ChIP-Atlas: Colocalization analysis

Colocalization analysis for TP53

Query protein: TP53
Cell class: Blood
Sort key: SRX2940751 | SK-MEL-5
 
Color legends
ChIP-seq data:  H-H H-M M-M H-L M-L L-L N.D. Same  (Peak intensities are High, Middle or Low)

STRING data:  1000 750 500 250 0 N.D.  (Values = STRING's binding scores)

Downloads: TSV (text), GML (Cytoscape)
Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Colocalization
Cell types  Exp. IDs TP53's Colocalization partners

◢ TP53: Average

◢ SRX5865959: K-562

◢ SRX5865960: K-562

◢ SRX5865961: K-562

◢ SRX5865962: K-562

◢ SRX5865963: K-562

◢ SRX5865964: K-562

◢ SRX5865965: K-562

◢ SRX5865966: K-562

◢ SRX5865967: K-562

◢ SRX5865968: K-562

◢ SRX5865969: K-562

◢ SRX5865970: K-562

◢ SRX5865971: K-562

◢ SRX5865972: K-562

◢ SRX5865973: K-562

◢ SRX5865974: K-562

◢ SRX278504: Lymphoblastoid cells

◢ SRX278506: Lymphoblastoid cells

◢ SRX278507: Lymphoblastoid cells

◢ SRX278510: Lymphoblastoid cells

◢ SRX5865975: MOLM-13

◢ SRX5865976: MOLM-13

◢ SRX5865977: MOLM-13

◢ SRX5865978: MOLM-13

◢ SRX5865979: MOLM-13

◢ SRX5865980: MOLM-13

◢ SRX5865981: MOLM-13

◢ SRX5865982: MOLM-13

◢ SRX5865983: MOLM-13

◢ SRX5865984: MOLM-13

◢ SRX5865985: MOLM-13

◢ SRX5865986: MOLM-13

◢ SRX5865987: MOLM-13

◢ SRX5865988: MOLM-13

◢ SRX5865989: MOLM-13

◢ SRX5865990: MOLM-13

◣ SRX2940751: SK-MEL-5

◢ SRX3666488: T cells

◢ SRX3666490: T cells

◢ SRX3666492: T cells

◢ SRX3666494: T cells

◢ SRX3666496: T cells

◢ SRX3666498: T cells

◢ SRX3666500: T cells

◢ SRX3666502: T cells

◢ SRX3666504: T cells

◢ SRX3666506: T cells

◢ SRX3666508: T cells

◢ SRX3666510: T cells

◢ TP53: STRING
SK-MEL-5
  SRX2940751
TP53
 ↻ ≫
T cells
  SRX3666498
TP53
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cells
  SRX278506
TP53
 ↻ ≫
T cells
  SRX3666496
TP53
 ↻ ≫
T cells
  SRX3666510
TP53
 ↻ ≫
T cells
  SRX3666490
TP53
 ↻ ≫
T cells
  SRX3666504
TP53
 ↻ ≫
T cells
  SRX3666506
TP53
 ↻ ≫
T cells
  SRX3666508
TP53
 ↻ ≫
K-562
  SRX186741
SUZ12
 ↻ ≫
K-562
  SRX186700
HDAC6
 ↻ ≫
B cells
  SRX185893
BCL6
 ↻ ≫
SU-DHL-4
  SRX1048490
MEF2B
 ↻ ≫
OCI-LY-7
  SRX1048477
BACH2
 ↻ ≫
GM12878
  SRX102989
MYC
 ↻ ≫
OCI-LY-7
  SRX1048478
EP300
 ↻ ≫
OCI-LY-7
  SRX271854
EZH2
 ↻ ≫
K-562
  SRX116419
SETDB1
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150691
STAT1
 ↻ ≫
K-562
  SRX4708095
CCAR2
 ↻ ≫
Plasma Cells
  SRX203395
MED1
 ↻ ≫
K-562
  SRX4708073
HNRNPUL1
 ↻ ≫
K-562
  SRX218221
HSF2
 ↻ ≫
K-562
  SRX218218
HSF2
 ↻ ≫
GM12878
  SRX186610
ESRRA
 ↻ ≫
HBL-1
  SRX1652873
POU2AF1
 ↻ ≫
K-562
  SRX116439
KDM5B
 ↻ ≫
K-562
  SRX116426
HDAC6
 ↻ ≫
HBL-1
  SRX1652872
POU2AF1
 ↻ ≫
T cells
  SRX3666502
TP53
 ↻ ≫
T cells
  SRX3666500
TP53
 ↻ ≫
DND-41
  SRX186718
EZH2
 ↻ ≫
GM12878
  SRX186694
EZH2
 ↻ ≫
CD20+
  SRX186666
EZH2
 ↻ ≫
K-562
  SRX186648
SETDB1
 ↻ ≫
SU-DHL-10
  SRX347425
STAT3
 ↻ ≫
OCI-LY-3
  SRX347423
STAT3
 ↻ ≫
K-562
  SRX186764
CBX3
 ↻ ≫
GM12878
  SRX186622
SREBF1
 ↻ ≫
K-562
  SRX186615
ZC3H11A
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150730
IRF3
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150496
SUPT20H
 ↻ ≫
K-562
  SRX116427
CBX3
 ↻ ≫
P493-6
  SRX148962
CDK9
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX256997
RELA
 ↻ ≫
P493-6
  SRX129067
MYC
 ↻ ≫
K-562
  SRX150573
EP300
 ↻ ≫
T cells
  SRX3666488
TP53
 ↻ ≫
MOLM-13
  SRX1735799
CDK9
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX658609
MED1
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX326889
ERG
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150494
KAT2A
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX212358
EPAS1
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150636
STAT3
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX093192
EGR2
 ↻ ≫
MOLM-13
  SRX5865980
TP53
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX212351
HIF1A
 ↻ ≫
K-562
  SRX150580
GTF2F1
 ↻ ≫
PBDEFetal
  SRX150413
GATA1
 ↻ ≫
K-562
  SRX186770
CREBBP
 ↻ ≫
K-562
  SRX116429
CREBBP
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX256994
NR3C1
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX256998
RELA
 ↻ ≫
K-562
  SRX116449
SUZ12
 ↻ ≫
K-562
  SRX116448
SIRT6
 ↻ ≫
K-562
  SRX116421
HDAC1
 ↻ ≫
T cells
  SRX3666492
TP53
 ↻ ≫
P493-6
  SRX204414
MED1
 ↻ ≫
OCI-LY-10
  SRX347421
STAT3
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX212356
EPAS1
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX212355
EPAS1
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX212354
HIF1A
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX212353
HIF1A
 ↻ ≫
CUTLL1
  SRX070883
RBPJ
 ↻ ≫
Multiple Myeloma
  SRX129117
MED1
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX212363
EPAS1
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX212357
EPAS1
 ↻ ≫
K-562
  SRX186761
NCOR1
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150731
NFE2
 ↻ ≫
MV-4-11
  SRX1293532
KMT2A
 ↻ ≫
MOLM-13
  SRX5865988
TP53
 ↻ ≫
K-562
  SRX5865974
TP53
 ↻ ≫
K-562
  SRX5865972
TP53
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150585
NFYA
 ↻ ≫
KMS-28BM
  SRX6430575
EZH2
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX212352
HIF1A
 ↻ ≫
KMS-28PE
  SRX6430580
EZH2
 ↻ ≫
KMS-28PE
  SRX6430578
EZH2
 ↻ ≫
KMS-28BM
  SRX6430573
EZH2
 ↻ ≫
K-562
  SRX186772
EZH2
 ↻ ≫
K-562
  SRX092299
NR4A1
 ↻ ≫
GM12878
  SRX186608
SREBF2
 ↻ ≫
GM04604
  SRX8066535
CTCF
 ↻ ≫
K-562
  SRX092302
HDAC8
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX256995
NR3C1
 ↻ ≫
K-562
  SRX218220
HSF1
 ↻ ≫
Erythroblasts
  SRX467199
NR2C2
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX2730808
ARID5B
 ↻ ≫
K-562
  SRX218228
HSF2
 ↻ ≫
K-562
  SRX1491464
ASH1L
 ↻ ≫
THP-1
  SRX054458
NR1H3
 ↻ ≫
GM08714
  SRX150409
ZNF274
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX212360
HIF1A
 ↻ ≫
MOLM-13
  SRX1735800
CDK9
 ↻ ≫
MM1.RL
  SRX758135
NR3C1
 ↻ ≫
Lymphoblastoid cell line
  SRX256996
NR3C1
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX212361
HIF1A
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX212365
EPAS1
 ↻ ≫
K-562
  SRX186756
SIRT6
 ↻ ≫
RPMI 8226
  SRX6430588
EZH2
 ↻ ≫
THP-1
  SRX387776
VDR
 ↻ ≫
OCI-LY-19
  SRX347422
STAT3
 ↻ ≫
GM12878
  SRX093541
SUPT20H
 ↻ ≫
CD34 Hematopoietic stem cells
  SRX3768714
MLLT3
 ↻ ≫
HBL-1
  SRX1652871
POU2F2
 ↻ ≫
CD34 Hematopoietic stem cells
  SRX3768713
MLLT3
 ↻ ≫
BJAB
  SRX1652876
POU2F2
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150457
BRCA1
 ↻ ≫
TMD8
  SRX3387556
STAT3
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX212362
HIF1A
 ↻ ≫
OCI-LY1
  SRX3461647
KDM1A
 ↻ ≫
P493-6
  SRX148963
CDK9
 ↻ ≫
K-562
  SRX218217
HSF1
 ↻ ≫
Treg
  SRX212437
ETS1
 ↻ ≫
L-1236
  SRX790966
RELA
 ↻ ≫
L-1236
  SRX790965
RELA
 ↻ ≫
THP-1
  SRX045435
VDR
 ↻ ≫
K-562
  SRX186762
KAT2B
 ↻ ≫
K-562
  SRX116435
KAT2B
 ↻ ≫
MM.1S
  SRX447601
CDK7
 ↻ ≫
CD34+
  SRX447429
MLLT3
 ↻ ≫
GRANTA-519
  SRX373874
SOX11
 ↻ ≫
OCI-LY1
  SRX3135180
BCL6
 ↻ ≫
K-562
  SRX2442522
CUX1
 ↻ ≫
K-562
  SRX218225
HSF2
 ↻ ≫
MM.1S
  SRX2140215
CDKN1B
 ↻ ≫
MM.1S
  SRX2140214
CDKN1B
 ↻ ≫
MM.1S
  SRX2140213
CCND2
 ↻ ≫
Treg
  SRX212446
FOXP3
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX212366
EPAS1
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX212364
EPAS1
 ↻ ≫
Plasma Cells
  SRX203394
MAX
 ↻ ≫
K-562
  SRX186674
CHD7
 ↻ ≫
K-562
  SRX150625
IRF1
 ↻ ≫
K-562
  SRX1491463
ASH1L
 ↻ ≫
K-562
  SRX116432
NCOR1
 ↻ ≫
K-562
  SRX116418
CHD7
 ↻ ≫
K-562
  SRX097090
SMAD1
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX093191
EGR2
 ↻ ≫
THP-1
  SRX054457
NR1H3
 ↻ ≫
RPMI 8226
  SRX6430591
EZH2
 ↻ ≫
OCI-LY1
  SRX271857
EZH2
 ↻ ≫
NALM-6
  SRX3586353
RUNX1
 ↻ ≫
GM04648
  SRX8066533
CTCF
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150562
ZZZ3
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX212359
HIF1A
 ↻ ≫
P493-6
  SRX129087
MED1
 ↻ ≫
Dendritic Cells
  SRX5095870
SPI1
 ↻ ≫
CD34+
  SRX447428
KMT2A
 ↻ ≫
Th17 Cells
  SRX2661483
STAT3
 ↻ ≫
K-562
  SRX116425
HDAC6
 ↻ ≫
CD34 Hematopoietic stem cells
  SRX3768715
MLLT3
 ↻ ≫
P493-6
  SRX129088
MED1
 ↻ ≫
SET-2
  SRX2961559
STAT1
 ↻ ≫
Erythroblasts
  SRX3768721
MLLT3
 ↻ ≫
TMD8
  SRX3387555
STAT3
 ↻ ≫
GM12878
  SRX392811
EP300
 ↻ ≫
K-562
  SRX7494162
HIF1A
 ↻ ≫
Akata
  SRX2795369
BRD4
 ↻ ≫
Plasma Cells
  SRX203390
CDK9
 ↻ ≫
P493-6
  SRX148964
CDK9
 ↻ ≫
Kasumi-1
  SRX698184
CEBPA
 ↻ ≫
Th17 Cells
  SRX2661481
STAT3
 ↻ ≫
Th17 Cells
  SRX2661479
STAT3
 ↻ ≫
K-562
  SRX186706
CHD4
 ↻ ≫
PBMC
  SRX151950
STAT4
 ↻ ≫
THP-1
  SRX1213824
WDR5
 ↻ ≫
K-562
  SRX116431
CHD4
 ↻ ≫
delta-47
  SRX1091820
CTCF
 ↻ ≫
U-937
  SRX097110
CEBPA
 ↻ ≫
NB-4
  SRX014751
RXRA
 ↻ ≫
CD8+ T cells
  SRX2464017
EP300
 ↻ ≫
Mutu
  SRX2795363
BRD4
 ↻ ≫
CUTLL1
  SRX515116
KDM6B
 ↻ ≫
SEM
  SRX4931277
ELL2
 ↻ ≫
SEM
  SRX4931276
AFF4
 ↻ ≫
SEM
  SRX4931274
ELL2
 ↻ ≫
SEM
  SRX4931273
AFF4
 ↻ ≫
U-937
  SRX4705117
CHAF1A
 ↻ ≫
MOLM-13
  SRX4705112
CHAF1A
 ↻ ≫
B Lymphoblastoid cell line
  SRX2614803
DNMT3B
 ↻ ≫
MOLM-13
  SRX2546005
METTL14
 ↻ ≫
Pre-B cell leukemia
  SRX2323911
AFF1
 ↻ ≫
Hematopoietic Stem Cells
  SRX1089827
TAL1
 ↻ ≫
Hematopoietic Stem Cells
  SRX1089824
GATA1
 ↻ ≫
K-562
  SRX1085072
KDM2B
 ↻ ≫
REH
  SRX1085065
KDM2B
 ↻ ≫
Erythroid progenitors
  SRX5169134
GATA2
 ↻ ≫
GM12878
  SRX150559
NR2C2
 ↻ ≫
Macrophages
  SRX5839979
CREBBP
 ↻ ≫
GM12878
  SRX392814
EP300
 ↻ ≫
K-562
  SRX7494163
HIF1A
 ↻ ≫
K-562
  SRX7494161
HIF1A
 ↻ ≫
ALL xenograft
  SRX3636820
NR3C1
 ↻ ≫
Erythroblasts
  SRX646134
EZH2
 ↻ ≫
KARPAS-422
  SRX6430557
EZH2
 ↻ ≫
KG-1
  SRX3599220
EZH2
 ↻ ≫
HAP1
  SRX3312886
BRD4
 ↻ ≫
HAP1
  SRX3312885
BRD4
 ↻ ≫
MV-4-11
  SRX3031981
BRD4
 ↻ ≫
Akata
  SRX2795373
BRD4
 ↻ ≫
Akata
  SRX2795372
BRD4
 ↻ ≫
Akata
  SRX2795370
BRD4
 ↻ ≫
Akata
  SRX2795368
BRD4
 ↻ ≫
Akata
  SRX2795366
BRD4
 ↻ ≫
Mutu
  SRX2795365
BRD4
 ↻ ≫
Mutu
  SRX1923320
BRD4
 ↻ ≫
K-562
  SRX218227
HSF1
 ↻ ≫
THP-1
  SRX360404
VDR
 ↻ ≫
THP-1
  SRX360403
VDR
 ↻ ≫
THP-1
  SRX360402
VDR
 ↻ ≫
Mutu
  SRX1923325
BRD3
 ↻ ≫
Mutu
  SRX1923324
BRD3
 ↻ ≫
Mutu
  SRX1923323
BRD2
 ↻ ≫
ME-1
  SRX3030205
RUNX1
 ↻ ≫
GM06077
  SRX8066531
CTCF
 ↻ ≫
THP-1
  SRX728790
CDK12
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX697746
PRKCQ
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX697745
PRKCQ
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX697744
PRKCQ
 ↻ ≫
Jurkat
  SRX697743
PRKCQ
 ↻ ≫
CD4+ T cells
  SRX690997
PSIP1
 ↻ ≫
KBM-7
  SRX6840508
HAP1
 ↻ ≫
KARPAS-422
  SRX6430558
SUZ12
 ↻ ≫
B cells
  SRX5099499
STAT3
 ↻ ≫
U-937
  SRX4705118
CHAF1A
 ↻ ≫
U-937
  SRX4705116
CHAF1A
 ↻ ≫
U-937
  SRX4705114
CHAF1A
 ↻ ≫
Erythroblasts
  SRX467200
NR2C2
 ↻ ≫
MV-4-11
  SRX4170733
WDR5
 ↻ ≫
MV-4-11
  SRX4170731
WDR5
 ↻ ≫
MV-4-11
  SRX4170725
WDR5
 ↻ ≫
T cells
  SRX3942992
ZNF341
 ↻ ≫
PBMC
  SRX3942989
ZNF341
 ↻ ≫
B cells
  SRX3445723
ZNF341
 ↻ ≫
B cells
  SRX3445722
ZNF341
 ↻ ≫
HL-60
  SRX3434295
SKI
 ↻ ≫
OCI-LY-10
  SRX3387558
STAT3
 ↻ ≫
OCI-LY-10
  SRX3387557
STAT3
 ↻ ≫
HAP1
  SRX3312899
MTHFD1
 ↻ ≫
CD4+ T cells
  SRX2821737
FOSL1
 ↻ ≫
MM.1S
  SRX264463
CDK7
 ↻ ≫
B Lymphoblastoid cell line
  SRX2614802
DNMT3B
 ↻ ≫
B Lymphoblastoid cell line
  SRX2614801
DNMT3B
 ↻ ≫
B Lymphoblastoid cell line
  SRX2614800
DNMT3B
 ↻ ≫
MOLM-13
  SRX2546003
METTL14
 ↻ ≫
MOLM-13
  SRX2546001
METTL3
 ↻ ≫
CD34+
  SRX248936
LMO2
 ↻ ≫
CD4+ T cells
  SRX237290
SRCAP
 ↻ ≫
Pre-B cell leukemia
  SRX2323910
AFF1
 ↻