KNApSAcK Family
2012/03/30
Web Site:
KNApSAcK Family
FTP Site:
ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/knapsack/
生物種と代謝物の関係および薬用・食用植物の機能性に関するデータベース
README 目次
- ダウンロードデータの構成
- ダウンロードデータの説明
- 本データベースの利用許諾
- 更新履歴
- 参考文献
- 連絡先
1. ダウンロードデータの構成
- README
- 生物種-代謝物関係データ
- 代謝物機能データ
- 生物活性データ
- 食用植物データ
- 漢方処方データ
- 漢方生薬データ
- ジャム配合データ
- ジャムハーブデータ
- 世界の薬用/食用植物データ
2. ダウンロードデータの説明
2.1 README
| データ名 |
README |
| データ内容 |
「KNApSAcK Family」のダウンロードデータについて説明したHTMLファイル。 |
| ダウンロードファイル名 |
README.html（日本語） |
2.2 生物種-代謝物関係データ
| データ名 |
生物種-代謝物関係データ |
| データ内容の説明 |
生物種とその生物における代謝物の関係について、研究者が多くの論文を読んで整理し、データベース化して収録した。 |
| データファイル |
knapsack_core.zip (2.3 MB)
|
データファイルの各列のデータは以下の通りです。
| 項目名 |
項目の説明 |
| C_ID |
代謝物と生物種の対毎に付与されたID |
| CAS RN |
CAS登録番号 |
| Metabolite |
代謝物の名称 |
| Molecular Formula |
代謝物の組成式 |
| Organism |
生物種名 |
| Kingdom |
生物種の界名 |
| Family |
生物種の科名 |
| Genus |
生物種の属名 |
| Reference |
参考 |
2.3 代謝物機能データ
| データ名 |
代謝物機能データ |
| データ内容の説明 |
代謝物において報告された機能について収録している。
|
| データファイル |
knapsack_function.zip (120 KB)
|
データファイルの各列のデータは以下の通りです。
| 項目名 |
項目の説明 |
| Name |
代謝物名称 |
| Formula |
組成式 |
| C_ID |
KNApSAcK ID |
| Function |
機能 |
| Target |
機能が対象とする生物 |
| Reference |
参考文献 |
2.4 生物活性データ
| データ名 |
生物活性データ |
| データ内容の説明 |
生物活性について、研究者が多くの論文を読んで整理し、33,706対の生薬（1,399）- 生物活性（2,418）をデータベース化して収録した。
|
| データファイル |
knapsack_biologicalactivity_core.zip (334 KB)
|
データファイルの各列のデータは以下の通りです。
| 項目名 |
項目の説明 |
| 種名 |
種名 |
| KNApSAcK Core Link |
Core System (生物種-代謝物関係データ)へのリンク (簡易検索サイトのみ) |
| 健康・薬用・効能 (英語) |
健康・薬用・効能 (英語) |
| 健康・薬用・効能 (日本語) |
健康・薬用・効能 (日本語) |
| 書籍 |
参考文献 |
2.5 食用植物データ
| データ名 |
食用植物データ |
| データ内容の説明 |
食品の機能性について、研究者が多くの論文を読んで整理し、709種をデータベース化して収録した。
|
| データファイル |
knapsack_lunchboxcore.zip (287 KB)
|
データファイルの各列のデータは以下の通りです。
| 項目名 |
項目の説明 |
| 大分類 |
生物種の大分類 |
| 種名 |
生物種の名称 |
| 学名 (一般名) |
生物種の学名 (一般) |
| 科名 |
生物種の科名 |
| 原産 |
原産 |
| 日本伝来 |
日本伝来 |
| 概説 |
概説 |
| 食用 |
食用 |
| 健康促進・薬用 |
健康促進・薬用 |
| 一般文献 |
一般文献 |
| 加工品 |
加工品 |
| 画像 |
画像へのリンク (簡易検索サイトのみ) |
2.6 漢方処方データ
| データ名 |
漢方処方データ |
| データ内容の説明 |
1,581種の漢方処方について、研究者が多くの論文を読んで整理し、データベース化して収録した。
|
| データファイル |
knapsack_kampo_core.zip (53.7 KB)
|
データファイルの各列のデータは以下の通りです。
| 項目名 |
項目の説明 |
| 漢方名[Kampo Name] |
漢方の名称 (漢字) |
| 漢方名[Rome] |
漢方の名称 (ローマ字) |
| 漢方名[Kana] |
漢方の名称 (かな) |
| 文献[Reference] |
参考文献 |
| 生薬名[Herb Name] |
生薬の名称 |
| 書籍 |
書籍 |
2.7 漢方生薬データ
| データ名 |
漢方生薬データ |
| データ内容の説明 |
漢方に用いられる278種の生薬について、研究者が多くの論文を読んで整理し、データベース化して収録した。
|
| データファイル |
knapsack_kampo_syoyaku.zip (13.9 KB)
|
データファイルの各列のデータは以下の通りです。
| 項目名 |
項目の説明 |
| 生薬名 (漢字) |
生薬の名称 (漢字) |
| 生薬名 (カナ) |
生薬の名称 (カナ) |
| 慣用名 |
慣用の名称 (英語) |
| 学名 |
学名 |
| 文献[Reference] |
参考文献 |
| 効能[Effect] |
効能 |
| 効能グループ[EffectGroup] |
効能グループ |
| その他[Note] |
その他記載 |
2.8 ジャム配合データ
| データ名 |
ジャム配合データ |
| データ内容の説明 |
5,310種のインドネシアジャム配合処方について、研究者が多くの論文を読んで整理し、データベース化して収録した。
|
| データファイル |
knapsack_jamu_core.zip (254 KB)
|
データファイルの各列のデータは以下の通りです。
| 項目名 |
項目の説明 |
| Company or Reference |
企業名或いは文献 |
| Jamu Name |
ジャムのブランド名称 |
| Jamu Effect |
効能 |
| Jamu Effect Group |
効能グループ |
| Ingredlent Harbs |
ジャムに配合されたハーブの名称 |
| Jamu Source |
ジャムの情報元 |
2.9 ジャムハーブデータ
| データ名 |
ジャムハーブデータ |
| データ内容の説明 |
インドネシアジャムに含まれる1,133種のハーブデータについて、研究者が多くの論文を読んで整理し、データベース化して格納した。
|
| データファイル |
knapsack_jamu_harb.zip (55.9 KB)
|
データファイルの各列のデータは以下の通りです。
| 項目名 |
項目の説明 |
| Harb Name |
ハーブ名 |
| Harb Name (Indonesia) |
ハーブ名（インドネシア） |
| Harb Name (English/Chinese) |
ハーブ名（英語、中国語） |
| Position of Plants |
植物内での分類 |
| Effect |
効能 |
| Comment |
その他記述 |
| Reference |
参考 |
| Scientific Names |
学名 |
2.10 世界の薬用/食用植物データ
| データ名 |
世界の薬用/食用植物データ |
| データ内容の説明 |
48,256対の薬用植物と使用国（217GZ）の関係について、研究者が多くの論文を読んで整理し、データベース化して収録した。
|
| データファイル |
knapsack_worldcore.zip (523 KB)
|
データファイルの各列のデータは以下の通りです。
| 項目名 |
項目の説明 |
| 国名 |
国名（日本語） |
| 国名(正式) |
国名（正式：英語） |
| 国名(略式) |
国名（略式：英語） |
| 国番号 |
国番号 |
| 地域 |
地域 |
| Species Name |
生物種名 |
| Purpose |
目的 |
| Reference |
文献 |
3. 本データベースの利用許諾
利用許諾更新日: 2012/03/30
本データベースは、以下で定める利用許諾に基づきご利用いただくことができます。
本利用許諾は、本データベース利用における許諾内容、及び利用者が従うべき条件を定めています。
本データベースの利用許諾は、クリエイティブ・コモンズ 表示-継承2.1 日本の定める利用許諾です。
本データベースのクレジットは、
”KNApSAcK Family © 金谷 重彦 (奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示 継承2.1 日本”ですので、
利用にあたり必ず表示してください。
クリエイティブ・コモンズ 表示-継承2.1 日本の概要は
こちらです。
具体的な許諾条項は
こちらをご覧ください。
本データベースにおいて、標準利用許諾の下で以下の条件に従う限り許諾されている事項：
- 本データベースの全部または一部に自由にアクセスし、データを取得することができます。
- 本データベースの全部または一部のデータを自由に再配布することができます。
- 本データベースの全部または一部のデータを利用した、データベースなどの二次的著作物を自由に作成し、配布することができます。
本データベースにおいて、標準利用許諾に基づいて利用する際に従うべき条件：
- 本データベースの全部または一部、あるいは二次的著作物の配布に際しては、本データベースの作成者のクレジットを表示しなければなりません。
- 本データベースの全部または一部のデータを利用して作成された二次的著作物は、この利用許諾の下で配布されなければなりません。
- 本利用許諾で許諾されていない事項については、以下のデータベース作成者に連絡をとり、利用許諾を求める必要があります。
データベース作成者連絡先：
〒630-0192 奈良県生駒市高山町8916−5
奈良先端科学技術大学院大学 情報科学研究科 金谷重彦
Tel: (教授)0743-72-5952 (秘書)0743-72-5257
Fax: 0743-72-5258
E-mail: skanaya[at]gtc[dot]naist[dot]jp
4. 更新履歴
| 更新日 |
更新内容 |
| 2012/03/30 |
生命科学系データベースアーカイブにてダウンロードデータ公開開始 |
| 2008/07/01 |
KNApSAcK Family(http://kanaya.naist.jp/KNApSAcK_Family/)で公開開始 |
5. 参考文献
Farit Mochamad Afendi, Taketo Okada, Mami Yamazaki, Aki Hirai-Morita, Yukiko Nakamura, Kensuke Nakamura, Shun Ikeda, Hiroki Takahashi, Md. Altaf-Ul-Amin1, Latifah K. Darusman, Kazuki Saito and Shigehiko Kanaya.
KNApSAcK Family Databases: Integrated Metabolite-Plant Species Databases for Multifaceted Plant Research
Plant Cell Physiol., 53,e1.1-11,(2012). doi:10.1093/pcp/pcr165
PMID:
22123792
6. 連絡先
「KNApSAcK Family」についてのお問い合わせは、下記連絡先までご連絡ください。
〒630-0192
奈良県生駒市高山町8916−5
Tel: (教授)0743-72-5952 (秘書)0743-72-5257
Fax: 0743-72-5258
E-mail: skanaya[at]gtc[dot]naist[dot]jp