160の化合物を用いて実施した動物試験で作製した肝臓および腎臓の病理標本の高解像度画像データベース
データ名 | README |
データ内容 | 「Open TG-GATEs 病理写真データベース」のダウンロードデータについて説明したHTMLファイル。 |
ダウンロードファイル名 | README.html(日本語) |
データ名 | 病理写真情報 |
データ内容の説明 | 「病理写真(SVS形式)」中の個々の高解像度デジタル画像についての情報です。 |
データファイル | open_tggates_pathological_image.zip (370 KB) |
項目名 | 項目の説明 |
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EXP_ID | 実験セット毎に付けられたIDです。in vivo試験は0040~となっています。主にCOMPOUND_NAME、SPECIES、SINGLE_REPEAT_TYPEの組み合わせで定まります。 |
GROUP_ID | 群毎に付けられたIDです。01~16など二桁の数字が割り当てられています。主にDOSE、SACRIFICE_PERIODの組み合わせで定まります。 |
INDIVIDUAL_ID | 同一群内で、in vivo試験における個体に付けられたIDです。1から一桁の数字が割り当てられています。 |
COMPOUND_NAME | 化合物の名称です。 |
ORGAN | 臓器の種類を表しています。LiverとKidneyの2種類が存在します。 |
FILE_LOCATION | HTTPSサイトの画像ファイルのパスです。 |
CAPTURE_NO/NO_OF_SAMPLE(n/n) | 写真撮影番号と撮影枚数を表しています。例えば、1/2と表示されている場合は、1臓器について2枚のプレパラートが作製されており、そのうちの1枚目のプレパラートの写真であることを示しています。 |
SPECIES | 生物種を表しています。 |
SINGLE_REPEAT_TYPE | in vivo試験における投与回数(単回投与:Single、28日間反復投与:Repeat)を表しています。 |
ADMINISTRATION_ROUTE_TYPE | 化合物の投与経路を表しています。 |
ANIMAL_AGE(week) | in vivo試験におけるラットの週齢を表しています。 |
SACRIFICE_PERIOD | in vivo試験における屠殺時間を表しています。 |
DOSE | 投与量を表しています。 |
DOSE_UNIT | 投与量の単位を表しています。 |
データ名 | 病理写真(SVS形式) |
データ内容の説明 | 動物試験で作製した肝臓および腎臓のヘマトキシリン・エオジン染色病理標本(プレパラート)の高解像度デジタル画像です。 |
データファイル | データファイル名: SVS形式のデジタル画像 データのURL: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/open-tggates-pathological-images/LATEST/images/ ファイルサイズ: 25 TB (SVSファイルの合計) |
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独立行政法人 医薬基盤研究所
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E-mail: opentggates[at]nibio[dot]go[dot]jp
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更新日 | 更新内容 |
2012/04/13 | 生命科学系データベースアーカイブにてダウンロードデータ公開開始 |
2012/03/30 | Open TG-GATEs 病理写真データベース(http://virtualslide.nibio.go.jp/Authenticate2.php)で公開開始 |
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