COX7A2L ↻ ≫
WRAP53 ↻ ≫
TP53 ↻ ≫
TBPL1 ↻ ≫
RPS29 ↻ ≫
RPL37 ↻ ≫
PPP3R1 ↻ ≫
PPIP5K2 ↻ ≫
MMADHC ↻ ≫
TRIP4 ↻ ≫
REEP3 ↻ ≫
OSBPL7 ↻ ≫
KMT2D ↻ ≫
JMJD1C ↻ ≫
GSK3B ↻ ≫
SHISA5 ↻ ≫
MAP1LC3C ↻ ≫
FMO5 ↻ ≫
PPIL2 ↻ ≫
PDS5A ↻ ≫
PCIF1 ↻ ≫
NDUFA4 ↻ ≫
GRIK3 ↻ ≫
BZW1 ↻ ≫
ZBTB7B ↻ ≫
PTPRN2 ↻ ≫
PLCG1 ↻ ≫
LINS1 ↻ ≫
ID2 ↻ ≫
ASB7 ↻ ≫
KIF26A ↻ ≫
HNRNPA2B1 ↻ ≫
CBX3 ↻ ≫
ADH5 ↻ ≫
HEATR6 ↻ ≫
ATR ↻ ≫
SLC39A4 ↻ ≫
SGPP1 ↻ ≫
METTL18 ↻ ≫
LSM5 ↻ ≫
GPAA1 ↻ ≫
EXOSC4 ↻ ≫
CPSF1 ↻ ≫
C1orf112 ↻ ≫
AVL9 ↻ ≫
RANGAP1 ↻ ≫
FRAT1 ↻ ≫
LOC100509620 ↻ ≫
ETFBKMT ↻ ≫
YIF1A ↻ ≫
VPS11 ↻ ≫
TMEM151A ↻ ≫
CTTN ↻ ≫
PSMC5 ↻ ≫
FTSJ3 ↻ ≫
SH3PXD2A ↻ ≫
GNPDA2 ↻ ≫
B3GAT2 ↻ ≫
GOLGB1 ↻ ≫
PIP4P2 ↻ ≫
CKMT1A ↻ ≫
TFB2M ↻ ≫
NPM1 ↻ ≫
MEIG1 ↻ ≫
CNST ↻ ≫
NOSTRIN ↻ ≫
DCLRE1B ↻ ≫
CSDE1 ↻ ≫
AP4B1 ↻ ≫
TPD52L2 ↻ ≫
ABHD16B ↻ ≫
NEDD4 ↻ ≫
ATXN2 ↻ ≫
RCAN1 ↻ ≫
RAB1B ↻ ≫
C3orf14 ↻ ≫
APBB1 ↻ ≫
TEFM ↻ ≫
SDHAF3 ↻ ≫
ERCC6L2 ↻ ≫
TOMM22 ↻ ≫
SASS6 ↻ ≫
FNTB ↻ ≫
DDX58 ↻ ≫
NCR3LG1 ↻ ≫
GLUD2 ↻ ≫
EDN2 ↻ ≫
DPY19L3 ↻ ≫
RPL12 ↻ ≫
LRSAM1 ↻ ≫
KIF22 ↻ ≫
DDX23 ↻ ≫
ZNF670 ↻ ≫
NDRG1 ↻ ≫
RNFT1 ↻ ≫
BNIP1 ↻ ≫
EEF1AKNMT ↻ ≫
ZNF180 ↻ ≫
PROSER1 ↻ ≫
NHLRC3 ↻ ≫
SMAD3 ↻ ≫
CIC ↻ ≫
GLRX ↻ ≫