ChIP-Atlas: Colocalization analysis

Colocalization analysis for RAD21

Query protein: RAD21
Cell class: Blood
Sort key: SRX6777952 | HAP1
 
Color legends
ChIP-seq data:  H-H H-M M-M H-L M-L L-L N.D. Same  (Peak intensities are High, Middle or Low)

STRING data:  1000 750 500 250 0 N.D.  (Values = STRING's binding scores)

Downloads: TSV (text), GML (Cytoscape)
Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Colocalization
Cell types  Exp. IDs RAD21's Colocalization partners

◢ RAD21: Average

◢ SRX100461: GM12878

◢ SRX150412: GM12878

◢ SRX6777951: HAP1

◣ SRX6777952: HAP1

◢ SRX100492: K-562

◢ SRX150399: K-562

◢ SRX7202561: K-562

◢ SRX8841625: Lymphoblasts

◢ SRX8841627: Lymphoblasts

◢ SRX8841629: Lymphoblasts

◢ SRX8841631: Lymphoblasts

◢ SRX4001762: Macrophages

◢ SRX4001763: Macrophages

◢ SRX4001764: Macrophages

◢ SRX4001765: Macrophages

◢ SRX5883959: Multiple Myeloma

◢ SRX5883960: Multiple Myeloma

◢ SRX5883961: Multiple Myeloma

◢ SRX5883962: Multiple Myeloma

◢ SRX5391682: Neutrophils

◢ SRX5391683: Neutrophils

◢ SRX5391684: Neutrophils

◢ SRX5391685: Neutrophils

◢ SRX7083410: RAMOS

◢ SRX4001823: THP-1

◢ SRX4001824: THP-1

◢ SRX4001825: THP-1

◢ SRX4001826: THP-1

◢ SRX4001827: THP-1

◢ SRX4001868: THP-1

◢ SRX4001869: THP-1

◢ SRX4001870: THP-1

◢ SRX4001871: THP-1

◢ SRX4001872: THP-1

◢ SRX4001873: THP-1

◢ SRX4001874: THP-1

◢ SRX4001875: THP-1

◢ SRX4001876: THP-1

◢ SRX4001877: THP-1

◢ SRX4001878: THP-1

◢ SRX4001904: THP-1

◢ SRX4001905: THP-1

◢ SRX4001906: THP-1

◢ SRX4001907: THP-1

◢ SRX4001908: THP-1

◢ SRX4001909: THP-1

◢ SRX4001910: THP-1

◢ SRX4001911: THP-1

◢ SRX4001912: THP-1

◢ SRX4001913: THP-1

◢ SRX4001914: THP-1

◢ SRX4001942: THP-1

◢ SRX4001943: THP-1

◢ SRX4001944: THP-1

◢ SRX4001945: THP-1

◢ SRX476481: THP-1

◢ RAD21: STRING

HAP1
 SRX6777952
RAD21
Lymphoblastoid cells
 SRX151229
SMC1A
Hematopoietic Stem Cells
 SRX995497
STAG1
Hematopoietic Stem Cells
 SRX1738530
STAG1
Erythroid Cells
 SRX995500
CTCF
Kasumi-1
 SRX4890467
CTCF
Macrophages
 SRX4521396
CTCF
Lymphoblastoid cell line
 SRX356546
CTCF
T cells
 SRX1425809
CTCF
TF-1
 SRX1261519
GATA2
GM12878
 SRX038505
CTCF
CD4+ T cells
 SRX003794
CTCF
Lymphoblasts
 SRX8841631
RAD21
Lymphoblasts
 SRX8841627
RAD21
Neutrophils
 SRX5391683
RAD21
THP-1
 SRX476481
RAD21
Macrophages
 SRX2770860
SMC1A
K-562
 SRX150390
SMC3
MS1
 SRX356806
STAG1
Lymphoblastoid cell line
 SRX356729
STAG1
Lymphoblastoid cell line
 SRX356728
STAG1
GM19240
 SRX356711
STAG1
GM19239
 SRX356687
STAG1
GM19193
 SRX356645
STAG1
GM19193
 SRX356644
STAG1
GM19099
 SRX356628
STAG1
GM19099
 SRX356627
STAG1
GM18951
 SRX356611
STAG1
GM18951
 SRX356610
STAG1
GM18526
 SRX356594
STAG1
GM18526
 SRX356593
STAG1
GM18505
 SRX356577
STAG1
GM18505
 SRX356576
STAG1
Lymphoblastoid cell line
 SRX356560
STAG1
Lymphoblastoid cell line
 SRX356500
STAG1
Lymphoblastoid cell line
 SRX356499
STAG1
GM12878
 SRX356480
STAG1
GM10847
 SRX356454
STAG1
GM10847
 SRX356453
STAG1
KBM-7
 SRX8570929
HAP1
Neutrophils
 SRX5391688
CTCF
Kasumi-1
 SRX4890466
CTCF
Lymphoblastoid cell line
 SRX4288471
CTCF
THP-1
 SRX2655462
CTCF
THP-1
 SRX2655461
CTCF
THP-1
 SRX2655459
CTCF
THP-1
 SRX1744960
CTCF
THP-1
 SRX1744958
CTCF
TF-1
 SRX1261518
GATA2
CD34 Hematopoietic stem cells
 SRX097072
SMAD1
Lymphoblasts
 SRX8841629
RAD21
Lymphoblasts
 SRX8841625
RAD21
K-562
 SRX7202561
RAD21
THP-1
 SRX4001912
RAD21
THP-1
 SRX4001911
RAD21
THP-1
 SRX4001910
RAD21
THP-1
 SRX4001909
RAD21
THP-1
 SRX4001908
RAD21
THP-1
 SRX4001878
RAD21
THP-1
 SRX4001876
RAD21
THP-1
 SRX4001875
RAD21
THP-1
 SRX4001874
RAD21
THP-1
 SRX4001873
RAD21
THP-1
 SRX4001872
RAD21
THP-1
 SRX4001871
RAD21
THP-1
 SRX4001869
RAD21
THP-1
 SRX4001868
RAD21
THP-1
 SRX4001825
RAD21
THP-1
 SRX4001824
RAD21
THP-1
 SRX4001823
RAD21
Macrophages
 SRX4001765
RAD21
Macrophages
 SRX4001764
RAD21
Macrophages
 SRX4001763
RAD21
Macrophages
 SRX4001762
RAD21
K-562
 SRX150399
RAD21
GM12878
 SRX2458136
SMC1A
GM12878
 SRX2458135
SMC1A
GM12878
 SRX150456
SMC3
MS1
 SRX356805
STAG1
Lymphoblastoid cell line
 SRX356783
STAG1
Lymphoblastoid cell line
 SRX356782
STAG1
Lymphoblastoid cell line
 SRX356765
STAG1
Lymphoblastoid cell line
 SRX356764
STAG1
Lymphoblastoid cell line
 SRX356747
STAG1
Lymphoblastoid cell line
 SRX356746
STAG1
GM19240
 SRX356710
STAG1
GM19239
 SRX356688
STAG1
GM19238
 SRX356666
STAG1
GM19238
 SRX356665
STAG1
Lymphoblastoid cell line
 SRX356559
STAG1
GM12892
 SRX356544
STAG1
GM12892
 SRX356543
STAG1
GM12891
 SRX356522
STAG1
GM12891
 SRX356521
STAG1
GM12878
 SRX356481
STAG1
GM12878
 SRX356479
STAG1
KBM-7
 SRX8570949
HAP1
KBM-7
 SRX8570947
HAP1
KBM-7
 SRX8570945
HAP1
KBM-7
 SRX8570943
HAP1
KBM-7
 SRX8570941
HAP1
KBM-7
 SRX8570939
HAP1
KBM-7
 SRX8570937
HAP1
KBM-7
 SRX8570935
HAP1
KBM-7
 SRX8570932
HAP1
KBM-7
 SRX8570931
HAP1
KBM-7
 SRX8570927
HAP1
KBM-7
 SRX8570925
HAP1
KBM-7
 SRX8570923
HAP1
KBM-7
 SRX8570921
HAP1
KBM-7
 SRX8570919
HAP1
Multiple Myeloma
 SRX5883951
CTCF
K-562
 SRX5848173
CTCF
Lymphoblastoid cell line
 SRX356732
CTCF
Lymphoblastoid cell line
 SRX356484
CTCF
THP-1
 SRX2655460
CTCF
HAP1
 SRX6777951
RAD21
THP-1
 SRX4001945
RAD21
THP-1
 SRX4001944
RAD21
THP-1
 SRX4001943
RAD21
THP-1
 SRX4001942
RAD21
THP-1
 SRX4001914
RAD21
THP-1
 SRX4001913
RAD21
THP-1
 SRX4001907
RAD21
THP-1
 SRX4001906
RAD21
THP-1
 SRX4001905
RAD21
THP-1
 SRX4001904
RAD21
THP-1
 SRX4001877
RAD21
THP-1
 SRX4001870
RAD21
THP-1
 SRX4001827
RAD21
THP-1
 SRX4001826
RAD21
GM12878
 SRX150412
RAD21
K-562
 SRX5974560
CTCF
K-562
 SRX5974527
CTCF
Macrophages
 SRX4001756
CTCF
K-562
 SRX5974559
CTCF
Macrophages
 SRX4001757
CTCF
KBM-7
 SRX8570948
HAP1
KBM-7
 SRX8570946
HAP1
KBM-7
 SRX8570924
HAP1
KBM-7
 SRX8570922
HAP1
Multiple Myeloma
 SRX5883952
CTCF
Multiple Myeloma
 SRX5883950
CTCF
K-562
 SRX5848183
CTCF
K-562
 SRX5848175
CTCF
K-562
 SRX5848171
CTCF
K-562
 SRX5848167
CTCF
THP-1
 SRX4001947
CTCF
THP-1
 SRX4001886
CTCF
THP-1
 SRX4001834
CTCF
Macrophages
 SRX4001760
CTCF
THP-1
 SRX1744961
CTCF
THP-1
 SRX1744959
CTCF
THP-1
 SRX1744957
CTCF
THP-1
 SRX1744956
CTCF
Lymphoma, B-Cell
 SRX092416
CTCF
Macrophages
 SRX4001754
CTCF
KBM-7
 SRX8570938
HAP1
K-562
 SRX5848166
CTCF
THP-1
 SRX476480
CTCF
THP-1
 SRX4001946
CTCF
THP-1
 SRX4001888
CTCF
THP-1
 SRX4001887
CTCF
Macrophages
 SRX4001758
CTCF
HuT 78
 ERX2868735
CTCF
KBM-7
 SRX8570930
HAP1
THP-1
 SRX4001889
CTCF
KBM-7
 SRX8570944
HAP1
KBM-7
 SRX8570940
HAP1
KBM-7
 SRX8570933
HAP1
KBM-7
 SRX8570920
HAP1
K-562
 SRX6828389
CTCF
THP-1
 SRX4001880
CTCF
THP-1
 SRX4001879
CTCF
Macrophages
 SRX4001761
CTCF
THP-1
 SRX4001885
CTCF
HuT 78
 ERX2868734
CTCF
KBM-7
 SRX8570926
HAP1
THP-1
 SRX4001882
CTCF
THP-1
 SRX4001881
CTCF
HAP1
 SRX2570610
CTCF
HAP1
 SRX2570609
CTCF
K-562
 SRX2442515
CTCF
Macrophages
 SRX4521398
CTCF
K-562
 SRX6913081
BRD4
THP-1
 SRX4001884
CTCF
HAP1
 SRX2570608
CTCF
Erythroid Cells
 SRX995501
STAG1
Jurkat
 ERX2868821
CTCF
BLaER1
 SRX7396395
CTCF
KBM-7
 SRX8570928
HAP1
CD34 Hematopoietic stem cells
 SRX3408800
CTCF
Erythroid Cells
 SRX1738532
STAG1
K-562
 SRX5974528
CTCF
K-562
 SRX2442513
CTCF
KBM-7
 SRX8570918
HAP1
BLaER1
 SRX7396396
CTCF
Macrophages
 SRX4001759
CTCF
K-562
 SRX5974543
CTCF
THP-1
 SRX4001883
CTCF
K-562
 SRX5974511
CTCF
Lymphoblasts
 SRX8841617
CTCF
K-562
 SRX5974512
CTCF
HAP1
 SRX2570611
CTCF
Neutrophils
 SRX5391687
CTCF
CD36+
 SRX037936
CTCF
K-562
 SRX5974544
CTCF
CD34+
 SRX6902859
CTCF
CD34+
 SRX6902858
CTCF
BLaER1
 SRX7396392
CTCF
K-562
 SRX5974576
CTCF
GM20000
 SRX188950
CTCF
GM13976
 SRX188962
CTCF
BLaER1
 SRX7396391
CTCF
Neutrophils
 SRX5391689
CTCF
Lymphoma, B-Cell
 SRX092414
CTCF
CD36+
 SRX037937
CTCF
HAP1
 SRX2570613
SMC1A
T cells
 SRX1425808
CTCF
BCBL1
 SRX151246
SMC1A
Hematopoietic Stem Cells
 SRX1738529
CTCF
HAP1
 SRX2570615
SMC1A
GM12865
 SRX080403
CTCF
Leukemia cell line
 SRX7396397
CTCF
BLaER1
 SRX7396389
CTCF
Hematopoietic Stem Cells
 SRX995496
CTCF
BLaER1
 SRX7396390
CTCF
T-ALL
 SRX6578935
CTCF
T-ALL
 SRX6578934
CTCF
CUTLL1
 SRX6578944
CTCF
CUTLL1
 SRX6578943
CTCF
T cells
 SRX6578928
CTCF
CUTLL1
 SRX6578948
CTCF