NITE NBRC Yeast Image Collection

2016/10/24

HTTPS Site: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/nite-nbrc-yeast-image/

酵母の3種の形状（細胞、菌糸、胞子）画像と、撮影時の培地条件に関するデータを収録したデータベース

README 目次

  1. ダウンロードデータの構成
  2. ダウンロードデータの説明
  3. 本データベースの利用許諾
  4. 更新履歴
  5. 参考文献
  6. 連絡先

1. ダウンロードデータの構成

  1. README
  2. 酵母画像情報
  3. 酵母画像(PNG形式)
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2. ダウンロードデータの説明

2.1 README

データ名 README
データ内容 「NITE NBRC Yeast Image Collection」のダウンロードデータについて説明したHTMLファイル。
ダウンロードファイル名 README.html (日本語)
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2.2 酵母画像情報

データ名 酵母画像情報
データ内容の説明 酵母の電子顕微鏡写真と当該酵母に関する情報のリスト
データファイル nite_nbrc_yeast_image.zip (115 KB)

データファイルの各列のデータは以下の通りです。
項目名項目の説明
ＩＦＯ番号 菌株の番号（NBRCへのリンク）
菌種名 菌の種名（学名）
命名者 学名の命名者
var. 変種
AUTVAR 変種の命名者
オリジナル名 オリジナル名称、別名
来歴 来歴
培地 培地番号
培養温度 培地の温度（℃）
担当 担当者の氏名
IFO2 IFO2番号
細胞の形状 簡易検索ではアイコン画像が表示される。
菌糸の形状 簡易検索ではアイコン画像が表示される。
胞子の形状 簡易検索ではアイコン画像が表示される。
胞子の表面構造 簡易検索ではアイコン画像が表示される。
F1. Glucose グルコース（+/-で表示）
F2. Galactose ガラクトース（+/-で表示）
F3. Sucrose スクロース（+/-で表示）
F4. Maltose マルトース（+/-で表示）
F5. Trehalose トレハロース（+/-で表示）
F6. Lactose ラクトース（+/-で表示）
F7. Raffinose ラフィノース（+/-で表示）
F8. D-Xylose D-キシロース（+/-で表示）
F9. αMethyl D-glucoside α-メチル-D-グルコシド（+/-で表示）
A01. Glucose グルコース（+/-で表示）
A02. Galactose ガラクトース（+/-で表示）
A03. L-sorbose L-ソルボース（+/-で表示）
A04. Sucrose スクロース（+/-で表示）
A05. Maltose マルトース（+/-で表示）
A06. Cellobiose セロビオース（+/-で表示）
A07. Trehalose トレハロース（+/-で表示）
A08. Lactose ラクトース（+/-で表示）
A09. Melibiose メリビオース（+/-で表示）
A10. Raffinose ラフィノース（+/-で表示）
A11. Melezitose メレジトース（+/-で表示）
A12. Inulin イヌリン（+/-で表示）
A13. Soluble starch 可溶性でんぷん（+/-で表示）
A14. D-Xylose D-キシロース（+/-で表示）
A15. L-Arabinose L-アラビノース（+/-で表示）
A16. D-Arabinose D-アラビノース（+/-で表示）
A17. D-Ribose D-リボース（+/-で表示）
A18. L-Rhamnose L-ラムノース（+/-で表示）
A19. Ethanol エタノール（+/-で表示）
A20. Glycerol グリセロール（+/-で表示）
A21. Erythritol エリトリトール（+/-で表示）
A22. Ribitol リビトール（+/-で表示）
A23. Galactitol ガラクチトール（+/-で表示）
A24. D-Mannitol D-マンニトール（+/-で表示）
A25. D-Glucitol D-ソルビトール（+/-で表示）
A26. α-Methyl Glucoside α-メチル-D-グルコシド（+/-で表示）
A27. Salicin サリシン（+/-で表示）
A28. DL-Lactate DL-乳酸（+/-で表示）
A29. Succinate コハク酸（+/-で表示）
A30. Citrate クエン酸（+/-で表示）
A31. Inositol イノシトール（+/-で表示）
A32. Arbutin アルブチン（+/-で表示）
A33. D-Gluconate D-グルコン酸（+/-で表示）
A34. D-Glucosamine D-グルコサミン（+/-で表示）
A35. N-Acetyl D-Glucosamine N-アセチル-D-グルコサミン（+/-で表示）
A36. 2-Keto D-Gluconate 2-デヒドロ-D-グルコン酸（+/-で表示）
A37. 5-Keto D-Gluconate ５-デヒドロ-D-グルコン酸（+/-で表示）
A38. Hexadecane ヘキサデカン（+/-で表示）
A39. Methanol メタノール（+/-で表示）
N1. Nitrate 硝酸塩（+/-で表示）
N2. Ethylamine エチルアミン（+/-で表示）
N3. L-Lysine L-リシン（+/-で表示）
N4. Cadaverine カダベリン（+/-で表示）
N5. Creatine クレアチン（+/-で表示）
G1. Growth in vitamin-free medium ビタミン無添加培地（+/-で表示）
G2. Growth in 10% NaCl + 5% glucose in yeast nitorogen base 10%NaCl + 5% グルコース酵母窒素基礎培地（+/-で表示）
G3. Growth on 50%(w/w) glucose-yeast extract agar 50% グルコースイースト寒天培地（+/-で表示）
G4. Growth at 37flC （+/-で表示）
G5. Growth in the presence of 100 ppm cycloheximide 100ppmシクロヘキシミド培地での成長（+/-で表示）
G6. Starch formetion でんぷん生成（+/-で表示）
G7. Urea hydrolysis 尿素加水分解（+/-で表示）
G8. Diazonium Blue B reaction ジアゾニウム塩染色反応（+/-で表示）
Co-Q コエンザイムQ（+/-で表示）
Mol% G+C G+C含量
Comments 菌株についての補足情報
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2.3 酵母画像(PNG形式)

データ名 酵母画像(PNG形式)
データ内容の説明 酵母の電子顕微鏡写真（PNG形式）
データファイル nite_nbrc_yeast_large_image_package.zip (1.3 GB)
nite_nbrc_yeast_thumbnail_package.zip (128 MB)
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3. 本データベースの利用許諾

利用許諾更新日: 2016/10/24

本データベースは、以下で定める利用許諾に基づきご利用いただくことができます。 本利用許諾は、本データベース利用における許諾内容、及び利用者が従うべき条件を定めています。


Creative Commons License

本データベースの利用許諾は、 クリエイティブ・コモンズ　表示-継承4.0　国際の定める利用許諾です。
本データベースのクレジットは、 ”NITE NBRC yeast image collection © 川崎浩子 (製品評価技術基盤機構) licensed under CC表示-継承4.0 国際”ですので、 利用にあたり必ず表示してください。

クリエイティブ・コモンズ　表示-継承4.0　国際の概要は こちらです。 具体的な許諾条項は こちらをご覧ください。

本データベースにおいて、以下の条件に従う限り許諾されている事項：

  1. 本データベースの全部または一部に自由にアクセスし、データを取得することができます。
  2. 本データベースの全部または一部のデータを自由に再配布することができます。
  3. 本データベースの全部または一部のデータを利用した、データベースなどの翻案物を自由に作成し、配布することができます。

 

本利用許諾に基づいて利用する際に従うべき条件：

  1. 本データベースの全部または一部、あるいは翻案物の配布に際しては、本データベースの作成者のクレジットを表示しなければなりません。
  2. 本データベースの全部または一部のデータを利用して作成された翻案物は、CC表示-継承4.0（もしくは、それ以降のバージョン）、またはCC表示-継承互換ライセンス（リストはこちら）の下で配布されなければなりません。
  3. 本利用許諾で許諾されていない事項については、以下のデータベース作成者に連絡をとり、利用許諾を求める必要があります。

データベース作成者連絡先：
〒292-0818　 木更津市かずさ鎌足2-5-8
独立行政法人　製品評価技術基盤機構　バイオテクノロジーセンター
E-mail: kawasaki-hiroko[at]nite[dot]go[dot]jp

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4. 更新履歴

更新日更新内容
2016/10/24 生命科学系データベースアーカイブにてダウンロードデータ公開開始
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5. 参考文献

-
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6. 連絡先

「NITE NBRC Yeast Image Collection」についてのお問い合わせは、下記連絡先までご連絡ください。

〒292-0818
木更津市かずさ鎌足2-5-8
独立行政法人　製品評価技術基盤機構　バイオテクノロジーセンター
Tel: 0438-20-5763(代表）
Fax: 0438-52-2329
E-mail: kawasaki-hiroko[at]nite[dot]go[dot]jp

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