ChIP-Atlas: Colocalization analysis

Colocalization analysis for BRD4

Query protein: BRD4
Cell class: Blood
Sort key: SRX4781500 | Chronic myeloid leukemia
 
Color legends
ChIP-seq data:  H-H H-M M-M H-L M-L L-L N.D. Same  (Peak intensities are High, Middle or Low)

STRING data:  1000 750 500 250 0 N.D.  (Values = STRING's binding scores)

Downloads: TSV (text), GML (Cytoscape)
Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Colocalization
Cell types  Exp. IDs BRD4's Colocalization partners

◢ BRD4: Average

◢ SRX4781505: Acute myeloid leukemia

◢ SRX4781506: Acute myeloid leukemia

◢ SRX4781507: Acute myeloid leukemia

◢ SRX4781508: Acute myeloid leukemia

◢ SRX4781509: Acute myeloid leukemia

◢ SRX4781510: Acute myeloid leukemia

◢ SRX4781511: Acute myeloid leukemia

◢ SRX4781512: Acute myeloid leukemia

◢ SRX2795366: Akata

◢ SRX2795367: Akata

◢ SRX2795368: Akata

◢ SRX2795369: Akata

◢ SRX2795370: Akata

◢ SRX2795371: Akata

◢ SRX2795372: Akata

◢ SRX2795373: Akata

◢ SRX3591428: B-CLL cells

◢ SRX3591429: B-CLL cells

◢ SRX3591430: B-CLL cells

◢ SRX3591431: B-CLL cells

◢ SRX3591432: B-CLL cells

◢ SRX3591433: B-CLL cells

◢ SRX3591434: B-CLL cells

◢ SRX3591435: B-CLL cells

◢ SRX3591436: B-CLL cells

◢ SRX3591437: B-CLL cells

◢ SRX3591438: B-CLL cells

◢ SRX3591439: B-CLL cells

◢ SRX3154232: BCBL1

◢ SRX1491254: CAL-1

◢ SRX1491257: CAL-1

◢ SRX103444: CD4+ T cells

◢ SRX103445: CD4+ T cells

◢ SRX198033: CD4+ T cells

◢ SRX198034: CD4+ T cells

◢ SRX6913099: CD4+ T cells

◢ SRX6913100: CD4+ T cells

◢ SRX6913101: CD4+ T cells

◢ SRX6913102: CD4+ T cells

◢ SRX4781497: Chronic myeloid leukemia

◢ SRX4781498: Chronic myeloid leukemia

◢ SRX4781499: Chronic myeloid leukemia

◣ SRX4781500: Chronic myeloid leukemia

◢ SRX4781501: Chronic myeloid leukemia

◢ SRX4781502: Chronic myeloid leukemia

◢ SRX4781503: Chronic myeloid leukemia

◢ SRX4781504: Chronic myeloid leukemia

◢ SRX369136: CUTLL1

◢ SRX448953: DND-41

◢ SRX448960: DND-41

◢ SRX1491260: GEN2.2

◢ SRX1491263: GEN2.2

◢ SRX749133: GM12878

◢ SRX3312884: HAP1

◢ SRX3312885: HAP1

◢ SRX3312886: HAP1

◢ SRX3312887: HAP1

◢ SRX2937338: J-Lat A72

◢ SRX2937341: J-Lat A72

◢ SRX2937344: J-Lat A72

◢ SRX2937347: J-Lat A72

◢ SRX2937350: J-Lat A72

◢ SRX2937351: J-Lat A72

◢ SRX1880278: Jurkat

◢ SRX2245491: K-562

◢ SRX2245492: K-562

◢ SRX2841992: K-562

◢ SRX2841994: K-562

◢ SRX2841996: K-562

◢ SRX6913080: K-562

◢ SRX6913081: K-562

◢ SRX6913082: K-562

◢ SRX6913083: K-562

◢ SRX6913087: K-562

◢ SRX6913088: K-562

◢ SRX6913089: K-562

◢ SRX6913090: K-562

◢ SRX6913091: K-562

◢ SRX7135368: K-562

◢ SRX7135369: K-562

◢ SRX2548292: KK1

◢ SRX2548294: KK1

◢ SRX448939: KOPT-K1

◢ SRX448946: KOPT-K1

◢ SRX1460238: LP-1

◢ SRX1460239: LP-1

◢ SRX1460241: LP-1

◢ SRX2867628: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX2867629: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX2867630: Lymphoblastoid cell line

◢ SRX204901: MM.1S

◢ SRX204902: MM.1S

◢ SRX204903: MM.1S

◢ SRX204904: MM.1S

◢ SRX204905: MM.1S

◢ SRX219372: MM.1S

◢ SRX264460: MM.1S

◢ SRX264461: MM.1S

◢ SRX1287852: MOLM-14

◢ SRX1287854: MOLM-14

◢ SRX1287856: MOLM-14

◢ SRX1287858: MOLM-14

◢ SRX1637463: MOLT-4

◢ SRX1637465: MOLT-4

◢ SRX1637466: MOLT-4

◢ SRX327761: Multiple Myeloma

◢ SRX1923320: Mutu

◢ SRX1923321: Mutu

◢ SRX2795362: Mutu

◢ SRX2795363: Mutu

◢ SRX2795364: Mutu

◢ SRX2795365: Mutu

◢ SRX1134739: MV-4-11

◢ SRX1134743: MV-4-11

◢ SRX1134746: MV-4-11

◢ SRX1134749: MV-4-11

◢ SRX1134763: MV-4-11

◢ SRX1134766: MV-4-11

◢ SRX1134769: MV-4-11

◢ SRX2245495: MV-4-11

◢ SRX2245496: MV-4-11

◢ SRX3031981: MV-4-11

◢ SRX3031982: MV-4-11

◢ SRX3031983: MV-4-11

◢ SRX3031984: MV-4-11

◢ SRX3031985: MV-4-11

◢ SRX3031986: MV-4-11

◢ SRX3031987: MV-4-11

◢ SRX3031988: MV-4-11

◢ ERX195059: OCI-AML3

◢ ERX195060: OCI-AML3

◢ ERX195061: OCI-AML3

◢ SRX3263399: OCI-AML3

◢ SRX3263400: OCI-AML3

◢ SRX275403: OCI-LY1

◢ SRX275404: OCI-LY1

◢ SRX398291: OCI-LY1

◢ SRX398293: OCI-LY1

◢ SRX204408: P493-6

◢ SRX204409: P493-6

◢ SRX204410: P493-6

◢ SRX203387: Plasma Cells

◢ SRX203388: Plasma Cells

◢ SRX1497383: RAJI

◢ SRX1497393: RAJI

◢ SRX1873449: SEM

◢ SRX2548296: ST1

◢ SRX2548298: ST1

◢ SRX1460851: Th1 Cells

◢ SRX1460852: Th1 Cells

◢ SRX6913045: THP-1

◢ SRX6913046: THP-1

◢ SRX6913047: THP-1

◢ SRX6913048: THP-1

◢ SRX6913049: THP-1

◢ SRX6913050: THP-1

◢ SRX6913062: THP-1

◢ SRX6913063: THP-1

◢ SRX6913064: THP-1

◢ SRX6913065: THP-1

◢ SRX6913066: THP-1

◢ SRX6913067: THP-1

◢ SRX6913068: THP-1

◢ SRX6913069: THP-1

◢ BRD4: STRING

Chronic myeloid leukemia
 SRX4781500
BRD4
Macrophages
 SRX5839977
CREBBP
Erythroid progenitors
 SRX687554
HDAC1
Jurkat
 SRX206835
RUNX1
THP-1
 SRX2900590
NCOA2
Lymphoblastoid cell line
 SRX2778389
YY1
RS4-11
 SRX151223
AFF1
Lymphoblastoid cell line
 SRX2778398
YY1
ICN1
 SRX625677
IKZF1
PBMC
 SRX3942990
ZNF341
K-562
 SRX1431735
SPI1
K-562
 SRX1431734
SPI1
CD34+ cells
 SRX3195440
MLLT3
697
 SRX6909698
MED1
Erythroblasts
 SRX646134
EZH2
Jurkat
 SRX697745
PRKCQ
Jurkat
 SRX697746
PRKCQ
Erythroblasts
 SRX467201
NR2C2
Th17 Cells
 SRX965494
STAT3
HL-60
 SRX3434295
SKI
Mutu
 SRX1923324
BRD3
Mutu
 SRX1923320
BRD4
CUTLL1
 SRX515116
KDM6B
GM04604
 SRX8066535
CTCF
MOLM-13
 SRX4705112
CHAF1A
ME-1
 SRX3030205
RUNX1
Hematopoietic Stem Cells
 SRX1089823
GATA1
GM06077
 SRX8066531
CTCF
Mutu
 SRX1923325
BRD3
K-562
 SRX7494164
HIF1A
Jurkat
 SRX697744
PRKCQ
MV-4-11
 SRX4170729
WDR5
DND-41
 SRX1085069
KDM2B
HAP1
 SRX3312887
BRD4
Erythroblasts
 SRX467200
NR2C2
RAMOS
 SRX1212540
TCF3
HB1119
 DRX059612
KMT2B
HAP1
 SRX3312884
BRD4
HAP1
 SRX3312897
MTHFD1
SU-DHL-6
 SRX271858
EZH2
NOMO-1
 SRX1642494
BRD9
MV-4-11
 SRX4170728
WDR5
OCI-LY1
 SRX3135180
BCL6
SET-2
 SRX2961559
STAT1
Pfeiffer
 SRX271860
EZH2
MOLM-13
 SRX2546005
METTL14
MOLM-13
 SRX2546001
METTL3
CD34 Hematopoietic stem cells
 SRX3768714
MLLT3
SKNO-1
 SRX1942893
ASXL2
HAP1
 SRX3312885
BRD4
Akata
 SRX2795367
BRD4
Akata
 SRX2795366
BRD4
THP-1
 SRX360403
VDR
THP-1
 SRX728789
CDK12
SEM
 SRX4931277
ELL2
MV-4-11
 SRX4170732
WDR5
Jurkat
 SRX2730808
ARID5B
Erythroblasts
 SRX3768721
MLLT3
K-562
 SRX7494162
HIF1A
ALL xenograft
 SRX3636820
NR3C1
HAP1
 SRX3312898
MTHFD1
GM12878
 SRX475789
EP300
MV-4-11
 SRX4170731
WDR5
HB1119
 DRX059613
TAF1C
HB1119
 DRX059608
AFF1
HAP1
 SRX3312886
BRD4
Akata
 SRX2795368
BRD4
MV-4-11
 SRX4170724
WDR5
HAP1
 SRX3312899
MTHFD1
HB1119
 DRX059607
MLLT6
U-937
 SRX4705118
CHAF1A
Hematopoietic Stem Cells
 SRX1089825
TAL1
HAP1
 SRX3312896
MTHFD1
Mutu
 SRX2795363
BRD4
Akata
 SRX2795369
BRD4
GM04648
 SRX8066533
CTCF
MV-4-11
 SRX4170725
WDR5
U-937
 SRX4705117
CHAF1A
Treg
 SRX212442
RUNX1
SEM
 SRX4931276
AFF4
CD4+ T cells
 SRX2821737
FOSL1
OCI-LY-10
 SRX3387558
STAT3
TMD8
 SRX3387556
STAT3
K-562
 SRX7494163
HIF1A
SU-DHL-6
 SRX6430594
EZH2
TMD8
 SRX3387555
STAT3
GM12878
 SRX475791
EP300
MV-4-11
 SRX4170733
WDR5
CD4+ T cells
 SRX2821736
FOSL1