ChIP-Atlas: Colocalization analysis

Colocalization analysis for RAD21

Query protein: RAD21
Cell class: Blood
Sort key: SRX5883962 | Multiple Myeloma
 
Color legends
ChIP-seq data:  H-H H-M M-M H-L M-L L-L N.D. Same  (Peak intensities are High, Middle or Low)

STRING data:  1000 750 500 250 0 N.D.  (Values = STRING's binding scores)

Downloads: TSV (text), GML (Cytoscape)
Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Colocalization
<
Cell types  Exp. IDs RAD21's Colocalization partners

◢ RAD21: Average

◢ SRX100461: GM12878

◢ SRX150412: GM12878

◢ SRX6777951: HAP1

◢ SRX6777952: HAP1

◢ SRX100492: K-562

◢ SRX150399: K-562

◢ SRX7202561: K-562

◢ SRX8841625: Lymphoblasts

◢ SRX8841627: Lymphoblasts

◢ SRX8841629: Lymphoblasts

◢ SRX8841631: Lymphoblasts

◢ SRX4001762: Macrophages

◢ SRX4001763: Macrophages

◢ SRX4001764: Macrophages

◢ SRX4001765: Macrophages

◢ SRX5883959: Multiple Myeloma

◢ SRX5883960: Multiple Myeloma

◢ SRX5883961: Multiple Myeloma

◣ SRX5883962: Multiple Myeloma

◢ SRX5391682: Neutrophils

◢ SRX5391683: Neutrophils

◢ SRX5391684: Neutrophils

◢ SRX5391685: Neutrophils

◢ SRX7083410: RAMOS

◢ SRX4001823: THP-1

◢ SRX4001824: THP-1

◢ SRX4001825: THP-1

◢ SRX4001826: THP-1

◢ SRX4001827: THP-1

◢ SRX4001868: THP-1

◢ SRX4001869: THP-1

◢ SRX4001870: THP-1

◢ SRX4001871: THP-1

◢ SRX4001872: THP-1

◢ SRX4001873: THP-1

◢ SRX4001874: THP-1

◢ SRX4001875: THP-1

◢ SRX4001876: THP-1

◢ SRX4001877: THP-1

◢ SRX4001878: THP-1

◢ SRX4001904: THP-1

◢ SRX4001905: THP-1

◢ SRX4001906: THP-1

◢ SRX4001907: THP-1

◢ SRX4001908: THP-1

◢ SRX4001909: THP-1

◢ SRX4001910: THP-1

◢ SRX4001911: THP-1

◢ SRX4001912: THP-1

◢ SRX4001913: THP-1

◢ SRX4001914: THP-1

◢ SRX4001942: THP-1

◢ SRX4001943: THP-1

◢ SRX4001944: THP-1

◢ SRX4001945: THP-1

◢ SRX476481: THP-1

◢ RAD21: STRING
Multiple Myeloma
  SRX5883962
RAD21
 ↻ ≫
KARPAS-422
  SRX6430558
SUZ12
 ↻ ≫
KARPAS-422
  SRX6430557
EZH2
 ↻ ≫
Multiple Myeloma
  SRX5883961
RAD21
 ↻ ≫
Multiple Myeloma
  SRX5883960
RAD21
 ↻ ≫
Multiple Myeloma
  SRX5883959
RAD21
 ↻ ≫
K-562
  SRX7494163
HIF1A
 ↻ ≫
Erythroid progenitors
  SRX687556
GATA2
 ↻ ≫
Erythroid progenitors
  SRX687554
HDAC1
 ↻ ≫
Erythroblasts
  SRX646126
SUZ12
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX5839977
CREBBP
 ↻ ≫
Multiple Myeloma
  SRX541386
EZH2
 ↻ ≫
Multiple Myeloma
  SRX541384
EZH2
 ↻ ≫
PBMC
  SRX3942990
ZNF341
 ↻ ≫
CD34+
  SRX386204
GFI1B
 ↻ ≫
CD34+ cells
  SRX3195440
MLLT3
 ↻ ≫
OCI-LY1
  SRX3135181
BCL6
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX206835
RUNX1
 ↻ ≫
RS4-11
  SRX151223
AFF1
 ↻ ≫
K-562
  SRX1431735
SPI1
 ↻ ≫
K-562
  SRX1431734
SPI1
 ↻ ≫
Hematopoietic Stem Cells
  SRX1089828
NFE2
 ↻ ≫
HB1119
  DRX059610
CBX8
 ↻ ≫
Chronic myeloid leukemia
  SRX4781469
BRD2
 ↻ ≫
Acute myeloid leukemia
  SRX4781512
BRD4
 ↻ ≫
Chronic myeloid leukemia
  SRX4781500
BRD4
 ↻ ≫
Chronic myeloid leukemia
  SRX4781498
BRD4
 ↻ ≫
Chronic myeloid leukemia
  SRX4781488
BRD3
 ↻ ≫
Chronic myeloid leukemia
  SRX4781484
BRD3
 ↻ ≫
Chronic myeloid leukemia
  SRX4781482
BRD3
 ↻ ≫
Chronic myeloid leukemia
  SRX4781466
BRD2
 ↻ ≫
Th17 Cells
  SRX2661483
STAT3
 ↻ ≫
K-562
  SRX1097313
ATRX
 ↻ ≫
ALL-SIL
  SRX1085073
KDM2B
 ↻ ≫
GM06077
  SRX8066531
CTCF
 ↻ ≫
K-562
  SRX7494162
HIF1A
 ↻ ≫
GM12878
  SRX749133
BRD4
 ↻ ≫
CCRF-CEM
  SRX728785
PAF1
 ↻ ≫
Acute myeloid leukemia
  SRX5930120
HDAC3
 ↻ ≫
SEM
  SRX4931277
ELL2
 ↻ ≫
SEM
  SRX4931276
AFF4
 ↻ ≫
Chronic myeloid leukemia
  SRX4781504
BRD4
 ↻ ≫
Chronic myeloid leukemia
  SRX4781483
BRD3
 ↻ ≫
Chronic myeloid leukemia
  SRX4781472
BRD2
 ↻ ≫
GM12878
  SRX475789
EP300
 ↻ ≫
U-937
  SRX4705117
CHAF1A
 ↻ ≫
CD34 Hematopoietic stem cells
  SRX3768715
MLLT3
 ↻ ≫
P493-6
  SRX353807
MYC
 ↻ ≫
HAP1
  SRX3312899
MTHFD1
 ↻ ≫
HAP1
  SRX3312897
MTHFD1
 ↻ ≫
Akata
  SRX2795373
BRD4
 ↻ ≫
Th17 Cells
  SRX2661481
STAT3
 ↻ ≫
B Lymphoblastoid cell line
  SRX2614800
DNMT3B
 ↻ ≫
CD34+
  SRX248936
LMO2
 ↻ ≫
CD8+ T cells
  SRX2464017
EP300
 ↻ ≫
P493-6
  SRX148962
CDK9
 ↻ ≫
SEM
  SRX4931274
ELL2
 ↻ ≫
Chronic myeloid leukemia
  SRX4781468
BRD2
 ↻ ≫
GM12878
  SRX392814
EP300
 ↻ ≫
NALM-6
  SRX3586353
RUNX1
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cells
  SRX151229
SMC1A
 ↻ ≫
Hematopoietic Stem Cells
  SRX995497
STAG1
 ↻ ≫
Hematopoietic Stem Cells
  SRX1738530
STAG1
 ↻ ≫
Erythroid Cells
  SRX995500
CTCF
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX4521396
CTCF
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356546
CTCF
 ↻ ≫
TF-1
  SRX1261519
GATA2
 ↻ ≫
GM12878
  SRX038505
CTCF
 ↻ ≫
K-562
  SRX7202561
RAD21
 ↻ ≫
Neutrophils
  SRX5391683
RAD21
 ↻ ≫
K-562
  SRX150390
SMC3
 ↻ ≫
MS1
  SRX356806
STAG1
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356729
STAG1
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356728
STAG1
 ↻ ≫
GM19240
  SRX356711
STAG1
 ↻ ≫
GM19239
  SRX356687
STAG1
 ↻ ≫
GM19193
  SRX356645
STAG1
 ↻ ≫
GM19193
  SRX356644
STAG1
 ↻ ≫
GM19099
  SRX356628
STAG1
 ↻ ≫
GM19099
  SRX356627
STAG1
 ↻ ≫
GM18951
  SRX356611
STAG1
 ↻ ≫
GM18951
  SRX356610
STAG1
 ↻ ≫
GM18526
  SRX356594
STAG1
 ↻ ≫
GM18526
  SRX356593
STAG1
 ↻ ≫
GM18505
  SRX356577
STAG1
 ↻ ≫
GM18505
  SRX356576
STAG1
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356560
STAG1
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356500
STAG1
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356499
STAG1
 ↻ ≫
GM12878
  SRX356480
STAG1
 ↻ ≫
GM10847
  SRX356454
STAG1
 ↻ ≫
GM10847
  SRX356453
STAG1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570929
HAP1
 ↻ ≫
Neutrophils
  SRX5391688
CTCF
 ↻ ≫
Kasumi-1
  SRX4890467
CTCF
 ↻ ≫
Kasumi-1
  SRX4890466
CTCF
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX4288471
CTCF
 ↻ ≫
THP-1
  SRX2655462
CTCF
 ↻ ≫
THP-1
  SRX2655461
CTCF
 ↻ ≫
THP-1
  SRX2655459
CTCF
 ↻ ≫
T cells
  SRX1425809
CTCF
 ↻ ≫
TF-1
  SRX1261518
GATA2
 ↻ ≫
CD34 Hematopoietic stem cells
  SRX097072
SMAD1
 ↻ ≫
Lymphoblasts
  SRX8841631
RAD21
 ↻ ≫
Lymphoblasts
  SRX8841629
RAD21
 ↻ ≫
Lymphoblasts
  SRX8841627
RAD21
 ↻ ≫
Lymphoblasts
  SRX8841625
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX476481
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001913
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001912
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001911
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001909
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001908
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001878
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001876
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001875
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001873
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001872
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001871
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001869
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001868
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001827
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001825
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001823
RAD21
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX4001765
RAD21
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX4001764
RAD21
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX4001763
RAD21
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX4001762
RAD21
 ↻ ≫
K-562
  SRX150399
RAD21
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX2770860
SMC1A
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX4001756
CTCF
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001874
RAD21
 ↻ ≫
GM12878
  SRX2458136
SMC1A
 ↻ ≫
GM12878
  SRX2458135
SMC1A
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150456
SMC3
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356783
STAG1
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356782
STAG1
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356765
STAG1
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356764
STAG1
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356747
STAG1
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356746
STAG1
 ↻ ≫
GM19240
  SRX356710
STAG1
 ↻ ≫
GM19239
  SRX356688
STAG1
 ↻ ≫
GM19238
  SRX356666
STAG1
 ↻ ≫
GM19238
  SRX356665
STAG1
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356559
STAG1
 ↻ ≫
GM12892
  SRX356544
STAG1
 ↻ ≫
GM12892
  SRX356543
STAG1
 ↻ ≫
GM12891
  SRX356522
STAG1
 ↻ ≫
GM12891
  SRX356521
STAG1
 ↻ ≫
GM12878
  SRX356481
STAG1
 ↻ ≫
GM12878
  SRX356479
STAG1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570949
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570947
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570945
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570943
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570941
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570939
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570937
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570935
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570932
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570931
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570927
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570925
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570923
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570921
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570919
HAP1
 ↻ ≫
Multiple Myeloma
  SRX5883951
CTCF
 ↻ ≫
K-562
  SRX5848173
CTCF
 ↻ ≫
THP-1
  SRX2655460
CTCF
 ↻ ≫
THP-1
  SRX1744960
CTCF
 ↻ ≫
THP-1
  SRX1744958
CTCF
 ↻ ≫
HAP1
  SRX6777951
RAD21
 ↻ ≫
Neutrophils
  SRX5391684
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001945
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001944
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001943
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001942
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001914
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001910
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001907
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001906
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001905
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001904
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001877
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001870
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001826
RAD21
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001824
RAD21
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150412
RAD21
 ↻ ≫
MS1
  SRX356805
STAG1
 ↻ ≫
K-562
  SRX5974560
CTCF
 ↻ ≫
Neutrophils
  SRX5391686
CTCF
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX4001760
CTCF
 ↻ ≫
GM18526
  SRX356579
CTCF
 ↻ ≫
Neutrophils
  SRX5391685
RAD21
 ↻ ≫
GM12878
  SRX100461
RAD21
 ↻ ≫
K-562
  SRX5974559
CTCF
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570948
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570924
HAP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX8570922
HAP1
 ↻ ≫
K-562
  SRX7202562
CTCF
 ↻ ≫
K-562
  SRX6828392
CTCF
 ↻ ≫
K-562
  SRX6828391
CTCF
 ↻ ≫
Multiple Myeloma
  SRX5883950
CTCF
 ↻ ≫
K-562
  SRX5848183
CTCF
 ↻ ≫
K-562
  SRX5848175
CTCF
 ↻ ≫
K-562
  SRX5848171
CTCF
 ↻ ≫
K-562
  SRX5848167
CTCF
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001947
CTCF
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001886
CTCF
 ↻ ≫
THP-1
  SRX4001834
CTCF
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX4001757
CTCF
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX4001754
CTCF
 ↻ ≫
MS1
  SRX356787
CTCF
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356768
CTCF
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356750
CTCF
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356732
CTCF
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356714
CTCF
 ↻ ≫
GM19193
  SRX356629
CTCF
 ↻ ≫
GM19099
  SRX356613
CTCF
 ↻ ≫
GM19099
  SRX356612
CTCF
 ↻ ≫
GM18951
  SRX356595
CTCF
 ↻ ≫
GM18526
  SRX356578
CTCF
 ↻ ≫
GM18505
  SRX356561
CTCF
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356547
CTCF
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX356484
CTCF
 ↻ ≫
THP-1
  SRX1744959
CTCF
 ↻ ≫
THP-1
  SRX1744957
CTCF
 ↻ ≫
THP-1
  SRX1744956
CTCF
 ↻ ≫
THP-1
  ERX2868694
CTCF
 ↻ ≫
THP-1
  ERX2868692
CTCF
 ↻ ≫
Multiple Myeloma
  SRX5883952
CTCF
 ↻ ≫
CD4+ T cells
  SRX003794
CTCF
 ↻