MassBank

2016/05/17

Web Site: http://www.massbank.jp/
FTP Site: ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/massbank/

代謝物質(基礎代謝、植物二次代謝標準物質)を高分解能質量分析によって測定したマススペクトルを収集したデータベース

README 目次

  1. ダウンロードデータの構成
  2. ダウンロードデータの説明
  3. 本データベースの利用許諾
  4. 更新履歴
  5. 参考文献
  6. 連絡先

1. ダウンロードデータの構成

  1. README
  2. MassBank Record Index
  3. MassBank Raw Data
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2. ダウンロードデータの説明

2.1 README

データ名 README
データ内容 「MassBank」のダウンロードデータについて説明したHTMLファイル。
ダウンロードファイル名 README.html(日本語)
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2.2 MassBank Record Index

データ名 MassBank Record Index
データ内容の説明 MassBankに登録されている個別レコードデータのインデックス情報
データファイル massbank_record_index.zip (814 KB)

データファイルの各列のデータは以下の通りです。
項目名項目の説明
id 内部用連番ID
accession MassBankレコードID
record_title MassBankレコードタイトル
name サンプルの名称
date 作成日付
authors 著者名
license データに対するライセンス(Creative Commons)
formula 組成式
exact_mass mass解析値
group データ登録機関名
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2.3 MassBank Raw Data

データ名 MassBank Raw Data
データ内容の説明 各データ提供機関から収集されたマススペクトルデータ
データファイル massbank_raw.zip (62.7 MB)

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3. 本データベースの利用許諾

利用許諾更新日: 2016/05/17

本データベースは、データによって利用許諾が異なります。
MassBank Record Index
本データベースの利用許諾は、 クリエイティブ・コモンズ 表示-継承4.0 国際の定める利用許諾です。
本データベースのクレジットは、 ”MassBank Record Index © MassBank Project licensed under CC表示-継承4.0 国際”ですので、 利用にあたり必ず表示してください。

クリエイティブ・コモンズ 表示-継承4.0 国際の概要は こちらです。 具体的な許諾条項は こちらをご覧ください。

本データベースにおいて、以下の条件に従う限り許諾されている事項:

  1. 本データベースの全部または一部に自由にアクセスし、データを取得することができます。
  2. 本データベースの全部または一部のデータを自由に再配布することができます。
  3. 本データベースの全部または一部のデータを利用した、データベースなどの翻案物を自由に作成し、配布することができます。

 

本利用許諾に基づいて利用する際に従うべき条件:

  1. 本データベースの全部または一部、あるいは翻案物の配布に際しては、本データベースの作成者のクレジットを表示しなければなりません。
  2. 本データベースの全部または一部のデータを利用して作成された翻案物は、CC表示-継承4.0(もしくは、それ以降のバージョン)、またはCC表示-継承互換ライセンス(リストはこちら)の下で配布されなければなりません。
  3. 本利用許諾で許諾されていない事項については、以下のデータベース作成者に連絡をとり、利用許諾を求める必要があります。

データベース作成者連絡先:
Mail:admin[at]massbank[dot]jp
Tel :0743-72-5326(直通)
住所:〒630-0192 奈良県生駒市 高山町8916-5

MassBank Raw Data
ファイル毎に利用許諾が異なります。
ファイルの利用許諾は、データの提供機関もしくはデータの提供者によって定められており、各ファイルの”LICENSE”欄に記載されています。

データベース作成者連絡先:
データ提供機関リストをご覧ください。

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4. 更新履歴

更新日 更新内容
2016/05/17 生命科学系データベースアーカイブにてダウンロードデータ公開開始。
2006/12/06 MassBank (http://www.massbank.jp/)で公開開始
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5. 参考文献

H. Horai, M. Arita, S. Kanaya, Y. Nihei, T. Ikeda, K. Suwa. Y. Ojima, K. Tanaka, S. Tanaka, K. Aoshima, Y. Oda, Y. Kakazu, M. Kusano, T. Tohge, F. Matsuda, Y. Sawada, M. Yokota Hirai, H. Nakanishi, K. Ikeda, N. Akimoto, T. Maoka, H. Takahashi, T. Ara, N. Sakurai, H. Suzuki, D. Shibata, S. Neumann, T. Iida, K. Tanaka, K. Funatsu, F. Matsuura, T. Soga, R. Taguchi, K. Saito and T. Nishioka
MassBank: A public repository for sharing mass spectral data for life sciences
J. Mass Spectrom/45, 703-714
PMID: 20623627

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6. 連絡先

「MassBank」についてのお問い合わせは、下記連絡先までご連絡ください。

Mail:admin[at]massbank[dot]jp
Tel :0743-72-5326(直通)
住所:〒630-0192 奈良県生駒市 高山町8916-5

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MassBankデータ提供機関リスト

#データ提供機関名連絡先MassBank Raw Dataのフォルダ名ライセンス
1 アテネ大学 - Athens_Univ ※データ毎に異なる
2 ボイシ州立大学 chrischandler[at]u[dot]boisestate[dot]edu Boise_State_Univ CC BY-SA
3 中部大学 rytagu[at]isc[dot]chubu[dot]ac[dot]jp Chubu_Univ CC BY-NC-SA
4 スイス連邦水質科学研究所 Emma[dot]Schymanski[at]eawag[dot]ch Eawag CC BY
5 チュービンゲン大学 - Env_Anal_Chem_U_Tuebingen CC BY
6 東大院工 funatsu[at]chemsys[dot]t[dot]u-tokyo[dot]ac[dot]jp Fac_Eng_Univ_Tokyo CC BY-NC-SA
7 福山大学生物化学研 matsuura[at]bt[dot]fubt[dot]fukuyama-u[dot]ac[dot]jp Fukuyama_Univ CC BY-SA
8 ジーエルサイエンス csc[at]gls[dot]co[dot]jp GL_Sciences_Inc CC BY-SA
9 ライプニッツ植物化学研究所 steffen[dot]neumann[at]ipb-halle[dot]de IPB_Halle CC BY-SA
10 日本電子株式会社 taksatoh[at]jeol[dot]co[dot]jp JEOL_Ltd CC BY-NC-SA
11 かずさDNA研究所 shibata[at]kazusa[dot]or[dot]jp Kazusa CC BY-SA
12 慶應大先端生命研 soga[at]sfc[dot]keio[dot]ac[dot]jp Keio_Univ CC BY-NC-SA
13 京大院薬・生産開発研 akimoto[at]pharm[dot]kyoto-u[dot]ac[dot]jp,
maoka[at]mbox[dot]kyoto-inet[dot]or[dot]jp
Kyoto_Univ CC BY-SA
14 MetaboLights - MetaboLights CC BY-SA
15 メタボロン社 aevans[at]metabolon[dot]com Metabolon CC BY-NC-ND
16 マックスプランク化学生態学研究所 svatos[at]ice[dot]mpg[dot]de MPI_for_Chemical_Ecology CC BY-NC-SA
17 日本質量分析学会 - MSSJ CC BY-SA
18 奈良先端大情報科学研究科 skanaya[at]gtc[dot]naist[dot]jp NAIST CC BY-SA
19 日大文理 takaiida[at]chs[dot]nihon-u[dot]ac[dot]jp Nihon_Univ ※データ毎に異なる
20 大阪府立母子保健総合医療センター研究所 waday[at]lab[dot]mch[dot]pref[dot]osaka[dot]jp Osaka_MCHRI CC BY-SA
21 大阪大学 fukusaki[at]bio[dot]eng[dot]osaka-u[dot]ac[dot]jp Osaka_Univ CC BY-SA
22 オズワルド・クルーズ財団 massbank[at]cpqrr[dot]fiocruz[dot]br Oswaldo_Cruz_Foundation CC BY-NC
23 PFOS研究グループ tycobb_jp[at]d[dot]miura18[dot]com PFOS_research_group CC BY-SA
24 理研植物科学研究センター arita[at]bi[dot]s[dot]u-tokyo[dot]ac[dot]jp RIKEN CC BY-SA
25 鳥取大農 kimura[at]muses[dot]tottori-u[dot]ac[dot]jp,
kawano[at]muses[dot]tottori-u[dot]ac[dot]jp
Tottori_Univ CC BY-SA
26 ヘルムホルツ協会環境研究所 tobias[dot]schulze[at]ufz[dot]de UFZ CC BY
27 コネチカット大学 david[dot]grant[at]uconn[dot]edu Univ_Connecticut CC BY-SA
28 富山大和漢薬研 ktanaka[at]inm[dot]u-toyama[dot]ac[dot]jp Univ_Toyama CC BY-SA
29 産業医科大学 h-morii[at]health[dot]uoeh-u[dot]ac[dot]jp UOEH CC BY-SA
30 プリバダ・アンテノル・オレゴ大学 - UPAO CC BY
31 ワシントン州立大学 lange-m[at]wsu[dot]edu Washington_State_Univ CC BY-SA

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