ChIP-Atlas: Colocalization analysis

Colocalization analysis for TP53

Query protein: TP53
Cell class: Digestive tract
Sort key: SRX5313217 | HCT 116
 
Color legends
ChIP-seq data:  H-H H-M M-M H-L M-L L-L N.D. Same  (Peak intensities are High, Middle or Low)

STRING data:  1000 750 500 250 0 N.D.  (Values = STRING's binding scores)

Downloads: TSV (text), GML (Cytoscape)
Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Colocalization
Cell types  Exp. IDs TP53's Colocalization partners

◢ TP53: Average

◢ SRX1384027: HCT 116

◢ SRX1384028: HCT 116

◢ SRX2060918: HCT 116

◢ SRX2060919: HCT 116

◢ SRX2940755: HCT 116

◢ SRX3962719: HCT 116

◢ SRX3962720: HCT 116

◢ SRX3962721: HCT 116

◢ SRX3962722: HCT 116

◢ SRX3962723: HCT 116

◢ SRX5313202: HCT 116

◢ SRX5313203: HCT 116

◢ SRX5313204: HCT 116

◢ SRX5313212: HCT 116

◢ SRX5313213: HCT 116

◢ SRX5313215: HCT 116

◢ SRX5313216: HCT 116

◣ SRX5313217: HCT 116

◢ SRX5313228: HCT 116

◢ SRX5313229: HCT 116

◢ SRX5313230: HCT 116

◢ SRX5313231: HCT 116

◢ SRX5313232: HCT 116

◢ SRX5313233: HCT 116

◢ SRX5394956: HCT 116

◢ SRX612780: HCT 116

◢ SRX672731: HCT 116

◢ SRX672732: HCT 116

◢ ERX159257: LoVo

◢ ERX159258: LoVo

◢ ERX159259: LoVo

◢ SRX3102568: SW 480

◢ SRX3102569: SW 480

◢ SRX4235879: SW 480

◢ SRX4235880: SW 480

◢ TP53: STRING

HCT 116
 SRX5313217
TP53
HCT 116
 SRX3962721
TP53
HCT 116
 SRX5313210
EP300
HCT 116
 SRX5313204
TP53
HCT 116
 SRX5123054
POU2F1
HCT 116
 SRX5313233
TP53
HCT 116
 SRX3962722
TP53
HCT 116
 SRX5313203
TP53
HCT 116
 SRX5313216
TP53
HCT 116
 SRX5313232
TP53
HCT 116
 SRX2060919
TP53
SW 480
 SRX3680730
BRD4
SW 480
 SRX679419
PROX1
SW 480
 SRX4235878
KMT2D
SW 480
 SRX3680731
BRD4
HCT 116
 SRX190303
JUND
HCT 116
 SRX094469
TCF7L2
HCT 116
 SRX3962720
TP53
SW 480
 SRX3102569
TP53
HCT 116
 SRX1066865
BANP
HCT 116
 SRX1066863
BANP
HCT 116
 SRX1384025
ATF3
SW 480
 SRX3394271
FOXA2
HCT 116
 SRX190228
TEAD4
HCT 116
 SRX190214
CBX3
HCT 116
 SRX190212
FOSL1
HCT 116
 DRX021120
MBD4
HCT 116
 DRX021119
MBD2
HCT 116
 DRX021118
MBD1
SW 480
 SRX4235880
TP53
SW 480
 SRX4235879
TP53
HCT 116
 SRX1384027
TP53
HCT 116
 SRX190213
ATF3
HCT 116
 SRX190308
CEBPB
HCT 116
 SRX190292
USF1
HCT 116
 SRX190361
SIN3A
HCT 116
 SRX5313202
TP53
HCT 116
 SRX1177906
CDK9
Colonic organoids
 SRX3417626
VDR
LoVo
 SRX359886
ETV5
HCT 116
 SRX190221
ELF1
HCT 116
 SRX149660
CDK8
LoVo
 SRX359884
E2F3
HCT 116
 SRX100399
YY1
HCT 116
 SRX3189055
APC
HCT 116
 SRX1384028
TP53
HCT 116
 SRX5313208
EP300
HCT 116
 SRX190358
SP1
HCT 116
 SRX8155176
MED1
DLD-1
 SRX7677725
NELFCD
HCT 116
 SRX5486445
ZIC2
HCT 116
 SRX5486444
ZIC2
HCT 116
 SRX5486434
ZIC5
HCT 116
 SRX5486425
ZIC5
HCT 116
 SRX5486413
ZIC5
SW 480
 SRX398302
CDK8
LoVo
 SRX359960
TAL1
LoVo
 SRX2654818
CTCF
HCT 116
 SRX190360
MAX
HCT 116
 SRX190307
SRF
HCT 116
 SRX190302
EGR1
SNU-1750
 SRX1892836
ELF1
HT-29
 SRX1538804
JUND
HT-29
 SRX1538763
NR1H3
HT-29
 SRX1538760
NR1H3
HCT 116
 SRX1078848
ELL2
HCT 116
 SRX1078847
ELL2
HCT 116
 SRX1078846
ELL2
HCT 116
 SRX1078841
AFF4
HCT 116
 SRX1078839
AFF4
HCT 116
 SRX5394956
TP53
HCT 116
 SRX5313213
TP53
LoVo
 SRX359947
NPAT
HCT 116
 SRX3566190
TEAD1
HCT 116
 SRX3566180
TEAD1
HCT 116
 SRX6384755
MED26
HCT 116
 SRX672731
TP53
HCT 116
 SRX2060918
TP53
HCT 116
 SRX113706
SP1
LoVo
 SRX359880
ATF2
LoVo
 SRX359899
JUN
NCI-N87
 SRX2267452
BRD4
NCI-N87
 SRX2267450
BRD4
COLO 741
 SRX1272808
BRD4
KATO III
 SRX367644
KLF5
LoVo
 SRX359916
RELA
SW 480
 SRX3102571
RELA
LS-180
 SRX096350
TCF4
HCT 116
 SRX748427
TCF7L2
HCT 116
 SRX6384758
RAD21
DKO
 SRX5880871
RAD21
DKO
 SRX5880870
SMC1A
DKO
 SRX5880869
CTCF
HCT 116
 SRX5880865
RAD21
HCT 116
 SRX5880864
SMC1A
HCT 116
 SRX5880863
CTCF
GP5d
 SRX360581
SMC3
GP5d
 SRX360578
RAD21
GP5d
 SRX360568
CTCF
LoVo
 SRX359970
RAD21
LoVo
 SRX359892
HOXA4
LoVo
 SRX359887
GLI2
HCT 116
 SRX306184
ICE1
HCT 116
 SRX306181
ICE1
HCT 116
 SRX2064717
RAD21
HCT 116
 SRX2064716
RAD21
HCT 116
 SRX2064715
RAD21
HCT 116
 SRX2064714
RAD21
HCT 116
 SRX199880
CTCF
HCT 116
 SRX199879
CTCF
HCT 116
 SRX190359
CTCF
HCT 116
 SRX190304
RAD21
COLO 829
 SRX1801655
CTCF
COLO 829
 SRX1801654
CTCF
HT-29
 SRX1538803
JUND
HT-29
 SRX1538766
PPARG
HT-29
 SRX1538762
NR1H3
HT-29
 SRX1538761
NR1H3
HT-29
 SRX1538759
NR1H2
HT-29
 SRX1538758
NR1H2
HCT 116
 SRX149659
CDK8
HCT 116
 SRX1177905
HEXIM1
LS-180
 SRX096347
CTNNB1
Caco-2
 SRX080411
CTCF
HEEpiC
 SRX080389
CTCF
HEEpiC
 SRX080375
CTCF
Caco-2
 SRX080352
CTCF
DLD-1
 DRX013181
RAD21
DLD-1
 DRX013180
CTCF
HCT 116
 SRX3962723
TP53
HCT 116
 SRX160745
EZH2
HCT 116
 SRX6066505
CDK9
HCT 116
 SRX535181
HSF1
HCT 116
 SRX535179
HSF1
HCT 116
 SRX535178
HSF1
HCT 116
 SRX535176
HSF1
HCT 116
 SRX535174
HSF1
HCT 116
 SRX535173
HSF1
HCT 116
 SRX8155175
MED1
HCT 116
 SRX8155174
MED1
Colonic organoids
 SRX3417630
VDR
HT-29
 SRX768290
SOX9
DLD-1
 SRX7677728
NELFE
DLD-1
 SRX7677726
NELFCD
DKO
 SRX6680411
CBX5
HCT 116
 SRX6384785
MED26
HCT 116
 SRX6384757
RAD21
HCT 116
 SRX5486414
ZIC5
LoVo
 SRX360020
CTCF
LoVo
 SRX359859
CTCF
HCT 116
 SRX3566186
TEAD1
HCT 116
 SRX3566182
TEAD1
HCT 116
 SRX3520285
ATR
HCT 116
 SRX3520282
ATR
AGS
 SRX3124572
STAT3
HCT 116
 SRX290521
TET2
HCT 116
 SRX2442516
CTCF
HCT 116
 SRX160744
MTA2
HCT 116
 SRX149661
CDK8
HCT 116
 SRX1078876
PAF1
HCT 116
 SRX1078845
ELL2
HCT 116
 SRX1078842
AFF4
HCT 116
 SRX1078840
AFF4
HCT 116
 SRX7692441
POLR2C
HCT 116
 SRX7692440
POLR2C
HCT 116
 SRX7692437
POLR2C
HCT 116
 SRX7692436
POLR2C
DLD-1
 SRX7677738
NCBP1
DLD-1
 SRX7677729
SUPT5H
DLD-1
 SRX7677724
SUPT5H
DLD-1
 SRX7677723
SUPT5H
DLD-1
 SRX7677721
NELFE
DLD-1
 SRX7677719
NELFCD
HCT 116
 SRX6384756
MED26
HCT 116
 SRX6066513
NELFE
HCT 116
 SRX6066493
POLR2C
HCT 116
 SRX6066492
POLR2C
HCT 116
 SRX6066491
POLR2C
HCT 116
 SRX6066490
POLR2C
HCT 116
 SRX4385550
SUPT5H
KYSE-150
 SRX424010
KDM4C
Colorectal cancer organoid
 SRX3868796
REST
Colorectal cancer organoid
 SRX3868792
REST
HCT 116
 SRX3091912
ZFX
HCT 116
 SRX217738
TAF3
DLD-1
 SRX7677736
NCBP1
DLD-1
 SRX7677730
SUPT5H
DLD-1
 SRX7677727
NELFE
HCT 116
 SRX6384786
MED26
HCT 116
 SRX6066512
NELFE
HCT 116
 SRX6066511
NELFE
HCT 116
 SRX4385551
SUPT5H
SGC-7901
 SRX4964897
ISL1
SGC-7901
 SRX4964896
ISL1
LS-180
 SRX159189
CREBBP
LS-180
 SRX159188
CREBBP
HCT 116
 SRX5313209
EP300
HCT 116
 SRX360377
EP300
HCT 116
 SRX2533037
SIRT1
LoVo
 SRX359956
SP1
LoVo
 SRX359825
FOS
LoVo
 SRX359987
BRCA1
LoVo
 SRX359946
NFYC
LoVo
 SRX359945
NFYB
LoVo
 SRX359910
NFYA
RKO
 SRX286203
BRD1
RKO
 SRX286202
ING5
RKO
 SRX286201
ING2
SW 480
 SRX7100373
KDM1A
SW 480
 SRX7100372
KDM1A
SW 480
 SRX7100371
KDM1A
LoVo
 SRX359974
TFAM
EC109
 SRX8473459
EZH2
Het-1A
 SRX8473458
EZH2
HCT 116
 SRX825988
EZH2
Gastrointestinal Stromal Tumors
 SRX3944344
BRD4
Gastrointestinal Stromal Tumors
 SRX3944342
BRD4
Gastrointestinal Stromal Tumors
 SRX3944340
BRD4
NCI-N87
 SRX2267453
BRD4
NCI-N87
 SRX2267451
BRD4
HCT 116
 SRX1569439
BRD4
HCT 116
 SRX1569438
BRD4
HCT 116
 SRX1569430
BRD4
HCT 116
 SRX1569429
BRD4
LS-180
 SRX1272805
BRD4
SW 480
 SRX1272798
BRD4
HCT-15
 SRX1272794
BRD4
HT-29
 SRX1272786
BRD4
HCT 116
 SRX1272782
BRD4
HCT 116
 SRX1123966
SMARCA4
HCT 116
 SRX1123964
SMARCA4
LoVo
 SRX359849
ID4
HCT 116
 SRX6066504
CDK9
HCT 116
 SRX6066503
CDK9
HCT 116
 SRX6066502
CDK9
HCT 116
 SRX1078844
CDK9
HCT 116
 SRX1078843
CDK9
HCT 116
 SRX1384029
ATF3
HCT 116
 SRX1384026
ATF3
HCT 116
 DRX090760
RAD51
HCT 116
 DRX069273
RAD51
LoVo
 SRX359959
STAT5A
DLD-1
 SRX2744654
STAT5A
DLD-1
 SRX2744652
STAT5A
DLD-1
 SRX2744650
STAT5A
DLD-1
 SRX2744648
STAT5A
DLD-1
 SRX2744646
STAT5A
DLD-1
 SRX2744644
STAT5A
LoVo
 SRX359876
NR4A2
LoVo
 ERX157273
E2F7
LoVo
 SRX359882
CREB1
LoVo
 SRX359911
NR1I2
LoVo
 SRX360048
YBX1
LoVo
 SRX359930
E2F8
Colon cancer
 SRX155776
HSF1
Colon cancer
 SRX155775
HSF1
Colon cancer
 SRX155773
HSF1
Colon cancer
 SRX155772
HSF1
HT-29
 SRX155746
HSF1
HT-29
 SRX155745
HSF1
HCT-15
 SRX155743
HSF1
HCT-15
 SRX155742
HSF1
SW 620
 SRX155740
HSF1
SW 620
 SRX155739
HSF1
TE-5
 SRX7572095
KLF5
ESO-26
 SRX6060974
KLF5
AGS
 SRX367640
KLF5
YCC-3
 SRX367636
KLF5
LoVo
 SRX361890
KLF5
LoVo
 SRX361884
KLF5
GP5d
 SRX360589
KLF5
GP5d
 SRX360575
KLF5
LoVo
 SRX359966
ZBTB33
HCT 116
 SRX100503
ZBTB33
LoVo
 SRX359913
NR4A1
LoVo
 SRX359957
STAT1
AGS
 SRX3124571
STAT1
LoVo
 SRX359840
HNF1B
SW 480
 SRX3102570
RELA
HCT 116
 SRX5123056
POU2F1
HCT 116
 SRX5123055
POU2F1
LoVo
 SRX360045
TOE1
LoVo
 SRX360035
RBPJ
HCT 116
 SRX306176
ELL
LS-180
 SRX096349
TCF4
HCT 116
 SRX8155173
MED1
HCT 116
 SRX4937342
MED1
HCT 116
 SRX4937341
MED1
HCT 116
 SRX4937340
MED1
HCT 116
 SRX4937339
MED1
HCT 116
 SRX4937338
MED1
HCT 116
 SRX4937337
MED1
HCT 116
 SRX4937336
MED1
HCT 116
 SRX4937335
MED1
LS-180
 SRX159191
MED1
LS-180
 SRX159190
MED1
LoVo
 SRX359998
FOXC1
HCT 116
 SRX4107932
SKP2
HCT 116
 SRX4107930
SKP2
Colonic organoids
 SRX3417634
VDR
Colonic organoids
 SRX3417632
VDR
Colonic organoids
 SRX3417631
VDR
Colonic organoids
 SRX3417627
VDR
LS-180
 SRX096344
VDR
LS-180
 SRX096343
VDR
HCT 116
 SRX4937334
KAT2A
HCT 116
 SRX4937333
KAT2A
HCT 116
 SRX4937332
KAT2A
HCT 116
 SRX4937331
KAT2A
HCT 116
 SRX2511892
KAT2B
LoVo
 SRX359951
RUNX1
Caco-2
 SRX986358
HNF1A
DLD-1
 SRX7677763
DCP2
DLD-1
 SRX7677762
DCP2
DLD-1
 SRX7677761
DCP2
DLD-1
 SRX7677760
DCP2
DLD-1
 SRX7677759
XRN2
DLD-1
 SRX7677742
XRN2
DLD-1
 SRX7677741
XRN2
DLD-1
 SRX7677740
XRN2
DLD-1
 SRX7677739
NCBP1
DLD-1
 SRX7677737
NCBP1
DLD-1
 SRX7677722
NELFE
DLD-1
 SRX7677720
NELFCD
TE-5
 SRX7572085
SREBF1
KYSE-150
 SRX7572083
SREBF1
HCT 116
 SRX748434
HNF4A
HCT 116
 SRX748433
HNF4A
HCT 116
 SRX748430
TCF7L2
HCT 116
 SRX748429
TCF7L2
HCT 116
 SRX748428
TCF7L2
HCT 116
 SRX748426
HNF4A
HCT 116
 SRX748425
HNF4A
HCT 116
 SRX748424
TCF7L2