ChIP-Atlas: Colocalization analysis

Colocalization analysis for RELA

Query protein: RELA
Cell class: Blood
Sort key: SRX790965 | L-1236
 
Color legends
ChIP-seq data:  H-H H-M M-M H-L M-L L-L N.D. Same  (Peak intensities are High, Middle or Low)

STRING data:  1000 750 500 250 0 N.D.  (Values = STRING's binding scores)

Downloads: TSV (text), GML (Cytoscape)
Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Colocalization
Cell types  Exp. IDs RELA's Colocalization partners

◢ RELA: Average

◢ SRX4401061: BJAB

◢ SRX4401062: BJAB

◢ SRX4401063: BJAB

◢ SRX4401064: BJAB

◢ SRX4401065: BJAB

◢ SRX4401066: BJAB

◢ SRX5371742: CD4+ T cells

◢ SRX5371743: CD4+ T cells

◢ SRX017887: GM10847

◢ SRX017888: GM10847

◢ SRX017889: GM10847

◢ SRX017890: GM10847

◢ SRX017891: GM10847

◢ SRX150606: GM10847

◢ SRX017905: GM12878

◢ SRX017906: GM12878

◢ SRX017907: GM12878

◢ SRX017908: GM12878

◢ SRX150557: GM12878

◢ SRX2837382: GM12878

◢ SRX017911: GM12891

◢ SRX017912: GM12891

◢ SRX017913: GM12891

◢ SRX150605: GM12891

◢ SRX017882: GM12892

◢ SRX017883: GM12892

◢ SRX017884: GM12892

◢ SRX150365: GM12892

◢ SRX017875: GM15510

◢ SRX017876: GM15510

◢ SRX017877: GM15510

◢ SRX017878: GM15510

◢ SRX017879: GM15510

◢ SRX150608: GM15510

◢ SRX017863: GM18526

◢ SRX017864: GM18526

◢ SRX017865: GM18526

◢ SRX017866: GM18526

◢ SRX017867: GM18526

◢ SRX017900: GM18526

◢ SRX017901: GM18526

◢ SRX017902: GM18526

◢ SRX150361: GM18526

◢ SRX150362: GM18526

◢ SRX017894: GM18951

◢ SRX017895: GM18951

◢ SRX017896: GM18951

◢ SRX017897: GM18951

◢ SRX150610: GM18951

◢ SRX017870: GM19099

◢ SRX017871: GM19099

◢ SRX017872: GM19099

◢ SRX150353: GM19099

◢ SRX017858: GM19193

◢ SRX017859: GM19193

◢ SRX017860: GM19193

◢ SRX150359: GM19193

◣ SRX790965: L-1236

◢ SRX790966: L-1236

◢ SRX256997: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX256998: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX256999: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX257000: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX7083406: RAMOS

◢ SRX1460847: Th1 Cells

◢ SRX1460848: Th1 Cells

◢ SRX4001966: THP-1

◢ SRX4001967: THP-1

◢ RELA: STRING
L-1236
  SRX790965
RELA
 ↻ ≫
OCI-LY-10
  SRX347421
STAT3
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150585
NFYA
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX256995
NR3C1
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX256994
NR3C1
 ↻ ≫
HBL-1
  SRX1652872
POU2AF1
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150730
IRF3
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150636
STAT3
 ↻ ≫
K-562
  SRX218221
HSF2
 ↻ ≫
K-562
  SRX218218
HSF2
 ↻ ≫
K-562
  SRX186700
HDAC6
 ↻ ≫
GM12878
  SRX186694
EZH2
 ↻ ≫
K-562
  SRX186615
ZC3H11A
 ↻ ≫
GM12878
  SRX186610
ESRRA
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150691
STAT1
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150496
SUPT20H
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150494
KAT2A
 ↻ ≫
MV-4-11
  SRX1293532
KMT2A
 ↻ ≫
K-562
  SRX116439
KDM5B
 ↻ ≫
K-562
  SRX092302
HDAC8
 ↻ ≫
K-562
  SRX092299
NR4A1
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX256997
RELA
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX256996
NR3C1
 ↻ ≫
T cells
  SRX3666504
TP53
 ↻ ≫
T cells
  SRX3666502
TP53
 ↻ ≫
T cells
  SRX3666498
TP53
 ↻ ≫
T cells
  SRX3666496
TP53
 ↻ ≫
K-562
  SRX186761
NCOR1
 ↻ ≫
K-562
  SRX4708073
HNRNPUL1
 ↻ ≫
OCI-LY-7
  SRX271854
EZH2
 ↻ ≫
K-562
  SRX218228
HSF2
 ↻ ≫
Plasma Cells
  SRX203395
MED1
 ↻ ≫
K-562
  SRX186764
CBX3
 ↻ ≫
K-562
  SRX186648
SETDB1
 ↻ ≫
P493-6
  SRX148962
CDK9
 ↻ ≫
K-562
  SRX116427
CBX3
 ↻ ≫
K-562
  SRX116426
HDAC6
 ↻ ≫
K-562
  SRX116421
HDAC1
 ↻ ≫
K-562
  SRX116419
SETDB1
 ↻ ≫
GM12878
  SRX102989
MYC
 ↻ ≫
KMS-28PE
  SRX6430580
EZH2
 ↻ ≫
KMS-28PE
  SRX6430578
EZH2
 ↻ ≫
KMS-28BM
  SRX6430575
EZH2
 ↻ ≫
P493-6
  SRX204414
MED1
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX256998
RELA
 ↻ ≫
K-562
  SRX186762
KAT2B
 ↻ ≫
MM1.RL
  SRX758135
NR3C1
 ↻ ≫
K-562
  SRX150580
GTF2F1
 ↻ ≫
T cells
  SRX3666506
TP53
 ↻ ≫
T cells
  SRX3666500
TP53
 ↻ ≫
K-562
  SRX116432
NCOR1
 ↻ ≫
KMS-28BM
  SRX6430573
EZH2
 ↻ ≫
K-562
  SRX218220
HSF1
 ↻ ≫
K-562
  SRX218217
HSF1
 ↻ ≫
MM.1S
  SRX2140215
CDKN1B
 ↻ ≫
MM.1S
  SRX2140213
CCND2
 ↻ ≫
HBL-1
  SRX1652873
POU2AF1
 ↻ ≫
K-562
  SRX1491463
ASH1L
 ↻ ≫
P493-6
  SRX148963
CDK9
 ↻ ≫
P493-6
  SRX129067
MYC
 ↻ ≫
K-562
  SRX186772
EZH2
 ↻ ≫
K-562
  SRX186770
CREBBP
 ↻ ≫
K-562
  SRX116429
CREBBP
 ↻ ≫
OCI-LY-7
  SRX1048478
EP300
 ↻ ≫
K-562
  SRX116435
KAT2B
 ↻ ≫
K-562
  SRX150625
IRF1
 ↻ ≫
K-562
  SRX186756
SIRT6
 ↻ ≫
T cells
  SRX3666508
TP53
 ↻ ≫
T cells
  SRX3666488
TP53
 ↻ ≫
K-562
  SRX4708095
CCAR2
 ↻ ≫
THP-1
  SRX387776
VDR
 ↻ ≫
K-562
  SRX218227
HSF1
 ↻ ≫
K-562
  SRX218225
HSF2
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX212366
EPAS1
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX212365
EPAS1
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX212364
EPAS1
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX212363
EPAS1
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX212362
HIF1A
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX212361
HIF1A
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX212360
HIF1A
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX212359
HIF1A
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX212358
EPAS1
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX212357
EPAS1
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX212355
EPAS1
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX212354
HIF1A
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX212353
HIF1A
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX212351
HIF1A
 ↻ ≫
Plasma Cells
  SRX203394
MAX
 ↻ ≫
K-562
  SRX186741
SUZ12
 ↻ ≫
K-562
  SRX186674
CHD7
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150731
NFE2
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150457
BRCA1
 ↻ ≫
K-562
  SRX116449
SUZ12
 ↻ ≫
K-562
  SRX116418
CHD7
 ↻ ≫
SU-DHL-4
  SRX1048490
MEF2B
 ↻ ≫
OCI-LY-7
  SRX1048477
BACH2
 ↻ ≫
U-937
  SRX097110
CEBPA
 ↻ ≫
K-562
  SRX097090
SMAD1
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX093192
EGR2
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX093191
EGR2
 ↻ ≫
THP-1
  SRX054458
NR1H3
 ↻ ≫
THP-1
  SRX054457
NR1H3
 ↻ ≫
THP-1
  SRX045435
VDR
 ↻ ≫
NB-4
  SRX014750
PML
 ↻ ≫
K-562
  SRX116448
SIRT6
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX326889
ERG
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX212356
EPAS1
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX212352
HIF1A
 ↻ ≫
CD20+
  SRX186666
EZH2
 ↻ ≫
MOLM-13
  SRX1735800
CDK9
 ↻ ≫
L-1236
  SRX790966
RELA
 ↻ ≫
Dendritic Cells
  SRX5095870
SPI1
 ↻ ≫
Erythroblasts
  SRX467199
NR2C2
 ↻ ≫
MM.1S
  SRX447601
CDK7
 ↻ ≫
CD34+
  SRX447429
MLLT3
 ↻ ≫
MM.1S
  SRX2140214
CDKN1B
 ↻ ≫
Treg
  SRX212446
FOXP3
 ↻ ≫
Treg
  SRX212437
ETS1
 ↻ ≫
CUTLL1
  SRX070883
RBPJ
 ↻ ≫
RPMI 8226
  SRX6430588
EZH2
 ↻ ≫
Multiple Myeloma
  SRX129117
MED1
 ↻ ≫
K-562
  SRX150573
EP300
 ↻ ≫
DOHH-2
  SRX1048455
EP300
 ↻ ≫
CD34+
  SRX447428
KMT2A
 ↻ ≫
K-562
  SRX2442522
CUX1
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150559
NR2C2
 ↻ ≫
P493-6
  SRX129088
MED1
 ↻ ≫
K-562
  SRX116425
HDAC6
 ↻ ≫
P493-6
  SRX129087
MED1
 ↻ ≫
KARPAS-422
  SRX6430557
EZH2
 ↻ ≫
GM12878
  SRX186608
SREBF2
 ↻ ≫
MOLM-13
  SRX1735799
CDK9
 ↻ ≫
GM18951
  SRX017895
RELA
 ↻ ≫
GM12892
  SRX017884
RELA
 ↻ ≫
GM19099
  SRX017870
RELA
 ↻ ≫
GM19193
  SRX017859
RELA
 ↻ ≫
GM12892
  SRX150365
RELA
 ↻ ≫
GM18526
  SRX150361
RELA
 ↻ ≫
GM19193
  SRX150359
RELA
 ↻ ≫
GM18951
  SRX017897
RELA
 ↻ ≫
GM10847
  SRX017891
RELA
 ↻ ≫
GM19099
  SRX017872
RELA
 ↻ ≫
GM19099
  SRX017871
RELA
 ↻ ≫
GM19193
  SRX017860
RELA
 ↻ ≫
GM12878
  SRX017907
RELA
 ↻ ≫
GM15510
  SRX150608
RELA
 ↻ ≫
GM18951
  SRX150610
RELA
 ↻ ≫
GM10847
  SRX150606
RELA
 ↻ ≫
GM18526
  SRX017865
RELA
 ↻ ≫
GM19099
  SRX150353
RELA
 ↻ ≫
GM18526
  SRX150362
RELA
 ↻ ≫
GM12878
  SRX017906
RELA
 ↻ ≫
GM12878
  SRX2837382
RELA
 ↻ ≫
GM12891
  SRX017913
RELA
 ↻ ≫
GM15510
  SRX017878
RELA
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150557
RELA
 ↻ ≫
GM12878
  SRX017908
RELA
 ↻ ≫
GM18526
  SRX017867
RELA
 ↻ ≫
GM12891
  SRX017912
RELA
 ↻ ≫
GM15510
  SRX017877
RELA
 ↻ ≫
GM12878
  SRX2837384
RELB
 ↻ ≫
Th1 Cells
  SRX1460847
RELA
 ↻ ≫
GM19193
  SRX017858
RELA
 ↻ ≫
GM12891
  SRX150605
RELA
 ↻ ≫
GM12878
  SRX2837383
RELB
 ↻ ≫
GM12891
  SRX017911
RELA
 ↻ ≫
L-1236
  SRX790972
NFKB2
 ↻ ≫
GM12892
  SRX017883
RELA
 ↻ ≫
GM10847
  SRX017890
RELA
 ↻ ≫
GM15510
  SRX017879
RELA
 ↻ ≫
GM12878
  SRX2837386
REL
 ↻ ≫
GM12878
  SRX475754
EP300
 ↻ ≫
GM12878
  SRX475753
EP300
 ↻ ≫
GM18526
  SRX017900
RELA
 ↻ ≫
GM12878
  SRX2837387
NFKB1
 ↻ ≫
GM12878
  SRX017905
RELA
 ↻ ≫
L-1236
  SRX790969
NFKB1
 ↻ ≫
GM12878
  SRX2837388
NFKB1
 ↻ ≫
GM12878
  SRX392820
EP300
 ↻ ≫
GM12878
  SRX392819
EP300
 ↻ ≫
L-1236
  SRX790970
NFKB1
 ↻ ≫
GM12878
  SRX475748
EP300
 ↻ ≫
L-1236
  SRX790971
NFKB2
 ↻ ≫
GM12878
  SRX2837389
NFKB2
 ↻ ≫
GM12878
  SRX475751
EP300
 ↻ ≫
GM12878
  SRX475750
EP300
 ↻ ≫
GM12878
  SRX475749
EP300
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150374
EP300
 ↻ ≫
GM12878
  SRX190187
FOXM1
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150732
TBL1XR1
 ↻ ≫
GM12878
  SRX2458138
MED1
 ↻ ≫
GM12878
  SRX475752
EP300
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150641
EP300
 ↻ ≫
GM12878
  SRX100387
BCL3
 ↻ ≫
GM12878
  SRX190337
NFIC
 ↻ ≫
GM12878
  SRX100433
BCL11A
 ↻ ≫
GM12878
  SRX190236
ATF2
 ↻ ≫
GM12878
  SRX100407
PAX5
 ↻ ≫
BJAB
  SRX4401064
RELA
 ↻