ChIP-Atlas: Colocalization analysis

Colocalization analysis for RAD21

Query protein: RAD21
Cell class: Blood
Sort key: SRX5391682 | Neutrophils
 
Color legends
ChIP-seq data:  H-H H-M M-M H-L M-L L-L N.D. Same  (Peak intensities are High, Middle or Low)

STRING data:  1000 750 500 250 0 N.D.  (Values = STRING's binding scores)

Downloads: TSV (text), GML (Cytoscape)
Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Colocalization
Cell types  Exp. IDs RAD21's Colocalization partners

◢ RAD21: Average

◢ SRX100461: GM12878

◢ SRX150412: GM12878

◢ SRX6777951: HAP1

◢ SRX6777952: HAP1

◢ SRX100492: K-562

◢ SRX150399: K-562

◢ SRX7202561: K-562

◢ SRX8841625: Lymphoblasts

◢ SRX8841627: Lymphoblasts

◢ SRX8841629: Lymphoblasts

◢ SRX8841631: Lymphoblasts

◢ SRX4001762: Macrophages

◢ SRX4001763: Macrophages

◢ SRX4001764: Macrophages

◢ SRX4001765: Macrophages

◢ SRX5883959: Multiple Myeloma

◢ SRX5883960: Multiple Myeloma

◢ SRX5883961: Multiple Myeloma

◢ SRX5883962: Multiple Myeloma

◣ SRX5391682: Neutrophils

◢ SRX5391683: Neutrophils

◢ SRX5391684: Neutrophils

◢ SRX5391685: Neutrophils

◢ SRX7083410: RAMOS

◢ SRX4001823: THP-1

◢ SRX4001824: THP-1

◢ SRX4001825: THP-1

◢ SRX4001826: THP-1

◢ SRX4001827: THP-1

◢ SRX4001868: THP-1

◢ SRX4001869: THP-1

◢ SRX4001870: THP-1

◢ SRX4001871: THP-1

◢ SRX4001872: THP-1

◢ SRX4001873: THP-1

◢ SRX4001874: THP-1

◢ SRX4001875: THP-1

◢ SRX4001876: THP-1

◢ SRX4001877: THP-1

◢ SRX4001878: THP-1

◢ SRX4001904: THP-1

◢ SRX4001905: THP-1

◢ SRX4001906: THP-1

◢ SRX4001907: THP-1

◢ SRX4001908: THP-1

◢ SRX4001909: THP-1

◢ SRX4001910: THP-1

◢ SRX4001911: THP-1

◢ SRX4001912: THP-1

◢ SRX4001913: THP-1

◢ SRX4001914: THP-1

◢ SRX4001942: THP-1

◢ SRX4001943: THP-1

◢ SRX4001944: THP-1

◢ SRX4001945: THP-1

◢ SRX476481: THP-1

◢ RAD21: STRING
Neutrophils
  SRX5391682
RAD21
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cells
  SRX151229
SMC1A
 ↻ ≫
Hematopoietic Stem Cells
  SRX995497
STAG1
 ↻ ≫
Hematopoietic Stem Cells
  SRX1738530
STAG1
 ↻ ≫
Erythroid Cells
  SRX995500
CTCF
 ↻ ≫
Kasumi-1
  SRX4890467
CTCF
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX4521396
CTCF
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356546
CTCF
 ↻ ≫
T cells
  SRX1425809
CTCF
 ↻ ≫
TF-1
  SRX1261519
GATA2
 ↻ ≫
GM12878
  SRX038505
CTCF
 ↻ ≫
CD4+ T cells
  SRX003794
CTCF
 ↻ ≫
Lymphoblasts
  SRX8841631
RAD21
 ↻ ≫
Lymphoblasts
  SRX8841627
RAD21
 ↻ ≫
Neutrophils
  SRX5391683
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX476481
RAD21
 ↻ ≫
Neutrophils
  SRX5391688
CTCF
 ↻ ≫
Neutrophils
  SRX5391686
CTCF
 ↻ ≫
Neutrophils
  SRX5391684
RAD21
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX4001756
CTCF
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX4001758
CTCF
 ↻ ≫
K-562
  SRX2442515
CTCF
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX4521398
CTCF
 ↻ ≫
K-562
  SRX6913081
BRD4
 ↻ ≫
Erythroid Cells
  SRX1738532
STAG1
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX4001759
CTCF
 ↻ ≫
Neutrophils
  SRX5391687
CTCF
 ↻ ≫
CD34+
  SRX6902859
CTCF
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX4001755
CTCF
 ↻ ≫
Neutrophils
  SRX5391689
CTCF
 ↻ ≫
T cells
  SRX1425808
CTCF
 ↻ ≫
Hematopoietic Stem Cells
  SRX1738529
CTCF
 ↻ ≫
Erythroblasts
  SRX4046310
KDM6A
 ↻ ≫
Neutrophils
  SRX5391679
SMC3
 ↻ ≫
Neutrophils
  SRX5391680
SMC3
 ↻ ≫
Neutrophils
  SRX5391691
CTCF
 ↻ ≫
Neutrophils
  SRX5391681
SMC3
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX2770860
SMC1A
 ↻ ≫
K-562
  SRX150390
SMC3
 ↻ ≫
MS1
  SRX356806
STAG1
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356729
STAG1
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356728
STAG1
 ↻ ≫
GM19240
  SRX356711
STAG1
 ↻ ≫
GM19239
  SRX356687
STAG1
 ↻ ≫
GM19193
  SRX356645
STAG1
 ↻ ≫
GM19193
  SRX356644
STAG1
 ↻ ≫
GM19099
  SRX356628
STAG1
 ↻ ≫
GM19099
  SRX356627
STAG1
 ↻ ≫
GM18951
  SRX356611
STAG1
 ↻ ≫
GM18951
  SRX356610
STAG1
 ↻ ≫
GM18526
  SRX356594
STAG1
 ↻ ≫
GM18526
  SRX356593
STAG1
 ↻ ≫
GM18505
  SRX356577
STAG1
 ↻ ≫
GM18505
  SRX356576
STAG1
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356560
STAG1
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356500
STAG1
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356499
STAG1
 ↻ ≫
GM12878
  SRX356480
STAG1
 ↻ ≫
GM10847
  SRX356454
STAG1
 ↻ ≫
GM10847
  SRX356453
STAG1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570929
HAP1
 ↻ ≫
Kasumi-1
  SRX4890466
CTCF
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX4288471
CTCF
 ↻ ≫
THP-1
  SRX2655462
CTCF
 ↻ ≫
THP-1
  SRX2655461
CTCF
 ↻ ≫
THP-1
  SRX2655459
CTCF
 ↻ ≫
THP-1
  SRX1744960
CTCF
 ↻ ≫
THP-1
  SRX1744958
CTCF
 ↻ ≫
TF-1
  SRX1261518
GATA2
 ↻ ≫
CD34 Hematopoietic stem cells
  SRX097072
SMAD1
 ↻ ≫
Lymphoblasts
  SRX8841629
RAD21
 ↻ ≫
Lymphoblasts
  SRX8841625
RAD21
 ↻ ≫
K-562
  SRX7202561
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001912
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001911
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001910
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001909
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001908
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001878
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001876
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001875
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001874
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001873
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001872
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001871
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001869
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001868
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001825
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001824
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001823
RAD21
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX4001765
RAD21
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX4001764
RAD21
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX4001763
RAD21
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX4001762
RAD21
 ↻ ≫
K-562
  SRX150399
RAD21
 ↻ ≫
Neutrophils
  SRX5391685
RAD21
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX4001757
CTCF
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX4001760
CTCF
 ↻ ≫
Lymphoma, B-Cell
  SRX092416
CTCF
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX2770858
SMC1A
 ↻ ≫
Erythroid Cells
  SRX995501
STAG1
 ↻ ≫
BLaER1
  SRX7396395
CTCF
 ↻ ≫
Neutrophils
  SRX5391690
CTCF
 ↻ ≫
K-562
  SRX2442513
CTCF
 ↻ ≫
BLaER1
  SRX7396396
CTCF
 ↻ ≫
Lymphoblasts
  SRX8841617
CTCF
 ↻ ≫
CD36+
  SRX037936
CTCF
 ↻ ≫
CD34+
  SRX6902858
CTCF
 ↻ ≫
GM13976
  SRX188962
CTCF
 ↻ ≫
K-562
  SRX080396
CTCF
 ↻ ≫
K-562
  SRX038623
CTCF
 ↻ ≫
CD36+
  SRX037937
CTCF
 ↻ ≫
GM12878
  SRX080367
CTCF
 ↻ ≫
BCBL1
  SRX151246
SMC1A
 ↻ ≫
GM12864
  SRX080425
CTCF
 ↻ ≫
GM12865
  SRX080403
CTCF
 ↻ ≫
GM12873
  SRX080349
CTCF
 ↻ ≫
Hematopoietic Stem Cells
  SRX995496
CTCF
 ↻ ≫
BLaER1
  SRX7396390
CTCF
 ↻ ≫
T-ALL
  SRX6578935
CTCF
 ↻ ≫
T-ALL
  SRX6578934
CTCF
 ↻ ≫
CUTLL1
  SRX6578944
CTCF
 ↻ ≫
CUTLL1
  SRX6578943
CTCF
 ↻ ≫
T cells
  SRX6578928
CTCF
 ↻ ≫
CUTLL1
  SRX6578948
CTCF
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX6578937
CTCF
 ↻ ≫
CUTLL1
  SRX6578947
CTCF
 ↻ ≫
CUTLL1
  SRX6578941
CTCF
 ↻ ≫
CUTLL1
  SRX6578940
CTCF
 ↻ ≫
GM12874
  SRX080420
CTCF
 ↻ ≫
GM12875
  SRX080333
CTCF
 ↻ ≫
CUTLL1
  SRX6578946
CTCF
 ↻ ≫
CUTLL1
  SRX6578942
CTCF
 ↻ ≫
EOL-1
  SRX3927286
BRD9
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX4288473
CTCF
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX4521397
CTCF
 ↻ ≫
Lymphoblasts
  SRX8841619
CTCF
 ↻ ≫
Lymphoblasts
  SRX8841621
CTCF
 ↻ ≫
Lymphoblasts
  SRX8841623
CTCF
 ↻ ≫
Leukemia cell line
  SRX7396398
CTCF
 ↻ ≫
GM12878
  SRX2458136
SMC1A
 ↻ ≫
GM12878
  SRX2458135
SMC1A
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150456
SMC3
 ↻ ≫
MS1
  SRX356805
STAG1
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356783
STAG1
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356782
STAG1
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356765
STAG1
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356764
STAG1
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356747
STAG1
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356746
STAG1
 ↻ ≫
GM19240
  SRX356710
STAG1
 ↻ ≫
GM19239
  SRX356688
STAG1
 ↻ ≫
GM19238
  SRX356666
STAG1
 ↻ ≫
GM19238
  SRX356665
STAG1
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356559
STAG1
 ↻ ≫
GM12892
  SRX356544
STAG1
 ↻ ≫
GM12892
  SRX356543
STAG1
 ↻ ≫
GM12891
  SRX356522
STAG1
 ↻ ≫
GM12891
  SRX356521
STAG1
 ↻ ≫
GM12878
  SRX356481
STAG1
 ↻ ≫
GM12878
  SRX356479
STAG1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570949
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570947
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570945
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570943
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570941
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570939
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570937
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570935
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570932
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570931
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570927
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570925
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570923
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570921
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570919
HAP1
 ↻ ≫
Multiple Myeloma
  SRX5883951
CTCF
 ↻ ≫
K-562
  SRX5848173
CTCF
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356732
CTCF
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356484
CTCF
 ↻ ≫
THP-1
  SRX2655460
CTCF
 ↻ ≫
HAP1
  SRX6777951
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001945
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001944
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001943
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001942
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001914
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001913
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001907
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001906
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001905
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001904
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001877
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001870
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001827
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001826
RAD21
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150412
RAD21
 ↻ ≫
K-562
  SRX5974560
CTCF
 ↻ ≫
K-562
  SRX5974527
CTCF
 ↻ ≫
GM12878
  SRX100461
RAD21
 ↻ ≫
K-562
  SRX5974559
CTCF
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570948
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570946
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570924
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570922
HAP1
 ↻ ≫
K-562
  SRX7202562
CTCF
 ↻ ≫
K-562
  SRX6828392
CTCF
 ↻ ≫
K-562
  SRX6828391
CTCF
 ↻ ≫
Multiple Myeloma
  SRX5883952
CTCF
 ↻ ≫
Multiple Myeloma
  SRX5883950
CTCF
 ↻ ≫
K-562
  SRX5848183
CTCF
 ↻ ≫
K-562
  SRX5848175
CTCF
 ↻ ≫
K-562
  SRX5848171
CTCF
 ↻ ≫
K-562
  SRX5848167
CTCF
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001947
CTCF
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001886
CTCF
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001834
CTCF
 ↻ ≫
MS1
  SRX356787
CTCF
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356768
CTCF
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356750
CTCF
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356714
CTCF
 ↻ ≫
GM19193
  SRX356629
CTCF
 ↻ ≫
GM19099
  SRX356613
CTCF
 ↻ ≫
GM19099
  SRX356612
CTCF
 ↻ ≫
GM18951
  SRX356595
CTCF
 ↻ ≫
GM18526
  SRX356579
CTCF
 ↻ ≫
GM18526
  SRX356578
CTCF
 ↻ ≫
GM18505
  SRX356561
CTCF
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356547
CTCF
 ↻ ≫
GM10847
  SRX356437
CTCF
 ↻ ≫
THP-1
  SRX1744961
CTCF
 ↻ ≫
THP-1
  SRX1744959
CTCF
 ↻ ≫
THP-1
  SRX1744957
CTCF
 ↻