KTmAbDB - C. elegans Monoclonal Antibody Collection

2015/06/24

WebSite: http://www.cdb.riken.jp/dge/KTmAbDB/KTtop.html
HTTPS Site: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/ktmabdb

線虫C. elegans胚の特異的な細胞型・組織・細胞内構造を認識するモノクローナル抗体コレクションのデータベース。

README 目次

  1. ダウンロードデータの構成
  2. ダウンロードデータの説明
  3. 本データベースの利用許諾
  4. 更新履歴
  5. 参考文献
  6. 連絡先

1. ダウンロードデータの構成

  1. README
  2. モノクローナル抗体コレクションと免疫染色顕微鏡画像
  3. 免疫染色顕微鏡画像ファイル
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2. ダウンロードデータの説明

2.1 README

データ名 README
データ内容 「KTmAbDB」のダウンロードデータについて説明したHTMLファイル。
ダウンロードファイル名 README.html（日本語）
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2.2 線虫の変異株データ

データ名 モノクローナル抗体コレクションと免疫染色顕微鏡画像
データ内容の説明 線虫C. elegans胚の特異的な細胞型・組織・細胞内構造を認識するモノクローナル抗体コレクションと、 各抗体の胚発生過程各時期の免疫染色顕微鏡画像
データファイル ktmabdb.zip (3KB)
データファイルの各列のデータは以下の通りです。
項目名 項目の説明
mAb Name モノクローナル抗体
Representative image 代表的な免疫染色顕微鏡画像。TogoDBでは画像が表示され、ダウンロードデータでは画像ファイル名となる。
Localization 局在
Green Costaining DAPI（DNAを染色）またはMH27（上皮の細胞間接着を染色）による同時染色（緑色）
Isotype アイソタイプ
Images 胚発生過程各時期の免疫染色顕微鏡画像。HTML形式の表で記述される。

2.3 線虫の変異株データ

データ名 免疫染色顕微鏡画像ファイル
データ内容の説明 各モノクローナル抗体の胚発生過程各時期の免疫染色顕微鏡画像の画像ファイル。 JPEG形式の131ファイル。 画像ファイル名は、以下の規則で名付けされている。 同時染色の画像の場合、「ol」がファイル名に付与される。
「（モノクローナル抗体）_(胚発生過程時期）（番号）(_ol).jpg 」
例：KT02_2 cell_1_ol.jpg　の場合
抗体名：KT02
胚発生過程時期: 2 cell
番号: 1
同時染色: ol
データファイル ktmabdb_images.zip (8.35MB)
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3. 本データベースの利用許諾

利用許諾更新日: 2010/02/15

本データベースは、以下で定める利用許諾に基づきご利用いただくことができます。 本利用許諾は、本データベース利用における許諾内容、及び利用者が従うべき条件を定めています。


Creative Commons License

本データベースの利用許諾は、クリエイティブ・コモンズ　表示-継承2.1　日本の定める利用許諾です。
本データベースのクレジットは、 ”KTmAbDB, Copyright© 2010 杉本 亜砂子（東北大学）　licensed under CC表示-継承2.1 日本”ですので、 利用にあたり必ず表示してください。

クリエイティブ・コモンズ　表示-継承2.1　日本の概要は こちらです。 具体的な許諾条項は こちらをご覧ください。

本利用許諾の下で以下の条件に従う限り許諾されている事項：

  1. 本データベースの全部または一部に自由にアクセスし、データを取得することができます。
  2. 本データベースの全部または一部のデータを自由に再配布することができます。
  3. 本データベースの全部または一部のデータを利用した、データベースなどの二次的著作物を自由に作成し、配布することができます。

本利用許諾に基づいて利用する際に従うべき条件：

  1. 本データベースの全部または一部、あるいは二次的著作物の配布に際しては、本データベースの作成者のクレジットを表示しなければなりません。
  2. 本データベースの全部または一部のデータを利用して作成された二次的著作物は、この利用許諾の下で配布されなければなりません。
  3. 本利用許諾で許諾されていない事項については、以下のデータベース作成者に連絡をとり、利用許諾を求める必要があります。

〒980－8577 仙台市青葉区片平２-1-1
東北大学大学院　生命科学研究科
生命機能科学専攻　細胞機能構築統御学講座
発生ダイナミクス分野
Tel:022-217-6194
E-mail:asugimoto[at]m[dot]tains[dot]tohoku[dot]ac[dot]jp

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4. 更新履歴

更新日 更新内容
2015/06/24 オリジナルサイトの運用終了に伴い、データベースの説明の以下の情報を変更
  • データベース運用場所
  • オリジナルサイト
2010/03/05 生命科学系データベースアーカイブにてダウンロードデータ公開開始
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5. 参考文献

Takeda, K., Watanabe, C., Qadota, H., Hanazawa, M., and Sugimoto, A.
Efficient production of monoclonal antibodies recognizing specific structures in Caenorhabditis elegans embryos using an antigen subtraction method.
PMID: 18498356

6.連絡先

「KTmAbDB」についてのお問い合わせは、下記連絡先までご連絡ください。

〒980－8577 仙台市青葉区片平２-1-1
東北大学大学院　生命科学研究科
生命機能科学専攻　細胞機能構築統御学講座
発生ダイナミクス分野
Tel:022-217-6194
E-mail:asugimoto[at]m[dot]tains[dot]tohoku[dot]ac[dot]jp

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