KNApSAcK Bicycle
2014/05/16Web Site: KNApSAcK Bicycle
HTTPS Site: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/knapsack-bicycle/
藻類のタンパク質と二次代謝反応の情報を集めたデータベース
README 目次
1. ダウンロードデータの構成
2. ダウンロードデータの説明
2.1 README
| データ名 | README |
| データ内容 | 「KNApSAcK Bicycle」のダウンロードデータについて説明したHTMLファイル。 |
| ダウンロードファイル名 | README.html（日本語） |
2.2 藻類二次代謝反応データ
| データ名 | 藻類二次代謝反応データ |
| データ内容の説明 | 94種類の藻類に存在する96,641個のタンパク質と二次代謝反応のリストです。 |
| データファイル | knapsack_bicycle_main.zip (66 MB) |
データファイルの各列のデータは以下の通りです。
| ag_id | Algae ID (このデータベース独自のID) |
| protein | タンパク質名 |
| kegg_id | KEGG ID (データなし) |
| ec | EC番号 |
| equation | 化学反応式 |
| domain | 分類 |
| phylum | 分類階級（門） |
| order | 分類階級（目） |
| family | 分類階級（科） |
| reaction_mechanism | 反応メカニズム (データなし) |
| pathway | パスウェイ情報 (データなし) |
| curator | キュレーター |
| species | 生物種名 |
| gene | 遺伝子名 |
| reference | 参考文献 |
| amino_seq_accession | アミノ酸配列Accession ID |
| amino_seq | アミノ酸配列 |
| dna_seq_accession | DNA配列Accession ID |
| dna_seq | DNA配列 |
3. 本データベースの利用許諾
利用許諾更新日: 2012/03/30
本データベースは、以下で定める利用許諾に基づきご利用いただくことができます。 本利用許諾は、本データベース利用における許諾内容、及び利用者が従うべき条件を定めています。
本データベースの利用許諾は、 クリエイティブ・コモンズ 表示-継承2.1 日本の定める利用許諾です。
本データベースのクレジットは、 ”KNApSAcK Family © 金谷 重彦 (奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示 継承2.1 日本”ですので、 利用にあたり必ず表示してください。
クリエイティブ・コモンズ 表示-継承2.1 日本の概要は こちらです。 具体的な許諾条項は こちらをご覧ください。
本データベースにおいて、以下の条件に従う限り許諾されている事項：
- 本データベースの全部または一部に自由にアクセスし、データを取得することができます。
- 本データベースの全部または一部のデータを自由に再配布することができます。
- 本データベースの全部または一部のデータを利用した、データベースなどの二次的著作物を自由に作成し、配布することができます。
本利用許諾に基づいて利用する際に従うべき条件：
- 本データベースの全部または一部、あるいは二次的著作物の配布に際しては、本データベースの作成者のクレジットを表示しなければなりません。
- 本データベースの全部または一部のデータを利用して作成された二次的著作物は、この利用許諾の下で配布されなければなりません。
- 本利用許諾で許諾されていない事項については、以下のデータベース作成者に連絡をとり、利用許諾を求める必要があります。
データベース作成者連絡先：
〒630-0192 奈良県生駒市高山町8916−5
奈良先端科学技術大学院大学 情報科学研究科 金谷重彦
Tel: (教授)0743-72-5952 (秘書)0743-72-5257
Fax: 0743-72-5258
E-mail: skanaya[at]gtc[dot]naist[dot]jp
4. 更新履歴
| 更新日 | 更新内容 |
| 2014/05/16 | 生命科学系データベースアーカイブにてダウンロードデータ公開開始 |
| 2013/09 | KNApSAcK Bicycle (http://kanaya.naist.jp/bicycle/top.html)で公開開始 |
5. 参考文献
-
6. 連絡先
「KNApSAcK Bicycle」についてのお問い合わせは、下記連絡先までご連絡ください。
〒630-0192
奈良県生駒市高山町8916−5
Tel: (教授)0743-72-5952 (秘書)0743-72-5257
Fax: 0743-72-5258
E-mail: skanaya[at]gtc[dot]naist[dot]jp