ChIP-Atlas: Colocalization analysis

Colocalization analysis for RUNX1

Query protein: RUNX1
Cell class: Blood
Sort key: SRX1261520 | TF-1
 
Color legends
ChIP-seq data:  H-H H-M M-M H-L M-L L-L N.D. Same  (Peak intensities are High, Middle or Low)

STRING data:  1000 750 500 250 0 N.D.  (Values = STRING's binding scores)

Downloads: TSV (text), GML (Cytoscape)
Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Colocalization
Cell types  Exp. IDs RUNX1's Colocalization partners

◢ RUNX1: Average

◢ SRX6909701: 697

◢ SRX1036364: Acute myeloid leukemia

◢ SRX3789538: Acute myeloid leukemia

◢ SRX3789539: Acute myeloid leukemia

◢ SRX3789540: Acute myeloid leukemia

◢ SRX3789541: Acute myeloid leukemia

◢ SRX5729922: Acute myeloid leukemia

◢ SRX5729923: Acute myeloid leukemia

◢ SRX107295: CCRF-CEM

◢ SRX107296: CCRF-CEM

◢ SRX029435: CD34+

◢ SRX062339: CD34+

◢ SRX248935: CD34+

◢ SRX212443: CD4+ T cells

◢ SRX212444: CD4+ T cells

◢ SRX029081: CMK

◢ SRX369126: CUTLL1

◢ SRX1089834: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX1089835: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX3434294: HL-60

◢ SRX1041800: Jurkat

◢ SRX1492212: Jurkat

◢ SRX2014504: Jurkat

◢ SRX206835: Jurkat

◢ SRX015826: Jurkat (Clone E6-1)

◢ SRX128782: Jurkat (Clone E6-1)

◢ SRX128783: Jurkat (Clone E6-1)

◢ SRX128784: Jurkat (Clone E6-1)

◢ SRX029083: K-562

◢ SRX029085: K-562

◢ SRX062335: Kasumi-1

◢ SRX062336: Kasumi-1

◢ SRX062337: Kasumi-1

◢ SRX062338: Kasumi-1

◢ SRX112544: Kasumi-1

◢ SRX112545: Kasumi-1

◢ SRX1514291: Kasumi-1

◢ SRX259611: Kasumi-1

◢ SRX259612: Kasumi-1

◢ SRX259621: Kasumi-1

◢ SRX259622: Kasumi-1

◢ SRX747571: Kasumi-1

◢ SRX858324: Kasumi-1

◢ SRX265222: ME-1

◢ SRX3030205: ME-1

◢ SRX3030206: ME-1

◢ SRX4393711: ME-1

◢ SRX4393712: ME-1

◢ SRX5567179: ME-1

◢ SRX5567180: ME-1

◢ SRX3586353: NALM-6

◢ SRX3586355: NALM-6

◢ SRX1803059: NB-4

◢ SRX2963102: PBMC

◢ SRX1036365: Peripheral blood stem cells

◢ SRX3586365: Pre-B lymphoblast cells

◢ SRX3586366: Pre-B lymphoblast cells

◢ SRX3586367: Pre-B lymphoblast cells

◢ SRX202967: SEM

◢ SRX063913: SKNO-1

◣ SRX1261520: TF-1

◢ SRX1261521: TF-1

◢ SRX1261522: TF-1

◢ SRX212442: Treg

◢ SRX682384: TSU-1621MT

◢ SRX952434: U-937

◢ RUNX1: STRING

TF-1
 SRX1261520
RUNX1
TF-1
 SRX1261523
SMC3
TF-1
 SRX1261522
RUNX1
MOLM-14
 SRX5242457
MED1
Macrophages
 SRX4712348
LDB1
Macrophages
 SRX4712347
LDB1
PBMC
 SRX5007090
BCL11B
MOLM-14
 SRX5242459
MED1
CTV-1
 SRX5574474
SPI1
CTV-1
 SRX5574473
SPI1
OCI-AML3
 SRX3263401
CEBPB
Lymphoblastoid cell line
 SRX472275
TERF1
KG-1
 SRX3599225
SUZ12
GEN2.2
 SRX1491263
BRD4
CTV-1
 SRX5574477
SPI1
Lymphoblastoid cell line
 SRX472276
TERF2
RAMOS
 SRX5346124
MYC
HL-60
 SRX3934086
INTS13
RAMOS
 SRX5346134
WDR5
Kasumi-1
 SRX4472653
EP300
RAMOS
 SRX5346135
WDR5
RAMOS
 SRX5346130
WDR5
RAMOS
 SRX5346129
WDR5
HL-60
 SRX3345959
NAB2
OCI-AML3
 SRX3263402
CEBPB
Kasumi-1
 SRX3098199
CEBPA
K-562
 SRX2841998
NUP98
Monocytes
 SRX3586325
NR3C1
B cells
 SRX2253220
CD74
B cells
 SRX2253219
CD74
RAMOS
 SRX5346136
WDR5
RAMOS
 SRX5346128
WDR5
Monocytes
 SRX3934090
INTS13
REH
 SRX1898038
RAG1
GEN2.2
 SRX1491260
BRD4
K-562
 SRX4170711
WDR5
K-562
 SRX4170709
WDR5
CTV-1
 SRX5574479
SPI1
CTV-1
 SRX5574476
SPI1
CTV-1
 SRX5574475
SPI1
Macrophages
 SRX1023796
SPI1
THP-1
 SRX5852998
AR
HUDEP-2
 SRX7584815
ATF4
MKPL-1
 SRX6866209
RXRA
MOLM-14
 SRX5242454
MED1
Kasumi-1
 SRX4390178
JUND
HL-60
 SRX3345960
NAB2
OCI-AML3
 SRX3263400
BRD4
B cells
 SRX3083285
BACH2
B cells
 SRX2253223
CD74
TF-1
 SRX1261525
SMC3
K-562
 SRX4170710
WDR5
K-562
 SRX4170707
WDR5
Macrophages
 SRX1023795
SPI1
Macrophages
 SRX1023794
SPI1
MKPL-1
 SRX6866208
PPARG
Macrophages
 SRX3934093
NAB2
K-562
 SRX2841999
NUP153
K-562
 SRX4170708
WDR5
JB6
 SRX4394539
STAT3
KK1
 SRX2548294
BRD4
MO1043
 SRX2438580
NOTCH1
MV-4-11
 SRX1293535
ASH1L
SU-DHL-4
 ERX1035596
FOXP1
THP-1
 SRX5852999
AR
TALL-1
 SRX5574511
SPI1
TALL-1
 SRX5574510
SPI1
OCI-LY-3
 SRX518671
SPI1
Jurkat
 SRX7785395
ATF4
RAMOS
 SRX7083412
SUPT5H
CD4+ T cells
 SRX6913097
BRD3
THP-1
 SRX4001968
FOS
THP-1
 SRX4001966
RELA
Kasumi-1
 SRX3098200
CEBPA
ST1
 SRX2548298
BRD4
RPMI 8402
 SRX212645
ZFX
CAL-1
 SRX220959
CBFA2T3
CD4+ T cells
 SRX6913098
BRD3
CD4+ T cells
 SRX6913096
BRD3
CD4+ T cells
 SRX6913094
BRD2
CD4+ T cells
 SRX6913093
BRD2
THP-1
 SRX6913060
BRD3
THP-1
 SRX6913059
BRD3
TMD8
 SRX5099497
STAT3
CD4+ T cells
 SRX4345361
NFATC1
THP-1
 SRX4001969
FOS
ME-1
 SRX5567179
RUNX1
ME-1
 SRX4393711
RUNX1
Kasumi-1
 SRX236112
RUNX1T1
Kasumi-1
 SRX1514278
RUNX1T1
Kasumi-1
 SRX4890469
LDB1
Kasumi-1
 SRX4890468
LDB1
Kasumi-1
 SRX747572
RUNX1T1
PER-117
 SRX8472392
RUNX2
Kasumi-1
 SRX1514291
RUNX1
Kasumi-1
 SRX858324
RUNX1
Kasumi-1
 SRX763970
JMJD1C
Kasumi-1
 SRX5409710
NETO2
SKNO-1
 SRX026638
ERG
CD34+
 SRX062339
RUNX1
Kasumi-1
 SRX3098195
RUNX1T1
Kasumi-1
 SRX1514281
LYL1
Kasumi-1
 SRX747571
RUNX1
TF-1
 SRX1261524
SMC3
ME-1
 SRX5567180
RUNX1
ME-1
 SRX4393712
RUNX1
Kasumi-1
 SRX259622
RUNX1
ME-1
 SRX3030206
RUNX1
Kasumi-1
 SRX3098194
RUNX1T1
NB-4
 SRX1803059
RUNX1
Kasumi-1
 SRX259621
RUNX1
Kasumi-1
 SRX259612
RUNX1
Pre-B lymphoblast cells
 SRX3586366
RUNX1
Kasumi-1
 SRX112545
RUNX1
Kasumi-1
 SRX858325
RUNX1T1
Pre-B lymphoblast cells
 SRX3586365
RUNX1
Pre-B lymphoblast cells
 SRX3586367
RUNX1
Pre-leukemia stem cells
 SRX1735651
FOXO1
CD34+
 SRX248931
FLI1
Hematopoietic cells
 SRX026660
ERG
NB-4
 SRX1304579
JMJD1C
ME-1
 SRX265233
EP300
Kasumi-1
 SRX1514276
FLI1
Kasumi-1
 SRX698186
LMO2
Kasumi-1
 SRX747573
NCOR1
Kasumi-1
 SRX026635
TCF12
CTV-1
 SRX5574486
FLI1
CTV-1
 SRX5574467
FLI1
TSU-1621MT
 SRX682384
RUNX1
Kasumi-1
 SRX236115
TCF3
SEM
 SRX4484980
FLI1
Acute myeloid leukemia
 SRX1036364
RUNX1
SKH1
 SRX2574235
GATA2
KARPAS-45
 SRX8472389
RUNX2
Jurkat
 SRX1492212
RUNX1
Jurkat
 SRX1041800
RUNX1
TSU-1621MT
 SRX682376
ERG
U-937
 SRX952434
RUNX1
HL-60
 SRX3434294
RUNX1
Kasumi-1
 SRX698187
LMO3
Kasumi-1
 SRX4472654
EP300
CTV-1
 SRX5574487
FLI1
CUTLL1
 SRX369126
RUNX1
SKH1
 SRX2574236
GATA2
CTV-1
 SRX5574485
ETS1
Kasumi-1
 SRX1514277
ERG
Kasumi-1
 SRX112544
RUNX1
Kasumi-1
 SRX236114
TCF12
Kasumi-1
 SRX3098193
RUNX1T1
CTV-1
 SRX5574484
ETS1
CTV-1
 SRX5574466
ETS1
CTV-1
 SRX5574465
ETS1
Acute myeloid leukemia
 SRX5930116
EP300
Kasumi-1
 SRX1514284
EP300
HL-60
 SRX3434293
SKI
HL-60
 SRX1304576
JMJD1C
ME-1
 SRX5567178
RNF2
CTV-1
 SRX5574468
FLI1
CD34 Hematopoietic stem cells
 SRX1477666
MED12
SEM
 SRX202967
RUNX1
EOL-1
 SRX3927290
DPF2
ME-1
 SRX265234
HDAC1
U-937
 SRX097097
SMAD1
CD34 Hematopoietic stem cells
 SRX097073
SMAD1
T-ALL
 SRX725589
TAL1
THP-1
 SRX3824044
KMT2B
697
 SRX6909701
RUNX1
MOLT-4
 SRX1637467
CDK9
UPR9
 SRX014782
RARA
TSU-1621MT
 SRX682385
LMO2
Kasumi-1
 SRX1304574
LYL1
Peripheral blood stem cells
 SRX1036365
RUNX1
RPMI 8402
 SRX158110
TCF12
CTV-1
 SRX5574501
SMARCA4
SKH1
 SRX3098188
MECOM
MOLT-4
 SRX1637469
CDK9
MV-4-11
 SRX3031986
BRD4
Kasumi-1
 SRX1514286
HDAC2
MOLT-4
 SRX1637470
CDK9
Kasumi-1
 SRX3098196
RUNX1T1
TSU-1621MT
 SRX682388
TAL1
CTV-1
 SRX5574506
SPI1
Kasumi-1
 SRX259611
RUNX1
HL-60
 SRX3434291
SKI
MV-4-11
 SRX2375366
CDK9
T-ALL
 SRX725586
MYB
TSU-1621MT
 SRX682382
FUS
SKNO-1
 SRX026640
FLI1
ICN12
 SRX656347
TCF3
SKNO-1
 SRX026639
ERG
ME-1
 SRX5567177
RNF2
Kasumi-1
 SRX1514285
HDAC1
ICN12
 SRX656350
EP300
Jurkat
 SRX658610
MYB
CTV-1
 SRX5574488
SMARCA4
697
 SRX6909699
EP300
RCH-ACV
 SRX2043231
EP300
THP-1
 SRX1304581
JMJD1C
MOLT-4
 SRX1637465
BRD4
MV-4-11
 SRX2375362
CDK9
SEM
 SRX2043226
TCF3
Jurkat
 SRX725578
MYB
SEM
 SRX4484982
RUNX2
Acute myeloid leukemia
 SRX5930115
NCOR2