KNApSAcK Bicycle

2014/05/16

Web Site: KNApSAcK Bicycle
HTTPS Site: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/knapsack-bicycle/

藻類のタンパク質と二次代謝反応の情報を集めたデータベース

README 目次

  1. ダウンロードデータの構成
  2. ダウンロードデータの説明
  3. 本データベースの利用許諾
  4. 更新履歴
  5. 参考文献
  6. 連絡先

1. ダウンロードデータの構成

  1. README
  2. 藻類二次代謝反応データ
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2. ダウンロードデータの説明

2.1 README

データ名 README
データ内容 「KNApSAcK Bicycle」のダウンロードデータについて説明したHTMLファイル。
ダウンロードファイル名 README.html(日本語)
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2.2 藻類二次代謝反応データ

データ名 藻類二次代謝反応データ
データ内容の説明 94種類の藻類に存在する96,641個のタンパク質と二次代謝反応のリストです。
データファイル knapsack_bicycle_main.zip (66 MB)

データファイルの各列のデータは以下の通りです。
ag_id Algae ID (このデータベース独自のID)
protein タンパク質名
kegg_id KEGG ID (データなし)
ec EC番号
equation 化学反応式
domain 分類
phylum 分類階級(門)
order 分類階級(目)
family 分類階級(科)
reaction_mechanism 反応メカニズム (データなし)
pathway パスウェイ情報 (データなし)
curator キュレーター
species 生物種名
gene 遺伝子名
reference 参考文献
amino_seq_accession アミノ酸配列Accession ID
amino_seq アミノ酸配列
dna_seq_accession DNA配列Accession ID
dna_seq DNA配列
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3. 本データベースの利用許諾

利用許諾更新日: 2012/03/30

本データベースは、以下で定める利用許諾に基づきご利用いただくことができます。 本利用許諾は、本データベース利用における許諾内容、及び利用者が従うべき条件を定めています。

Creative Commons License

本データベースの利用許諾は、 クリエイティブ・コモンズ 表示-継承2.1 日本の定める利用許諾です。
本データベースのクレジットは、 ”KNApSAcK Family © 金谷 重彦 (奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示 継承2.1 日本”ですので、 利用にあたり必ず表示してください。

クリエイティブ・コモンズ 表示-継承2.1 日本の概要は こちらです。 具体的な許諾条項は こちらをご覧ください。

本データベースにおいて、以下の条件に従う限り許諾されている事項:

  1. 本データベースの全部または一部に自由にアクセスし、データを取得することができます。
  2. 本データベースの全部または一部のデータを自由に再配布することができます。
  3. 本データベースの全部または一部のデータを利用した、データベースなどの二次的著作物を自由に作成し、配布することができます。

 

本利用許諾に基づいて利用する際に従うべき条件:

  1. 本データベースの全部または一部、あるいは二次的著作物の配布に際しては、本データベースの作成者のクレジットを表示しなければなりません。
  2. 本データベースの全部または一部のデータを利用して作成された二次的著作物は、この利用許諾の下で配布されなければなりません。
  3. 本利用許諾で許諾されていない事項については、以下のデータベース作成者に連絡をとり、利用許諾を求める必要があります。

データベース作成者連絡先:
〒630-0192 奈良県生駒市高山町8916−5
奈良先端科学技術大学院大学 情報科学研究科 金谷重彦
Tel: (教授)0743-72-5952 (秘書)0743-72-5257
Fax: 0743-72-5258
E-mail: skanaya[at]gtc[dot]naist[dot]jp

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4. 更新履歴

更新日 更新内容
2014/05/16 生命科学系データベースアーカイブにてダウンロードデータ公開開始
2013/09 KNApSAcK Bicycle (http://kanaya.naist.jp/bicycle/top.html)で公開開始
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5. 参考文献

-

6. 連絡先

「KNApSAcK Bicycle」についてのお問い合わせは、下記連絡先までご連絡ください。

〒630-0192
奈良県生駒市高山町8916−5
Tel: (教授)0743-72-5952 (秘書)0743-72-5257
Fax: 0743-72-5258
E-mail: skanaya[at]gtc[dot]naist[dot]jp

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