ChIP-Atlas: Colocalization analysis

Colocalization analysis for CDK9

Query protein: CDK9
Cell class: Blood
Sort key: SRX203391 | Plasma Cells
 
Color legends
ChIP-seq data:  H-H H-M M-M H-L M-L L-L N.D. Same  (Peak intensities are High, Middle or Low)

STRING data:  1000 750 500 250 0 N.D.  (Values = STRING's binding scores)

Downloads: TSV (text), GML (Cytoscape)
Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Colocalization
Cell types  Exp. IDs CDK9's Colocalization partners

◢ CDK9: Average

◢ SRX244177: MM.1S

◢ SRX244180: MM.1S

◢ SRX327758: MM.1S

◢ SRX327759: MM.1S

◢ SRX447603: MM.1S

◢ SRX1735799: MOLM-13

◢ SRX1735800: MOLM-13

◢ SRX1637467: MOLT-4

◢ SRX1637469: MOLT-4

◢ SRX1637470: MOLT-4

◢ SRX2375362: MV-4-11

◢ SRX2375366: MV-4-11

◢ SRX148962: P493-6

◢ SRX148963: P493-6

◢ SRX148964: P493-6

◢ SRX203390: Plasma Cells

◣ SRX203391: Plasma Cells

◢ SRX728779: THP-1

◢ SRX728780: THP-1

◢ CDK9: STRING

Plasma Cells
 SRX203391
CDK9
Jurkat
 SRX2711485
USP7
MM.1S
 SRX327759
CDK9
K-562
 SRX100487
ETS1
HPB-ALL
 SRX159138
NOTCH1
Jurkat
 SRX1880278
BRD4
SEM
 SRX4484986
ELF1
Jurkat
 SRX326888
GABPA
Jurkat
 SRX326887
GABPA
CD4+ T cells
 SRX6913099
BRD4
Jurkat
 SRX2711484
USP7
CUTLL1
 SRX3433645
USP7
HL-60
 SRX190278
GABPA
MM.1S
 SRX244178
MED1
MM.1S
 SRX244177
CDK9
MM.1S
 SRX204906
MED1
T-ALL
 SRX7750230
YY1
MM.1S
 SRX244180
CDK9
K-562
 SRX186630
HCFC1
GM12878
 SRX100541
ELF1
Erythroblasts
 SRX4046306
HCFC1
MM.1S
 SRX327755
MED1
MM.1S
 SRX204905
BRD4
P493-6
 SRX1539275
MYC
Erythroblasts
 SRX4046302
CXXC1
Erythroblasts
 SRX646135
NFE2
GM12878
 SRX475760
GABPA
GM12878
 SRX475759
GABPA
GM12878
 SRX475757
GABPA
GM12878
 SRX475743
GABPA
GM12878
 SRX190216
CREB1
GM12878
 SRX150510
MXI1
Erythroblasts
 SRX1089829
NFE2
K-562
 SRX100570
SIN3A
K-562
 SRX100539
ELF1
CUTLL1
 SRX3433644
USP7
MM.1S
 SRX204902
BRD4
P493-6
 SRX204413
MAX
P493-6
 SRX129083
MAX
P493-6
 SRX129082
MAX
NB-4
 SRX150722
MYC
K-562
 SRX150678
MYC
K-562
 SRX150627
MYC
K-562
 SRX150595
MYC
RAJI
 SRX1497394
MYC
Multiple Myeloma
 SRX129116
MYC
K-562
 SRX103009
MYC
K-562
 SRX6913086
BRD3
Jurkat
 SRX3934088
INTS13
NAMALWA
 SRX389278
NRF1
MM.1S
 SRX1726514
TFDP1
K-562
 SRX150628
IRF1
GM12878
 SRX150597
MAX
GM12878
 SRX150389
NRF1
P493-6
 SRX129084
MAX
K-562
 SRX100425
ATF3
HL-60
 SRX3934087
INTS13
THP-1
 SRX6913048
BRD4
MM.1S
 SRX366792
BRD3
HL-60
 SRX3345955
INTS13
P493-6
 SRX204410
BRD4
MOLM-14
 SRX1287852
BRD4
MM.1S
 SRX1726515
E2F1
MM.1S
 SRX327756
MED1
GM12878
 SRX150411
SIN3A
P493-6
 SRX129066
MYC
K-562
 SRX150424
MAX
HL-60
 SRX3345956
INTS13
HL-60
 SRX3345954
INTS13
HL-60
 SRX3345953
INTS13
B-CLL cells
 SRX3591432
BRD4
MM.1S
 SRX264460
BRD4
K-562
 SRX186641
SAP30
K-562
 SRX116422
HDAC1
Erythroid Cells
 SRX1042049
USF1
P493-6
 SRX129068
MYC
BL-41
 SRX095396
MYC
K-562
 SRX186644
HDAC1
MM.1S
 SRX2140207
HDAC1
Kasumi-1
 SRX1514285
HDAC1
B-CLL cells
 SRX3591435
BRD4
B-CLL cells
 SRX3591438
BRD4
RAJI
 SRX1497384
MYC
MM.1S
 SRX219372
BRD4
MM.1S
 SRX204903
BRD4
MM.1S
 SRX203396
MED1
K-562
 SRX150490
MYC
P493-6
 SRX5307507
MAX
RAMOS
 SRX5346116
MYC
P493-6
 SRX353809
MYC
K-562
 SRX150545
MYC
K-562
 SRX015142
MYC
K-562
 SRX150676
E2F6
GM12878
 SRX150637
USF2
K-562
 SRX100514
E2F6
HL-60
 SRX3345958
INTS13
RAMOS
 SRX5346117
MYC
B-CLL cells
 SRX3591429
BRD4
P493-6
 SRX542554
MYC
RAMOS
 SRX5346120
MYC
RAMOS
 SRX5346119
MYC
RAMOS
 SRX5346118
MYC
P493-6
 SRX204411
MYC
Jurkat
 SRX1880279
MYC
P493-6
 SRX1539276
MYC
K-562
 SRX150507
MYC
K-562
 SRX080157
MYC
K-562
 SRX080156
MYC
P493-6
 SRX5307508
MAX
K-562
 SRX3768262
PLAG1
K-562
 SRX3768261
PLAG1
NB-4
 SRX150723
MAX
K-562
 SRX150695
BHLHE40
K-562
 SRX150618
MAX
K-562
 SRX150576
MXI1
GM12878
 SRX150509
BHLHE40
Multiple Myeloma
 SRX129093
MAX
K-562
 SRX100568
MAX
K-562
 SRX100486
USF1
GM12878
 SRX100392
USF1
GM12878
 SRX082164
MAX
K-562
 SRX059373
E2F6
GM12878
 SRX100555
ETS1
Jurkat (Clone E6-1)
 SRX015825
ETS1
MM.1S
 SRX327758
CDK9
OCI-LY1
 SRX398294
MED1
MM.1S
 SRX327757
MED1
OCI-LY1
 SRX275409
E2F1
MOLM-14
 SRX1287854
BRD4
MM.1S
 SRX264464
CDK7
MM.1S
 SRX264462
CDK7
Jurkat
 SRX1880280
CDK7
Akata
 SRX2795371
BRD4
Lymphoblastoid cells
 SRX151230
NIPBL
K-562
 SRX150679
E2F4
MM.1S
 SRX2140216
CCND2
THP-1
 SRX6913062
BRD4
OCI-LY-10
 SRX347421
STAT3
RAJI
 SRX1497396
E2F1
K-562
 SRX116447
SAP30
MM.1S
 SRX204901
BRD4
SU-DHL-2
 SRX347426
STAT3
Plasma Cells
 SRX203388
BRD4
Multiple Myeloma
 SRX327761
BRD4
GM12878
 SRX082165
MYC
MM.1S
 SRX264458
MED1
Mutu
 SRX2795364
BRD4
P493-6
 SRX542553
MYC
RAMOS
 SRX5346121
MYC
P493-6
 SRX5307511
MYC
GEN2.2
 SRX1073586
MYC
GM12878
 SRX102989
MYC
RAMOS
 SRX095397
MYC
K-562
 SRX080155
MYC
P493-6
 SRX5307506
MAX
HL-60
 SRX3345957
INTS13
OCI-LY1
 SRX398293
BRD4
OCI-LY-7
 SRX971780
KMT2D
MM.1S
 SRX204904
BRD4
Monocytes
 SRX3934096
INTS13
Monocytes
 SRX3934095
INTS13
GM12892
 SRX100534
TAF1
GM12891
 SRX100438
TAF1
Erythroblasts
 SRX4046307
MEN1
K-562
 SRX186614
JUN
CD4+ T cells
 SRX6913100
BRD4
Th1 Cells
 SRX1460852
BRD4
SU-DHL-6
 SRX347428
STAT3
GM12878
 SRX100582
TAF1
Jurkat
 SRX398095
CDK7
MV-4-11
 SRX2375362
CDK9
OCI-LY1
 SRX689472
BCOR
Kasumi-1
 SRX026635
TCF12
CUTLL1
 SRX373733
ETS1
CTV-1
 SRX5574466
ETS1
ME-1
 SRX5567178
RNF2
Monocytes-CD14+
 SRX212652
STAT1
Monocytes-CD14+
 SRX212651
STAT1
MOLM-14
 SRX1287848
CDK8
MOLM-13
 SRX2961794
TRIM24
Kasumi-1
 SRX747574
EP300
Th1 Cells
 SRX1460848
RELA
CUTLL1
 SRX070882
NOTCH1
MOLT-4
 SRX1637467
CDK9
MOLM-13
 SRX2961792
TRIM24
MOLM-14
 SRX1287850
CDK8
Kasumi-1
 SRX1514291
RUNX1
CUTLL1
 SRX070885
ZNF143
MOLT-4
 SRX1637463
BRD4
Kasumi-1
 SRX747572
RUNX1T1
GM12878
 SRX100554
BCLAF1
Bone marrow mononuclear cells
 SRX2281260
KMT2A
MV-4-11
 SRX2375366
CDK9
MV-4-11
 SRX1134739
BRD4
TSU-1621MT
 SRX682384
RUNX1
NB-4
 SRX1803059
RUNX1
CD34+
 SRX062339
RUNX1
CD4+ T cells
 SRX666439
BCL6
CTV-1
 SRX5574485
ETS1
CTV-1
 SRX5574468
FLI1
CTV-1
 SRX5574467
FLI1
CTV-1
 SRX5574465
ETS1
Kasumi-1
 SRX4890469
LDB1
SEM
 SRX4484980
FLI1
ME-1
 SRX265233
EP300
NB-4
 SRX1304579
JMJD1C
SKNO-1
 SRX026638
ERG
MV-4-11
 SRX1134766
BRD4
CUTLL1
 SRX369132
RBPJ
GM12878
 SRX100383
SIX5
MOLT-4
 SRX1637470
CDK9
MOLT-4
 SRX2314264
SUPT5H
MOLT-4
 SRX2314263
SUPT5H
MV-4-11
 SRX1134763
BRD4
MV-4-11
 SRX1134743
BRD4
Kasumi-1
 SRX5409710
NETO2
MOLT-4
 SRX1637465
BRD4
MOLT-4
 SRX2314265
SUPT5H
KOPT-K1
 SRX448939
BRD4
B cells
 SRX130609
BCOR
MOLT-4
 SRX1637469
CDK9
THP-1
 SRX6913069
BRD4
Acute myeloid leukemia
 SRX1036364
RUNX1
CD4+ T cells
 SRX850667
BCL6
TSU-1621MT
 SRX682376
ERG
CTV-1
 SRX5574487
FLI1
CTV-1
 SRX5574484
ETS1
MOLM-13
 SRX2961790
TRIM24
Kasumi-1
 SRX1514281
LYL1
MOLT-4
 SRX2314262
SUPT5H
CD4+ T cells
 SRX7894794
ETS1
Pre-B lymphoblast cells
 SRX3586367
RUNX1
CUTLL1
 SRX369131
NOTCH1
HPB-ALL
 SRX159131
ZNF143
K-562
 SRX159129
ZNF143
K-562
 SRX150647
ZNF143
CUTLL1
 SRX070884
RBPJ
ME-1
 SRX5567179
RUNX1
ME-1
 SRX4393711
RUNX1
K-562
 SRX895429
SUMO2
Kasumi-1
 SRX763970
JMJD1C
CTV-1
 SRX5574486
FLI1
B cells
 SRX130608
BCL6
TF-1
 SRX1261524
SMC3
K-562
 SRX100428
SIX5
K-562
 SRX100423
SIX5
CUTLL1
 SRX070881
NOTCH1
JURL-MK1
 SRX035160
BCL6
THP-1
 SRX6913056
BRD2
Kasumi-1
 SRX4890468
LDB1
Monocytes-CD14+
 SRX212647
STAT1
Thymus
 SRX1046558
RAG2
Acute promyelocytic leukemia
 SRX026657
ERG
K-562
 SRX3852890
NELFA
K-562
 SRX6913085
BRD2
K-562
 SRX6913072
BRD2
THP-1
 SRX6913054
BRD2
K-562
 SRX186645
RBBP5
K-562
 SRX116442
RBBP5
K-562
 SRX4708090
GTF2F1
GM12878
 SRX150692
ZNF143
Lymphoblastoid cell line
 SRX2867628
BRD4
CD4+ T cells
 SRX103444
BRD4
Kasumi-1
 SRX747571
RUNX1
K-562
 SRX849404
CDK8
K-562
 SRX6913074
BRD2
CTV-1
 SRX5574469
SMARCA4
GM12878
 SRX475758
GABPA
Lymphoblastoid cell line
 SRX2778394
YY1
Lymphoblastoid cell line
 SRX2778392
YY1
Lymphoblastoid cell line
 SRX2778385
YY1
K-562
 SRX190346
CREB1
GM12878
 SRX190227
PML
K-562
 SRX150448
YY1
K-562
 SRX150420
ATF1
GM12878
 SRX150363
MAZ
GM12891
 SRX100580
YY1
K-562
 SRX100569
GABPA
GM12892
 SRX100561
YY1
GM12878
 SRX100522
SRF
K-562
 SRX100515
YY1
K-562
 SRX100491
YY1
K-562
 SRX100476
TAF1
GM12878
 SRX100451
YY1
GM12878
 SRX100401
GABPA
CD34 Hematopoietic stem cells
 SRX029315
GABPA
Peripheral blood stem cells
 SRX1036365
RUNX1
THP-1
 SRX6913057
BRD2
Cord blood mononuclear
 SRX2281258
KMT2A
B cells
 SRX976241
KMT2D
TSU-1621MT
 SRX682375
ERG
CUTLL1
 SRX369128
NOTCH1
GM12878
 SRX150425
ELK1
CD4+ T cells
 SRX032596
YY1
THP-1
 SRX6913055
BRD2
Kasumi-1
 SRX1514278
RUNX1T1
HL-60
 SRX1304576
JMJD1C
SKNO-1
 SRX063913
RUNX1
TSU-1621MT
 SRX682379
RARA
K-562
 SRX4708082
RBFOX2
MM.1S
 SRX447603
CDK9
ME-1
 SRX265230
ERG
ME-1
 SRX265229
ELF1
CD4+ T cells
 SRX212441
ETS1
Treg
 SRX212439
ETS1
K-562
 SRX186646
PHF8
MV-4-11
 SRX1293531
KMT2A
U-937
 SRX117011
FLI1
U-937
 SRX117010
FLI1
K-562
 SRX116437
PHF8
K-562
 SRX116436
PHF8
K-562
 SRX3852892
NELFE
K-562
 SRX3852891
NELFE
K-562
 SRX3852898
NELFA
Erythroblasts
 SRX4046308
RBBP5
Jurkat
 SRX326890
ERG
SEM
 SRX2281252
KMT2A
K-562
 SRX116438
KDM5B
BJAB
 SRX2059875
SUPT5H
K-562
 SRX3852900
NELFE
K-562
 SRX3852899
NELFE
K-562
 SRX150574
TBP
MV-4-11
 SRX3031986
BRD4
CUTLL1
 SRX369129
RBPJ
Pre-B lymphoblast cells
 SRX3586366
RUNX1
Kasumi-1
 SRX747573
NCOR1
Acute myeloid leukemia
 SRX5930125
KAT2A
CTV-1
 SRX5574507
SPI1
CTV-1
 SRX5574506
SPI1
Monocytes
 SRX5574373
SPI1
K-562
 SRX4708094
XRCC5
Lymphoblastoid cell line
 SRX2778395
YY1
Lymphoblastoid cell line
 SRX2778393
YY1
Lymphoblastoid cell line
 SRX2778387
YY1
Lymphoblastoid cell line
 SRX2778384
YY1
Lymphoblastoid cell line
 SRX2778382
YY1
Jurkat
 SRX2513053
TET2
Jurkat
 SRX2513052
TET2
K-562
 SRX186782
KDM5B
GM12878
 SRX150458
CHD2
K-562
 SRX150417
MAZ
THP-1
 SRX1304581
JMJD1C
THP-1
 SRX103224
SPI1
K-562
 SRX100430
HEY1
K-562
 SRX037418
NFYA
Lymphoblastoid cell line
 SRX2867630
BRD4
SET-2
 SRX849396
CDK8
K-562
 SRX3852895
NELFA
THP-1
 SRX6913050
BRD4
Lymphoblastoid cell line
 SRX2867629
BRD4
CTV-1
 SRX5574494
SPI1
Kasumi-1
 SRX236115
TCF3
OCI-LY1
 SRX398291
BRD4
Kasumi-1
 SRX1514276
FLI1
K-562
 SRX100453
THAP1
THP-1
 SRX6913042
BRD3
MV-4-11
 SRX3031988
BRD4
MV-4-11
 SRX3031985
BRD4
MV-4-11
 SRX3031984
BRD4
MV-4-11
 SRX3031983
BRD4
MV-4-11
 SRX3031982
BRD4
MV-4-11
 SRX1134746
BRD4
OCI-AML3
 ERX195059
BRD4
K-562
 SRX895433
SUMO2
MV-4-11
 SRX849400
CDK8
Kasumi-1
 SRX698188
SPI1
Dendritic Cells
 SRX5574367
SPI1
MOLM-13
 SRX4525861
SMARCA4
Peripheral blood mononuclear cells
 SRX4212578
EZH2
MOLM-13
 SRX3927297
DPF2
MOLM-13
 SRX3927294
SMARCA4
EOL-1
 SRX3927290
DPF2
EOL-1
 SRX3927288
SMARCC1
THP-1
 SRX3824044
KMT2B
HL-60
 SRX3434293
SKI
MV-4-11
 SRX2245499
CEBPA
Monocytes-CD14+
 SRX212649
STAT1
Monocytes-CD14+
 SRX212648
STAT1
GM12878
 SRX186622
SREBF1
Kasumi-1
 SRX1514286
HDAC2
Kasumi-1
 SRX1514280
TAL1
Kasumi-1
 SRX1514277
ERG
MOLM-14
 SRX1287846
CDK8
MOLM-14
 SRX1287844
CDK8
U-937
 SRX097097
SMAD1
SKNO-1
 SRX026640
FLI1
SKNO-1
 SRX026639
ERG
NALM-6
 SRX4211810
PAX5
HL-60
 SRX3934085
INTS13
THP-1
 SRX728780
CDK9
THP-1
 SRX728779
CDK9
Th1 Cells
 SRX1460849
AFF4
B-CLL cells
 SRX3591434
BRD4
MV-4-11
 SRX1134769
BRD4
SET-2
 SRX849394
CDK8
Jurkat
 SRX725582
MYB
B cells
 SRX4116559
FOXP1
EOL-1
 SRX3927285
BRD7
GM12878
 SRX2458138
MED1
SEM
 SRX1873451
MED1
Th1 Cells
 SRX1799593
TBX21
Th1 Cells
 SRX1799591
TBX21
K-562
 SRX100565
SRF
K-562
 SRX100560
BCLAF1
B-CLL cells
 SRX3591437
BRD4
SKH1
 SRX2574235
GATA2
Kasumi-1
 SRX858324
RUNX1
697
 SRX6909701
RUNX1
CUTLL1
 SRX369126
RUNX1
Pre-B lymphoblast cells
 SRX3586365
RUNX1
ME-1
 SRX265222
RUNX1
Kasumi-1
 SRX259612
RUNX1
SEM
 SRX202967
RUNX1
Jurkat
 SRX1492212
RUNX1
Jurkat
 SRX1041800
RUNX1
PER-117
 SRX8472392
RUNX2
KARPAS-45
 SRX8472389
RUNX2
Th1 Cells
 SRX735289
TBX21
ALL-SIL
 SRX731025
TLX1
T-ALL
 SRX725589
TAL1
T-ALL
 SRX725586
MYB
Jurkat
 SRX725578
MYB
K-562
 SRX6913076
BRD3
K-562
 SRX6913075
BRD2
697
 SRX6909699
EP300
Jurkat
 SRX658611
MYB
Jurkat
 SRX658610
MYB
ICN12
 SRX656350
EP300
ICN12
 SRX656347
TCF3
CTV-1
 SRX5574502
SMARCA4
CTV-1
 SRX5574501
SMARCA4
CTV-1
 SRX5574493
SPI1
CTV-1
 SRX5574489
SMARCA4
CTV-1
 SRX5574488
SMARCA4
Jurkat
 SRX4705120
GATA3
EOL-1
 SRX3927284
SMARCA4
CUTLL1
 SRX369138
EP300
ME-1
 SRX265225
TCF12
Monocytes-CD14+
 SRX212650
STAT1
RCH-ACV
 SRX2043231
EP300
RPMI 8402
 SRX158113
TAL1
RPMI 8402
 SRX158111
TAL1
RPMI 8402
 SRX158110
TCF12
RPMI 8402
 SRX158106
TCF3
Jurkat
 SRX1492213
GATA3
Jurkat
 SRX1041802
GATA3
Jurkat (Clone E6-1)
 SRX015827
CREBBP
UPR9
 SRX014782
RARA
CD4+ T cells
 SRX6913101
BRD4
OCI-AML3
 ERX195061
BRD4
OCI-AML3
 ERX195060
BRD4
Lymphoblastoid cell line
 SRX4046314
CXXC1
Kasumi-1
 SRX1514284
EP300
B-CLL cells
 SRX3591431
BRD4
MOLM-14
 SRX1287856
BRD4
ME-1
 SRX265219
CBFB
Th1 Cells
 SRX1460850
AFF4
K-562
 SRX482859
TBP
GM12878
 SRX150357
TBP
CD4+ T cells
 SRX6913102
BRD4
THP-1
 SRX6913065
BRD4
THP-1
 SRX6913045
BRD4
B-CLL cells
 SRX3591428
BRD4
OCI-LY1
 SRX275404
BRD4
CD4+ T cells
 SRX198034
BRD4
Pre-B cells
 SRX3460917
IKZF1
OCI-LY-19
 SRX347422
STAT3
SKH1
 SRX2574236
GATA2
ME-1
 SRX5567180
RUNX1
ME-1
 SRX4393712
RUNX1
Acute myeloid leukemia
 SRX3789539
RUNX1
PBMC
 SRX2963102
RUNX1
K-562
 SRX7135365
BRD2
K-562
 SRX6913079
BRD3
K-562
 SRX6913073
BRD2
THP-1
 SRX6913039
BRD2
ICN12
 SRX656349
PBX1
Acute myeloid leukemia
 SRX5930124
KAT2A
OCI-AML3
 SRX5668141
KMT2A
IMS-M2
 SRX5668135
KMT2A
CTV-1
 SRX5574500
SPI1
Macrophages
 SRX5574377
SPI1
SEM
 SRX4484982
RUNX2
CUTLL1
 SRX369125
GABPA
U-937
 SRX265238
CBFB
Thymus
 SRX1968078
BCL11B
K-562
 SRX150584
IRF1
Erythroid Cells
 SRX1042046
BPTF
K-562
 SRX037417
PRAME
CD4+ T cells
 SRX017698
CREBBP
CUTLL1
 SRX369136
BRD4
K-562
 SRX063920
ERG
CUTLL1
 SRX515115
KDM6B
Jurkat
 SRX3934089
INTS13
K-562
 SRX186625
ELK1