遺伝子名称シソーラス

2012/01/17

WebSite: http://lifesciencedb.jp/MEXT_H18/ii-7d71540862808853958b767a30fb63d04f9b/ii-1-8f9e66f830b730bd30fc30e930b9/907a4f1d5b50540d79f030b730bd30fc30e930b9
HTTPS Site: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/lsdb_gene_thesaurus

9種類の生物(ヒト、マウス、ラット、ゼブラフィッシュ、ショウジョウバエ、線虫、出芽酵母、分裂酵母、枯草菌)を対象に遺伝子名、 遺伝子ファミリ名を集め並列関係【同義】および上下関係【ファミリ名】で関係付けました。 頭文字表記や代表的な遺伝子・ゲノムデータベースID情報も名称と扱います。

README 目次

  1. ダウンロードデータの構成
  2. ダウンロードデータの説明
  3. 本データベースの利用許諾
  4. 更新履歴
  5. 参考文献
  6. 連絡先

1. ダウンロードデータの構成

  1. README
  2. 遺伝子名称シソーラス
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2. ダウンロードデータの説明

2.1 README

データ名 README
データ内容 「遺伝子名称シソーラス」のダウンロードデータについて説明したHTMLファイルです。
ダウンロードファイル名 README.html（日本語）
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2.2  ゲノム・ポストゲノム分野の主要プロジェクト一覧データ

データ名 遺伝子名称シソーラス
データ内容の説明 さまざまなデータベースや論文で利用されている表記を専門的キュレータが編集して、 遺伝子が持つ多様な表記のあいだの関係を明かにした遺伝子名シソーラス
データファイル dictionary.zip(4.6MB)


データファイルの各列のデータは以下の通りです。
項目名 項目の説明（参照元情報）
SWISS-PROT_IDSWISS-PROTのID
EntrezGene_IDEntrezGeneのID
Other_ID上記以外のDBのID
Gene_Name遺伝子名

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3. 本データベースの利用許諾

利用許諾更新日: 2012/01/17

本データベースは、以下で定める利用許諾に基づきご利用いただくことができます。 本利用許諾は、本データベース利用における許諾内容、及び利用者が従うべき条件を定めています。


Creative Commons License

本データベースの利用許諾は、 クリエイティブ・コモンズ　表示-継承2.1　日本の定める利用許諾です。
本データベースのクレジットは、 ”遺伝子名称シソーラス © ライフサイエンス統合データベースセンター licensed under CC表示 継承2.1 日本”ですので、 利用にあたり必ず表示してください。

クリエイティブ・コモンズ　表示-継承2.1　日本の概要は こちらです。 具体的な許諾条項は こちらをご覧ください。

本データベースにおいて、以下の条件に従う限り許諾されている事項：

  1. 本データベースの全部または一部に自由にアクセスし、データを取得することができます。
  2. 本データベースの全部または一部のデータを自由に再配布することができます。
  3. 本データベースの全部または一部のデータを利用した、データベースなどの二次的著作物を自由に作成し、配布することができます。

 

本利用許諾に基づいて利用する際に従うべき条件：

  1. 本データベースの全部または一部、あるいは二次的著作物の配布に際しては、本データベースの作成者のクレジットを表示しなければなりません。
  2. 本データベースの全部または一部のデータを利用して作成された二次的著作物は、この利用許諾の下で配布されなければなりません。
  3. 本利用許諾で許諾されていない事項については、以下のデータベース作成者に連絡をとり、利用許諾を求める必要があります。

データベース作成者連絡先：
大学共同利用機関法人　情報・システム研究機構　ライフサイエンス統合データベースセンター
E-mail :E-mail : info [at] dbcls [dot] rois [dot] ac [dot] jp

3.3 本データベースへのリンクについて

本データベース内の全てのコンテンツに対しては、自由にリンクを貼ることができます。 ただし、コンテンツの内容は予告なく変更される場合があります。

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4. 更新履歴

更新日 更新内容
2012/01/17 利用許諾を変更
2007/03 文部科学省ライフサイエンス統合データベースプロジェクトH18年度成果公開サイトで公開開始
2009/03/18 データベースアーカイブにてダウンロードデータ公開開始
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5. 参考文献

6.連絡先

「遺伝子名称シソーラス」についてのお問い合わせは、下記連絡先までご連絡ください。

大学共同利用機関法人　情報・システム研究機構　ライフサイエンス統合データベースセンター
E-mail : info [at] dbcls [dot] rois [dot] ac [dot] jp
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