ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for FOXN3

Query protein: FOXN3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX3881589 | Hep G2
 
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  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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FOXN3's Target genes

◢ FOXN3: Average

◢ SRX3881588: Hep G2

◣ SRX3881589: Hep G2

◢ SRX3881590: Hep G2

◢ SRX3881591: Hep G2

◢ FOXN3: STRING
CNOT3 ↻ ≫
CRYBB2 ↻ ≫
PAXBP1 ↻ ≫
NPNT ↻ ≫
TINAGL1 ↻ ≫
RAB5IF ↻ ≫
KCNIP4 ↻ ≫
ZMYM3 ↻ ≫
LOC105370980 ↻ ≫
SLC39A14 ↻ ≫
MTRNR2L1 ↻ ≫
FILIP1L ↻ ≫
CMSS1 ↻ ≫
NGB ↻ ≫
YJU2 ↻ ≫
POLN ↻ ≫
HAUS3 ↻ ≫
LRP2 ↻ ≫
KRTAP9-6 ↻ ≫
TNRC6A ↻ ≫
TARBP2 ↻ ≫
MAP3K12 ↻ ≫
TTYH1 ↻ ≫
COQ8A ↻ ≫
RORC ↻ ≫
C2CD4D ↻ ≫
ELMOD1 ↻ ≫
SOX5 ↻ ≫
SPDYE14 ↻ ≫
SPDYE10P ↻ ≫
CYSLTR2 ↻ ≫
SYT2 ↻ ≫
STX6 ↻ ≫
PDE1C ↻ ≫
BAIAP2L2 ↻ ≫
LOC107986453 ↻ ≫
PHYH ↻ ≫
MTRNR2L2 ↻ ≫
MSH3 ↻ ≫
DHFR ↻ ≫
DMBX1 ↻ ≫
COL6A1 ↻ ≫
TYR ↻ ≫
ELAVL2 ↻ ≫
RHOC ↻ ≫
MTRNR2L8 ↻ ≫
EXOG ↻ ≫
SCGB1C2 ↻ ≫
TAC1 ↻ ≫
CABIN1 ↻ ≫
TNNI2 ↻ ≫
NOP14 ↻ ≫
GRK4 ↻ ≫
NAV3 ↻ ≫
SLITRK3 ↻ ≫
BCL9 ↻ ≫
ERAP1 ↻ ≫
PLA2G7 ↻ ≫
TLR6 ↻ ≫
LDB2 ↻ ≫
CD163L1 ↻ ≫
MYH14 ↻ ≫
CCDC200 ↻ ≫
CREB3L3 ↻ ≫
PDGFB ↻ ≫
FBLL1 ↻ ≫
FRG2 ↻ ≫
TSR2 ↻ ≫
RHOBTB2 ↻ ≫
MECOM ↻ ≫
TAF7L ↻ ≫
RAPGEF2 ↻ ≫
MAGEA2B ↻ ≫
MAGEA2 ↻ ≫
CSAG3 ↻ ≫
GDF6 ↻ ≫
LRCOL1 ↻ ≫
TMEM100 ↻ ≫
OPRL1 ↻ ≫
LKAAEAR1 ↻ ≫
FOXP1 ↻ ≫
CPLX2 ↻ ≫
CST9 ↻ ≫
C13orf42 ↻ ≫
ZNF462 ↻ ≫
SNX16 ↻ ≫
G6PC2 ↻ ≫
PIR ↻ ≫
BMX ↻ ≫
CALCR ↻ ≫
STYXL1 ↻ ≫
GABRE ↻ ≫
ERCC2 ↻ ≫
CBLN4 ↻ ≫
SHOX2 ↻ ≫
RSRC1 ↻ ≫
FGF13 ↻ ≫
PPM1L ↻ ≫
CYP2A6 ↻ ≫
SURF4 ↻ ≫
C2orf69 ↻ ≫
SLC9A3R2 ↻ ≫
ELAPOR1 ↻ ≫
C1orf194 ↻ ≫
RPL26 ↻ ≫
NLRP12 ↻ ≫
RICTOR ↻ ≫
CLUL1 ↻ ≫
OR10G9 ↻ ≫
OR10G8 ↻ ≫
CCDC66 ↻ ≫
PLK3 ↻ ≫
SLC35F3 ↻ ≫
RAPH1 ↻ ≫
TMIGD3 ↻ ≫
ADORA3 ↻ ≫
SYT7 ↻ ≫
RNASET2 ↻ ≫
MPI ↻ ≫
RABGEF1 ↻ ≫
PKD1L2 ↻ ≫
CDC5L ↻ ≫
GPR85 ↻ ≫
APOA4 ↻ ≫
CEP97 ↻ ≫
CACNG2 ↻ ≫
NR2F1 ↻ ≫
STOML3 ↻ ≫
CASC3 ↻ ≫
DOCK9 ↻ ≫
WT1 ↻ ≫
P2RY8 ↻ ≫
RUSC2 ↻ ≫
PIGQ ↻ ≫
NHLRC4 ↻ ≫
HECW2 ↻ ≫
TMLHE ↻ ≫
SPRY3 ↻ ≫
TRPC5 ↻ ≫
RTL4 ↻ ≫
OR4F17 ↻ ≫
UCKL1 ↻ ≫
CRACR2A ↻ ≫
NOL3 ↻ ≫
GABRA4 ↻ ≫
ACTA1 ↻ ≫
CYP2A13 ↻ ≫
IP6K1 ↻ ≫
NR5A1 ↻ ≫
SNX9 ↻ ≫
GRP ↻ ≫
GTF2H5 ↻ ≫
GALR1 ↻ ≫
MDGA1 ↻ ≫
ANO3 ↻ ≫
PRDM6 ↻ ≫
MGAT4A ↻ ≫
TCF4 ↻ ≫
LMBRD2 ↻ ≫
TNFRSF6B ↻ ≫
MRPS14 ↻ ≫
GBA ↻ ≫
MRGPRG ↻ ≫
MMP2 ↻ ≫
ADGRE5 ↻ ≫
MSR1 ↻ ≫
XRCC2 ↻ ≫
RNF148 ↻ ≫
MBD3L3 ↻ ≫
ZNF367 ↻ ≫
EPN1 ↻ ≫
ZP3 ↻ ≫
FLI1 ↻ ≫
COL23A1 ↻ ≫
NPIPB5 ↻ ≫
DENND1B ↻ ≫
CDH9 ↻ ≫
MAST4 ↻ ≫
DHRS9 ↻ ≫
USP39 ↻ ≫
C2orf68 ↻ ≫
CACNG3 ↻ ≫
MBD3L2 ↻ ≫
SNX18 ↻ ≫
SCGB1C1 ↻ ≫
ODF3 ↻ ≫
LIMD1 ↻ ≫
ABCB1 ↻ ≫
LMBR1L ↻ ≫
DNAJA4 ↻ ≫
C7orf50 ↻ ≫
PIAS1 ↻ ≫
RGPD2 ↻ ≫
RGPD1 ↻ ≫
PABPC5 ↻ ≫
MID1 ↻ ≫
GABRA2 ↻ ≫
SPATA13 ↻ ≫
RCN2 ↻ ≫
SLC27A1 ↻ ≫
RASGRF2 ↻ ≫
HERC6 ↻ ≫
TMC3 ↻ ≫
POM121 ↻ ≫
SLC2A14 ↻ ≫
PARVB ↻ ≫
OSBPL1A ↻ ≫
GCNT2 ↻ ≫
BCL6 ↻ ≫
HOXC8 ↻ ≫
RPS6 ↻ ≫
CST8 ↻ ≫
ANKRD31 ↻ ≫
VCX3B ↻ ≫
CCR9 ↻ ≫
DUX4 ↻ ≫
FCHSD2 ↻ ≫
COL12A1 ↻ ≫
ERGIC3 ↻ ≫
SELE ↻ ≫
CYP2A7 ↻ ≫
HOPX ↻ ≫
API5 ↻ ≫
FOXN1 ↻ ≫
HOXB13 ↻ ≫
INPP4B ↻ ≫
ABCA8 ↻ ≫
TMX4 ↻ ≫
AARSD1 ↻ ≫
KCNJ1 ↻ ≫
CHRNA9 ↻ ≫
MBD3L5 ↻ ≫
SH2D1A ↻ ≫
ABCA6 ↻ ≫
CCDC134 ↻ ≫
TRMT12 ↻ ≫
CABCOCO1 ↻ ≫
CRYGD ↻ ≫
RGSL1 ↻ ≫
MBD3L4 ↻ ≫
IL18R1 ↻ ≫
MYDGF ↻ ≫
LTA4H ↻ ≫
OR4F5 ↻ ≫
MAMLD1 ↻ ≫
RUVBL1 ↻ ≫
ITGA10 ↻ ≫
EEFSEC ↻ ≫
KRTAP2-2 ↻ ≫
KRTAP2-1 ↻ ≫
C2orf78 ↻ ≫
KBTBD11 ↻ ≫
C12orf73 ↻ ≫
ZFYVE1 ↻ ≫
MANBA ↻ ≫
ZNF430 ↻ ≫
SDCBP ↻ ≫
LINC01638 ↻ ≫
ZNF235 ↻ ≫
MTHFD2L ↻ ≫
MTMR9 ↻ ≫
ELANE ↻ ≫
CFD ↻ ≫
IL1R2 ↻ ≫
OR4M1 ↻ ≫
REG3A ↻ ≫
EML5 ↻ ≫
OR11H4 ↻ ≫
SLC30A10 ↻ ≫
RBKS ↻ ≫
BABAM2 ↻ ≫
SLC25A37 ↻ ≫
MTHFD1L ↻ ≫
OR4K3 ↻ ≫
OR4K2 ↻ ≫
MS4A4A ↻ ≫
FOXJ1 ↻ ≫
OR2T1 ↻ ≫
TNFSF8 ↻ ≫
DHX40 ↻ ≫
LRGUK ↻ ≫
CCDC39 ↻ ≫
ALMS1 ↻ ≫
PGM2L1 ↻ ≫
CEACAM19 ↻ ≫
CFAP69 ↻ ≫
C7orf33 ↻ ≫
CPSF6 ↻ ≫
PVR ↻ ≫
TBC1D16 ↻ ≫
CCDC40 ↻ ≫
CTSE ↻ ≫
RIPK2 ↻ ≫
EIF4G3 ↻ ≫
FRG2C ↻ ≫
ILF2 ↻ ≫
H4C8 ↻ ≫
WBP4 ↻ ≫
ELF1 ↻ ≫
RNASE4 ↻ ≫
ANG ↻ ≫
KNL1 ↻ ≫
C8orf37 ↻ ≫
HMGN4 ↻ ≫
CCDC115 ↻ ≫
WDR74 ↻ ≫
NCOA7 ↻ ≫
TP53I3 ↻ ≫
NEK10 ↻ ≫
DCT ↻ ≫
RABL2B ↻ ≫
INTS5 ↻ ≫
LUC7L2 ↻ ≫
FMC1-LUC7L2 ↻ ≫
FMC1 ↻ ≫
ZNF697 ↻ ≫
LCK ↻ ≫
CEP126 ↻ ≫
ANGPTL5 ↻ ≫
SIRPB1 ↻ ≫
H3C10 ↻ ≫
H2BC14 ↻ ≫
H2BC13 ↻ ≫
H2AC14 ↻ ≫
H2AC13 ↻ ≫
FNDC10 ↻ ≫
H3C6 ↻ ≫
SACM1L ↻ ≫
CRNKL1 ↻ ≫
CFAP61 ↻ ≫
UTP14A ↻ ≫
QRFPR ↻ ≫
MAMDC2 ↻ ≫
GAS2L3 ↻ ≫
TARS1 ↻ ≫
MEIS3 ↻ ≫
HES7 ↻ ≫
DACH1 ↻ ≫
IFITM10 ↻ ≫
TRIM7 ↻ ≫
KLK14 ↻ ≫
SRSF5 ↻ ≫
SPAG16 ↻ ≫
HIF3A ↻ ≫
ADGRL1 ↻ ≫
TMEFF2 ↻ ≫
CPLX1 ↻ ≫
ARMC3 ↻ ≫
ITGB1 ↻ ≫
POLR3F ↻ ≫
DZANK1 ↻ ≫
GCGR ↻ ≫
SCML4 ↻ ≫
ACOX3 ↻ ≫
WHRN ↻ ≫
TTBK1 ↻ ≫
CFAP43 ↻ ≫
SPEF2 ↻ ≫
RABL2A ↻ ≫
CFAP58 ↻ ≫
HMGA2 ↻ ≫
CD96 ↻ ≫
DNASE2B ↻ ≫
IGFBP4 ↻ ≫
ALOXE3 ↻ ≫
KCNH7 ↻ ≫
PPP2R2C ↻ ≫
NAPSA ↻ ≫
HOXC6 ↻ ≫
HOXC4 ↻ ≫
FAM236B ↻ ≫
FAM236A ↻ ≫
CELF2 ↻ ≫
POLR3E ↻ ≫
DNAH7 ↻ ≫
AIFM2 ↻ ≫
C16orf46 ↻ ≫
PLXDC1 ↻ ≫
SUPT20HL1 ↻ ≫
KMT5C ↻ ≫
FANK1 ↻ ≫
VEGFC ↻ ≫
HIP1 ↻ ≫
TMEM119 ↻ ≫
SP140 ↻ ≫
SP110 ↻ ≫
KCNH2 ↻ ≫
SHF ↻ ≫
RBPJ ↻ ≫
OR1F1 ↻ ≫
UGT1A3 ↻ ≫
SLC6A19 ↻ ≫
PDE4B ↻ ≫
MYNN ↻ ≫
ACTRT3 ↻ ≫
NDP ↻ ≫
CRLF2 ↻ ≫
CEACAM4 ↻ ≫
CD79A ↻ ≫
ARHGEF1 ↻ ≫
C19orf81 ↻ ≫
MFSD4B ↻ ≫
ADGB ↻ ≫
BASP1 ↻ ≫
TSGA10 ↻ ≫
PSG8 ↻ ≫
KIF17 ↻ ≫
C2orf15 ↻ ≫
RBFOX3 ↻ ≫
UPK2 ↻ ≫
UGT3A2 ↻ ≫
DDAH1 ↻ ≫
CCN1 ↻ ≫
RNASE9 ↻ ≫
PCOTH ↻ ≫
PCNX1 ↻ ≫
MIPEP ↻ ≫
H2BC8 ↻ ≫
H2AC8 ↻ ≫
ADGRG1 ↻ ≫
CALN1 ↻ ≫
TIGD2 ↻ ≫
TBX21 ↻ ≫
ANGPT4 ↻ ≫
TCEAL1 ↻ ≫
SLCO2A1 ↻ ≫
PDZK1IP1 ↻ ≫
PDCD5 ↻ ≫
SAA2-SAA4 ↻ ≫
SAA2 ↻ ≫
NPHP1 ↻ ≫
CUL7 ↻ ≫
GPRC5D ↻ ≫
ZSWIM2 ↻ ≫
TRPV1 ↻ ≫
SLC22A11 ↻ ≫
KCNAB2 ↻ ≫
TP53I11 ↻ ≫
MLXIPL ↻ ≫
FBXW11 ↻ ≫
FAM189A1 ↻ ≫
CPT2 ↻ ≫
SHQ1 ↻ ≫
ZNF275 ↻ ≫
TMEM82 ↻ ≫
MTAP ↻ ≫
TMEM31 ↻ ≫
CGREF1 ↻ ≫
MBIP ↻ ≫
SLF1 ↻ ≫
KIAA0825 ↻ ≫
REPS2 ↻ ≫
BRINP1 ↻ ≫
ZNF789 ↻ ≫
ATP5MF-PTCD1 ↻ ≫
ATP5MF ↻ ≫
CUBN ↻ ≫
CFAP221 ↻ ≫
ACMSD ↻ ≫
TRAF3IP2 ↻ ≫
HELT ↻ ≫
TTC30A ↻ ≫
CFAP206 ↻ ≫
ZNF536 ↻ ≫
ZBBX ↻ ≫
PPIAL4C ↻ ≫
NASP ↻ ≫
SLC39A8 ↻ ≫
FAM161A ↻ ≫
RBM28 ↻ ≫
STK11IP ↻ ≫
MRPS2 ↻ ≫
C9orf116 ↻ ≫
ZNF497 ↻ ≫
ST6GALNAC1 ↻ ≫
LMX1B ↻ ≫
FAM120B ↻ ≫
UBXN11 ↻ ≫
SOGA1 ↻ ≫
NLGN3 ↻ ≫
IGSF5 ↻ ≫
BRWD3 ↻ ≫
ANK1 ↻ ≫
TMEM132C ↻ ≫
USP17L7 ↻ ≫
USP17L2 ↻ ≫
ERICH1 ↻ ≫
DLGAP2 ↻ ≫
SPART ↻ ≫
DEXI ↻ ≫
CLEC16A ↻ ≫
TTC26 ↻ ≫
GNA12 ↻ ≫
ELMOD2 ↻ ≫
RABGAP1L ↻ ≫
FOXI2 ↻ ≫
NPAS3 ↻ ≫
LCTL ↻ ≫
LOC102723623 ↻ ≫
GOLGA6L22 ↻ ≫
DYNC2I1 ↻ ≫
ACTN2 ↻ ≫
ACTRT2 ↻ ≫
BTN3A3 ↻ ≫
C17orf64 ↻ ≫
ZNF479 ↻ ≫
HSPA6 ↻ ≫
NCEH1 ↻ ≫
MKKS ↻ ≫
WASF2 ↻ ≫
HPSE2 ↻ ≫
GSTA4 ↻ ≫
EPHX2 ↻ ≫
CCN2 ↻ ≫
UBN2 ↻ ≫
DLGAP4 ↻ ≫
ACTL9 ↻ ≫
ZNF197 ↻ ≫
TRIM49D2 ↻ ≫
TRIM49D1 ↻ ≫
SULF1 ↻ ≫
SPATA16 ↻ ≫
SERPINB7 ↻ ≫
PPP1R2B ↻ ≫
KMO ↻ ≫
ARHGAP24 ↻ ≫
TRIP4 ↻ ≫
RAB11FIP2 ↻ ≫
GCNT3 ↻ ≫
TRAF3IP3 ↻ ≫
NPIPB4 ↻ ≫
NPIPB3 ↻ ≫
MEIS2 ↻ ≫
FTCDNL1 ↻ ≫
AP3B2 ↻ ≫
NEK5 ↻ ≫
FNDC7 ↻ ≫
ZBTB20 ↻ ≫
LYRM4 ↻ ≫
LASP1 ↻ ≫
FARS2 ↻ ≫
CRLS1 ↻ ≫
HELZ2 ↻ ≫
CFAP53 ↻ ≫
CD38 ↻ ≫
ATAD3C ↻ ≫
RPAP3 ↻ ≫
SYT8 ↻ ≫
PDE1A ↻ ≫
AQP12A ↻ ≫
DYNC2H1 ↻ ≫
ARAP3 ↻ ≫
NDUFS7 ↻ ≫
GPR78 ↻ ≫
TASP1 ↻ ≫
LOC102723971 ↻ ≫
LOC100132202 ↻ ≫
FBXO48 ↻ ≫
APLF ↻ ≫
UCN3 ↻ ≫
FSCN2 ↻ ≫
VOPP1 ↻ ≫
KRTAP5-5 ↻ ≫
ANKRD18B ↻ ≫
CCL3L3 ↻ ≫
CCL3L1 ↻ ≫
CCL3 ↻ ≫
MYO1B ↻ ≫
SRFBP1 ↻ ≫
OR10D3 ↻ ≫
TMEM106B ↻ ≫
WFDC3 ↻ ≫
GCFC2 ↻ ≫
DPY19L1 ↻ ≫
DNTTIP1 ↻ ≫
PCTP ↻ ≫
KRTAP4-6 ↻ ≫
UBXN2B ↻ ≫
INSM2 ↻ ≫
DNAJC27 ↻ ≫
CASQ2 ↻ ≫
POTEH ↻ ≫
TTLL5 ↻ ≫
FAM104A ↻ ≫
ERG28 ↻ ≫
CCDC30 ↻ ≫
TTC39B ↻ ≫
MED23 ↻ ≫
FBXO33 ↻ ≫
FAM187A ↻ ≫
EFTUD2 ↻ ≫
CCDC103 ↻ ≫
NBPF1 ↻ ≫
LURAP1L ↻ ≫
KRTAP4-12 ↻ ≫
ISL1 ↻ ≫
FAM171B ↻ ≫
TTC30B ↻ ≫
ANKRD55 ↻ ≫
IGFL2 ↻ ≫
RDH14 ↻ ≫
DIS3L2 ↻ ≫
TNFSF14 ↻ ≫
PLCB1 ↻ ≫
PKIB ↻ ≫
HECTD1 ↻ ≫
ARL4A ↻ ≫
KLF7 ↻ ≫
GORASP2 ↻ ≫
C2CD6 ↻ ≫
HSPA4L ↻ ≫
AHI1 ↻ ≫
TIMM21 ↻ ≫
LONRF2 ↻ ≫
KATNAL1 ↻ ≫
FBXO15 ↻ ≫
XYLT1 ↻ ≫
SLAIN2 ↻ ≫
AGPS ↻ ≫
PHTF1 ↻ ≫
KRTAP4-4 ↻ ≫
PKP4 ↻ ≫
PHOSPHO2 ↻ ≫
MFF ↻ ≫
ERCC4 ↻ ≫
CCDC173 ↻ ≫
CCDC148 ↻ ≫
WDR35 ↻ ≫
E2F3 ↻ ≫
ATP5F1E ↻ ≫
ASPH ↻ ≫
NCKAP1 ↻ ≫
KIZ ↻ ≫
IPO4 ↻ ≫
DNAJC10 ↻ ≫
COQ9 ↻ ≫
CIAPIN1 ↻ ≫
PIGF ↻ ≫
CRIPT ↻ ≫
BTBD3 ↻ ≫
ARRDC4 ↻ ≫
FMNL2 ↻ ≫
SMC6 ↻ ≫
RALGPS2 ↻ ≫
GEN1 ↻ ≫
PDXDC1 ↻ ≫
TANK ↻ ≫
SNRPF ↻ ≫
SEPSECS ↻ ≫
NDUFAF6 ↻ ≫
WDR43 ↻ ≫
CHN1 ↻ ≫
SPATA33 ↻ ≫
CRYM ↻ ≫
DHRS7 ↻ ≫
JMJD1C ↻ ≫
CTHRC1 ↻ ≫
RBMS1 ↻ ≫
SPATA4 ↻ ≫
PRPF40A ↻ ≫
FHAD1 ↻ ≫
BAG2 ↻ ≫
ATP5MC3 ↻ ≫
ARL6IP6 ↻ ≫
WIPF1 ↻ ≫
MTX2 ↻ ≫
TTC23L ↻ ≫
GMCL1 ↻ ≫
ENDOV ↻ ≫
ADNP ↻ ≫
TTC8 ↻ ≫
SCFD1 ↻ ≫
PNPT1 ↻ ≫
PIFO ↻ ≫
PCNA ↻ ≫
PCDHA4 ↻ ≫
HSF2 ↻ ≫
DDX18 ↻ ≫
CDS2 ↻ ≫
STXBP6 ↻ ≫
SGO2 ↻ ≫
PET117 ↻ ≫
KAT14 ↻ ≫
GTF2E2 ↻ ≫
PTPN4 ↻ ≫
H2BC4 ↻ ≫
H2AC6 ↻ ≫
STX7 ↻ ≫
EML6 ↻ ≫
CDYL2 ↻ ≫
NTN5 ↻ ≫
COCH ↻ ≫
UBQLN1 ↻ ≫
TTC12 ↻ ≫
PAK5 ↻ ≫
OGFOD1 ↻ ≫
NUDT21 ↻ ≫
PPP1R14C ↻ ≫
MDM1 ↻ ≫
PDE4D ↻ ≫
CDC7 ↻ ≫
SEC23A ↻ ≫
DIDO1 ↻ ≫
FERMT1 ↻ ≫
CHMP4B ↻ ≫
MYC ↻ ≫