NBDC NikkajiRDF

2015/05/29

Web Site: http://nikkajiweb.jst.go.jp/
FTP Site: ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/nikkaji/

日本化学物質辞書(日化辞)のデータを化合物情報のRDF記述で標準となっているオントロジーを用いてRDF化したデータベース

README 目次

  1. ダウンロードデータの構成
  2. ダウンロードデータの説明
  3. 本データベースの利用許諾
  4. 更新履歴
  5. 参考文献
  6. 連絡先

1. ダウンロードデータの構成

  1. README
  2. 日化辞の本体のRDFデータ
  3. 日化辞のInChIのRDFデータ
  4. 日化辞のSMILESのRDFデータ
  5. 日化辞とJ-GLOBALのリンク情報のRDFデータ
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2. ダウンロードデータの説明

2.1 README

データ名 README
データ内容 「NBDC NikkajiRDF」のダウンロードデータについて説明したHTMLファイル。
ダウンロードファイル名 README.html(日本語)
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2.2 日化辞の本体のRDFデータ

データ名 日化辞の本体のRDFデータ
データ内容の説明 330万件以上の化学物質の日化辞番号、分子式、分子量、和名、英名など基本情報のRDFデータです。
データファイル NBDC_NikkajiRDF_main.zip (731 MB)

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2.3 日化辞のInChIのRDFデータ

データ名 日化辞のInChIのRDFデータ
データ内容の説明 日化辞番号(日化辞の化学物質のID)とInChIおよびInChIKeyの関係のRDFデータ。
データファイル NBDC_NikkajiRDF_InChI.zip (281 MB)

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2.4 日化辞のSMILESのRDFデータ

データ名 日化辞のSMILESのRDFデータ
データ内容の説明 日化辞番号(日化辞の化学物質のID)とCanonical SMILESの関係のRDFデータ。Chemical Information Ontology(CHEMINF)やSemanticscience Integrated Ontology(SIO)などのオントロジーを使用。
データファイル NBDC_NikkajiRDF_canonicalSmiles.zip (61.8 MB)

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2.5 日化辞とJ-GLOBALのリンク情報のRDFデータ

データ名 日化辞とJ-GLOBALのリンク情報のRDFデータ
データ内容の説明 日化辞の化学物質と、研究者、文献、特許、遺伝子など科学技術情報を関連づけて提供するJ-GLOBAL(http://jglobal.jst.go.jp/)のリンク情報のRDFデータ。
データファイル NBDC_NikkajiRDF_link2JGLOBAL.zip (1.8 MB)

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3. 本データベースの利用許諾

利用許諾更新日: 2015/05/29

本データベースは、以下で定める利用許諾に基づきご利用いただくことができます。 本利用許諾は、本データベース利用における許諾内容、及び利用者が従うべき条件を定めています。

Creative Commons License

本データベースの利用許諾は、 クリエイティブ・コモンズ 表示2.1 日本の定める利用許諾です。
本データベースのクレジットは、 ”NBDC NikkajiRDF © 国立研究開発法人 科学技術振興機構 licensed under CC表示2.1 日本”ですので、 利用にあたり必ず表示してください。

クリエイティブ・コモンズ 表示2.1 日本の概要は こちらです。 具体的な許諾条項は こちらをご覧ください。

本データベースにおいて、以下の条件に従う限り許諾されている事項:

  1. 本データベースの全部または一部に自由にアクセスし、データを取得することができます。
  2. 本データベースの全部または一部のデータを自由に再配布することができます。
  3. 本データベースの全部または一部のデータを利用した、データベースなどの二次的著作物を自由に作成し、配布することができます。

本利用許諾に基づいて利用する際に従うべき条件:

  1. 本データベースの全部または一部、あるいは二次的著作物の配布に際しては、本データベースの作成者のクレジットを表示しなければなりません。
  2. 本利用許諾で許諾されていない事項については、以下のデータベース作成者に連絡をとり、利用許諾を求める必要があります。

データベース作成者連絡先:
E-mail: support[at]biosciencedbc[dot]jp

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4. 更新履歴

更新日 更新内容
2015/05/29 生命科学系データベースアーカイブにてダウンロードデータ公開開始
2005/03/31 日化辞Web (http://nikkajiweb.jst.go.jp/) で公開開始
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5. 参考文献

日化辞RDFデータの公開と化合物情報の統合
木村 孝宏, 櫛田 達矢
情報管理 58(3) 掲載予定

6. 連絡先

「NBDC NikkajiRDF」についてのお問い合わせは、下記連絡先までご連絡ください。

E-mail: support[at]biosciencedbc[dot]jp

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