ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for SMAD3

Query protein: SMAD3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX1445371 | hESC H1
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
SMAD3's Target genes

◢ SMAD3: Average

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◢ SRX130090: hESC derived mesendodermal cells

◢ SRX1445365: hESC H1

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◢ SRX1445369: hESC H1

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◢ SRX064482: hESC H9

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◢ SRX148896: LX2

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◢ SRX2425862: MDA-MB-231

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◢ SRX366168: NCI-H441

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◢ SRX4096734: PC-3

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◢ SRX5757570: WHIM12

◢ SMAD3: STRING

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CLDN6 ↻ ≫
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TENM4 ↻ ≫
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PCED1B ↻ ≫
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PDGFA ↻ ≫
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GOLGA6C ↻ ≫
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GOLGA6A ↻ ≫
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GID8 ↻ ≫
GSC ↻ ≫
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ID1 ↻ ≫
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FRAT2 ↻ ≫
LEFTY1 ↻ ≫
EOMES ↻ ≫
CDC14B ↻ ≫
TAF12 ↻ ≫
TPCN1 ↻ ≫
C10orf99 ↻ ≫
SFRP2 ↻ ≫
PPP1R16A ↻ ≫
FOXH1 ↻ ≫
AK4 ↻ ≫
ZNF600 ↻ ≫
POLDIP3 ↻ ≫
BOD1L1 ↻ ≫
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SNRPN ↻ ≫
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FGF2 ↻ ≫
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AFF1 ↻ ≫
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DNAJB8 ↻ ≫
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NFE2L3 ↻ ≫
MAD2L2 ↻ ≫
DRAXIN ↻ ≫
NBL1 ↻ ≫
MOG ↻ ≫
GJA1 ↻ ≫
CACHD1 ↻ ≫
SRSF7 ↻ ≫
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PARP16 ↻ ≫
JPT1 ↻ ≫
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CSRNP2 ↻ ≫
FAM53C ↻ ≫
CDC25C ↻ ≫
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DNAJC25 ↻ ≫
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MYLIP ↻ ≫
CALM1 ↻ ≫
MKNK2 ↻ ≫
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SDC4 ↻ ≫
FSCN1 ↻ ≫
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C12orf65 ↻ ≫
FAM43A ↻ ≫
NXF1 ↻ ≫
HSPA1B ↻ ≫
UNK ↻ ≫
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VAMP1 ↻ ≫
PFKFB3 ↻ ≫
UBE2S ↻ ≫
PRDX1 ↻ ≫
TTI2 ↻ ≫
ARL4D ↻ ≫
SERPINE1 ↻ ≫
IER3 ↻ ≫
FLOT1 ↻ ≫
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POLR3D ↻ ≫
PITRM1 ↻ ≫
KDM4A ↻ ≫
INTS5 ↻ ≫
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NOTCH2NLB ↻ ≫
NOTCH2NLA ↻ ≫
VASN ↻ ≫
FUS ↻ ≫
TRIM25 ↻ ≫
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H4C11 ↻ ≫
PSAP ↻ ≫
DNAJB1 ↻ ≫
NAGK ↻ ≫
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PLEC ↻ ≫
SCRT1 ↻ ≫
DGAT1 ↻ ≫
SOCS3 ↻ ≫
NOTCH2 ↻ ≫
FBF1 ↻ ≫
PABPC1 ↻ ≫
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NDRG1 ↻ ≫
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SOCS1 ↻ ≫
BTG1 ↻ ≫
POR ↻ ≫
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PLK2 ↻ ≫
GADD45B ↻ ≫
H2BC15 ↻ ≫
H2AC15 ↻ ≫
SIRT4 ↻ ≫
NCEH1 ↻ ≫
USP42 ↻ ≫
SRSF3 ↻ ≫
NFKBIZ ↻ ≫
ANO10 ↻ ≫
HNRNPH1 ↻ ≫
PUS7 ↻ ≫
ZDHHC4 ↻ ≫
PTPN6 ↻ ≫
C12orf57 ↻ ≫
TUFT1 ↻ ≫
ARL15 ↻ ≫
LDHA ↻ ≫
ABHD5 ↻ ≫
H4C14 ↻ ≫
H3C15 ↻ ≫
H3C14 ↻ ≫
H2AC19 ↻ ≫
H2AC18 ↻ ≫
SPTAN1 ↻ ≫
HEXB ↻ ≫
HMBS ↻ ≫
PIK3R3 ↻ ≫
MTHFD2 ↻ ≫
TRA2B ↻ ≫
TFRC ↻ ≫
SRSF6 ↻ ≫
EXT1 ↻ ≫
H2BC14 ↻ ≫
H2AC14 ↻ ≫
RINT1 ↻ ≫
C5orf24 ↻ ≫
SDCBP ↻ ≫
LRCH4 ↻ ≫
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ADCK5 ↻ ≫
KIF2C ↻ ≫
LUC7L ↻ ≫
FAM234A ↻ ≫
CYCS ↻ ≫
POLR2J3 ↻ ≫
PRRG2 ↻ ≫
NOSIP ↻ ≫
RBM25 ↻ ≫
TGOLN2 ↻ ≫
MED11 ↻ ≫
MARCHF6 ↻ ≫
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HNRNPAB ↻ ≫
NEU1 ↻ ≫
TTPAL ↻ ≫
POLG ↻ ≫
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KIF5B ↻ ≫
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DENR ↻ ≫
PNP ↻ ≫
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PEDS1 ↻ ≫
DESI2 ↻ ≫
TAF4 ↻ ≫
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SERINC5 ↻ ≫
FLYWCH1 ↻ ≫
UBE2D1 ↻ ≫
ORC5 ↻ ≫
POLG2 ↻ ≫
DDX5 ↻ ≫
CEP95 ↻ ≫
C1QTNF6 ↻ ≫
H4C3 ↻ ≫
H1-6 ↻ ≫
R3HDM4 ↻ ≫
KISS1R ↻ ≫
GNAI2 ↻ ≫
SLC1A5 ↻ ≫
HBEGF ↻ ≫
H2AX ↻ ≫
DPAGT1 ↻ ≫
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RELT ↻ ≫
DNAJB2 ↻ ≫
SYPL1 ↻ ≫
PABPC4 ↻ ≫
TAGLN2 ↻ ≫
SKP1 ↻ ≫
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SQSTM1 ↻ ≫
CRISPLD2 ↻ ≫
RPL3 ↻ ≫
BSG ↻ ≫
NANS ↻ ≫
CYBC1 ↻ ≫
ATF3 ↻ ≫
RAD23A ↻ ≫
CALR ↻ ≫
ZFAND5 ↻ ≫
TATDN1 ↻ ≫
NDUFB9 ↻ ≫
FDXR ↻ ≫
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CBX3 ↻ ≫
ZMYND15 ↻ ≫
CXCL16 ↻ ≫
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SMURF2 ↻ ≫
ZNFX1 ↻ ≫
CDKN1A ↻ ≫
HPS4 ↻ ≫
TRIM28 ↻ ≫
SPPL2A ↻ ≫
SLC16A3 ↻ ≫
SLC35B2 ↻ ≫
SLC35G1 ↻ ≫
APTX ↻ ≫
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NTMT1 ↻ ≫
DNM1L ↻ ≫
KANSL2 ↻ ≫
EHD1 ↻ ≫
MAT2A ↻ ≫
SLC35A4 ↻ ≫
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PHACTR4 ↻ ≫
MLXIP ↻ ≫
ACLY ↻ ≫
SLC38A2 ↻ ≫
CITED2 ↻ ≫
C9orf50 ↻ ≫
P4HA1 ↻ ≫
IQCD ↻ ≫
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MEPCE ↻ ≫
PDLIM7 ↻ ≫
NUDCD1 ↻ ≫
PTDSS1 ↻ ≫
MTERF3 ↻ ≫
FTL ↻ ≫
MRPS16 ↻ ≫
BRMS1L ↻ ≫
MGAT1 ↻ ≫
TSEN34 ↻ ≫
MSANTD2 ↻ ≫
TCTEX1D4 ↻ ≫
BTBD19 ↻ ≫
DNAJA1 ↻ ≫
ARL6IP1 ↻ ≫
IRF1 ↻ ≫
MYBL2 ↻ ≫
TUBA1C ↻ ≫
ZNF248 ↻ ≫
PLAG1 ↻ ≫
CHCHD7 ↻ ≫
SPRING1 ↻ ≫
RNFT2 ↻ ≫
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PLK3 ↻ ≫
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RPL5 ↻ ≫
OAT ↻ ≫
PHLDA2 ↻ ≫
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IMPA1 ↻ ≫
UAP1 ↻ ≫
DRG1 ↻ ≫
SEBOX ↻ ≫
STRAP ↻ ≫
NRL ↻ ≫
ZCWPW1 ↻ ≫
TUBB2A ↻ ≫
PPIF ↻ ≫
METRNL ↻ ≫
SRSF2 ↻ ≫
MFSD11 ↻ ≫
RPS9 ↻ ≫
BBC3 ↻ ≫
TRAF4 ↻ ≫
ZBED8 ↻ ≫
NBPF1 ↻ ≫
CRTC1 ↻ ≫
SLC3A2 ↻ ≫
NBN ↻ ≫
BAMBI ↻ ≫
TMEM199 ↻ ≫
POLDIP2 ↻ ≫
KRBA2 ↻ ≫
NDUFAF3 ↻ ≫
IMPDH2 ↻ ≫
DALRD3 ↻ ≫
SENP5 ↻ ≫
ERCC1 ↻ ≫
NET1 ↻ ≫
RPLP0 ↻ ≫
GCN1 ↻ ≫
TRIB1 ↻ ≫
RHOB ↻ ≫
TNPO1 ↻ ≫
SIL1 ↻ ≫
FARSA ↻ ≫
ASCC1 ↻ ≫
ANAPC16 ↻ ≫
SNAPC1 ↻ ≫
RND1 ↻ ≫
PCK2 ↻ ≫
LRPAP1 ↻ ≫
SRA1 ↻ ≫
IER5L ↻ ≫
ID2 ↻ ≫
CSNK1G3 ↻ ≫
PPP1R3C ↻ ≫
SLC30A5 ↻ ≫
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SMN2 ↻ ≫
SMN1 ↻ ≫
INTS13 ↻ ≫
FGFR1OP2 ↻ ≫
RPL26 ↻ ≫
STK38 ↻ ≫
LOC100287896 ↻ ≫
LIPT2 ↻ ≫
AMACR ↻ ≫
C2orf42 ↻ ≫
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S100A13 ↻ ≫
S100A1 ↻ ≫
CHTOP ↻ ≫
BZW2 ↻ ≫
CAVIN1 ↻ ≫
FAM83D ↻ ≫
STIP1 ↻ ≫
UQCC3 ↻ ≫
LBHD1 ↻ ≫
SPIDR ↻ ≫
SH3GLB2 ↻ ≫
TECR ↻ ≫
TMEM167B ↻ ≫
NASP ↻ ≫
SMIM12 ↻ ≫
B2M ↻ ≫
MRPS25 ↻ ≫
GTF2B ↻ ≫
CSKMT ↻ ≫
C11orf98 ↻ ≫
PPP1R12C ↻ ≫
XKR9 ↻ ≫
LACTB2 ↻ ≫
SLC27A3 ↻ ≫
PTPRA ↻ ≫
PACSIN2 ↻ ≫
STN1 ↻ ≫
HERC3 ↻ ≫
CCDC80 ↻ ≫
PTPN2 ↻ ≫
SRP68 ↻ ≫
NRBF2 ↻ ≫
FAM133B ↻ ≫
CEBPB ↻ ≫
NDUFB8 ↻ ≫
HIF1AN ↻ ≫
RNF135 ↻ ≫
MIGA2 ↻ ≫
HLA-E ↻ ≫
WIPI2 ↻ ≫
INTS6 ↻ ≫
TMSB10 ↻ ≫
PARK7 ↻ ≫
GRB2 ↻ ≫
CCS ↻ ≫
CCDC87 ↻ ≫
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GALNT10 ↻ ≫
AHR ↻ ≫
PGP ↻ ≫
OAZ1 ↻ ≫
GOLPH3 ↻ ≫
SUPT4H1 ↻ ≫
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ECD ↻ ≫
CYP20A1 ↻ ≫
RELL2 ↻ ≫
HDAC3 ↻ ≫
XPO5 ↻ ≫
POLH ↻ ≫
STX10 ↻ ≫
IER2 ↻ ≫
NCOA5 ↻ ≫
EEF2 ↻ ≫
SGK1 ↻ ≫
EFR3A ↻ ≫
DNAJC9 ↻ ≫
ZNF143 ↻ ≫
PRDX2 ↻ ≫
YWHAG ↻ ≫
RPL12 ↻ ≫
LRSAM1 ↻ ≫
SERTAD1 ↻ ≫
ZFAND2A ↻ ≫
CRACR2B ↻ ≫
FAM126A ↻ ≫
RAB11A ↻ ≫
TNIP2 ↻ ≫
MYH9 ↻ ≫
GPR89B ↻ ≫
PRMT9 ↻ ≫
RNF34 ↻ ≫
RPAP2 ↻ ≫
GLMN ↻ ≫
FAM174C ↻ ≫
CIRBP ↻ ≫
THBS1 ↻ ≫
RIOX1 ↻ ≫
CCN2 ↻ ≫
STPG3 ↻ ≫
FAM166A ↻ ≫
ING1 ↻ ≫
CARS2 ↻ ≫
KAT6A ↻ ≫
DGKH ↻ ≫
DYNLL1 ↻ ≫
RMDN1 ↻ ≫
CPNE3 ↻ ≫
E4F1 ↻ ≫
PPFIA1 ↻ ≫
DBNL ↻ ≫
GPR89A ↻ ≫
SLC26A2 ↻ ≫
TNFAIP2 ↻ ≫
KDM4B ↻ ≫
TRAPPC10 ↻ ≫
ATP5F1B ↻ ≫
TMEM190 ↻ ≫
EPHA2 ↻ ≫
PRPF4 ↻ ≫
CDC26 ↻ ≫
TGFBI ↻ ≫
ATP6V0C ↻ ≫
AMDHD2 ↻ ≫
RBMX ↻ ≫
SWI5 ↻ ≫
GOLGA2 ↻ ≫
PARP2 ↻ ≫
LRIG2 ↻ ≫
CCNB1IP1 ↻ ≫
TBC1D31 ↻ ≫
RIPK2 ↻ ≫
TSPAN17 ↻ ≫
NFKBIA ↻ ≫
MED17 ↻ ≫
PDXK ↻ ≫
NCOA3 ↻ ≫
CTNNB1 ↻ ≫
SFT2D3 ↻ ≫
ZBTB37 ↻ ≫
PTPN1 ↻ ≫
WASHC4 ↻ ≫
CALM2 ↻ ≫
BTBD10 ↻ ≫
FER ↻ ≫
ADRB2 ↻ ≫
PPP1R15A ↻ ≫
PLEKHA4 ↻ ≫
UBA2 ↻ ≫
EIF1 ↻ ≫
FBXW11 ↻ ≫
KCTD7 ↻ ≫
TEKT2 ↻ ≫
DUSP1 ↻ ≫
ADPRS ↻ ≫
C19orf48 ↻ ≫
TMED9 ↻ ≫
TAF13 ↻ ≫
B4GALT7 ↻ ≫
HRH1 ↻ ≫
TMX1 ↻ ≫
SLC2A3 ↻ ≫
RBM6 ↻ ≫
TMEM151B ↻ ≫
TMEM79 ↻ ≫
SMG5 ↻ ≫
GLS ↻ ≫
BAZ2A ↻ ≫
TACC1 ↻ ≫
ALAS1 ↻ ≫
ZNF148 ↻ ≫
EEF1A1 ↻ ≫
ALDOA ↻ ≫
FOS ↻ ≫
RBM14-RBM4 ↻ ≫
RBM14 ↻ ≫
DENND6A ↻ ≫
DPY19L4 ↻ ≫
SELENOT ↻ ≫
UBALD1 ↻ ≫
PIEZO1 ↻ ≫
SLC25A25 ↻ ≫
ANKMY2 ↻ ≫
RASA1 ↻ ≫
DNTTIP2 ↻ ≫
TMEM242 ↻ ≫
MAPK8 ↻ ≫
TUBB4B ↻ ≫
TEP1 ↻ ≫
C15orf39 ↻ ≫
ZMAT3 ↻ ≫
YLPM1 ↻ ≫
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IPO11 ↻ ≫
DIMT1 ↻ ≫
CHAD ↻ ≫
SCFD1 ↻ ≫
NFKBIE ↻ ≫
TPI1 ↻ ≫
SPSB2 ↻ ≫
CPEB4 ↻ ≫
RPS3 ↻ ≫
LIMA1 ↻ ≫
NUDT15 ↻ ≫
TRIP11 ↻ ≫
AMOTL2 ↻ ≫
TM9SF3 ↻ ≫
ACER3 ↻ ≫
PSMD14 ↻ ≫
SRSF5 ↻ ≫
FLNA ↻ ≫
EMD ↻ ≫
RGS3 ↻ ≫
ACAP2 ↻ ≫
HSPA5 ↻ ≫
ICE1 ↻ ≫
SEPHS2 ↻ ≫
MRPL2 ↻ ≫
KLC4 ↻ ≫
CUL7 ↻ ≫
RSAD1 ↻ ≫
RND3 ↻ ≫
MGRN1 ↻ ≫
KNTC1 ↻ ≫
MFAP3 ↻ ≫
FAM114A2 ↻ ≫
PKM ↻ ≫
ADSL ↻ ≫
PMAIP1 ↻ ≫
ZACN ↻ ≫
GALR2 ↻ ≫
TMEM170A ↻ ≫
THOC3 ↻ ≫
TMEM249 ↻ ≫
SLC52A2 ↻ ≫
FBXW2 ↻ ≫
FBXL6 ↻ ≫
NPM1 ↻ ≫
COTL1 ↻ ≫
SLC20A1 ↻ ≫
SLC35C2 ↻ ≫
AFG3L2 ↻ ≫
IPP ↻ ≫
DPY30 ↻ ≫
CCNL1 ↻ ≫
RPS11 ↻ ≫
RPL13A ↻ ≫
RETSAT ↻ ≫
ELMOD3 ↻ ≫
NUFIP2 ↻ ≫
FAM220A ↻ ≫
PDZD8 ↻ ≫
SPECC1L ↻ ≫
CATSPERE ↻ ≫
ADSS2 ↻ ≫
HMGCS1 ↻ ≫
EI24 ↻ ≫
SAT1 ↻ ≫
VCL ↻ ≫
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SULT1A4 ↻ ≫
SULT1A3 ↻ ≫
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GTF2A1 ↻ ≫
MRGBP ↻ ≫
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EMC6 ↻ ≫
NIPBL ↻ ≫
ANXA5 ↻ ≫
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CYB561A3 ↻ ≫
ZNF326 ↻ ≫
CZIB ↻ ≫
RIDA ↻ ≫
POP1 ↻ ≫
AKAP1 ↻ ≫
RAC3 ↻ ≫
CRLS1 ↻ ≫
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CCNG1 ↻ ≫
GTF2H5 ↻ ≫
DSCC1 ↻ ≫
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ABHD17A ↻ ≫
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POMZP3 ↻ ≫
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ZNF622 ↻ ≫
NCL ↻ ≫
DNMT1 ↻ ≫
ABTB2 ↻ ≫
RAB2A ↻ ≫
MANSC1 ↻ ≫
BORCS5 ↻ ≫
AMT ↻ ≫
TKT ↻ ≫
GSTP1 ↻ ≫
TCTA ↻ ≫
RHOA ↻ ≫
FGFR1 ↻ ≫
HERPUD1 ↻ ≫
TM4SF1 ↻ ≫
CLIC4 ↻ ≫
WDR47 ↻ ≫
SCAMP2 ↻ ≫
C7orf26 ↻ ≫
SLFN5 ↻ ≫
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