ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for CLOCK

Query protein: CLOCK
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX235054 | U2OS
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
CLOCK's Target genes

◢ CLOCK: Average

◢ SRX359928: LoVo

◢ SRX1091022: NOMO-1

◢ SRX1091025: NOMO-1

◢ SRX1091030: NOMO-1

◢ SRX1091036: THP-1

◢ SRX1091039: THP-1

◢ SRX1393087: U2OS

◢ SRX1393088: U2OS

◣ SRX235054: U2OS

◢ CLOCK: STRING
AGAP11 ↻ ≫
PLD6 ↻ ≫
GET4 ↻ ≫
NR1D2 ↻ ≫
NKIRAS1 ↻ ≫
RALGDS ↻ ≫
COLEC11 ↻ ≫
DBP ↻ ≫
G3BP1 ↻ ≫
PER2 ↻ ≫
MTHFD1L ↻ ≫
CAMKK1 ↻ ≫
CDK4 ↻ ≫
CRY2 ↻ ≫
EIF5A2 ↻ ≫
ANKRD12 ↻ ≫
PIP4P2 ↻ ≫
YPEL5 ↻ ≫
FNIP1 ↻ ≫
AVPI1 ↻ ≫
TSPAN4 ↻ ≫
CLN6 ↻ ≫
TFDP1 ↻ ≫
CPEB1 ↻ ≫
SLC25A13 ↻ ≫
VPS26A ↻ ≫
ATXN2 ↻ ≫
RORC ↻ ≫
RNMT ↻ ≫
FAM210A ↻ ≫
SLC35A5 ↻ ≫
ATG3 ↻ ≫
MRPL40 ↻ ≫
HIRA ↻ ≫
HERC3 ↻ ≫
LAMP1 ↻ ≫
ISOC2 ↻ ≫
CASC3 ↻ ≫
TEF ↻ ≫
PUM2 ↻ ≫
FAH ↻ ≫
SNAP29 ↻ ≫
PI4KA ↻ ≫
KAT5 ↻ ≫
MDGA2 ↻ ≫
HIF1A ↻ ≫
ZNRF2 ↻ ≫
LRFN4 ↻ ≫
GGA2 ↻ ≫
CORO7-PAM16 ↻ ≫
CORO7 ↻ ≫
NPTN ↻ ≫
COPS7A ↻ ≫
RASD2 ↻ ≫
PINX1 ↻ ≫
TMEM116 ↻ ≫
ERP29 ↻ ≫
SPATC1L ↻ ≫
OGDH ↻ ≫
MXI1 ↻ ≫
THNSL1 ↻ ≫
TBC1D3L ↻ ≫
TBC1D3K ↻ ≫
TBC1D3I ↻ ≫
TBC1D3H ↻ ≫
TBC1D3G ↻ ≫
TBC1D3F ↻ ≫
TBC1D3E ↻ ≫
TBC1D3D ↻ ≫
TBC1D3C ↻ ≫
TBC1D3 ↻ ≫
CRY1 ↻ ≫
TRIM8 ↻ ≫
TBCEL-TECTA ↻ ≫
TBCEL ↻ ≫
HPS5 ↻ ≫
GTF2H1 ↻ ≫
KHDRBS1 ↻ ≫
C7orf57 ↻ ≫
LGR6 ↻ ≫
GYG1 ↻ ≫
PDP2 ↻ ≫
CLUAP1 ↻ ≫
ARL4A ↻ ≫
TMEM185B ↻ ≫
SPG21 ↻ ≫
GGT5 ↻ ≫
TRAPPC2L ↻ ≫
GALNS ↻ ≫
AMZ1 ↻ ≫
PIP4P1 ↻ ≫
PHF20 ↻ ≫
ILVBL ↻ ≫
MARCHF8 ↻ ≫
MRPL36 ↻ ≫
BHLHE40 ↻ ≫
DIXDC1 ↻ ≫
PALD1 ↻ ≫
LARP1 ↻ ≫
ZBTB37 ↻ ≫
OSGEP ↻ ≫
APEX1 ↻ ≫
ZNF706 ↻ ≫
KRTAP2-1 ↻ ≫
CCDC85B ↻ ≫
PMS2 ↻ ≫
AIMP2 ↻ ≫
COMMD8 ↻ ≫
DDX5 ↻ ≫
CEP95 ↻ ≫
KRTAP4-8 ↻ ≫
KRTAP4-11 ↻ ≫
GBE1 ↻ ≫
FLCN ↻ ≫
ILF3 ↻ ≫
HDAC4 ↻ ≫
CUTA ↻ ≫
AATF ↻ ≫
SOX12 ↻ ≫
YDJC ↻ ≫
TRAPPC6A ↻ ≫
BLOC1S3 ↻ ≫
ZNF331 ↻ ≫
SERF2 ↻ ≫
PCGF1 ↻ ≫
MC3R ↻ ≫
KRTAP4-12 ↻ ≫
CSRNP1 ↻ ≫
NAPA ↻ ≫
KRTAP4-4 ↻ ≫
COX14 ↻ ≫
CLCN7 ↻ ≫
AGO1 ↻ ≫
RRAGC ↻ ≫
L3HYPDH ↻ ≫
JKAMP ↻ ≫
CNDP2 ↻ ≫
CHKA ↻ ≫
KISS1 ↻ ≫
MTHFR ↻ ≫
CLCN6 ↻ ≫
MAP2K7 ↻ ≫
TKTL1 ↻ ≫
TEX28 ↻ ≫
MAPK1 ↻ ≫
USP36 ↻ ≫
WTAP ↻ ≫
SOD2 ↻ ≫
RAD50 ↻ ≫
KRTAP9-8 ↻ ≫
SCN5A ↻ ≫
PDE1B ↻ ≫
CIPC ↻ ≫
NPM1 ↻ ≫
GLI2 ↻ ≫
ITGB2 ↻ ≫
BHLHE41 ↻ ≫
PPAT ↻ ≫
PAICS ↻ ≫
SCAF11 ↻ ≫
SIRT1 ↻ ≫
UBE2Q1 ↻ ≫
CEP72 ↻ ≫
LDHA ↻ ≫
KRTAP9-7 ↻ ≫
KRTAP9-4 ↻ ≫
IER3 ↻ ≫
ACY3 ↻ ≫
DEPTOR ↻ ≫
TXNIP ↻ ≫
N6AMT1 ↻ ≫
LOC100996750 ↻ ≫
KRTAP4-7 ↻ ≫
EIF4A3 ↻ ≫
AIG1 ↻ ≫
KRTAP2-3 ↻ ≫
SNX8 ↻ ≫
MAT2A ↻ ≫
LDHB ↻ ≫
ADK ↻ ≫
SLC25A38 ↻ ≫
DACT3 ↻ ≫
CGREF1 ↻ ≫
ARHGAP39 ↻ ≫
ACAD9 ↻ ≫
RTN4R ↻ ≫
KRTAP9-2 ↻ ≫
KRTAP2-4 ↻ ≫
CD7 ↻ ≫
HK2 ↻ ≫
SQLE ↻ ≫
RIMBP2 ↻ ≫
KIAA1522 ↻ ≫
GOLIM4 ↻ ≫
CRTAM ↻ ≫
NLK ↻ ≫
ZFP91 ↻ ≫
KRTAP10-6 ↻ ≫
TMEM204 ↻ ≫
SPRING1 ↻ ≫
RNFT2 ↻ ≫
PAPLN ↻ ≫
MARS2 ↻ ≫
UBE2QL1 ↻ ≫
ARRDC4 ↻ ≫
USP32 ↻ ≫
MTRNR2L8 ↻ ≫
ZNF74 ↻ ≫
FRMD1 ↻ ≫
TCERG1 ↻ ≫
RELL1 ↻ ≫
KRTAP10-5 ↻ ≫
POTEH ↻ ≫
HAGH ↻ ≫
FAHD1 ↻ ≫
GTF3A ↻ ≫
TMEM248 ↻ ≫
MGAT3 ↻ ≫
KRTAP9-6 ↻ ≫
CTSH ↻ ≫
TDRD15 ↻ ≫
NUP188 ↻ ≫
INO80 ↻ ≫
HGC6.3 ↻ ≫
DOLK ↻ ≫
CAD ↻ ≫
ZCCHC7 ↻ ≫
AJUBA ↻ ≫
HOXA3 ↻ ≫
C3orf70 ↻ ≫
PDE4A ↻ ≫
NPEPL1 ↻ ≫
MARVELD1 ↻ ≫
KRTAP2-2 ↻ ≫
KRTAP10-7 ↻ ≫
ERRFI1 ↻ ≫
NOL8 ↻ ≫
CENPP ↻ ≫
PDE4DIP ↻ ≫
SLC16A1 ↻ ≫
RELT ↻ ≫
KRTAP10-3 ↻ ≫
SPACA3 ↻ ≫
SHTN1 ↻ ≫
LPAR6 ↻ ≫
B3GNTL1 ↻ ≫
KRTAP4-1 ↻ ≫
ZSCAN22 ↻ ≫
KRTAP10-1 ↻ ≫
RUBCN ↻ ≫
PRLH ↻ ≫
FYTTD1 ↻ ≫
CISD1 ↻ ≫
ASPH ↻ ≫
KRTAP9-9 ↻ ≫
ZNF566 ↻ ≫
NAB2 ↻ ≫
CALN1 ↻ ≫
SHANK1 ↻ ≫
PER3 ↻ ≫
NR1D1 ↻ ≫
COL6A1 ↻ ≫
NR6A1 ↻ ≫
SERPINE1 ↻ ≫
KLF11 ↻ ≫
OSGIN1 ↻ ≫
H4C14 ↻ ≫
HLF ↻ ≫
MTRNR2L2 ↻ ≫
FAF2 ↻ ≫
H4C11 ↻ ≫
U2AF2 ↻ ≫
RAD9A ↻ ≫
BAIAP2L2 ↻ ≫
PDE4C ↻ ≫
H4C15 ↻ ≫
G6PC3 ↻ ≫
ACTN2 ↻ ≫
RPS29 ↻ ≫
CCDC24 ↻ ≫
PPP1R3C ↻ ≫
SNN ↻ ≫
LRP2 ↻ ≫
GNPDA1 ↻ ≫
SNRPE ↻ ≫
PC ↻ ≫
MAF1 ↻ ≫
C14orf119 ↻ ≫
ACIN1 ↻ ≫
SYCP1 ↻ ≫
PTBP1 ↻ ≫
LIN54 ↻ ≫
H4C12 ↻ ≫
CREBRF ↻ ≫
TLE6 ↻ ≫
POLI ↻ ≫
XKR9 ↻ ≫
LACTB2 ↻ ≫
FAM214B ↻ ≫
RAB3IL1 ↻ ≫
RGPD2 ↻ ≫
RGPD1 ↻ ≫
MTA2 ↻ ≫
CRYBB2 ↻ ≫
CPLX3 ↻ ≫
FAM117B ↻ ≫
GIGYF1 ↻ ≫
FAM76A ↻ ≫
HSF2 ↻ ≫
WDR74 ↻ ≫
STMN1 ↻ ≫
ZC3H4 ↻ ≫
PIK3R2 ↻ ≫
SMARCE1 ↻ ≫
OTUD1 ↻ ≫
HSPB1 ↻ ≫
HOXC13 ↻ ≫
CAP1 ↻ ≫
SETD1A ↻ ≫
TSGA10 ↻ ≫
GMFB ↻ ≫
ESYT1 ↻ ≫
SLC30A1 ↻ ≫
EIF4G1 ↻ ≫
ERCC4 ↻ ≫
ZNF239 ↻ ≫
CCDC107 ↻ ≫
FOXRED2 ↻ ≫
CHAMP1 ↻ ≫
TMEM80 ↻ ≫
DEAF1 ↻ ≫
TRIP6 ↻ ≫
RPL28 ↻ ≫
GPR146 ↻ ≫
DGAT2 ↻ ≫
SLC20A1 ↻ ≫
EPM2A ↻ ≫
LAMTOR4 ↻ ≫
MTRNR2L9 ↻ ≫
UNKL ↻ ≫
ZNF696 ↻ ≫
NMRK1 ↻ ≫
CCK ↻ ≫
PNPLA2 ↻ ≫
THPO ↻ ≫
ANGPTL2 ↻ ≫