ChIP-Atlas: Colocalization analysis

Colocalization analysis for REST

Query protein: REST
Cell class: Blood
Sort key: SRX100485 | K-562
 
Color legends
ChIP-seq data:  H-H H-M M-M H-L M-L L-L N.D. Same  (Peak intensities are High, Middle or Low)

STRING data:  1000 750 500 250 0 N.D.  (Values = STRING's binding scores)

Downloads: TSV (text), GML (Cytoscape)
Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Colocalization
Cell types  Exp. IDs REST's Colocalization partners

◢ REST: Average

◢ SRX331853: CD4+ T cells

◢ SRX100394: GM12878

◢ SRX190200: GM12878

◢ SRX392780: GM12878

◢ SRX392781: GM12878

◢ SRX392782: GM12878

◢ SRX392783: GM12878

◢ SRX392784: GM12878

◢ SRX392785: GM12878

◢ SRX392786: GM12878

◢ SRX392787: GM12878

◢ SRX392788: GM12878

◢ SRX392789: GM12878

◢ SRX392790: GM12878

◢ SRX392791: GM12878

◢ SRX475747: GM12878

◢ SRX475773: GM12878

◢ SRX475774: GM12878

◢ SRX475775: GM12878

◢ SRX475776: GM12878

◢ SRX475777: GM12878

◢ SRX475778: GM12878

◢ SRX475779: GM12878

◢ SRX475780: GM12878

◢ SRX475781: GM12878

◢ SRX475782: GM12878

◢ SRX475783: GM12878

◢ SRX475784: GM12878

◢ SRX475785: GM12878

◢ SRX475786: GM12878

◢ SRX475787: GM12878

◢ SRX475788: GM12878

◢ SRX190210: HL-60

◢ SRX392792: Jurkat

◢ SRX392793: Jurkat

◢ SRX392794: Jurkat

◢ SRX392795: Jurkat

◢ SRX392796: Jurkat

◢ SRX392797: Jurkat

◢ SRX392798: Jurkat

◢ SRX392799: Jurkat

◢ SRX392800: Jurkat

◢ SRX392801: Jurkat

◢ SRX392802: Jurkat

◢ SRX392803: Jurkat

◢ SRX392804: Jurkat

◢ SRX392805: Jurkat

◢ SRX392806: Jurkat

◣ SRX100485: K-562

◢ SRX116443: K-562

◢ SRX186703: K-562

◢ REST: STRING
K-562
  SRX100485
REST
 ↻ ≫
GM12878
  SRX475787
REST
 ↻ ≫
GM12878
  SRX475783
REST
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX392806
REST
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX392805
REST
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX392801
REST
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX392792
REST
 ↻ ≫
GM12878
  SRX392791
REST
 ↻ ≫
GM12878
  SRX392788
REST
 ↻ ≫
GM12878
  SRX392787
REST
 ↻ ≫
GM12878
  SRX392786
REST
 ↻ ≫
CD4+ T cells
  SRX331853
REST
 ↻ ≫
GM12878
  SRX475788
REST
 ↻ ≫
GM12878
  SRX475786
REST
 ↻ ≫
GM12878
  SRX475785
REST
 ↻ ≫
GM12878
  SRX475784
REST
 ↻ ≫
GM12878
  SRX475781
REST
 ↻ ≫
GM12878
  SRX475780
REST
 ↻ ≫
GM12878
  SRX475779
REST
 ↻ ≫
GM12878
  SRX475778
REST
 ↻ ≫
GM12878
  SRX475777
REST
 ↻ ≫
GM12878
  SRX475776
REST
 ↻ ≫
GM12878
  SRX475775
REST
 ↻ ≫
GM12878
  SRX475774
REST
 ↻ ≫
GM12878
  SRX475773
REST
 ↻ ≫
GM12878
  SRX475747
REST
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX392804
REST
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX392803
REST
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX392802
REST
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX392800
REST
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX392799
REST
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX392797
REST
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX392796
REST
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX392795
REST
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX392794
REST
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX392793
REST
 ↻ ≫
GM12878
  SRX392790
REST
 ↻ ≫
GM12878
  SRX392789
REST
 ↻ ≫
GM12878
  SRX392785
REST
 ↻ ≫
GM12878
  SRX392784
REST
 ↻ ≫
GM12878
  SRX392783
REST
 ↻ ≫
GM12878
  SRX392782
REST
 ↻ ≫
GM12878
  SRX392781
REST
 ↻ ≫
GM12878
  SRX392780
REST
 ↻ ≫
GM12878
  SRX190200
REST
 ↻ ≫
K-562
  SRX186703
REST
 ↻ ≫
K-562
  SRX116443
REST
 ↻ ≫
GM12878
  SRX100394
REST
 ↻ ≫
GM12878
  SRX475782
REST
 ↻ ≫
HL-60
  SRX190210
REST
 ↻ ≫
OCI-LY-7
  SRX971780
KMT2D
 ↻ ≫
K-562
  SRX190178
PML
 ↻ ≫
K-562
  SRX150518
RCOR1
 ↻ ≫
Erythroid progenitors
  SRX687557
GATA2
 ↻ ≫
Erythroblasts
  SRX646136
TAL1
 ↻ ≫
K-562
  SRX5974588
TAL1
 ↻ ≫
K-562
  SRX5974587
TAL1
 ↻ ≫
K-562
  SRX5974578
GATA1
 ↻ ≫
K-562
  SRX5974577
GATA1
 ↻ ≫
K-562
  SRX5974572
TAL1
 ↻ ≫
K-562
  SRX5974571
TAL1
 ↻ ≫
K-562
  SRX5974562
GATA1
 ↻ ≫
K-562
  SRX5974561
GATA1
 ↻ ≫
K-562
  SRX5974556
TAL1
 ↻ ≫
K-562
  SRX5974555
TAL1
 ↻ ≫
K-562
  SRX5974546
GATA1
 ↻ ≫
K-562
  SRX5974545
GATA1
 ↻ ≫
K-562
  SRX5974540
TAL1
 ↻ ≫
K-562
  SRX5974539
TAL1
 ↻ ≫
K-562
  SRX5974530
GATA1
 ↻ ≫
K-562
  SRX5974529
GATA1
 ↻ ≫
K-562
  SRX5974524
TAL1
 ↻ ≫
K-562
  SRX5974523
TAL1
 ↻ ≫
K-562
  SRX5974514
GATA1
 ↻ ≫
K-562
  SRX5974513
GATA1
 ↻ ≫
CD34+
  SRX386203
TAL1
 ↻ ≫
CD34+
  SRX386202
GATA1
 ↻ ≫
Erythroblasts
  SRX381543
LDB1
 ↻ ≫
K-562
  SRX3445685
TAL1
 ↻ ≫
K-562
  SRX3445684
TAL1
 ↻ ≫
K-562
  SRX3445682
GATA1
 ↻ ≫
K-562
  SRX3445677
TAL1
 ↻ ≫
K-562
  SRX3445676
TAL1
 ↻ ≫
K-562
  SRX3445674
GATA1
 ↻ ≫
K-562
  SRX3445669
TAL1
 ↻ ≫
K-562
  SRX3445668
TAL1
 ↻ ≫
K-562
  SRX3445667
GATA1
 ↻ ≫
K-562
  SRX3445666
GATA1
 ↻ ≫
HUDEP-2
  SRX3161011
ZBTB7A
 ↻ ≫
K-562
  SRX3161002
ZBTB7A
 ↻ ≫
Erythroid Precursor Cells
  SRX2481500
TAL1
 ↻ ≫
Erythroid Precursor Cells
  SRX2481499
GATA1
 ↻ ≫
Erythroid Cells
  SRX205165
TAL1
 ↻ ≫
K-562
  SRX190362
CEBPD
 ↻ ≫
K-562
  SRX190351
TEAD4
 ↻ ≫
K-562
  SRX190333
STAT5A
 ↻ ≫
K-562
  SRX190305
TRIM28
 ↻ ≫
K-562
  SRX190238
NR2F2
 ↻ ≫
K-562
  SRX190188
CBX3
 ↻ ≫
K-562
  SRX186616
ZMIZ1
 ↻ ≫
K-562
  SRX186613
GATA1
 ↻ ≫
CD34+
  SRX160844
GATA1
 ↻ ≫
CD34+
  SRX160843
GATA1
 ↻ ≫
K-562
  SRX150653
TBL1XR1
 ↻ ≫
K-562
  SRX150648
JUND
 ↻ ≫
K-562
  SRX150626
CCNT2
 ↻ ≫
K-562
  SRX150623
HMGN3
 ↻ ≫
K-562
  SRX150575
TAL1
 ↻ ≫
PBDE
  SRX150544
GATA1
 ↻ ≫
K-562
  SRX150481
EP300
 ↻ ≫
K-562
  SRX150453
GATA2
 ↻ ≫
TF-1
  SRX1261526
SMC3
 ↻ ≫
TF-1
  SRX1261517
GATA2
 ↻ ≫
TF-1
  SRX1261516
GATA2
 ↻ ≫
Erythroblasts
  SRX1089826
TAL1
 ↻ ≫
K-562
  SRX1070427
ORC2
 ↻ ≫
K-562
  SRX100585
GATA2
 ↻ ≫
PBMC
  SRX099231
GATA1
 ↻ ≫
PBMC
  SRX099230
GATA1
 ↻ ≫
K-562
  SRX097106
SMAD1
 ↻ ≫
K-562
  SRX097089
SMAD1
 ↻ ≫
K-562
  SRX097086
GATA1
 ↻ ≫
K-562
  SRX097085
GATA1
 ↻ ≫
CD34+
  SRX097070
GATA1
 ↻ ≫
CD34+
  SRX097068
GATA1
 ↻ ≫
K-562
  SRX092303
GATA2
 ↻ ≫
K-562
  SRX092301
JUND
 ↻ ≫
CD36+
  SRX037941
GATA1
 ↻ ≫
CD36+
  SRX037940
GATA1
 ↻ ≫
CD36+
  SRX037939
TAL1
 ↻ ≫
CD36+
  SRX037938
TAL1
 ↻ ≫
K-562
  SRX014811
GATA2
 ↻ ≫
K-562
  SRX100569
GABPA
 ↻ ≫
K-562
  SRX4708093
TARDBP
 ↻ ≫
K-562
  SRX150465
RCOR1
 ↻ ≫
K-562
  SRX7135367
HDAC1
 ↻ ≫
K-562
  SRX7135363
HDAC2
 ↻ ≫
K-562
  SRX100516
HDAC2
 ↻ ≫
K-562
  SRX4493021
KDM1A
 ↻ ≫
K-562
  SRX4493020
KDM1A
 ↻ ≫
K-562
  SRX186766
KDM1A
 ↻ ≫
K-562
  SRX116430
KDM1A
 ↻ ≫
CD34+
  SRX6902860
GATA1
 ↻ ≫
K-562
  SRX3445675
GATA1
 ↻ ≫
K-562
  SRX3161001
ZBTB7A
 ↻ ≫
K-562
  SRX190346
CREB1
 ↻ ≫
K-562
  SRX190334
CEBPB
 ↻ ≫
K-562
  SRX186614
JUN
 ↻ ≫
K-562
  SRX150695
BHLHE40
 ↻ ≫
K-562
  SRX150678
MYC
 ↻ ≫
K-562
  SRX150627
MYC
 ↻ ≫
K-562
  SRX150619
GATA1
 ↻ ≫
K-562
  SRX150573
EP300
 ↻ ≫
K-562
  SRX150549
STAT2
 ↻ ≫
K-562
  SRX150420
ATF1
 ↻ ≫
K-562
  SRX150416
ARID3A
 ↻ ≫
K-562
  SRX1070428
ORC2
 ↻ ≫
K-562
  SRX100425
ATF3
 ↻ ≫
K-562
  SRX097105
CEBPA
 ↻ ≫
K-562
  SRX097088
GATA2
 ↻ ≫
K-562
  SRX097087
GATA2
 ↻ ≫
K-562
  SRX037417
PRAME
 ↻ ≫
K-562
  SRX029086
GATA1
 ↻ ≫
K-562
  SRX014810
GATA1
 ↻ ≫
K-562
  SRX150574
TBP
 ↻ ≫
K-562
  SRX6913088
BRD4
 ↻ ≫
K-562
  SRX6913087
BRD4
 ↻ ≫
K-562
  SRX6913080
BRD4
 ↻ ≫
K-562
  SRX100476
TAF1
 ↻ ≫
K-562
  SRX3161004
ZBTB7A
 ↻ ≫
K-562
  SRX150595
MYC
 ↻ ≫
K-562
  SRX103009
MYC
 ↻ ≫
K-562
  SRX150583
IRF1
 ↻ ≫
K-562
  SRX6913082
BRD4
 ↻ ≫
K-562
  SRX2841992
BRD4
 ↻ ≫
K-562
  SRX150584
IRF1
 ↻ ≫
K-562
  SRX150721
UBTF
 ↻ ≫
K-562
  SRX150545
MYC
 ↻ ≫
K-562
  SRX150424
MAX
 ↻ ≫
K-562
  SRX092300
JUNB
 ↻ ≫
K-562
  SRX6913081
BRD4
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX392798
REST
 ↻ ≫
K-562
  SRX100570
SIN3A
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX4712347
LDB1
 ↻ ≫
RS4-11
  SRX151223
AFF1
 ↻ ≫
GM12892
  SRX100534
TAF1
 ↻ ≫
Kasumi-1
  SRX747574
EP300
 ↻ ≫
K-562
  SRX4708090
GTF2F1
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX398095
CDK7
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX206835
RUNX1
 ↻ ≫
CD4+ T cells
  SRX198034
BRD4
 ↻ ≫
GM15510
  SRX150608
RELA
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150357
TBP
 ↻ ≫
MV-4-11
  SRX1293534
PSIP1
 ↻ ≫
MV-4-11
  SRX1134766
BRD4
 ↻ ≫
MV-4-11
  SRX1134763
BRD4
 ↻ ≫
GM12891
  SRX100438
TAF1
 ↻ ≫
THP-1
  SRX6913048
BRD4
 ↻ ≫
THP-1
  SRX6913042
BRD3
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX4712348
LDB1
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX2867628
BRD4
 ↻ ≫
GM12878
  SRX190227
PML
 ↻ ≫
MOLM-14
  SRX1287854
BRD4
 ↻ ≫
GM12878
  SRX100582
TAF1
 ↻ ≫
MOLM-14
  SRX1287856
BRD4
 ↻ ≫
CD4+ T cells
  SRX6913100
BRD4
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX697746
PRKCQ
 ↻ ≫
CD4+ T cells
  SRX6913099
BRD4
 ↻ ≫
K-562
  SRX6913086
BRD3
 ↻ ≫
K-562
  SRX6913074
BRD2
 ↻ ≫
THP-1
  SRX6913066
BRD4
 ↻ ≫
THP-1
  SRX6913045
BRD4
 ↻ ≫
Erythroblasts
  SRX646126
SUZ12
 ↻ ≫
KOPT-K1
  SRX448939
BRD4
 ↻ ≫
B-CLL cells
  SRX3591432
BRD4
 ↻ ≫
B-CLL cells
  SRX3591428
BRD4
 ↻ ≫
P493-6
  SRX204410
BRD4
 ↻ ≫
K-562
  SRX849404
CDK8
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX697745
PRKCQ
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX697743
PRKCQ
 ↻ ≫
OCI-LY1
  SRX398294
MED1
 ↻ ≫
CD34 Hematopoietic stem cells
  SRX3768714
MLLT3
 ↻ ≫
CD34 Hematopoietic stem cells
  SRX3768713
MLLT3
 ↻ ≫
GM12891
  SRX100442
POU2F2
 ↻ ≫
CD34 Hematopoietic stem cells
  SRX3768715
MLLT3
 ↻ ≫
MV-4-11
  SRX849400
CDK8
 ↻ ≫
SET-2
  SRX849396
CDK8
 ↻ ≫
GM06077
  SRX8066531
CTCF
 ↻ ≫
K-562
  SRX7494162
HIF1A
 ↻ ≫
K-562
  SRX6913085
BRD2
 ↻ ≫
K-562
  SRX6913072
BRD2
 ↻ ≫
THP-1
  SRX6913055
BRD2
 ↻ ≫
KARPAS-422
  SRX6430557
EZH2
 ↻ ≫
ICN1
  SRX625677
IKZF1
 ↻ ≫
ICN1
  SRX625673
IKZF1
 ↻ ≫
MOLM-14
  SRX5242454
MED1
 ↻ ≫
SEM
  SRX4931277
ELL2
 ↻ ≫
SEM
  SRX4931276
AFF4
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX4705120
GATA3
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX4705119
CHAF1A
 ↻ ≫
MV-4-11
  SRX4170725
WDR5
 ↻ ≫
MV-4-11
  SRX4170724
WDR5
 ↻ ≫
HAP1
  SRX3312899
MTHFD1
 ↻ ≫
HAP1
  SRX3312898
MTHFD1
 ↻ ≫
HAP1
  SRX3312897
MTHFD1
 ↻ ≫
HAP1
  SRX3312896
MTHFD1
 ↻ ≫
HAP1
  SRX3312887
BRD4
 ↻ ≫
HAP1
  SRX3312886
BRD4
 ↻ ≫
HAP1
  SRX3312885
BRD4
 ↻ ≫
HAP1
  SRX3312884
BRD4
 ↻ ≫
OCI-LY1
  SRX3135180
BCL6
 ↻ ≫
ME-1
  SRX3030205
RUNX1
 ↻