ChIP-Atlas: Colocalization analysis

Colocalization analysis for RELA

Query protein: RELA
Cell class: Blood
Sort key: SRX1460848 | Th1 Cells
 
Color legends
ChIP-seq data:  H-H H-M M-M H-L M-L L-L N.D. Same  (Peak intensities are High, Middle or Low)

STRING data:  1000 750 500 250 0 N.D.  (Values = STRING's binding scores)

Downloads: TSV (text), GML (Cytoscape)
Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Colocalization
Cell types  Exp. IDs RELA's Colocalization partners

◢ RELA: Average

◢ SRX4401061: BJAB

◢ SRX4401062: BJAB

◢ SRX4401063: BJAB

◢ SRX4401064: BJAB

◢ SRX4401065: BJAB

◢ SRX4401066: BJAB

◢ SRX5371742: CD4+ T cells

◢ SRX5371743: CD4+ T cells

◢ SRX017887: GM10847

◢ SRX017888: GM10847

◢ SRX017889: GM10847

◢ SRX017890: GM10847

◢ SRX017891: GM10847

◢ SRX150606: GM10847

◢ SRX017905: GM12878

◢ SRX017906: GM12878

◢ SRX017907: GM12878

◢ SRX017908: GM12878

◢ SRX150557: GM12878

◢ SRX2837382: GM12878

◢ SRX017911: GM12891

◢ SRX017912: GM12891

◢ SRX017913: GM12891

◢ SRX150605: GM12891

◢ SRX017882: GM12892

◢ SRX017883: GM12892

◢ SRX017884: GM12892

◢ SRX150365: GM12892

◢ SRX017875: GM15510

◢ SRX017876: GM15510

◢ SRX017877: GM15510

◢ SRX017878: GM15510

◢ SRX017879: GM15510

◢ SRX150608: GM15510

◢ SRX017863: GM18526

◢ SRX017864: GM18526

◢ SRX017865: GM18526

◢ SRX017866: GM18526

◢ SRX017867: GM18526

◢ SRX017900: GM18526

◢ SRX017901: GM18526

◢ SRX017902: GM18526

◢ SRX150361: GM18526

◢ SRX150362: GM18526

◢ SRX017894: GM18951

◢ SRX017895: GM18951

◢ SRX017896: GM18951

◢ SRX017897: GM18951

◢ SRX150610: GM18951

◢ SRX017870: GM19099

◢ SRX017871: GM19099

◢ SRX017872: GM19099

◢ SRX150353: GM19099

◢ SRX017858: GM19193

◢ SRX017859: GM19193

◢ SRX017860: GM19193

◢ SRX150359: GM19193

◢ SRX790965: L-1236

◢ SRX790966: L-1236

◢ SRX256997: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX256998: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX256999: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX257000: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX7083406: RAMOS

◢ SRX1460847: Th1 Cells

◣ SRX1460848: Th1 Cells

◢ SRX4001966: THP-1

◢ SRX4001967: THP-1

◢ RELA: STRING
Th1 Cells
  SRX1460848
RELA
 ↻ ≫
GM12878
  SRX100554
BCLAF1
 ↻ ≫
MM.1S
  SRX327756
MED1
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX2867630
BRD4
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150458
CHD2
 ↻ ≫
GM12878
  SRX190227
PML
 ↻ ≫
MM.1S
  SRX327755
MED1
 ↻ ≫
GM12878
  SRX190216
CREB1
 ↻ ≫
OCI-LY1
  SRX398294
MED1
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX2867628
BRD4
 ↻ ≫
CD4+ T cells
  SRX6913100
BRD4
 ↻ ≫
MM.1S
  SRX244178
MED1
 ↻ ≫
MM.1S
  SRX204906
MED1
 ↻ ≫
GM12878
  SRX100582
TAF1
 ↻ ≫
GM12892
  SRX100534
TAF1
 ↻ ≫
GM12891
  SRX100438
TAF1
 ↻ ≫
GM12878
  SRX100522
SRF
 ↻ ≫
SU-DHL-6
  SRX347428
STAT3
 ↻ ≫
OCI-LY1
  SRX398293
BRD4
 ↻ ≫
MV-4-11
  SRX3031985
BRD4
 ↻ ≫
B cells
  SRX130609
BCOR
 ↻ ≫
Kasumi-1
  SRX747574
EP300
 ↻ ≫
Jurkat (Clone E6-1)
  SRX015825
ETS1
 ↻ ≫
OCI-LY-7
  SRX971780
KMT2D
 ↻ ≫
GM12878
  SRX475760
GABPA
 ↻ ≫
Cord blood mononuclear
  SRX2281258
KMT2A
 ↻ ≫
Monocytes-CD14+
  SRX212652
STAT1
 ↻ ≫
Monocytes-CD14+
  SRX212649
STAT1
 ↻ ≫
MV-4-11
  SRX1134766
BRD4
 ↻ ≫
MV-4-11
  SRX1134763
BRD4
 ↻ ≫
CD4+ T cells
  SRX6913099
BRD4
 ↻ ≫
K-562
  SRX6913072
BRD2
 ↻ ≫
THP-1
  SRX6913055
BRD2
 ↻ ≫
GM12878
  SRX475759
GABPA
 ↻ ≫
GM12878
  SRX475757
GABPA
 ↻ ≫
GM12878
  SRX475743
GABPA
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX398095
CDK7
 ↻ ≫
CUTLL1
  SRX369137
MED1
 ↻ ≫
MM.1S
  SRX327757
MED1
 ↻ ≫
P493-6
  SRX204410
BRD4
 ↻ ≫
CD4+ T cells
  SRX198034
BRD4
 ↻ ≫
HL-60
  SRX190278
GABPA
 ↻ ≫
MV-4-11
  SRX1134743
BRD4
 ↻ ≫
GM12878
  SRX100555
ETS1
 ↻ ≫
K-562
  SRX100476
TAF1
 ↻ ≫
GM12878
  SRX100451
YY1
 ↻ ≫
GM12878
  SRX100401
GABPA
 ↻ ≫
K-562
  SRX6913086
BRD3
 ↻ ≫
K-562
  SRX6913085
BRD2
 ↻ ≫
THP-1
  SRX6913069
BRD4
 ↻ ≫
THP-1
  SRX6913057
BRD2
 ↻ ≫
THP-1
  SRX6913056
BRD2
 ↻ ≫
Erythroblasts
  SRX646135
NFE2
 ↻ ≫
GM12878
  SRX475758
GABPA
 ↻ ≫
K-562
  SRX4708094
XRCC5
 ↻ ≫
KOPT-K1
  SRX448939
BRD4
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX3934088
INTS13
 ↻ ≫
K-562
  SRX3852899
NELFE
 ↻ ≫
K-562
  SRX3852898
NELFA
 ↻ ≫
K-562
  SRX3852895
NELFA
 ↻ ≫
K-562
  SRX3852890
NELFA
 ↻ ≫
CUTLL1
  SRX369136
BRD4
 ↻ ≫
MM.1S
  SRX327759
CDK9
 ↻ ≫
MM.1S
  SRX327758
CDK9
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX326888
GABPA
 ↻ ≫
MV-4-11
  SRX3031988
BRD4
 ↻ ≫
MM.1S
  SRX244180
CDK9
 ↻ ≫
MM.1S
  SRX244177
CDK9
 ↻ ≫
MOLT-4
  SRX2314265
SUPT5H
 ↻ ≫
MOLT-4
  SRX2314262
SUPT5H
 ↻ ≫
Monocytes-CD14+
  SRX212651
STAT1
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX1880278
BRD4
 ↻ ≫
K-562
  SRX186782
KDM5B
 ↻ ≫
MOLT-4
  SRX1637463
BRD4
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150510
MXI1
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150425
ELK1
 ↻ ≫
MOLM-14
  SRX1287850
CDK8
 ↻ ≫
K-562
  SRX116438
KDM5B
 ↻ ≫
MV-4-11
  SRX1134739
BRD4
 ↻ ≫
Erythroblasts
  SRX1089829
NFE2
 ↻ ≫
CD4+ T cells
  SRX103444
BRD4
 ↻ ≫
GM12891
  SRX100580
YY1
 ↻ ≫
GM12892
  SRX100561
YY1
 ↻ ≫
K-562
  SRX100430
HEY1
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150597
MAX
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150363
MAZ
 ↻ ≫
Th1 Cells
  SRX1460852
BRD4
 ↻ ≫
P493-6
  SRX353809
MYC
 ↻ ≫
Th1 Cells
  SRX1460849
AFF4
 ↻ ≫
THP-1
  SRX6913054
BRD2
 ↻ ≫
SEM
  SRX4484986
ELF1
 ↻ ≫
Erythroblasts
  SRX4046306
HCFC1
 ↻ ≫
Erythroblasts
  SRX4046302
CXXC1
 ↻ ≫
NAMALWA
  SRX389278
NRF1
 ↻ ≫
CUTLL1
  SRX373733
ETS1
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX326887
GABPA
 ↻ ≫
MOLT-4
  SRX2314264
SUPT5H
 ↻ ≫
MOLT-4
  SRX2314263
SUPT5H
 ↻ ≫
Bone marrow mononuclear cells
  SRX2281260
KMT2A
 ↻ ≫
SEM
  SRX2281252
KMT2A
 ↻ ≫
BJAB
  SRX2059875
SUPT5H
 ↻ ≫
K-562
  SRX186630
HCFC1
 ↻ ≫
HPB-ALL
  SRX159138
NOTCH1
 ↻ ≫
K-562
  SRX150647
ZNF143
 ↻ ≫
K-562
  SRX150420
ATF1
 ↻ ≫
K-562
  SRX100569
GABPA
 ↻ ≫
GM12878
  SRX100541
ELF1
 ↻ ≫
K-562
  SRX100539
ELF1
 ↻ ≫
K-562
  SRX100491
YY1
 ↻ ≫
CUTLL1
  SRX070885
ZNF143
 ↻ ≫
CD4+ T cells
  SRX7894794
ETS1
 ↻ ≫
THP-1
  SRX6913042
BRD3
 ↻ ≫
HL-60
  SRX3934087
INTS13
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX326890
ERG
 ↻ ≫
RAJI
  SRX1497394
MYC
 ↻ ≫
RAJI
  SRX1497384
MYC
 ↻ ≫
Th1 Cells
  SRX1460851
BRD4
 ↻ ≫
Th1 Cells
  SRX1460850
AFF4
 ↻ ≫
GM12878
  SRX100383
SIX5
 ↻ ≫
Monocytes
  SRX3934096
INTS13
 ↻ ≫
HL-60
  SRX3345953
INTS13
 ↻ ≫
CUTLL1
  SRX070882
NOTCH1
 ↻ ≫
Erythroid Cells
  SRX218421
EP300
 ↻ ≫
B cells
  SRX976241
KMT2D
 ↻ ≫
K-562
  SRX895429
SUMO2
 ↻ ≫
THP-1
  SRX6913048
BRD4
 ↻ ≫
OCI-LY1
  SRX689472
BCOR
 ↻ ≫
TSU-1621MT
  SRX682379
RARA
 ↻ ≫
TSU-1621MT
  SRX682375
ERG
 ↻ ≫
CD4+ T cells
  SRX666439
BCL6
 ↻ ≫
RAMOS
  SRX5346116
MYC
 ↻ ≫
K-562
  SRX4708082
RBFOX2
 ↻ ≫
K-562
  SRX4708072
HNRNPLL
 ↻ ≫
Erythroblasts
  SRX4046308
RBBP5
 ↻ ≫
Erythroblasts
  SRX4046307
MEN1
 ↻ ≫
HL-60
  SRX3934085
INTS13
 ↻ ≫
K-562
  SRX3852900
NELFE
 ↻ ≫
K-562
  SRX3852892
NELFE
 ↻ ≫
K-562
  SRX3852891
NELFE
 ↻ ≫
MM.1S
  SRX366792
BRD3
 ↻ ≫
CUTLL1
  SRX3433645
USP7
 ↻ ≫
CUTLL1
  SRX3433644
USP7
 ↻ ≫
HL-60
  SRX3345956
INTS13
 ↻ ≫
HL-60
  SRX3345955
INTS13
 ↻ ≫
HL-60
  SRX3345954
INTS13
 ↻ ≫
PBMC
  SRX2963102
RUNX1
 ↻ ≫
MOLM-13
  SRX2961794
TRIM24
 ↻ ≫
MOLM-13
  SRX2961792
TRIM24
 ↻ ≫
OCI-LY1
  SRX275409
E2F1
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX2711485
USP7
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX2711484
USP7
 ↻ ≫
ME-1
  SRX265230
ERG
 ↻ ≫
ME-1
  SRX265229
ELF1
 ↻ ≫
ME-1
  SRX265225
TCF12
 ↻ ≫
ME-1
  SRX265222
RUNX1
 ↻ ≫
ME-1
  SRX265219
CBFB
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX2513053
TET2
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX2513052
TET2
 ↻ ≫
MV-4-11
  SRX2375362
CDK9
 ↻ ≫
Monocytes-CD14+
  SRX212648
STAT1
 ↻ ≫
CD4+ T cells
  SRX212441
ETS1
 ↻ ≫
MM.1S
  SRX204905
BRD4
 ↻ ≫
P493-6
  SRX204413
MAX
 ↻ ≫
K-562
  SRX190346
CREB1
 ↻ ≫
K-562
  SRX186646
PHF8
 ↻ ≫
K-562
  SRX186645
RBBP5
 ↻ ≫
MM.1S
  SRX1726515
E2F1
 ↻ ≫
MM.1S
  SRX1726514
TFDP1
 ↻ ≫
P493-6
  SRX1539275
MYC
 ↻ ≫
NB-4
  SRX150722
MYC
 ↻ ≫
K-562
  SRX150678
MYC
 ↻ ≫
K-562
  SRX150627
MYC
 ↻ ≫
K-562
  SRX150626
CCNT2
 ↻ ≫
K-562
  SRX150623
HMGN3
 ↻ ≫
K-562
  SRX150595
MYC
 ↻ ≫
K-562
  SRX150424
MAX
 ↻ ≫
K-562
  SRX150417
MAZ
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150389
NRF1
 ↻ ≫
MV-4-11
  SRX1293531
KMT2A
 ↻ ≫
Multiple Myeloma
  SRX129116
MYC
 ↻ ≫
P493-6
  SRX129084
MAX
 ↻ ≫
P493-6
  SRX129083
MAX
 ↻ ≫
P493-6
  SRX129082
MAX
 ↻ ≫
P493-6
  SRX129068
MYC
 ↻ ≫
P493-6
  SRX129066
MYC
 ↻ ≫
U-937
  SRX117011
FLI1
 ↻ ≫
U-937
  SRX117010
FLI1
 ↻ ≫
K-562
  SRX116442
RBBP5
 ↻ ≫
K-562
  SRX116437
PHF8
 ↻ ≫
K-562
  SRX116436
PHF8
 ↻ ≫
Thymus
  SRX1046558
RAG2
 ↻ ≫
Peripheral blood stem cells
  SRX1036365
RUNX1
 ↻ ≫
K-562
  SRX103009
MYC
 ↻ ≫
K-562
  SRX100570
SIN3A
 ↻ ≫
K-562
  SRX100487
ETS1
 ↻ ≫
K-562
  SRX100425
ATF3
 ↻ ≫
CUTLL1
  SRX070884
RBPJ
 ↻ ≫
K-562
  SRX063920
ERG
 ↻ ≫
SKNO-1
  SRX063913
RUNX1
 ↻