ChIP-Atlas: Colocalization analysis

Colocalization analysis for BRD3

Query protein: BRD3
Cell class: Blood
Sort key: SRX6913060 | THP-1
 
Color legends
ChIP-seq data:  H-H H-M M-M H-L M-L L-L N.D. Same  (Peak intensities are High, Middle or Low)

STRING data:  1000 750 500 250 0 N.D.  (Values = STRING's binding scores)

Downloads: TSV (text), GML (Cytoscape)
Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Colocalization
Cell types  Exp. IDs BRD3's Colocalization partners

◢ BRD3: Average

◢ SRX4781489: Acute myeloid leukemia

◢ SRX4781490: Acute myeloid leukemia

◢ SRX4781491: Acute myeloid leukemia

◢ SRX4781492: Acute myeloid leukemia

◢ SRX4781493: Acute myeloid leukemia

◢ SRX4781494: Acute myeloid leukemia

◢ SRX4781495: Acute myeloid leukemia

◢ SRX4781496: Acute myeloid leukemia

◢ SRX6913096: CD4+ T cells

◢ SRX6913097: CD4+ T cells

◢ SRX6913098: CD4+ T cells

◢ SRX4781481: Chronic myeloid leukemia

◢ SRX4781482: Chronic myeloid leukemia

◢ SRX4781483: Chronic myeloid leukemia

◢ SRX4781484: Chronic myeloid leukemia

◢ SRX4781485: Chronic myeloid leukemia

◢ SRX4781486: Chronic myeloid leukemia

◢ SRX4781487: Chronic myeloid leukemia

◢ SRX4781488: Chronic myeloid leukemia

◢ SRX6913076: K-562

◢ SRX6913077: K-562

◢ SRX6913078: K-562

◢ SRX6913079: K-562

◢ SRX6913086: K-562

◢ SRX7135366: K-562

◢ SRX7135370: K-562

◢ SRX366792: MM.1S

◢ SRX366793: MM.1S

◢ SRX366794: MM.1S

◢ SRX366795: MM.1S

◢ SRX1923324: Mutu

◢ SRX1923325: Mutu

◢ SRX6913042: THP-1

◢ SRX6913043: THP-1

◢ SRX6913044: THP-1

◢ SRX6913058: THP-1

◢ SRX6913059: THP-1

◣ SRX6913060: THP-1

◢ SRX6913061: THP-1

◢ BRD3: STRING

THP-1
 SRX6913060
BRD3
JB6
 SRX4394539
STAT3
THP-1
 SRX6913059
BRD3
Monocytes
 SRX3586325
NR3C1
GEN2.2
 SRX1491263
BRD4
GEN2.2
 SRX1491260
BRD4
OCI-AML3
 SRX3263402
CEBPB
Macrophages
 SRX1023796
SPI1
Lymphoblastoid cell line
 SRX472276
TERF2
B cells
 SRX2253220
CD74
RAMOS
 SRX7083412
SUPT5H
CD4+ T cells
 SRX6913093
BRD2
CD4+ T cells
 SRX4345361
NFATC1
RPMI 8402
 SRX212645
ZFX
MKPL-1
 SRX6866208
PPARG
CTV-1
 SRX5574477
SPI1
HL-60
 SRX3345959
NAB2
Kasumi-1
 SRX3098200
CEBPA
K-562
 SRX2841999
NUP153
K-562
 SRX2841998
NUP98
Macrophages
 SRX1023794
SPI1
THP-1
 SRX5852998
AR
Monocytes
 SRX3934090
INTS13
OCI-AML3
 SRX3263400
BRD4
CD4+ T cells
 SRX6913096
BRD3
Kasumi-1
 SRX4390178
JUND
KK1
 SRX2548294
BRD4
NOMO-1
 SRX212643
ZFX
Macrophages
 SRX1023795
SPI1
MKPL-1
 SRX6866209
RXRA
CD4+ T cells
 SRX6913098
BRD3
CD4+ T cells
 SRX6913097
BRD3
THP-1
 SRX5852999
AR
CD4+ T cells
 SRX6913094
BRD2
TALL-1
 SRX5574511
SPI1
TALL-1
 SRX5574510
SPI1
THP-1
 SRX4001968
FOS
THP-1
 SRX4001966
RELA
B cells
 SRX2253225
CD74
CAL-1
 SRX220959
CBFA2T3
TF-1
 SRX1261525
SMC3
TF-1
 SRX1261520
RUNX1
RC-K8
 ERX1035594
FOXP1
K-562
 SRX6913085
BRD2
K-562
 SRX6913075
BRD2
K-562
 SRX6913074
BRD2
K-562
 SRX6913073
BRD2
K-562
 SRX6913072
BRD2
BJAB
 SRX2059875
SUPT5H
MOLT-4
 SRX2314265
SUPT5H
MOLT-4
 SRX2314264
SUPT5H
MOLT-4
 SRX2314263
SUPT5H
K-562
 SRX6913086
BRD3
K-562
 SRX6913076
BRD3
Acute myeloid leukemia
 SRX4781496
BRD3
Acute myeloid leukemia
 SRX4781493
BRD3
Acute myeloid leukemia
 SRX4781475
BRD2
Acute myeloid leukemia
 SRX4781473
BRD2
Acute myeloid leukemia
 SRX4781476
BRD2
K-562
 SRX3852898
NELFA
K-562
 SRX3852892
NELFE
K-562
 SRX3852890
NELFA
THP-1
 SRX6913057
BRD2
THP-1
 SRX6913056
BRD2
THP-1
 SRX6913055
BRD2
THP-1
 SRX6913054
BRD2
NAMALWA
 SRX389278
NRF1
K-562
 SRX3852900
NELFE
K-562
 SRX3852891
NELFE
Jurkat
 SRX2513053
TET2
Jurkat
 SRX2513052
TET2
SEM
 SRX2281252
KMT2A
K-562
 SRX100476
TAF1
Lymphoblastoid cell line
 SRX2867628
BRD4
MOLM-14
 SRX1287856
BRD4
MOLM-14
 SRX1287854
BRD4
MV-4-11
 SRX1134766
BRD4
MV-4-11
 SRX1134763
BRD4
GM12878
 SRX100582
TAF1
GM12891
 SRX100438
TAF1
Acute myeloid leukemia
 SRX4781512
BRD4
Acute myeloid leukemia
 SRX4781510
BRD4
Chronic myeloid leukemia
 SRX4781504
BRD4
Chronic myeloid leukemia
 SRX4781500
BRD4
Chronic myeloid leukemia
 SRX4781469
BRD2
Chronic myeloid leukemia
 SRX4781466
BRD2
Erythroblasts
 SRX4046302
CXXC1
Macrophages
 SRX5839977
CREBBP
K-562
 SRX6913091
BRD4
THP-1
 SRX6913062
BRD4
THP-1
 SRX6913050
BRD4
THP-1
 SRX6913045
BRD4
Acute myeloid leukemia
 SRX4781508
BRD4
Acute myeloid leukemia
 SRX4781477
BRD2
THP-1
 SRX2900590
NCOA2
RS4-11
 SRX151223
AFF1
GM12878
 SRX150389
NRF1
GM12892
 SRX100534
TAF1
K-562
 SRX100430
HEY1
Chronic myeloid leukemia
 SRX4781488
BRD3
Chronic myeloid leukemia
 SRX4781482
BRD3
THP-1
 SRX6913049
BRD4
Jurkat
 SRX3934089
INTS13
Th1 Cells
 SRX1460852
BRD4
THP-1
 SRX6913042
BRD3
CD8+ T cells
 SRX2464017
EP300
THP-1
 SRX6913039
BRD2
Chronic myeloid leukemia
 SRX4781502
BRD4
K-562
 SRX3852899
NELFE
K-562
 SRX3852895
NELFA
Mutu
 SRX1923320
BRD4
K-562
 SRX186782
KDM5B
K-562
 SRX6913078
BRD3
Kasumi-1
 SRX747574
EP300
THP-1
 SRX6913069
BRD4
THP-1
 SRX6913066
BRD4
THP-1
 SRX6913048
BRD4
Jurkat
 SRX398095
CDK7
MV-4-11
 SRX1134739
BRD4
K-562
 SRX6913079
BRD3
THP-1
 SRX728790
CDK12
THP-1
 SRX5503140
STAT1
NALM-6
 SRX3586355
RUNX1
OCI-LY1
 SRX3135180
BCL6
B Lymphoblastoid cell line
 SRX2614803
DNMT3B
B Lymphoblastoid cell line
 SRX2614802
DNMT3B
B Lymphoblastoid cell line
 SRX2614800
DNMT3B
MOLM-13
 SRX2546006
METTL14
MM.1S
 SRX1726514
TFDP1
Hematopoietic Stem Cells
 SRX1089827
TAL1
Hematopoietic Stem Cells
 SRX1089824
GATA1
K-562
 SRX1085072
KDM2B
HPB-ALL
 SRX1085070
KDM2B
Chronic myeloid leukemia
 SRX4781484
BRD3
CD8+ T cells
 SRX2464018
EP300
CD8+ T cells
 SRX2464016
EP300
T-ALL
 SRX7750230
YY1
THP-1
 SRX728789
CDK12
CD4+ T cells
 SRX6913099
BRD4
K-562
 SRX6913088
BRD4
K-562
 SRX6913082
BRD4
THP-1
 SRX6913067
BRD4
Erythroblasts
 SRX646126
SUZ12
ICN1
 SRX625677
IKZF1
Acute myeloid leukemia
 SRX4781511
BRD4
Chronic myeloid leukemia
 SRX4781498
BRD4
Chronic myeloid leukemia
 SRX4781472
BRD2
Chronic myeloid leukemia
 SRX4781468
BRD2
Erythroblasts
 SRX467201
NR2C2
Monocytes
 SRX3934095
INTS13
Jurkat
 SRX3934088
INTS13
HL-60
 SRX3934087
INTS13
HL-60
 SRX3934085
INTS13
CUTLL1
 SRX3433645
USP7
HL-60
 SRX3345953
INTS13
MOLT-4
 SRX2314262
SUPT5H
Cord blood mononuclear
 SRX2281258
KMT2A
CD4+ T cells
 SRX212448
FOXP3
MM.1S
 SRX204905
BRD4
CD4+ T cells
 SRX198034
BRD4
GM12878
 SRX190227
PML
K-562
 SRX186646
PHF8
Dendritic Cells
 SRX1614811
ZNF366
K-562
 SRX116438
KDM5B
K-562
 SRX116437
PHF8
K-562
 SRX116436
PHF8
GM12891
 SRX100580
YY1
GM12892
 SRX100561
YY1
K-562
 SRX100515
YY1
K-562
 SRX100491
YY1
GM12878
 SRX100451
YY1
Acute promyelocytic leukemia
 SRX026657
ERG
HB1119
 DRX059608
AFF1
Akata
 SRX2795369
BRD4
Akata
 SRX2795368
BRD4
Akata
 SRX2795367
BRD4
Akata
 SRX2795366
BRD4
Th1 Cells
 SRX1460848
RELA
K-562
 SRX1431735
SPI1
MM.1S
 SRX366792
BRD3
Erythroblasts
 SRX3768721
MLLT3
CD34 Hematopoietic stem cells
 SRX3768715
MLLT3
MV-4-11
 SRX849400
CDK8
U-937
 SRX4705118
CHAF1A
MV-4-11
 SRX4170725
WDR5
Erythroblasts
 SRX4046306
HCFC1
HAP1
 SRX3312899
MTHFD1
HAP1
 SRX3312898
MTHFD1
HAP1
 SRX3312897
MTHFD1
HAP1
 SRX3312896
MTHFD1
MOLM-13
 SRX2546003
METTL14
ALL-SIL
 SRX1085073
KDM2B
DND-41
 SRX1085069
KDM2B
Chronic myeloid leukemia
 SRX4781483
BRD3
K-562
 SRX150574
TBP
OCI-LY-7
 SRX971780
KMT2D
K-562
 SRX6913089
BRD4
K-562
 SRX6913087
BRD4
K-562
 SRX6913083
BRD4
K-562
 SRX6913080
BRD4
TSU-1621MT
 SRX682379
RARA
Chronic myeloid leukemia
 SRX4781470
BRD2
K-562
 SRX4708090
GTF2F1
K-562
 SRX4708082
RBFOX2
KOPT-K1
 SRX448939
BRD4
Erythroblasts
 SRX4046308
RBBP5
CUTLL1
 SRX369136
BRD4
B-CLL cells
 SRX3591434
BRD4
B-CLL cells
 SRX3591432
BRD4
B-CLL cells
 SRX3591431
BRD4
B-CLL cells
 SRX3591428
BRD4
CUTLL1
 SRX3433644
USP7
HL-60
 SRX3345955
INTS13
Lymphoblastoid cell line
 SRX2778398
YY1
Jurkat
 SRX2711485
USP7
Jurkat
 SRX2711484
USP7
MM.1S
 SRX244180
CDK9
Jurkat
 SRX1880278
BRD4
K-562
 SRX186645
RBBP5
MOLT-4
 SRX1637463
BRD4
P493-6
 SRX1539275
MYC
MV-4-11
 SRX1293531
KMT2A
K-562
 SRX116442
RBBP5
MV-4-11
 SRX1134743
BRD4
Thymus
 SRX1046558
RAG2
CD4+ T cells
 SRX103444
BRD4
GM12878
 SRX100541
ELF1
SKNO-1
 SRX063913
RUNX1
Mutu
 SRX1923325
BRD3
Mutu
 SRX1923324
BRD3
K-562
 SRX7494161
HIF1A
THP-1
 SRX6913065
BRD4
KARPAS-422
 SRX6430558
SUZ12
KARPAS-422
 SRX6430557
EZH2
Acute myeloid leukemia
 SRX4781480
BRD2
Acute myeloid leukemia
 SRX4781479
BRD2
Acute myeloid leukemia
 SRX4781474
BRD2
Chronic myeloid leukemia
 SRX4781471
BRD2
Acute myeloid leukemia
 SRX3789539
RUNX1
CUTLL1
 SRX2384347
MYC
CD4+ T cells
 SRX212447
FOXP3
K-562
 SRX1097313
ATRX
SUP-B15
 SRX1085067
KDM2B
REH
 SRX1085065
KDM2B
K-562
 SRX1085063
KDM2B
HL-60
 SRX3345954
INTS13
Th1 Cells
 SRX1460851
BRD4
HB1119
 DRX059612
KMT2B
CD34 Hematopoietic stem cells
 SRX3768714
MLLT3
GM12878
 SRX475789
EP300
CUTLL1
 SRX515116
KDM6B
Th17 Cells
 SRX965494
STAT3
GM04604
 SRX8066535
CTCF
GM06077
 SRX8066531
CTCF
K-562
 SRX7494162
HIF1A
CCRF-CEM
 SRX728785
PAF1
THP-1
 SRX728776
LEO1
CD4+ T cells
 SRX6913100
BRD4
THP-1
 SRX6913041
BRD2
THP-1
 SRX5503139
IRF9
SEM
 SRX4931277
ELL2
SEM
 SRX4931276
AFF4
SEM
 SRX4931274
ELL2
SEM
 SRX4931273
AFF4
MV-4-11
 SRX4170733
WDR5
MV-4-11
 SRX4170732
WDR5
MV-4-11
 SRX4170731
WDR5
MV-4-11
 SRX4170729
WDR5
MV-4-11
 SRX4170727
WDR5
Lymphoblastoid cell line
 SRX4046315
CXXC1
OCI-LY1
 SRX398293
BRD4
ALL xenograft
 SRX3636820
NR3C1
HL-60
 SRX3434295
SKI
OCI-LY-10
 SRX3387558
STAT3
OCI-LY-10
 SRX3387557
STAT3
HAP1
 SRX3312887
BRD4
HAP1
 SRX3312886
BRD4
HAP1
 SRX3312885
BRD4
HAP1
 SRX3312884
BRD4
MV-4-11
 SRX3031981
BRD4
ME-1
 SRX3030205
RUNX1
CD4+ T cells
 SRX2821736
FOSL1
Jurkat
 SRX2730808
ARID5B
Pfeiffer
 SRX271860
EZH2
SU-DHL-6
 SRX271858
EZH2
Th17 Cells
 SRX2661479
STAT3
B Lymphoblastoid cell line
 SRX2614801
DNMT3B
MOLM-13
 SRX2546005
METTL14
MOLM-13
 SRX2546001
METTL3
SKNO-1
 SRX1942893
ASXL2
HL-60
 SRX190278
GABPA
K-562
 SRX186630
HCFC1
RAJI
 SRX1497394
MYC
Hematopoietic Stem Cells
 SRX1089825
TAL1
Hematopoietic Stem Cells
 SRX1089823
GATA1
GM12878
 SRX100401
GABPA
K-562
 SRX037418
NFYA
Macrophages
 ERX2277468
CSF1R
HB1119
 DRX059613
TAF1C
HB1119
 DRX059611
DOT1L
HB1119
 DRX059607
MLLT6
GM12878
 SRX392813
EP300
Acute myeloid leukemia
 SRX4781478
BRD2
HB1119
 DRX059610
CBX8
THP-1
 SRX6913061
BRD3
CD34 Hematopoietic stem cells
 SRX3768713
MLLT3
GM12878
 SRX392814
EP300
K-562
 SRX849404
CDK8
SET-2
 SRX849396
CDK8