RPSD
2015/10/16HTTPS Site: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/rpsd/
イネなど7種類の植物のタンパク質の立体構造に関するデータベース
README 目次
1. ダウンロードデータの構成
2. ダウンロードデータの説明
2.1 README
| データ名 | README |
| データ内容 | 「RPDS」のダウンロードデータについて説明したHTMLファイル。 |
| ダウンロードファイル名 | README.html（日本語） |
2.2 Main
| データ名 | Main |
| データ内容の説明 | イネなど7種類の植物のタンパク質の立体構造に関する情報の一覧です。 |
| データファイル | rpsd_main_sjis.zip (Shitf JIS, 120 KB) rpsd_main_utf8.zip (UTF-8, 120 KB) |
データファイルの各列のデータは以下の通りです。
| 項目名 | 項目の説明 |
|---|---|
| PDB ID | PDB ID |
| Japanese name | 生物種の和名 |
| English name | 生物種の英名 |
| Scientific name | 生物種の学名 |
| Protein name | タンパク質名 |
| Gene name | 遺伝子名 |
| Source/Organism | 生物種 |
| Compound | 化合物 |
| Classification | 分類 |
| EC number | EC番号 |
| Authors | 著者 |
| Reference | 文献 |
| Key word | キーワード |
| Cross reference | クロスリファレンス |
| Experimental method | 実験手法 |
| Sequence characteristics | アミノ酸配列の特性 |
| Sequence | アミノ酸配列 |
| Image | 立体構造の画像ファイル名 |
2.3 Images
| データ名 | Images |
| データ内容の説明 | イネなど7種類の植物のタンパク質の立体構造の画像ファイルです。 |
| データファイル | rpsd_images.zip (18.3 MB) |
3. 本データベースの利用許諾
利用許諾更新日: 2014/11/10
本データベースは、以下で定める利用許諾に基づきご利用いただくことができます。 本利用許諾は、本データベース利用における許諾内容、及び利用者が従うべき条件を定めています。
本データベースの利用許諾は、クリエイティブ・コモンズ 表示-継承2.1 日本の定める利用許諾です。
本データベースのクレジットは、
”イネタンパク質構造データベース © 農業生物資源研究所 licensed under CC表示 継承2.1 日本”ですので、
利用にあたり必ず表示してください。
クリエイティブ・コモンズ 表示-継承2.1 日本の概要は
こちらです。
具体的な許諾条項は
こちらをご覧ください。
本データベースにおいて、標準利用許諾の下で以下の条件に従う限り許諾されている事項：
- 本データベースの全部または一部に自由にアクセスし、データを取得することができます。
- 本データベースの全部または一部のデータを自由に再配布することができます。
- 本データベースの全部または一部のデータを利用した、データベースなどの二次的著作物を自由に作成し、配布することができます。
本データベースにおいて、標準利用許諾に基づいて利用する際に従うべき条件：
- 本データベースの全部または一部、あるいは二次的著作物の配布に際しては、本データベースの作成者のクレジットを表示しなければなりません。
- 本データベースの全部または一部のデータを利用して作成された二次的著作物は、この利用許諾の下で配布されなければなりません。
- 本利用許諾で許諾されていない事項については、以下のデータベース作成者に連絡をとり、利用許諾を求める必要があります。
データベース作成者連絡先：
〒305-8602 茨城県つくば市観音台2-1-2
国立研究開発法人 農業生物資源研究所
山崎 俊正
E-mail: tyamazak[at]nias[dot]affrc[dot]go[dot]jp
4. 更新履歴
| 更新日 | 更新内容 |
| 2015/10/16 | 「データベースの説明」にてオリジナルサイト公開休止を案内 |
| 2014/11/10 | 生命科学系データベースアーカイブにてダウンロードデータ公開開始 |
| 2005/02/14 | イネタンパク質構造データベース (http://structure.rice.dna.affrc.go.jp/plant/index.html) にて最終更新 |
5. 参考文献
-6. 連絡先
「RPSD」についてのお問い合わせは、下記連絡先までご連絡ください。
データベース作成者連絡先：
〒305-8602 茨城県つくば市観音台2-1-2
国立研究開発法人 農業生物資源研究所
山崎 俊正
E-mail: tyamazak[at]nias[dot]affrc[dot]go[dot]jp