ChIP-Atlas: Colocalization analysis

Colocalization analysis for BRD4

Query protein: BRD4
Cell class: Lung
Sort key: SRX2267459 | PC-9
 
Color legends
ChIP-seq data:  H-H H-M M-M H-L M-L L-L N.D. Same  (Peak intensities are High, Middle or Low)

STRING data:  1000 750 500 250 0 N.D.  (Values = STRING's binding scores)

Downloads: TSV (text), GML (Cytoscape)
Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Colocalization
Cell types  Exp. IDs BRD4's Colocalization partners

◢ BRD4: Average

◢ SRX2652417: 24335

◢ SRX2652418: 24335

◢ SRX2267442: A549

◢ SRX2267443: A549

◢ SRX2267444: A549

◢ SRX2267445: A549

◢ SRX1360982: IMR-90

◢ SRX1360983: IMR-90

◢ SRX1360984: IMR-90

◢ SRX1658067: IMR-90

◢ SRX1658068: IMR-90

◢ SRX1658069: IMR-90

◢ SRX7701204: NCI-H1963

◢ SRX7701212: NCI-H1963

◢ SRX7701213: NCI-H1963

◢ SRX7701214: NCI-H1963

◢ SRX7701215: NCI-H1963

◢ SRX204900: NCI-H2171

◢ SRX3031996: NCI-H2171

◢ SRX327767: NCI-H2171

◢ SRX327769: NCI-H2171

◢ SRX2267446: NCI-H3122

◢ SRX2267447: NCI-H3122

◢ SRX2267448: NCI-H3122

◢ SRX2267449: NCI-H3122

◢ SRX2267454: PC-9

◢ SRX2267455: PC-9

◢ SRX2267456: PC-9

◢ SRX2267457: PC-9

◢ SRX2267458: PC-9

◣ SRX2267459: PC-9

◢ BRD4: STRING

PC-9
 SRX2267459
BRD4
PC-9
 SRX2267456
BRD4
A549
 SRX190268
TAF1
NCI-H1963
 SRX7701212
BRD4
PC-9
 SRX2267457
BRD4
NCI-H3122
 SRX2267447
BRD4
NCI-H1963
 SRX7701204
BRD4
PC-9
 SRX2267454
BRD4
NCI-H23
 SRX4001483
BRD2
NCI-H3122
 SRX2267449
BRD4
PC-9
 SRX5887614
YAP1
PC-9
 SRX5887613
TEAD4
PC-9
 SRX5887611
YAP1
PC-9
 SRX5887610
TEAD4
PC-9
 SRX5887620
TEAD4
PC-9
 SRX5887617
TEAD4
PC-9
 SRX2267458
BRD4
IMR-90
 SRX1658068
BRD4
NCI-H441
 SRX366167
SMAD3
BEAS-2B
 SRX1672137
NR3C1
NCI-H3122
 SRX2267446
BRD4
PC-9
 SRX5887621
YAP1
PC-9
 SRX2267455
BRD4
PC-9
 SRX5887623
SNAI2
NCI-H23
 SRX4001482
BRD2
BEAS-2B
 SRX5289971
NR3C1
Calu-3
 SRX2010843
JUN
NHBE
 SRX2010837
EHF
IMR-90
 SRX099405
RBL1
IMR-90
 SRX1360982
BRD4
IMR-90
 SRX186628
CHD1
NCI-H2087
 SRX174817
NKX2-1
SW 1271
 SRX3873713
AFF4
SW 1271
 SRX3873709
AFF1
Bronchial epithelial cells
 SRX1711344
INTS12
A549
 SRX100418
NR3C1
A549
 SRX150519
BHLHE40
A549
 SRX1531784
NIPBL
A549
 SRX366175
SMAD3
HBEC3-KT
 SRX3148648
EZH2
HBEC3-KT
 SRX3148642
DNMT1
HBEC3-KT
 SRX3148637
DNMT1
A549
 SRX190250
YY1
IMR-90
 SRX1658069
BRD4
IMR-90
 SRX1658067
BRD4
NCI-H1963
 SRX7701213
BRD4
IMR-90
 SRX1360984
BRD4
IMR-90
 SRX1360983
BRD4
Bronchial tracheal epithelial cells
 SRX4367442
TBP
Bronchial tracheal epithelial cells
 SRX4367441
TBP
Bronchial tracheal epithelial cells
 SRX4367432
TBP
IMR-90
 SRX150105
GTF2B
NCI-H2171
 SRX129111
MAX
Bronchial tracheal epithelial cells
 SRX4367422
TBP
NCI-H1299
 SRX3548668
SMARCA4
HBEC3-KT
 SRX3148653
EZH2
HBEC3-KT
 SRX3148652
DNMT1
HBEC3-KT
 SRX3148647
DNMT1
HBEC3-KT
 SRX3148643
EZH2
Lung cancer cell line
 SRX2731713
SOX2
A549
 SRX119636
PAF1
A549
 SRX100402
NR3C1
HBEC3-KT
 SRX3148638
EZH2
SW 1271
 SRX3873725
MYC
Bronchial tracheal epithelial cells
 SRX4367431
TBP
Bronchial tracheal epithelial cells
 SRX4367421
TBP
IMR-90
 SRX186618
MAZ
Bronchial epithelial cells
 SRX1711343
INTS12
NCI-H1963
 SRX7701214
BRD4
A549
 SRX100440
NR3C1
IMR-90
 SRX620746
TP53
SW 1271
 SRX3873717
ELL2
NCI-H2171
 SRX3873710
AFF4
NCI-H1299
 SRX1528429
USP7
A549
 SRX119635
PAF1
NCI-H2171
 SRX129110
MYC
A549
 SRX5576993
CRTC2
SW 1271
 SRX3873708
AFF1
NCI-H128
 SRX189238
MAX
NCI-H128
 SRX129107
MAX
NCI-H1963
 SRX7701215
BRD4
SW 1271
 SRX3873726
MYC
IMR-90
 SRX3324959
CREBBP
WI-38
 SRX204172
SUMO1
A549
 SRX5576992
CREB1
A549
 SRX5576990
CRTC2
A549
 SRX5576989
CREB1
IMR-90
 SRX392040
LMNB1
A549
 SRX386240
SETX
A549
 SRX386239
SETX
HCC827
 SRX2607385
JUN
IMR-90
 SRX1993516
HMGB2
IMR-90
 SRX1993515
HMGB2
A549
 SRX190175
CREB1
IMR-90
 SRX1112996
MAP1LC3B
IMR-90
 SRX1112995
MAP1LC3B
IMR-90
 SRX1112994
LMNB1
IMR-90
 SRX1112993
LMNB1
NCI-H1299
 SRX2946121
YEATS4
IMR-90
 SRX180823
E2F7
A549
 SRX190285
ETS1
A549
 SRX6778344
ELF1
A549
 SRX6778343
ELF1
A549
 SRX190289
GABPA
A549
 SRX190246
ELF1
NCI-H2171
 SRX327769
BRD4
A549
 SRX190205
REST
IMR-90
 SRX3324961
EP300
BEAS-2B
 SRX5289960
NR3C1
A549
 SRX1772379
DDX11
BEAS-2B
 SRX5289961
NR3C1
NCI-H23
 SRX4001479
BRD2
NCI-H23
 SRX4001478
BRD2
HCC95
 SRX277137
SOX2
A549
 SRX190288
ZBTB33
NCI-H69
 SRX731141
YAP1
IMR-90
 SRX326378
NUP98
IMR-90
 SRX329083
BCL10
IMR-90
 SRX329082
BCL10
IMR-90
 SRX3324964
EP300
IMR-90
 SRX3324957
CREBBP
A549
 SRX190184
MAX
NCI-H2171
 SRX189237
MAX
A549
 SRX1531785
MED1
NCI-H524
 SRX1044125
NEUROD1
IMR-90
 SRX329084
BCL10
A549
 SRX1772381
DDX11
IMR-90
 SRX016559
SNAPC2
WI-38
 SRX268884
HMBOX1
WI-38
 SRX204171
SUMO1
BEAS-2B
 SRX5289972
NR3C1
SW 1271
 SRX3873712
AFF4
IMR-90
 SRX326379
NUP98
IMR-90
 SRX130255
LMNB1
A549
 SRX2267442
BRD4
NCI-H128
 SRX189239
MYC
IMR-90
 SRX301445
BDP1
IMR-90
 SRX3324960
CREBBP
IMR-90
 SRX329086
BCL10
IMR-90
 SRX329085
BCL10
A549
 SRX190182
CREB1
A549
 SRX1772382
DDX11
A549
 SRX1772378
DDX11
WI-38
 SRX268883
NR2C2
A549
 SRX190245
ATF3
BEAS-2B
 SRX5289973
NR3C1
A549
 SRX190335
SIX5
IMR-90
 SRX3324963
EP300
NCI-H1963
 SRX7701200
ASXL3
PC-9
 SRX5887618
YAP1
Tracheal epithelial cells
 SRX268452
GRHL2
Tracheal epithelial cells
 SRX268451
GRHL2
Tracheal epithelial cells
 SRX268450
GRHL2
IMR-90
 SRX150109
SNAPC5
NCI-H2171
 SRX129089
MED1
MSTO-211H
 SRX1004563
TEAD1
NCI-H69
 SRX731142
YAP1
IMR-90
 SRX329081
BCL10
BEAS-2B
 SRX1672139
RELA
NCI-H2171
 SRX189240
MYC
IMR-90
 SRX150108
SNAPC1
A549
 SRX186612
MYC
WI-38
 SRX204165
UBE2I
NCI-H441
 SRX155752
HSF1
NCI-H1703
 SRX155734
HSF1
NCI-H1703
 SRX155733
HSF1
NCI-H1299
 ERX1974189
TP53
NCI-H1299
 ERX1974188
TP53
NCI-H2171
 SRX204900
BRD4
BEAS-2B
 SRX5289963
NR3C1
IMR-90
 SRX502808
HIRA
NCI-H2171
 SRX327767
BRD4
A549
 SRX1531780
NIPBL
Lung fibroblasts
 SRX212185
EP300
Lung fibroblasts
 SRX212184
EP300
IMR-90
 SRX147007
EP300
WI-38
 SRX204164
SUMO2
IMR-90
 SRX3791762
HMGA1
A549
 SRX190179
JUND
NCI-H3122
 SRX174819
NKX2-1
IMR-90
 SRX1038945
YAP1
IMR-90
 SRX1038944
YAP1
A549
 SRX2267443
BRD4
IMR-90
 SRX186619
MXI1
NCI-H3122
 SRX2267448
BRD4
BEAS-2B
 SRX5289968
NR3C1
NCI-H2171
 SRX3873714
ELL2
A549
 SRX190324
TEAD4
IMR-90
 SRX180825
E2F7
NCI-H3122
 SRX174820
FOXA1
A549
 SRX1531781
MED1
A549
 SRX2267444
BRD4
24335
 SRX2652428
EP300
WI-38
 SRX204173
SUMO2
NCI-H1299
 SRX3236738
BRD2
Lu-130
 SRX2858201
SUZ12
24335
 SRX2652426
NUTM1
A549
 SRX190222
E2F6
A549
 SRX184874
SAG
A549
 SRX184873
SAG
IMR-90
 SRX150103
BRF2
BEAS-2B
 SRX5289962
NR3C1
IMR-90
 SRX620747
TP53
A549
 SRX5849927
TP53
A549
 SRX5849926
TP53
A549
 SRX5849925
TP53
A549
 SRX5849924
TP53
Calu-1
 SRX5552347
TP53
Calu-1
 SRX5552346
TP53
Calu-1
 SRX5552345
TP53
Calu-1
 SRX5552344
TP53
IMR-90
 SRX4230307
TP53
A549
 SRX2940754
TP53
NCI-H460
 SRX2940753
TP53
IMR-90
 SRX208486
TP53
IMR-90
 SRX208485
TP53
IMR-90
 SRX208484
TP53
IMR-90
 SRX093319
TP53
NCI-H1299
 ERX1974193
TP53
NCI-H1299
 ERX1974192
TP53
NCI-H1299
 DRX135462
TP53
NCI-H1299
 DRX135461
TP53
A549
 SRX5725258
MYC
MRC-5
 SRX1813601
MYC
MRC-5
 SRX1813600
MYC
MRC-5
 SRX1813599
MYC
MRC-5
 SRX1813598
MYC
MRC-5
 SRX1813597
MYC
MRC-5
 SRX1813596
MYC
A549
 SRX181190
MYC
A549
 SRX181189
MYC
NCI-H128
 SRX129106
MYC
IMR-90
 SRX016556
BDP1
IMR-90
 SRX3324962
EP300
24335
 SRX2652427
EP300
A549
 SRX190283
EP300
IMR-90
 SRX3324958
CREBBP
WI-38
 SRX204163
SUMO1
WI-38
 SRX204162
SUMO1
Bronchial tracheal epithelial cells
 SRX3288981
IRF3
Bronchial tracheal epithelial cells
 SRX3288980
IRF3
Bronchial tracheal epithelial cells
 SRX3288979
IRF3
Bronchial tracheal epithelial cells
 SRX3288978
IRF3
Bronchial tracheal epithelial cells
 SRX3288977
IRF3
NCI-H526
 SRX890396
KDM1A
NCI-H526
 SRX890395
KDM1A
NCI-H1299
 SRX8400471
YAP1
NCI-H1299
 SRX8400470
YAP1
NCI-H1963
 SRX8333286
BAP1
NCI-H1963
 SRX8333285
BAP1
BEAS-2B
 SRX7794488
HIF1A
BEAS-2B
 SRX7794487
HIF1A
BEAS-2B
 SRX7794486
NFE2L2
BEAS-2B
 SRX7794485
NFE2L2
NCI-H1963
 SRX7701201
ASXL3
Calu-3
 SRX761563
EHF
Calu-3
 SRX761562
EHF
H2052
 SRX757326
YAP1
H2052
 SRX757325
YAP1
A549
 SRX7451121
EZH2
A549
 SRX7451120
EZH2
NCI-H69
 SRX731143
TEAD1
A549
 SRX7268483
NFE2L2
IMR-90
 SRX6878426
CTCF
IMR-90
 SRX6878425
CTCF
IMR-90
 SRX6878424
CTCF
IMR-90
 SRX6878423
CTCF
NCI-H520
 SRX6852821
POU3F2
LK-2
 SRX6852820
POU3F2
LK-2
 SRX6852815
TP63
LK-2
 SRX6852814
SOX2
LK-2
 SRX6852813
SOX2
HCC2814
 SRX6852812
SOX2
KNS-62
 SRX6852811
SOX2
HCC95
 SRX6852810
SOX2
NCI-H520
 SRX6852809
SOX2
LK-2
 SRX6852808
SOX2
BEAS-2B
 SRX6616802
NR3C1
BEAS-2B
 SRX6616801
NR3C1
BEAS-2B
 SRX6616800
NR3C1
BEAS-2B
 SRX6616799
NR3C1
A549
 SRX5982364
SMARCA4
A549
 SRX5982363
SMARCA2
A549
 SRX5982362
SMARCA2
A549
 SRX5982361
SMARCA2
A549
 SRX5982360
SMARCA2
A549
 SRX5982359
SMARCA2
A549
 SRX5982343
SMARCA4
A549
 SRX5982342
SMARCA4
A549
 SRX5982341
SMARCA4
A549
 SRX5982340
SMARCA4
PC-9
 SRX5887619
SNAI2
PC-9
 SRX5887616
SNAI2
PC-9
 SRX5887609
SNAI2
A549
 SRX5725262
MGA
A549
 SRX5725261
MGA
A549
 SRX5725260
MGA
A549
 SRX5725259
MGA
A549
 SRX5598318
MYOCD
IMR-90
 SRX5290914
CTCF
IMR-90
 SRX5290913
CTCF
IMR-90
 SRX5290912
CTCF
IMR-90
 SRX5290911
CTCF
BEAS-2B
 SRX5289991
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289990
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289989
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289988
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289987
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289986
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289985
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289984
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289983
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289982
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289981
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289980
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289979
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289978
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289977
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289976
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289975
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289974
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289970
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289969
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289967
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289966
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289965
NR3C1
BEAS-2B
 SRX5289964
NR3C1
IMR-90
 SRX502814
HIRA
IMR-90
 SRX502812
HIRA
IMR-90
 SRX502810
HIRA
BEAS-2B
 SRX497256
CTCF
BEAS-2B
 SRX497255
CTCF
IMR-90
 SRX4714473
GTF3C2
IMR-90
 SRX4714471
GTF3C2
A549
 SRX4673795
BRD3
A549
 SRX4673794
BCL6
A549
 SRX4673793
BCL6
A549
 SRX4672371
ARNT
A549
 SRX4672370
ARNT
A549
 SRX4672369
ARNT
NCI-H1048
 SRX4143035
POU2F3
A549
 SRX3985128
NFE2L2
SW 1271
 SRX3873716
ELL2
NCI-H2171
 SRX3873715
ELL2
NCI-H2171
 SRX3873711
AFF4
NCI-H2171
 SRX3873707
AFF1
NCI-H2171
 SRX3873706
AFF1
A549
 SRX3829962
MGA
A549
 SRX3829961
MGA
IMR-90
 SRX3791761
HMGA1
NCI-H441
 SRX366173
SMAD4
NCI-H441
 SRX366172
SMAD4
NCI-H441
 SRX366170
NKX2-1
NCI-H441
 SRX366169
NKX2-1
NCI-H441
 SRX366168
SMAD3
Lung fibroblasts
 SRX3585704
HMGB1
NCI-H1299
 SRX3548667
SMARCA4
HS-SY-II
 SRX3542504
SMARCA4
HS-SY-II
 SRX3542480
KDM2B
NCI-H1975
 SRX3392334
ZEB1
NCI-H1975
 SRX3392333
ZEB1
NCI-H1299
 SRX3236727
BRD2
NCI-H2171
 SRX3031996
BRD4
IMR-90
 SRX295036
MECP2