ChIP-Atlas: Colocalization analysis

Colocalization analysis for RAD21

Query protein: RAD21
Cell class: Digestive tract
Sort key: SRX2064716 | HCT 116
 
Color legends
ChIP-seq data:  H-H H-M M-M H-L M-L L-L N.D. Same  (Peak intensities are High, Middle or Low)

STRING data:  1000 750 500 250 0 N.D.  (Values = STRING's binding scores)

Downloads: TSV (text), GML (Cytoscape)
Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Colocalization
Cell types  Exp. IDs RAD21's Colocalization partners

◢ RAD21: Average

◢ SRX5880871: DKO

◢ DRX013181: DLD-1

◢ SRX360578: GP5d

◢ SRX360592: GP5d

◢ SRX190304: HCT 116

◢ SRX2064714: HCT 116

◢ SRX2064715: HCT 116

◣ SRX2064716: HCT 116

◢ SRX2064717: HCT 116

◢ SRX5880865: HCT 116

◢ SRX6384757: HCT 116

◢ SRX6384758: HCT 116

◢ SRX6384789: HCT 116

◢ SRX6384790: HCT 116

◢ SRX6384791: HCT 116

◢ SRX359858: LoVo

◢ SRX359878: LoVo

◢ SRX359970: LoVo

◢ SRX360017: LoVo

◢ SRX361886: LoVo

◢ SRX361892: LoVo

◢ RAD21: STRING

HCT 116
 SRX2064716
RAD21
HCT 116
 SRX5880864
SMC1A
GP5d
 SRX360581
SMC3
LoVo
 SRX359859
CTCF
LoVo
 SRX2654818
CTCF
HCT 116
 SRX6384789
RAD21
LoVo
 SRX361892
RAD21
GP5d
 SRX360578
RAD21
DKO
 SRX5880870
SMC1A
HCT 116
 SRX6384790
RAD21
LoVo
 SRX359970
RAD21
GP5d
 SRX360568
CTCF
GP5d
 SRX360592
RAD21
DLD-1
 DRX013181
RAD21
HCT 116
 SRX6384758
RAD21
DKO
 SRX5880871
RAD21
HCT 116
 SRX5880865
RAD21
HCT 116
 SRX2064717
RAD21
HCT 116
 SRX2064715
RAD21
HCT 116
 SRX2064714
RAD21
GP5d
 SRX360582
CTCF
DKO
 SRX5880869
CTCF
HCT 116
 SRX5880863
CTCF
HCT 116
 SRX199880
CTCF
HCT 116
 SRX199879
CTCF
HCT 116
 SRX190359
CTCF
COLO 829
 SRX1801655
CTCF
COLO 829
 SRX1801654
CTCF
Caco-2
 SRX080411
CTCF
HEEpiC
 SRX080389
CTCF
HEEpiC
 SRX080375
CTCF
Caco-2
 SRX080352
CTCF
DLD-1
 DRX013180
CTCF
HCT 116
 SRX2442516
CTCF
HCT 116
 SRX190304
RAD21
LoVo
 SRX360017
RAD21
LoVo
 SRX361886
RAD21
LoVo
 SRX360020
CTCF
LoVo
 SRX359878
RAD21
LoVo
 SRX2654819
CTCF
HCT 116
 SRX306181
ICE1
HCT 116
 SRX306184
ICE1
HCT 116
 SRX190214
CBX3
SW 480
 SRX4235879
TP53
DLD-1
 SRX7677762
DCP2
HCT 116
 SRX190360
MAX
HCT 116
 SRX190358
SP1
HCT 116
 SRX190307
SRF
HCT 116
 SRX190361
SIN3A
HCT 116
 SRX113706
SP1
GP5d
 SRX360595
SMC3
LoVo
 SRX360018
STAG1
LoVo
 SRX359822
CTCF
HCT 116
 SRX1140481
KDM3B
HCT 116
 SRX3520285
ATR
HCT 116
 SRX3520282
ATR
Caco-2
 SRX986358
HNF1A
HCT 116
 SRX8155176
MED1
HCT 116
 SRX8155175
MED1
HCT 116
 SRX8155174
MED1
DLD-1
 SRX7677742
XRN2
DLD-1
 SRX7677741
XRN2
DLD-1
 SRX7677739
NCBP1
DLD-1
 SRX7677737
NCBP1
DLD-1
 SRX7677725
NELFCD
HCT 116
 SRX6384785
MED26
HCT 116
 SRX5486445
ZIC2
HCT 116
 SRX5486444
ZIC2
HCT 116
 SRX5486434
ZIC5
HCT 116
 SRX5486430
ZIC5
HCT 116
 SRX5486425
ZIC5
HCT 116
 SRX5486424
ZIC5
HCT 116
 SRX5486414
ZIC5
HCT 116
 SRX5486413
ZIC5
HCT 116
 SRX535181
HSF1
HCT 116
 SRX535179
HSF1
HCT 116
 SRX535178
HSF1
HCT 116
 SRX535176
HSF1
HCT 116
 SRX535174
HSF1
HCT 116
 SRX535173
HSF1
SGC-7901
 SRX4964897
ISL1
SGC-7901
 SRX4964896
ISL1
KYSE-150
 SRX424011
KDM4C
AGS
 SRX371981
GATA6
KATO III
 SRX367645
GATA4
HCT 116
 SRX3520279
DNA2
Colonic organoids
 SRX3417634
VDR
Colonic organoids
 SRX3417631
VDR
Colonic organoids
 SRX3417630
VDR
GIST48
 SRX3372025
ETV1
TE-5
 SRX3367071
TP63
AGS
 SRX3124572
STAT3
AGS
 SRX3124571
STAT1
HCT 116
 SRX3020566
PHIP
HCT 116
 SRX3020562
PHIP
HCT 116
 SRX290521
TET2
HCT 116
 SRX272438
SMCHD1
HCT 116
 SRX2511892
KAT2B
HCT 116
 SRX2511891
CDKN1B
HCT 116
 SRX2060918
TP53
HCT 116
 SRX160745
EZH2
HCT 116
 SRX160744
MTA2
HT-29
 SRX155746
HSF1
HCT 116
 SRX1123966
SMARCA4
HCT 116
 SRX1078876
PAF1
HCT 116
 SRX1078848
ELL2
HCT 116
 SRX1078847
ELL2
HCT 116
 SRX1078846
ELL2
HCT 116
 SRX1078845
ELL2
HCT 116
 SRX1078844
CDK9
HCT 116
 SRX1078842
AFF4
HCT 116
 SRX1078841
AFF4
HCT 116
 SRX1078840
AFF4
HCT 116
 SRX1078839
AFF4
HCT 116
 SRX080253
AFF4
DLD-1
 SRX7677763
DCP2
DLD-1
 SRX7677727
NELFE
HCT 116
 SRX825988
EZH2
HCT 116
 SRX8155173
MED1
DLD-1
 SRX7677740
XRN2
DLD-1
 SRX7677728
NELFE
DLD-1
 SRX7677726
NELFCD
DLD-1
 SRX7677722
NELFE
Pharynx cancer cells
 SRX7101371
TEAD1
Pharynx cancer cells
 SRX7101370
TEAD1
Pharynx cancer cells
 SRX7101369
TEAD1
Pharynx cancer cells
 SRX7101368
TEAD1
HCT 116
 SRX5547229
YEATS4
HCT 116
 SRX5547218
MYC
HCT 116
 SRX5547216
MYC
HCT 116
 SRX4502351
CDK11A
HCT 116
 SRX4502350
CDK11A
HCT 116
 SRX4502349
CDK11A
HCT 116
 SRX4502348
CDK11A
HCT 116
 SRX4502347
CDK11A
HCT 116
 SRX4502346
CDK11A
HCT 116
 SRX4502345
CDK11A
HCT 116
 SRX4502344
CDK11A
DLD-1
 SRX4400347
ATF4
DLD-1
 SRX4400345
ATF4
DLD-1
 SRX4400344
ATF4
Gastrointestinal Stromal Tumors
 SRX3944344
BRD4
Gastrointestinal Stromal Tumors
 SRX3944342
BRD4
Gastrointestinal Stromal Tumors
 SRX3944340
BRD4
YCC-3
 SRX367636
KLF5
LoVo
 SRX359995
EGR2
Colonic organoids
 SRX3417632
VDR
Colonic organoids
 SRX3417627
VDR
Colonic organoids
 SRX3417626
VDR
GIST48
 SRX3372031
FOXF1
GIST48
 SRX3372030
ETV1
TE-5
 SRX3367070
SOX2
AGS
 SRX3124569
FXR1
HCT 116
 SRX3020567
PHIP
RKO
 SRX286203
BRD1
KYSE-70
 SRX277132
TP63
KYSE-70
 SRX277131
SOX2
Colon cancer
 SRX155775
HSF1
Colon cancer
 SRX155773
HSF1
Colon cancer
 SRX155772
HSF1
HT-29
 SRX155745
HSF1
HCT-15
 SRX155742
HSF1
SW 620
 SRX155740
HSF1
SW 620
 SRX155739
HSF1
LS-180
 SRX1272805
BRD4
HCT 116
 SRX1123967
SMARCC1
HCT 116
 SRX1078843
CDK9
RKO
 SRX101303
KAT7
LS-180
 SRX096347
CTNNB1
LS-180
 SRX096345
RXRA
HCT 116
 SRX190303
JUND
KYSE-150
 SRX424010
KDM4C
HCT 116
 SRX190308
CEBPB
HCT 116
 SRX190212
FOSL1
SNU-1750
 SRX1892834
TFAP4
HCT 116
 SRX1384025
ATF3
HCT 116
 SRX4937340
MED1
HCT 116
 SRX4937336
MED1
LoVo
 SRX359993
DMRT2
LoVo
 SRX359960
TAL1
LoVo
 SRX359899
JUN
LoVo
 SRX359897
IRF1
LoVo
 SRX359887
GLI2
LoVo
 SRX359886
ETV5
LoVo
 SRX359874
NR2F6
LoVo
 SRX359872
NKX2-8
LoVo
 SRX359861
LHX5
HCT 116
 SRX190228
TEAD4
HCT 116
 SRX190213
ATF3
HCT 116
 SRX1177905
HEXIM1
LoVo
 SRX359892
HOXA4
LoVo
 SRX359884
E2F3
LoVo
 SRX359880
ATF2
HCT 116
 SRX3091912
ZFX
RKO
 SRX286202
ING5
HCT 116
 SRX190292
USF1
COLO 741
 SRX1272808
BRD4
LoVo
 SRX360019
STAG2
GP5d
 SRX360591
NIPBL
GP5d
 SRX360577
NIPBL
LoVo
 SRX359987
BRCA1
LoVo
 SRX359962
TERF1
LoVo
 SRX359920
AHCTF1
GP5d
 SRX360588
JUND
GP5d
 SRX360574
JUND
LoVo
 SRX359963
TERF2
LoVo
 SRX359943
JUND
LoVo
 SRX359826
FOSB
HT-29
 SRX1538804
JUND
HT-29
 SRX1538803
JUND
LoVo
 SRX359971
RFX5
EC109
 SRX8473459
EZH2
Het-1A
 SRX8473458
EZH2
HCT 116
 SRX7692441
POLR2C
HCT 116
 SRX7692440
POLR2C
HCT 116
 SRX7692437
POLR2C
HCT 116
 SRX7692436
POLR2C
HT-29
 SRX768290
SOX9
DLD-1
 SRX7677761
DCP2
DLD-1
 SRX7677760
DCP2
DLD-1
 SRX7677759
XRN2
DLD-1
 SRX7677738
NCBP1
DLD-1
 SRX7677736
NCBP1
DLD-1
 SRX7677730
SUPT5H
DLD-1
 SRX7677729
SUPT5H
DLD-1
 SRX7677724
SUPT5H
DLD-1
 SRX7677723
SUPT5H
DLD-1
 SRX7677721
NELFE
DLD-1
 SRX7677720
NELFCD
DLD-1
 SRX7677719
NELFCD
TE-5
 SRX7572095
KLF5
TE-5
 SRX7572085
SREBF1
KYSE-150
 SRX7572083
SREBF1
HCT 116
 SRX748434
HNF4A
HCT 116
 SRX748433
HNF4A
HCT 116
 SRX748430
TCF7L2
HCT 116
 SRX748429
TCF7L2
HCT 116
 SRX748428
TCF7L2
HCT 116
 SRX748427
TCF7L2
HCT 116
 SRX748426
HNF4A
HCT 116
 SRX748425
HNF4A
HCT 116
 SRX748424
TCF7L2
HCT 116
 SRX748423
TCF7L2
HCT 116
 SRX748422
TCF7L2
HCT 116
 SRX748421
TCF7L2
HCT 116
 SRX748420
HNF4A
SW 480
 SRX7100373
KDM1A
SW 480
 SRX7100372
KDM1A
SW 480
 SRX7100371
KDM1A
SW 480
 SRX679419
PROX1
LoVo
 SRX6764992
WDR5
LoVo
 SRX6764991
WDR5
DKO-1
 SRX6748002
MECP2
DKO-1
 SRX6748001
MECP2
HCT 116
 SRX6748000
MECP2
HCT 116
 SRX6747999
MECP2
HCT 116
 SRX672732
TP53
HCT 116
 SRX672731
TP53
DKO
 SRX6680413
CBX1
DKO
 SRX6680411
CBX5
HCT 116
 SRX6680407
CBX1
HCT 116
 SRX6680405
CBX5
LS-174T
 SRX648246
MYC
LS-174T
 SRX648245
ZBTB17
LS-174T
 SRX648243
MYC
LS-174T
 SRX648242
ZBTB17
HCT 116
 SRX6384791
RAD21
HCT 116
 SRX6384786
MED26
HCT 116
 SRX6384757
RAD21
HCT 116
 SRX6384756
MED26
HCT 116
 SRX6384755
MED26
HCT 116
 SRX612780
TP53
ESO-26
 SRX6076676
HNF4A
ESO-26
 SRX6076675
GATA4
HCT 116
 SRX6066513
NELFE
HCT 116
 SRX6066512
NELFE
HCT 116
 SRX6066511
NELFE
HCT 116
 SRX6066510
NELFE
HCT 116
 SRX6066505
CDK9
HCT 116
 SRX6066504
CDK9
HCT 116
 SRX6066503
CDK9
HCT 116
 SRX6066502
CDK9
HCT 116
 SRX6066493
POLR2C
HCT 116
 SRX6066492
POLR2C
HCT 116
 SRX6066491
POLR2C
HCT 116
 SRX6066490
POLR2C
ESO-26
 SRX6060976
GATA6
ESO-26
 SRX6060975
ELF3
ESO-26
 SRX6060974
KLF5
HCT 116
 SRX5771381
SUPT6H
HCT 116
 SRX5771380
SUPT6H
HCT 116
 SRX5771379
SUPT6H
HCT 116
 SRX5771378
SUPT6H
HCT 116
 SRX5771377
SUPT6H
HCT 116
 SRX5771376
SUPT6H
HCT 116
 SRX5547228
YEATS4
HCT 116
 SRX5547219
MYC
HCT 116
 SRX5547217
MYC
HCT 116
 SRX5486443
ZIC2
HCT 116
 SRX5486439
TCF7L2
HCT 116
 SRX5486438
TCF7L2
HCT 116
 SRX5486437
TCF7L2
HCT 116
 SRX5486433
ZIC5
HCT 116
 SRX5486429
ZIC5
HCT 116
 SRX5486412
ZIC5
HCT 116
 SRX5394956
TP53
HCT 116
 SRX5313233
TP53
HCT 116
 SRX5313232
TP53
HCT 116
 SRX5313231
TP53
HCT 116
 SRX5313230
TP53
HCT 116
 SRX5313229
TP53
HCT 116
 SRX5313228
TP53
HCT 116
 SRX5313217
TP53
HCT 116
 SRX5313216
TP53
HCT 116
 SRX5313215
TP53
HCT 116
 SRX5313213
TP53
HCT 116
 SRX5313212
TP53
HCT 116
 SRX5313210
EP300
HCT 116
 SRX5313209
EP300
HCT 116
 SRX5313208
EP300
HCT 116
 SRX5313204
TP53
HCT 116
 SRX5313203
TP53
HCT 116
 SRX5313202
TP53
HCT 116
 SRX5123056
POU2F1
HCT 116
 SRX5123055
POU2F1
HCT 116
 SRX5123054
POU2F1
HCT 116
 SRX4937362
USP22
HCT 116
 SRX4937361
USP22
HCT 116
 SRX4937360
USP22
HCT 116
 SRX4937359
USP22
HCT 116
 SRX4937350
MED16
HCT 116
 SRX4937349
MED16
HCT 116
 SRX4937348
MED16
HCT 116
 SRX4937347
MED16
HCT 116
 SRX4937346
MED16
HCT 116
 SRX4937345
MED16
HCT 116
 SRX4937344
MED16
HCT 116
 SRX4937343
MED16
HCT 116
 SRX4937342
MED1
HCT 116
 SRX4937341
MED1
HCT 116
 SRX4937339
MED1
HCT 116
 SRX4937338
MED1
HCT 116
 SRX4937337
MED1
HCT 116
 SRX4937335
MED1
HCT 116
 SRX4937334
KAT2A
HCT 116
 SRX4937333
KAT2A
HCT 116
 SRX4937332
KAT2A
HCT 116
 SRX4937331
KAT2A
HCT 116
 SRX4937330
ATXN7L3
HCT 116
 SRX4937329
ATXN7L3
HCT 116
 SRX4937328
ATXN7L3
HCT 116
 SRX4937327
ATXN7L3
DLD-1
 SRX4400349
MYC
DLD-1
 SRX4400348
MYC
DLD-1
 SRX4400346
ATF4
HCT 116
 SRX4385554
SUPT5H
HCT 116
 SRX4385553
SUPT5H
HCT 116
 SRX4385552
SUPT5H
HCT 116
 SRX4385551
SUPT5H
HCT 116
 SRX4385550
SUPT5H
SW 480
 SRX423971
CTNNB1
SW 480
 SRX4235880
TP53
SW 480
 SRX4235878
KMT2D
HCT 116
 SRX4218025
CTCF
HCT 116
 SRX4172745
GATA1
HCT 116
 SRX4172744
GATA1
HCT 116
 SRX4172743
GATA1
HCT 116
 SRX4172742
GATA1
HCT 116
 SRX4172741
GATA1
HCT 116
 SRX4172740
GATA1
HCT 116
 SRX4172739
GATA1
HCT 116
 SRX4172738
GATA1
HCT 116
 SRX4107932
SKP2
HCT 116
 SRX4107930
SKP2
SW 480
 SRX398302
CDK8
HT-29
 SRX398298
CDK8
HCT 116
 SRX3962723
TP53
HCT 116
 SRX3962722
TP53
HCT 116
 SRX3962721
TP53
HCT 116
 SRX3962720
TP53
HCT 116
 SRX3962719
TP53
MKN-74
 SRX3927334
ONECUT2
MKN-74
 SRX3927332
ONECUT2
AGS
 SRX3927330
ONECUT2
AGS
 SRX3927328
ONECUT2
Colorectal cancer organoid
 SRX3868800
REST
Colorectal cancer organoid
 SRX3868798
REST
Colorectal cancer organoid
 SRX3868796
REST
Colorectal cancer organoid
 SRX3868794
REST
Colorectal cancer organoid
 SRX3868792
REST
HuG1-N
 SRX371983
GATA6
SW 480
 SRX3680731
BRD4
SW 480
 SRX3680730
BRD4
KATO III
 SRX367646
GATA6
KATO III
 SRX367644
KLF5
AGS
 SRX367642
GATA6
AGS
 SRX367641
GATA4
AGS
 SRX367640
KLF5
YCC-3
 SRX367638
GATA6
YCC-3
 SRX367637
GATA4
LoVo
 SRX361891
MYC
LoVo
 SRX361890
KLF5
LoVo
 SRX361888
HNF4A
LoVo
 SRX361885
MYC
LoVo
 SRX361884
KLF5
LoVo
 SRX361882
HNF4A
GP5d
 SRX360594
RFX2
GP5d
 SRX360593
REST
GP5d
 SRX360590
MYC
GP5d
 SRX360589
KLF5
GP5d
 SRX360584
HNF4A
GP5d
 SRX360580
RFX2
GP5d
 SRX360579
REST
GP5d
 SRX360576
MYC
GP5d
 SRX360575
KLF5
GP5d
 SRX360570
HNF4A
HCT 116
 SRX360377
EP300
HCT 116
 SRX360376
KMT2D
LoVo
 SRX360063
ZNF84
LoVo
 SRX360062
ZNF83
LoVo
 SRX360061
ZNF581
LoVo
 SRX360060
ZNF395
LoVo
 SRX360059
ZNF280D
LoVo
 SRX360058
ZNF266
LoVo
 SRX360057
ZNF263
LoVo
 SRX360056
ZNF217
LoVo
 SRX360055
ZNF143
LoVo
 SRX360054
ZNF12
LoVo
 SRX360053
ZBTB44
LoVo
 SRX360052
ZBTB4
LoVo
 SRX360051
ZBTB39
LoVo
 SRX360050
ZBTB24
LoVo
 SRX360049
ZBTB2
LoVo
 SRX360048
YBX1
LoVo
 SRX360046
TSHZ1
LoVo
 SRX360045
TOE1
LoVo
 SRX360044
THAP4
LoVo
 SRX360043
TFCP2
LoVo
 SRX360042
TEAD4
LoVo
 SRX360041
TCFL5
LoVo
 SRX360040
SNAPC4
LoVo
 SRX360039
SKI
LoVo
 SRX360038
RLF
LoVo
 SRX360037
RFX7
LoVo
 SRX360036
RCOR1
LoVo
 SRX360035
RBPJ
LoVo
 SRX360034
PRDM4
LoVo
 SRX360033
PLAG1
LoVo
 SRX360032
PCF11
LoVo
 SRX360031
PBX3
LoVo
 SRX360030
NKX2-3
LoVo
 SRX360029
NFIB
LoVo
 SRX360028
NFE2L3
LoVo
 SRX360027
MYBL1
LoVo
 SRX360026
MAFK
LoVo
 SRX360025
IRX2
LoVo
 SRX360024
HOXC13
LoVo
 SRX360023
HOXC11
LoVo
 SRX360022
GRHL1
LoVo
 SRX360021
FOXO4
LoVo
 SRX360016
NFE2L1
LoVo
 SRX360015
MYNN
LoVo
 SRX360014
MXI1
LoVo
 SRX360013
MEOX2
LoVo
 SRX360012
MAFF
LoVo
 SRX360011
LCORL
LoVo
 SRX360010
LCOR
LoVo
 SRX360009
KCMF1
LoVo
 SRX360008
IRF9
LoVo
 SRX360007
HOXD1
LoVo
 SRX360006
HOXB7
LoVo
 SRX360005
HOXA9
LoVo
 SRX360004
HNF4G
LoVo
 SRX360003
HAND1
LoVo
 SRX360002
GZF1