ChIP-Atlas: Colocalization analysis

Colocalization analysis for CTCF

Query protein: CTCF
Cell class: Blood
Sort key: SRX5883949 | Multiple Myeloma
 
Color legends
ChIP-seq data:  H-H H-M M-M H-L M-L L-L N.D. Same  (Peak intensities are High, Middle or Low)

STRING data:  1000 750 500 250 0 N.D.  (Values = STRING's binding scores)

Downloads: TSV (text), GML (Cytoscape)
Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Colocalization
Cell types  Exp. IDs CTCF's Colocalization partners

◢ CTCF: Average

◢ SRX5333219: 697

◢ SRX5333220: 697

◢ SRX3636814: ALL xenograft

◢ SRX3636815: ALL xenograft

◢ SRX3636816: ALL xenograft

◢ SRX3636817: ALL xenograft

◢ SRX151245: BCBL1

◢ SRX7396389: BLaER1

◢ SRX7396390: BLaER1

◢ SRX7396391: BLaER1

◢ SRX7396392: BLaER1

◢ SRX7396393: BLaER1

◢ SRX7396394: BLaER1

◢ SRX7396395: BLaER1

◢ SRX7396396: BLaER1

◢ SRX4284003: B cells

◢ SRX4284004: B cells

◢ SRX4284007: B cells

◢ SRX4284008: B cells

◢ SRX4284011: B cells

◢ SRX4284012: B cells

◢ SRX186670: CD20+

◢ SRX037935: CD34+

◢ SRX6902857: CD34+

◢ SRX6902858: CD34+

◢ SRX6902859: CD34+

◢ SRX3408800: CD34 Hematopoietic stem cells

◢ SRX037936: CD36+

◢ SRX037937: CD36+

◢ SRX003794: CD4+ T cells

◢ SRX6578940: CUTLL1

◢ SRX6578941: CUTLL1

◢ SRX6578942: CUTLL1

◢ SRX6578943: CUTLL1

◢ SRX6578944: CUTLL1

◢ SRX6578946: CUTLL1

◢ SRX6578947: CUTLL1

◢ SRX6578948: CUTLL1

◢ ERX2868792: Daudi

◢ ERX2868793: Daudi

◢ SRX1091817: delta-47

◢ SRX1091820: delta-47

◢ SRX186660: DND-41

◢ SRX3927292: EOL-1

◢ SRX3056625: Erythroblasts

◢ SRX3056626: Erythroblasts

◢ SRX3056628: Erythroblasts

◢ SRX3056629: Erythroblasts

◢ SRX381545: Erythroblasts

◢ SRX1738531: Erythroid Cells

◢ SRX5299873: Erythroid Cells

◢ SRX995500: Erythroid Cells

◢ SRX8066534: GM04604

◢ SRX8066535: GM04604

◢ SRX8066532: GM04648

◢ SRX8066533: GM04648

◢ SRX8066530: GM06077

◢ SRX8066531: GM06077

◢ SRX080368: GM06990

◢ SRX080371: GM06990

◢ SRX188968: GM10248

◢ SRX188947: GM10266

◢ SRX356437: GM10847

◢ SRX356438: GM10847

◢ SRX356439: GM10847

◢ SRX080374: GM12801

◢ SRX080339: GM12864

◢ SRX080425: GM12864

◢ SRX199892: GM12864

◢ SRX080388: GM12865

◢ SRX080403: GM12865

◢ SRX199864: GM12865

◢ SRX111778: GM12866

◢ SRX111774: GM12867

◢ SRX111773: GM12868

◢ SRX111776: GM12869

◢ SRX111775: GM12870

◢ SRX111777: GM12871

◢ SRX080355: GM12872

◢ SRX080357: GM12872

◢ SRX199861: GM12872

◢ SRX080349: GM12873

◢ SRX080393: GM12873

◢ SRX199857: GM12873

◢ SRX080404: GM12874

◢ SRX080420: GM12874

◢ SRX080333: GM12875

◢ SRX080427: GM12875

◢ SRX038504: GM12878

◢ SRX038505: GM12878

◢ SRX067503: GM12878

◢ SRX080367: GM12878

◢ SRX080369: GM12878

◢ SRX103011: GM12878

◢ SRX150690: GM12878

◢ SRX356455: GM12878

◢ SRX356456: GM12878

◢ SRX102993: GM12891

◢ SRX356501: GM12891

◢ SRX356502: GM12891

◢ SRX102998: GM12892

◢ SRX356523: GM12892

◢ SRX356524: GM12892

◢ SRX188962: GM13976

◢ SRX188946: GM13977

◢ SRX356561: GM18505

◢ SRX356562: GM18505

◢ SRX356578: GM18526

◢ SRX356579: GM18526

◢ SRX356595: GM18951

◢ SRX356596: GM18951

◢ SRX356612: GM19099

◢ SRX356613: GM19099

◢ SRX356629: GM19193

◢ SRX356630: GM19193

◢ SRX102979: GM19238

◢ SRX356646: GM19238

◢ SRX356647: GM19238

◢ SRX102978: GM19239

◢ SRX356667: GM19239

◢ SRX356668: GM19239

◢ SRX102977: GM19240

◢ SRX356689: GM19240

◢ SRX356690: GM19240

◢ SRX188950: GM20000

◢ SRX2570608: HAP1

◢ SRX2570609: HAP1

◢ SRX2570610: HAP1

◢ SRX2570611: HAP1

◢ SRX6777953: HAP1

◢ SRX6777954: HAP1

◢ ERX2868714: HEL 92.1.7

◢ SRX1738529: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX995496: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX080351: HL-60

◢ SRX5522009: HUDEP-2

◢ ERX2868732: HuT 78

◢ ERX2868733: HuT 78

◢ ERX2868734: HuT 78

◢ ERX2868735: HuT 78

◢ ERX2868794: Jurkat

◢ ERX2868800: Jurkat

◢ ERX2868812: Jurkat

◢ ERX2868821: Jurkat

◢ SRX003798: Jurkat

◢ SRX1030324: Jurkat

◢ SRX3927313: Jurkat

◢ SRX6578937: Jurkat

◢ SRX6578938: Jurkat

◢ ERX2868715: K-562

◢ ERX2868716: K-562

◢ SRX031247: K-562

◢ SRX038622: K-562

◢ SRX038623: K-562

◢ SRX067470: K-562

◢ SRX080353: K-562

◢ SRX080396: K-562

◢ SRX103010: K-562

◢ SRX1091813: K-562

◢ SRX1091816: K-562

◢ SRX150487: K-562

◢ SRX190276: K-562

◢ SRX2442513: K-562

◢ SRX2442515: K-562

◢ SRX5848165: K-562

◢ SRX5848166: K-562

◢ SRX5848167: K-562

◢ SRX5848171: K-562

◢ SRX5848172: K-562

◢ SRX5848173: K-562

◢ SRX5848174: K-562

◢ SRX5848175: K-562

◢ SRX5848176: K-562

◢ SRX5848177: K-562

◢ SRX5848178: K-562

◢ SRX5848179: K-562

◢ SRX5848180: K-562

◢ SRX5848181: K-562

◢ SRX5848182: K-562

◢ SRX5848183: K-562

◢ SRX5974511: K-562

◢ SRX5974512: K-562

◢ SRX5974527: K-562

◢ SRX5974528: K-562

◢ SRX5974543: K-562

◢ SRX5974544: K-562

◢ SRX5974559: K-562

◢ SRX5974560: K-562

◢ SRX5974575: K-562

◢ SRX5974576: K-562

◢ SRX6828388: K-562

◢ SRX6828389: K-562

◢ SRX6828391: K-562

◢ SRX6828392: K-562

◢ SRX6828393: K-562

◢ SRX7202559: K-562

◢ SRX7202560: K-562

◢ SRX7202562: K-562

◢ SRX974395: K-562

◢ SRX4890466: Kasumi-1

◢ SRX4890467: Kasumi-1

◢ SRX5883947: KMS-11

◢ ERX2868801: KU812

◢ ERX2868814: KU812

◢ SRX7396397: Leukemia cell line

◢ SRX7396398: Leukemia cell line

◢ SRX356482: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX356483: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX356484: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX356545: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX356546: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX356547: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX356712: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX356713: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX356714: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX356730: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX356731: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX356732: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX356748: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX356749: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX356750: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX356766: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX356767: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX356768: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX4288471: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX4288472: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX4288473: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX4288474: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX4288475: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX4288476: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX8841617: Lymphoblasts

◢ SRX8841619: Lymphoblasts

◢ SRX8841621: Lymphoblasts

◢ SRX8841623: Lymphoblasts

◢ SRX092414: Lymphoma, B-Cell

◢ SRX092416: Lymphoma, B-Cell

◢ SRX212319: Macrophages

◢ SRX4001754: Macrophages

◢ SRX4001755: Macrophages

◢ SRX4001756: Macrophages

◢ SRX4001757: Macrophages

◢ SRX4001758: Macrophages

◢ SRX4001759: Macrophages

◢ SRX4001760: Macrophages

◢ SRX4001761: Macrophages

◢ SRX4521396: Macrophages

◢ SRX4521397: Macrophages

◢ SRX4521398: Macrophages

◢ ERX2868717: MEG-01

◢ SRX219373: MM.1S

◢ SRX3927299: MOLM-13

◢ SRX212318: Monocytes

◢ SRX186704: Monocytes-CD14+

◢ SRX356784: MS1

◢ SRX356785: MS1

◢ SRX356786: MS1

◢ SRX356787: MS1

◢ SRX5883948: Multiple Myeloma

◣ SRX5883949: Multiple Myeloma

◢ SRX5883950: Multiple Myeloma

◢ SRX5883951: Multiple Myeloma

◢ SRX5883952: Multiple Myeloma

◢ ERX2868777: NAMALWA

◢ ERX2868782: NAMALWA

◢ SRX199871: NB-4

◢ SRX5391686: Neutrophils

◢ SRX5391687: Neutrophils

◢ SRX5391688: Neutrophils

◢ SRX5391689: Neutrophils

◢ SRX5391690: Neutrophils

◢ SRX5391691: Neutrophils

◢ ERX2868752: RAJI

◢ ERX2868813: RAJI

◢ ERX2868761: RAMOS

◢ ERX2868778: RAMOS

◢ SRX4484978: SEM

◢ SRX6578934: T-ALL

◢ SRX6578935: T-ALL

◢ ERX2868668: THP-1

◢ ERX2868669: THP-1

◢ ERX2868670: THP-1

◢ ERX2868671: THP-1

◢ ERX2868672: THP-1

◢ ERX2868673: THP-1

◢ ERX2868692: THP-1

◢ ERX2868693: THP-1

◢ ERX2868694: THP-1

◢ ERX2868695: THP-1

◢ ERX2868696: THP-1

◢ ERX2868697: THP-1

◢ SRX1063404: THP-1

◢ SRX1063405: THP-1

◢ SRX1744956: THP-1

◢ SRX1744957: THP-1

◢ SRX1744958: THP-1

◢ SRX1744959: THP-1

◢ SRX1744960: THP-1

◢ SRX1744961: THP-1

◢ SRX2655459: THP-1

◢ SRX2655460: THP-1

◢ SRX2655461: THP-1

◢ SRX2655462: THP-1

◢ SRX4001833: THP-1

◢ SRX4001834: THP-1

◢ SRX4001879: THP-1

◢ SRX4001880: THP-1

◢ SRX4001881: THP-1

◢ SRX4001882: THP-1

◢ SRX4001883: THP-1

◢ SRX4001884: THP-1

◢ SRX4001885: THP-1

◢ SRX4001886: THP-1

◢ SRX4001887: THP-1

◢ SRX4001888: THP-1

◢ SRX4001889: THP-1

◢ SRX4001915: THP-1

◢ SRX4001916: THP-1

◢ SRX4001917: THP-1

◢ SRX4001918: THP-1

◢ SRX4001919: THP-1

◢ SRX4001920: THP-1

◢ SRX4001921: THP-1

◢ SRX4001922: THP-1

◢ SRX4001923: THP-1

◢ SRX4001924: THP-1

◢ SRX4001925: THP-1

◢ SRX4001946: THP-1

◢ SRX4001947: THP-1

◢ SRX476480: THP-1

◢ ERX2868768: Toledo

◢ ERX2868811: Toledo

◢ DRX044425: T cells

◢ DRX044426: T cells

◢ SRX1425808: T cells

◢ SRX1425809: T cells

◢ SRX6578928: T cells

◢ SRX6578929: T cells

◢ CTCF: STRING

Multiple Myeloma
 SRX5883949
CTCF
THP-1
 SRX4001885
CTCF
THP-1
 SRX4001880
CTCF
THP-1
 SRX4001887
CTCF
THP-1
 SRX4001881
CTCF
GM12878
 SRX038504
CTCF
THP-1
 SRX4001886
CTCF
THP-1
 SRX4001888
CTCF
THP-1
 SRX4001882
CTCF
THP-1
 SRX4001879
CTCF
K-562
 SRX5974560
CTCF
Macrophages
 SRX4001754
CTCF
THP-1
 SRX4001884
CTCF
K-562
 SRX5848175
CTCF
K-562
 SRX5848167
CTCF
K-562
 SRX5848183
CTCF
THP-1
 SRX4001889
CTCF
K-562
 SRX7202562
CTCF
HAP1
 SRX2570608
CTCF
K-562
 SRX5848173
CTCF
HAP1
 SRX2570609
CTCF
K-562
 SRX5974559
CTCF
K-562
 SRX5848181
CTCF
HAP1
 SRX2570610
CTCF
HL-60
 SRX080351
CTCF
K-562
 SRX5848166
CTCF
THP-1
 SRX476480
CTCF
THP-1
 SRX4001834
CTCF
THP-1
 SRX4001833
CTCF
K-562
 SRX5848171
CTCF
K-562
 SRX5848172
CTCF
GM18505
 SRX356562
CTCF
K-562
 SRX5848176
CTCF
Macrophages
 SRX4001756
CTCF
K-562
 SRX7202559
CTCF
K-562
 SRX5848179
CTCF
Macrophages
 SRX4001760
CTCF
GM12865
 SRX199864
CTCF
HuT 78
 ERX2868733
CTCF
K-562
 SRX5848178
CTCF
K-562
 SRX6828391
CTCF
K-562
 SRX5848177
CTCF
K-562
 SRX6828389
CTCF
<