ChIP-Atlas: Colocalization analysis

Colocalization analysis for RUNX1

Query protein: RUNX1
Cell class: Blood
Sort key: SRX3789539 | Acute myeloid leukemia
 
Color legends
ChIP-seq data:  H-H H-M M-M H-L M-L L-L N.D. Same  (Peak intensities are High, Middle or Low)

STRING data:  1000 750 500 250 0 N.D.  (Values = STRING's binding scores)

Downloads: TSV (text), GML (Cytoscape)
Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Colocalization
Cell types  Exp. IDs RUNX1's Colocalization partners

◢ RUNX1: Average

◢ SRX6909701: 697

◢ SRX1036364: Acute myeloid leukemia

◢ SRX3789538: Acute myeloid leukemia

◣ SRX3789539: Acute myeloid leukemia

◢ SRX3789540: Acute myeloid leukemia

◢ SRX3789541: Acute myeloid leukemia

◢ SRX5729922: Acute myeloid leukemia

◢ SRX5729923: Acute myeloid leukemia

◢ SRX107295: CCRF-CEM

◢ SRX107296: CCRF-CEM

◢ SRX029435: CD34+

◢ SRX062339: CD34+

◢ SRX248935: CD34+

◢ SRX212443: CD4+ T cells

◢ SRX212444: CD4+ T cells

◢ SRX029081: CMK

◢ SRX369126: CUTLL1

◢ SRX1089834: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX1089835: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX3434294: HL-60

◢ SRX1041800: Jurkat

◢ SRX1492212: Jurkat

◢ SRX2014504: Jurkat

◢ SRX206835: Jurkat

◢ SRX015826: Jurkat (Clone E6-1)

◢ SRX128782: Jurkat (Clone E6-1)

◢ SRX128783: Jurkat (Clone E6-1)

◢ SRX128784: Jurkat (Clone E6-1)

◢ SRX029083: K-562

◢ SRX029085: K-562

◢ SRX062335: Kasumi-1

◢ SRX062336: Kasumi-1

◢ SRX062337: Kasumi-1

◢ SRX062338: Kasumi-1

◢ SRX112544: Kasumi-1

◢ SRX112545: Kasumi-1

◢ SRX1514291: Kasumi-1

◢ SRX259611: Kasumi-1

◢ SRX259612: Kasumi-1

◢ SRX259621: Kasumi-1

◢ SRX259622: Kasumi-1

◢ SRX747571: Kasumi-1

◢ SRX858324: Kasumi-1

◢ SRX265222: ME-1

◢ SRX3030205: ME-1

◢ SRX3030206: ME-1

◢ SRX4393711: ME-1

◢ SRX4393712: ME-1

◢ SRX5567179: ME-1

◢ SRX5567180: ME-1

◢ SRX3586353: NALM-6

◢ SRX3586355: NALM-6

◢ SRX1803059: NB-4

◢ SRX2963102: PBMC

◢ SRX1036365: Peripheral blood stem cells

◢ SRX3586365: Pre-B lymphoblast cells

◢ SRX3586366: Pre-B lymphoblast cells

◢ SRX3586367: Pre-B lymphoblast cells

◢ SRX202967: SEM

◢ SRX063913: SKNO-1

◢ SRX1261520: TF-1

◢ SRX1261521: TF-1

◢ SRX1261522: TF-1

◢ SRX212442: Treg

◢ SRX682384: TSU-1621MT

◢ SRX952434: U-937

◢ RUNX1: STRING

Acute myeloid leukemia
 SRX3789539
RUNX1
SEM
 SRX2281252
KMT2A
NAMALWA
 SRX389278
NRF1
MM.1S
 SRX366792
BRD3
Jurkat
 SRX2513052
TET2
GM12878
 SRX150389
NRF1
MM.1S
 SRX1726514
TFDP1
MM.1S
 SRX1726515
E2F1
MM.1S
 SRX366795
BRD3
MM.1S
 SRX366794
BRD3
MM.1S
 SRX366793
BRD3
Peripheral blood stem cells
 SRX1036365
RUNX1
ME-1
 SRX265222
RUNX1
SKNO-1
 SRX063913
RUNX1
Jurkat
 SRX326890
ERG
ME-1
 SRX265225
TCF12
ME-1
 SRX265230
ERG
HPB-ALL
 SRX159138
NOTCH1
PBMC
 SRX2963102
RUNX1
Jurkat
 SRX2513053
TET2
ME-1
 SRX265219
CBFB
Cord blood mononuclear
 SRX2281258
KMT2A
MOLT-4
 SRX2314265
SUPT5H
BJAB
 SRX2059875
SUPT5H
MV-4-11
 SRX1293531
KMT2A
TSU-1621MT
 SRX682379
RARA
TSU-1621MT
 SRX682375
ERG
Erythroblasts
 SRX4046307
MEN1
CUTLL1
 SRX3433645
USP7
U-937
 SRX117010
FLI1
K-562
 SRX037418
NFYA
MOLT-4
 SRX2314264
SUPT5H
Acute promyelocytic leukemia
 SRX026657
ERG
ME-1
 SRX265227
TAL1
SEM
 SRX4484986
ELF1
Bone marrow mononuclear cells
 SRX2281260
KMT2A
K-562
 SRX4708082
RBFOX2
K-562
 SRX3852900
NELFE
K-562
 SRX3852892
NELFE
K-562
 SRX3852891
NELFE
K-562
 SRX3852890
NELFA
K-562
 SRX150628
IRF1
Th1 Cells
 SRX1460848
RELA
K-562
 SRX100430
HEY1
CD34 Hematopoietic stem cells
 SRX026653
ERG
GM12878
 SRX100541
ELF1
K-562
 SRX3852898
NELFA
OCI-LY1
 SRX275409
E2F1
MOLT-4
 SRX2314263
SUPT5H
MOLT-4
 SRX2314262
SUPT5H
P493-6
 SRX129082
MAX
K-562
 SRX3852899
NELFE
K-562
 SRX3852895
NELFA
K-562
 SRX063921
ERG
ME-1
 SRX265229
ELF1
SEM
 SRX2281249
KMT2A
K-562
 SRX186645
RBBP5
K-562
 SRX116442
RBBP5
CUTLL1
 SRX3433644
USP7
SEM
 SRX1873447
KDM2B
U-937
 SRX117011
FLI1
MV-4-11
 SRX1134739
BRD4
Erythroblasts
 SRX4046302
CXXC1
MV-4-11
 SRX1134766
BRD4
MV-4-11
 SRX1134743
BRD4
K-562
 SRX063920
ERG
HL-60
 SRX3934085
INTS13
HL-60
 SRX3345955
INTS13
THP-1
 SRX6913056
BRD2
THP-1
 SRX6913055
BRD2
B-CLL cells
 SRX3591434
BRD4
MM.1S
 SRX204905
BRD4
K-562
 SRX190346
CREB1
K-562
 SRX186646
PHF8
GM12878
 SRX150458
CHD2
P493-6
 SRX129083
MAX
K-562
 SRX116437
PHF8
K-562
 SRX116436
PHF8
Thymus
 SRX1046558
RAG2
GM12878
 SRX100479
EGR1
K-562
 SRX063922
ERG
Jurkat
 SRX3934088
INTS13
HL-60
 SRX3934087
INTS13
HL-60
 SRX3345956
INTS13
HL-60
 SRX3345954
INTS13
P493-6
 SRX204413
MAX
K-562
 SRX186782
KDM5B
GM12878
 SRX150363
MAZ
P493-6
 SRX129084
MAX
K-562
 SRX116438
KDM5B
K-562
 SRX100491
YY1
K-562
 SRX100539
ELF1
Multiple Myeloma
 SRX129116
MYC
GM12891
 SRX100580
YY1
GM12892
 SRX100561
YY1
GM12878
 SRX100451
YY1
MM.1S
 SRX244180
CDK9
K-562
 SRX6913072
BRD2
Erythroblasts
 SRX4046306
HCFC1
K-562
 SRX100476
TAF1
MM.1S
 SRX327758
CDK9
MM.1S
 SRX244177
CDK9
K-562
 SRX186630
HCFC1
GM12878
 SRX100582
TAF1
RAMOS
 SRX5346116
MYC
GM12878
 SRX190216
CREB1
GM12878
 SRX150586
NFYB
K-562
 SRX037419
NFYB
OCI-LY-7
 SRX971780
KMT2D
697
 SRX6909700
PBX1
MM.1S
 SRX327759
CDK9
K-562
 SRX4708072
HNRNPLL
HL-60
 SRX3345953
INTS13
HL-60
 SRX190278
GABPA
K-562
 SRX150595
MYC
K-562
 SRX150574
TBP
RAJI
 SRX1497394
MYC
K-562
 SRX100569
GABPA
Th1 Cells
 SRX1460850
AFF4
GM12891
 SRX100438
TAF1
Macrophages
 SRX1733648
ATF2
K-562
 SRX150424
MAX
K-562
 SRX100515
YY1
Jurkat (Clone E6-1)
 SRX015825
ETS1
B-CLL cells
 SRX3591437
BRD4
K-562
 SRX150676
E2F6
GM12892
 SRX100534
TAF1
GM12878
 SRX100401
GABPA
Jurkat
 SRX326888
GABPA
CD4+ T cells
 SRX103444
BRD4
GM12878
 SRX150510
MXI1
Jurkat
 SRX326887
GABPA
K-562
 SRX150420
ATF1
GM12878
 SRX150597
MAX
K-562
 SRX150512
NFYA
K-562
 SRX150441
NRF1
K-562
 SRX150435
FOS
K-562
 SRX015141
FOS
Acute myeloid leukemia
 SRX3789538
RUNX1
K-562
 SRX7135367
HDAC1
GM12878
 SRX190227
PML
Macrophages
 SRX5624370
SREBF2
Macrophages
 SRX5624367
SREBF2
GM12878
 SRX475760
GABPA
GM12878
 SRX475759
GABPA
GM12878
 SRX475758
GABPA
GM12878
 SRX475757
GABPA
GM12878
 SRX475743
GABPA
CD4+ T cells
 SRX198034
BRD4
GM12878
 SRX100392
USF1
Macrophages
 SRX5624369
SREBF2
CUTLL1
 SRX070885
ZNF143
Acute myeloid leukemia
 SRX3789540
RUNX1
Macrophages
 SRX5624368
SREBF2
GM12878
 SRX100383
SIX5
T-ALL
 SRX7750230
YY1
GM12878
 SRX150637
USF2
K-562
 SRX150581
CHD2
K-562
 SRX150508
NFYB
GM12878
 SRX100577
PBX3
Pre-B lymphoblast cells
 SRX3586367
RUNX1
Kasumi-1
 SRX747574
EP300
Jurkat
 SRX2711484
USP7
MM.1S
 SRX244178
MED1
U-937
 SRX265238
CBFB
Kasumi-1
 SRX1514280
TAL1
MV-4-11
 SRX1134763
BRD4
THP-1
 SRX6913057
BRD2
THP-1
 SRX6913054
BRD2
B-CLL cells
 SRX3591431
BRD4
MM.1S
 SRX204906
MED1
K-562
 SRX150626
CCNT2
K-562
 SRX150623
HMGN3
Th1 Cells
 SRX1460849
AFF4
IMS-M2
 SRX5668135
KMT2A
CD4+ T cells
 SRX6913100
BRD4
B-CLL cells
 SRX3591438
BRD4
Th1 Cells
 SRX1460852
BRD4
P493-6
 SRX5307507
MAX
GM12892
 SRX100379
PAX5
OCI-AML3
 SRX5668141
KMT2A
Erythroblasts
 SRX4046308
RBBP5
CD4+ T cells
 SRX6913099
BRD4
OCI-LY1
 SRX398293
BRD4
Lymphoblastoid cell line
 SRX2867628
BRD4
ME-1
 SRX265224
TBP
K-562
 SRX4708090
GTF2F1
MM.1S
 SRX327757
MED1
Monocytes
 SRX3934096
INTS13
K-562
 SRX6913085
BRD2
K-562
 SRX150679
E2F4
P493-6
 SRX129068
MYC
SKNO-1
 SRX063912
CBFB
Erythroid Cells
 SRX218421
EP300
Jurkat
 SRX398095
CDK7
Monocytes
 SRX3934095
INTS13
Thymus
 SRX1968078
BCL11B
K-562
 SRX100487
ETS1
Jurkat
 SRX3934089
INTS13
IMS-M2
 SRX5668134
KMT2A
K-562
 SRX6913076
BRD3
CUTLL1
 SRX515115
KDM6B
B-CLL cells
 SRX3591433
BRD4
RAJI
 SRX1497396
E2F1