顕微鏡を活用した計測や数理モデリングで得られる時空間情報を数値として有する定量データのデータベース
データ名 | README |
データ内容 | 「SSBD」のダウンロードデータについて説明したHTMLファイル。 |
ダウンロードファイル名 | README.html(日本語) |
データ名 | BDML Datasets |
データ内容の説明 | データセットのサマリーと由来するリソース |
データファイル | ssbd_bdml_dataset.zip (2.0KB) |
項目名 | 項目の説明 |
---|---|
Organism | 生物種名 |
Datatype | 動態の種類 |
Basedon | 定量データが何から得られたか(顕微鏡計測またはコンピュータシミュレーション) |
Contributor | 定量データの作成者 |
Number of BDML-files | BDMLファイル数 |
Contact Information | 問い合わせ先 |
Summary of methods | 定量データの作成法の概要 |
PubMed ID | 定量データの元となる文献のPubMed ID |
License | BDMLファイルのライセンス |
Data Scale (XYZ,T) | XYZ座標と時間のスケールと単位 |
Dataset Description | データセットの説明 |
データ名 | BDML Metadata |
データ内容の説明 | BDML形式の定量データに対するメタ情報 |
データファイル | ssbd_bdml_metadata.zip (467KB) |
項目名 | 項目の説明 |
---|---|
Title | BDMLファイルのタイトル |
Description | BDMLファイルに記述された定量データの詳細情報 |
Organism | 生物種名 |
Datatype | 動態の種類 |
Local ID | BDMLファイルを特定するための独自ID |
Basedon | 何から得られた定量データか:顕微鏡計測またはコンピュータシミュレーション |
Contributor | 定量データの作成者 |
Contact Information | 問い合わせ先 |
Summary of methods | 定量データの作成法の概要 |
PubMed ID | 定量データの元となる文献のPubMed ID |
License | BDMLファイルのライセンス |
Schema | BDML形式のバージョン |
BDML ID | BDMLファイルのID |
Data Scale (XYZ,T) | XYZ座標と時間のスケールおよび単位 |
Source | 顕微鏡計測の場合は動画像のURL、コンピュータシミュレーションの場合は数理モデルを記述したファイルのURL |
BDML file | BDMLファイルをダウンロードするためのURL |
PDPML file | PDPMLファイルをダウンロードするためのURL |
SSBD web page | SSBDデータベースでの該当ページのURL |
SSBD-OMERO web page | SSBDデータベースで動画像を確認できるURL |
本データベースは、以下で定める利用許諾に基づきご利用いただくことができます。 本利用許諾は、本データベース利用における許諾内容、及び利用者が従うべき条件を定めています。
本データベースの利用許諾は、 クリエイティブ・コモンズ 表示-継承4.0 国際の定める利用許諾です。
本データベースのクレジットは、 ”SSBD © 大浪 修一 (理化学研究所) licensed under CC表示-継承4.0 国際”ですので、 利用にあたり必ず表示してください。
クリエイティブ・コモンズ 表示-継承4.0 国際の概要は こちらです。 具体的な許諾条項は こちらをご覧ください。
本データベースにおいて、以下の条件に従う限り許諾されている事項:
本利用許諾に基づいて利用する際に従うべき条件:
〒650-0047 神戸市中央区港島南町2-2-3
理化学研究所 生命システム研究センター
大浪 修一
Tel : 03-3599-8067
E-mail: sonami[at]riken[dot]jp
更新日 | 更新内容 |
2016/07/25 | 生命科学系データベースアーカイブにてダウンロードデータ公開開始 |
2013/09/03 | SSBD (http://ssbd.qbic.riken.jp/) で公開開始 |
〒650-0047 神戸市中央区港島南町2-2-3
理化学研究所 生命システム研究センター
大浪 修一
Tel : 03-3599-8067
E-mail: sonami[at]riken[dot]jp