ChIP-Atlas: Colocalization analysis

Colocalization analysis for RAD21

Query protein: RAD21
Cell class: Blood
Sort key: SRX5883960 | Multiple Myeloma
 
Color legends
ChIP-seq data:  H-H H-M M-M H-L M-L L-L N.D. Same  (Peak intensities are High, Middle or Low)

STRING data:  1000 750 500 250 0 N.D.  (Values = STRING's binding scores)

Downloads: TSV (text), GML (Cytoscape)
Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Colocalization
Cell types  Exp. IDs RAD21's Colocalization partners

◢ RAD21: Average

◢ SRX100461: GM12878

◢ SRX150412: GM12878

◢ SRX6777951: HAP1

◢ SRX6777952: HAP1

◢ SRX100492: K-562

◢ SRX150399: K-562

◢ SRX7202561: K-562

◢ SRX8841625: Lymphoblasts

◢ SRX8841627: Lymphoblasts

◢ SRX8841629: Lymphoblasts

◢ SRX8841631: Lymphoblasts

◢ SRX4001762: Macrophages

◢ SRX4001763: Macrophages

◢ SRX4001764: Macrophages

◢ SRX4001765: Macrophages

◢ SRX5883959: Multiple Myeloma

◣ SRX5883960: Multiple Myeloma

◢ SRX5883961: Multiple Myeloma

◢ SRX5883962: Multiple Myeloma

◢ SRX5391682: Neutrophils

◢ SRX5391683: Neutrophils

◢ SRX5391684: Neutrophils

◢ SRX5391685: Neutrophils

◢ SRX7083410: RAMOS

◢ SRX4001823: THP-1

◢ SRX4001824: THP-1

◢ SRX4001825: THP-1

◢ SRX4001826: THP-1

◢ SRX4001827: THP-1

◢ SRX4001868: THP-1

◢ SRX4001869: THP-1

◢ SRX4001870: THP-1

◢ SRX4001871: THP-1

◢ SRX4001872: THP-1

◢ SRX4001873: THP-1

◢ SRX4001874: THP-1

◢ SRX4001875: THP-1

◢ SRX4001876: THP-1

◢ SRX4001877: THP-1

◢ SRX4001878: THP-1

◢ SRX4001904: THP-1

◢ SRX4001905: THP-1

◢ SRX4001906: THP-1

◢ SRX4001907: THP-1

◢ SRX4001908: THP-1

◢ SRX4001909: THP-1

◢ SRX4001910: THP-1

◢ SRX4001911: THP-1

◢ SRX4001912: THP-1

◢ SRX4001913: THP-1

◢ SRX4001914: THP-1

◢ SRX4001942: THP-1

◢ SRX4001943: THP-1

◢ SRX4001944: THP-1

◢ SRX4001945: THP-1

◢ SRX476481: THP-1

◢ RAD21: STRING

Multiple Myeloma
 SRX5883960
RAD21
KARPAS-422
 SRX6430558
SUZ12
KARPAS-422
 SRX6430557
EZH2
Multiple Myeloma
 SRX5883962
RAD21
Multiple Myeloma
 SRX5883961
RAD21
Multiple Myeloma
 SRX5883959
RAD21
OCI-LY1
 SRX3461646
KDM1A
K-562
 SRX7494163
HIF1A
Erythroid progenitors
 SRX687556
GATA2
Erythroid progenitors
 SRX687554
HDAC1
Erythroblasts
 SRX646126
SUZ12
Macrophages
 SRX5839977
CREBBP
Multiple Myeloma
 SRX541386
EZH2
Multiple Myeloma
 SRX541384
EZH2
PBMC
 SRX3942990
ZNF341
CD34+
 SRX386204
GFI1B
CD34+ cells
 SRX3195440
MLLT3
OCI-LY1
 SRX3135181
BCL6
Jurkat
 SRX206835
RUNX1
RS4-11
 SRX151223
AFF1
K-562
 SRX1431735
SPI1
K-562
 SRX1431734
SPI1
Hematopoietic Stem Cells
 SRX1089828
NFE2
HB1119
 DRX059610
CBX8
Erythroblasts
 SRX646134
EZH2
ICN1
 SRX625677
IKZF1
ICN1
 SRX625673
IKZF1
P493-6
 SRX5307506
MAX
CD4+ T cells
 SRX4345358
NFATC2
T cells
 SRX3942992
ZNF341
PBMC
 SRX3942989
ZNF341
OCI-LY1
 SRX3461647
KDM1A
B cells
 SRX3445723
ZNF341
B cells
 SRX3445722
ZNF341
OCI-AML3
 SRX3263401
CEBPB
Akata
 SRX2795368
BRD4
Akata
 SRX2795367
BRD4
Akata
 SRX2795366
BRD4
Lymphoblastoid cell line
 SRX2778398
YY1
Lymphoblastoid cell line
 SRX2778397
YY1
Lymphoblastoid cell line
 SRX2778389
YY1
SU-DHL-6
 SRX271858
EZH2
OCI-LY1
 SRX271857
EZH2
SU-DHL-5
 SRX271856
EZH2
Farage
 SRX271855
EZH2
NOMO-1
 SRX1642495
BRD9
Macrophages
 SRX1023797
SPI1
HB1119
 DRX059612
KMT2B
HB1119
 DRX059608
AFF1
Chronic myeloid leukemia
 SRX4781469
BRD2
Acute myeloid leukemia
 SRX4781512
BRD4
Chronic myeloid leukemia
 SRX4781500
BRD4
Chronic myeloid leukemia
 SRX4781498
BRD4
Chronic myeloid leukemia
 SRX4781488
BRD3
Chronic myeloid leukemia
 SRX4781484
BRD3
Chronic myeloid leukemia
 SRX4781482
BRD3
Chronic myeloid leukemia
 SRX4781466
BRD2
Th17 Cells
 SRX2661483
STAT3
K-562
 SRX1097313
ATRX
ALL-SIL
 SRX1085073
KDM2B
GM06077
 SRX8066531
CTCF
K-562
 SRX7494162
HIF1A
GM12878
 SRX749133
BRD4
CCRF-CEM
 SRX728785
PAF1
Acute myeloid leukemia
 SRX5930120
HDAC3
SEM
 SRX4931277
ELL2
SEM
 SRX4931276
AFF4
Acute myeloid leukemia
 SRX4781510
BRD4
Chronic myeloid leukemia
 SRX4781504
BRD4
Chronic myeloid leukemia
 SRX4781483
BRD3
Chronic myeloid leukemia
 SRX4781472
BRD2
GM12878
 SRX475789
EP300
U-937
 SRX4705117
CHAF1A
CD34 Hematopoietic stem cells
 SRX3768715
MLLT3
P493-6
 SRX353807
MYC
HAP1
 SRX3312899
MTHFD1
HAP1
 SRX3312897
MTHFD1
Akata
 SRX2795373
BRD4
Th17 Cells
 SRX2661481
STAT3
B Lymphoblastoid cell line
 SRX2614800
DNMT3B
CD34+
 SRX248936
LMO2
CD8+ T cells
 SRX2464017
EP300
CD4+ T cells
 SRX212448
FOXP3
CD4+ T cells
 SRX212447
FOXP3
P493-6
 SRX148962
CDK9
K-562
 SRX7494161
HIF1A
THP-1
 SRX728790
CDK12
697
 SRX6651675
NR3C1
SU-DHL-6
 SRX6430594
EZH2
B cells
 SRX5099499
STAT3
SEM
 SRX4931273
AFF4
Chronic myeloid leukemia
 SRX4781503
BRD4
Chronic myeloid leukemia
 SRX4781485
BRD3
Chronic myeloid leukemia
 SRX4781471
BRD2
Chronic myeloid leukemia
 SRX4781465
BRD2
GM12878
 SRX475791
EP300
U-937
 SRX4705118
CHAF1A
U-937
 SRX4705116
CHAF1A
GM12878
 SRX392813
EP300
CD34 Hematopoietic stem cells
 SRX3768736
MLLT3
Erythroblasts
 SRX3768721
MLLT3
HAP1
 SRX3312887
BRD4
HAP1
 SRX3312886
BRD4
HAP1
 SRX3312885
BRD4
HAP1
 SRX3312884
BRD4
OCI-LY1
 SRX3135180
BCL6
Akata
 SRX2795372
BRD4
Akata
 SRX2795370
BRD4
B Lymphoblastoid cell line
 SRX2614801
DNMT3B
CUTLL1
 SRX2384347
MYC
HBL-1
 SRX1652872
POU2AF1
K-562
 SRX116432
NCOR1
REH
 SRX1085065
KDM2B
HB1119
 DRX059611
DOT1L
Lymphoblastoid cells
 SRX151229
SMC1A
Hematopoietic Stem Cells
 SRX995497
STAG1
Hematopoietic Stem Cells
 SRX1738530
STAG1
Erythroid Cells
 SRX995500
CTCF
Macrophages
 SRX4521396
CTCF
Lymphoblastoid cell line
 SRX356546
CTCF
TF-1
 SRX1261519
GATA2
GM12878
 SRX038505
CTCF
K-562
 SRX7202561
RAD21
Neutrophils
 SRX5391683
RAD21
K-562
 SRX150390
SMC3
MS1
 SRX356806
STAG1
Lymphoblastoid cell line
 SRX356729
STAG1
Lymphoblastoid cell line
 SRX356728
STAG1
GM19240
 SRX356711
STAG1
GM19239
 SRX356687
STAG1
GM19193
 SRX356645
STAG1
GM19193
 SRX356644
STAG1
GM19099
 SRX356628
STAG1
GM19099
 SRX356627
STAG1
GM18951
 SRX356611
STAG1
GM18951
 SRX356610
STAG1
GM18526
 SRX356594
STAG1
GM18526
 SRX356593
STAG1
GM18505
 SRX356577
STAG1
GM18505
 SRX356576
STAG1
Lymphoblastoid cell line
 SRX356560
STAG1
Lymphoblastoid cell line
 SRX356500
STAG1
Lymphoblastoid cell line
 SRX356499
STAG1
GM12878
 SRX356480
STAG1
GM10847
 SRX356454
STAG1
GM10847
 SRX356453
STAG1
KBM-7
 SRX8570929
HAP1
Neutrophils
 SRX5391688
CTCF
Kasumi-1
 SRX4890467
CTCF
Kasumi-1
 SRX4890466
CTCF
Lymphoblastoid cell line
 SRX4288471
CTCF
THP-1
 SRX2655462
CTCF
THP-1
 SRX2655461
CTCF
THP-1
 SRX2655459
CTCF
T cells
 SRX1425809
CTCF
TF-1
 SRX1261518
GATA2
CD34 Hematopoietic stem cells
 SRX097072
SMAD1
Lymphoblasts
 SRX8841631
RAD21
Lymphoblasts
 SRX8841629
RAD21
Lymphoblasts
 SRX8841627
RAD21
Lymphoblasts
 SRX8841625
RAD21
THP-1
 SRX476481
RAD21
THP-1
 SRX4001913
RAD21
THP-1
 SRX4001912
RAD21
THP-1
 SRX4001911
RAD21
THP-1
 SRX4001909
RAD21
THP-1
 SRX4001908
RAD21
THP-1
 SRX4001878
RAD21
THP-1
 SRX4001876
RAD21
THP-1
 SRX4001875
RAD21
THP-1
 SRX4001873
RAD21
THP-1
 SRX4001872
RAD21
THP-1
 SRX4001871
RAD21
THP-1
 SRX4001869
RAD21
THP-1
 SRX4001868
RAD21
THP-1
 SRX4001827
RAD21
THP-1
 SRX4001825
RAD21
THP-1
 SRX4001823
RAD21
Macrophages
 SRX4001765
RAD21
Macrophages
 SRX4001764
RAD21
Macrophages
 SRX4001763
RAD21
Macrophages
 SRX4001762
RAD21
K-562
 SRX150399
RAD21
Macrophages
 SRX2770860
SMC1A
Macrophages
 SRX4001756
CTCF
THP-1
 SRX4001874
RAD21
GM12878
 SRX2458136
SMC1A
GM12878
 SRX2458135
SMC1A
GM12878
 SRX150456
SMC3
Lymphoblastoid cell line
 SRX356783
STAG1
Lymphoblastoid cell line
 SRX356782
STAG1
Lymphoblastoid cell line
 SRX356765
STAG1
Lymphoblastoid cell line
 SRX356764
STAG1
Lymphoblastoid cell line
 SRX356747
STAG1
Lymphoblastoid cell line
 SRX356746
STAG1
GM19240
 SRX356710
STAG1
GM19239
 SRX356688
STAG1
GM19238
 SRX356666
STAG1
GM19238
 SRX356665
STAG1
Lymphoblastoid cell line
 SRX356559
STAG1
GM12892
 SRX356544
STAG1
GM12892
 SRX356543
STAG1
GM12891
 SRX356522
STAG1
GM12891
 SRX356521
STAG1
GM12878
 SRX356481
STAG1
GM12878
 SRX356479
STAG1
KBM-7
 SRX8570949
HAP1
KBM-7
 SRX8570947
HAP1
KBM-7
 SRX8570945
HAP1
KBM-7
 SRX8570943
HAP1
KBM-7
 SRX8570941
HAP1
KBM-7
 SRX8570939
HAP1
KBM-7
 SRX8570937
HAP1
KBM-7
 SRX8570935
HAP1
KBM-7
 SRX8570932
HAP1
KBM-7
 SRX8570931
HAP1
KBM-7
 SRX8570927
HAP1
KBM-7
 SRX8570925
HAP1
KBM-7
 SRX8570923
HAP1
KBM-7
 SRX8570921
HAP1
KBM-7
 SRX8570919
HAP1
Multiple Myeloma
 SRX5883951
CTCF
K-562
 SRX5848173
CTCF
THP-1
 SRX2655460
CTCF
THP-1
 SRX1744960
CTCF
THP-1
 SRX1744958
CTCF
HAP1
 SRX6777951
RAD21
Neutrophils
 SRX5391684
RAD21
THP-1
 SRX4001945
RAD21
THP-1
 SRX4001944
RAD21
THP-1
 SRX4001943
RAD21
THP-1
 SRX4001942
RAD21
THP-1
 SRX4001914
RAD21