JEDI System/OCEANS DB

2023/06/13

海洋プランクトンの画像と環境モニタリングデータを含むデータベース

README 目次

ダウンロードデータの構成
ダウンロードデータの説明
本データベースの利用許諾
更新履歴
参考文献
連絡先

1. ダウンロードデータの構成

README
多層海流データおよび波浪データ
乱流データ
クロロフィル・濁度データ
水温・塩分データ
溶存酸素飽和度データ
音響データ
光合成有効放射量データ
硝酸塩データ
多層水温データ
波高データ
水中画像ファイル
動植物プランクトンデータ

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2. ダウンロードデータの説明

2.1 README

データ名	README
データ内容	「JEDI System/OCEANS DB」のダウンロードデータについて説明したHTMLファイル。
ダウンロードファイル名	README.html (日本語)

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2.2 多層海流データおよび波浪データ

データ名	多層海流データおよび波浪データ
データ内容の説明	超音波式流向流速計(ADCP)で計測された多層海流データ，および超音波式波浪観測計(AWAC)で計測された波浪データ
データファイル	OCEANS_adcp1.zip (446 MB)

データファイルの各列のデータは以下の通りです。

項目名	項目の説明
AquaPro/RawBinary/*.prf	AquaProバイナリ生データファイル
AquaPro/ASCIIoutput/*.pra	AquaProアスキー出力ファイル
praファイルのフォーマット
ヘッダ行(1行目)
Month	[1-12]
Day	[1-31]
Year
Hour	[0-23]
Minute	[0-59]
Second	[0-59]
Error code
Status code
Battrey voltage	[V]
Sound speed	[m/s]
Heading	[degrees]
Pitch	[degrees]
Roll	[degrees]
Pressure	[dbar]
Temperture	[degrees C]
Analog input 1
Analog input 2
Number of beams
Number of cells
データ行(2～21行目; 以下ヘッダ行から繰り返し）
Cell number
Velocity (Beam 1)	X\|East [m/s]
Velocity (Beam 2)	Y\|North [m/s]
Velocity (Beam 3)	Z\|Up [m/s]
Amplitude (Beam 1)	[counts]
Amplitude (Beam 2)	[counts]
Amplitude (Bean 3)	[counts]
AWAC/RawBinary/*.wpr	AWACバイナル生データファイル
AWAC/ASCIIconvertedRAW/*.a[123]	AWAC波高データ（Beam1, 2, 3)
AWAC/ASCIIconvertedRAW/*.csv	AWACプロファイルデータ(コンマ区切りフォーマット）
AWAC/ASCIIconvertedRAW/*.dat	AWAC流速データ
AWAC/ASCIIconvertedRAW/*.hdr	AWACヘッダファイル（AWAC各ファイルのフォーマットを記述）
AWAC/ASCIIconvertedRAW/*.nmea	AWAC NMEAフォーマット（生データ）
AWAC/ASCIIconvertedRAW/*.sen	AWACセンサーデータ
AWAC/ASCIIconvertedRAW/*.ssl	AWACシステム状態ファイル
AWAC/ASCIIconvertedRAW/*.v[123]	AWAC流速データ(Beam1\|X\|East; Beam2\|Y\|North, Beam3\|Z\|Up)
AWAC/ASCIIconvertedRAW/*.wad	AWAC波浪データ
AWAC/ASCIIconvertedRAW/*.whd	AWAC波浪ヘッダデータ

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2.3 乱流データ

データ名	乱流データ
データ内容の説明	三次元精密流速系で計測された乱流データ
データファイル	OCEANS_adv.zip (22 GB)

データファイルの各列のデータは以下の通りです。

項目名	項目の説明
Raw/*.vec	生データ（バイナリ）
Raw/*.vea	生データ（アスキー）
Processed/*.txt	1分処理値データ(アスキー）
txtファイルのフォーマット
date	[YYYY/MM/DD]
time	[hh:mm:ss]
depth_m	Depth [meter]
press_dbar	Pressure [dbar]
temp_degC	Temperature [degrees C]
velE_m/s	Velocity (East) [m/s]
velN_m/s	Velocity (North) [m/s]
velU_m/s	Velocity (Up) [m/s]
corrE_%	Correlation (East) [%]
corrN_%	Correlation (North) [%]
corrU_%	Correlation (Up) [%]

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2.4 クロロフィル・濁度データ

データ名	クロロフィル・濁度データ
データ内容の説明	クロロフィル濁度計で計測されたクロロフィルおよび濁度のデータ
データファイル	OCEANS_ChlorTurbid.zip (514 MB)

データファイルの各列のデータは以下の通りです。

項目名	項目の説明
Date	[YYYY/MM/DD]
Time	[hh:mm:ss.sss]
pval
Temperature	[degrees C]
Chlorophyll	[ug/l] (microgram per litter)
Turbidity	[FTU] (Formazin Turbidity Unit)
Power voltage	[V]

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2.5 水温・塩分データ

データ名	水温・塩分データ
データ内容の説明	水温塩分計で計測された水温・塩分(電気伝導度)データ
データファイル	OCEANS_CondTemp.zip (626 MB)

データファイルの各列のデータは以下の通りです。

項目名	項目の説明
Date	[YYYY/MM/DD]
Time	[hh:mm:ss.sss]
pval
Conductivity	[mS/cm]
Temperature	[degrees C]
Salinity

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2.6 溶存酸素飽和度データ

データ名	溶存酸素飽和度データ
データ内容の説明	蛍光式(光学式)酸素センサーで計測された溶存酸素飽和度および水温データ
データファイル	OCEANS_DO.zip (443 MB)

データファイルの各列のデータは以下の通りです。

項目名	項目の説明
Date	[YYYY,MM,DD]
Time	[hh:mm:ss.sss]
pval
Temperature	[degrees C]
Dissolved Oxygen Concentration	[%]
Power voltage	[V]

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2.7 音響データ

データ名	音響データ
データ内容の説明	ハイドロフォン（水中マイク）で収録された海洋性哺乳類の音響データ
データファイル	OCEANS_hydrophone_2014.zip, OCEANS_hydrophone_2015.zip, OCEANS_hydrophone_2016.zip, OCEANS_hydrophone_2017.zip (236 GB)

データファイルの各列のデータは以下の通りです。

項目名	項目の説明
PNG	Portable Network Graphics format
WAV	RIFF waveform Audio Format

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2.8 光合成有効放射量データ

データ名	光合成有効放射量データ
データ内容の説明	光量子計で計測された光合成有効放射量データ(PAR)
データファイル	OCEANS_PAR.zip (748 M)

データファイルの各列のデータは以下の通りです。

項目名	項目の説明
Date	[YYYY/MM/DD]
Time	[hh:mm:ss.sss]
real
N1
N2
N3
N4
N5
N6
p_label (pg)
Photo Quantum	[umol/m2/s] (micro-mol/m2/sec)
v_label (v)
Power voltage	[V]

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2.9 硝酸塩データ

データ名	硝酸塩データ
データ内容の説明	水中紫外線硝酸塩センサーで計測された硝酸塩データ
データファイル	OCEANS_suna.zip (1.6 GB)

データファイルの各列のデータは以下の通りです。

項目名	項目の説明
date	Date [YYYY/MM/DD]
time	Time [hh:mm:ss.sss]
id	SATSLF0932
timefield	YYYY+day of year (e.g., 2016332 = Nov.27, 2016)
nitrate_um	Nitrate [umol/L] (micro-mol per litter)
nitrate_mg	Nitrate [mg/L] (microgram per litter)
Error
t_lamp
t_spec
humidity	Humidity
volt_12
volt_reg
volt_main
spec_ave
dark_ave
ch1-226
chksum	Checksum

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2.10 多層水温データ

データ名	多層水温データ
データ内容の説明	サーミスタ・チェーンで計測された20層水温データ
データファイル	OCEANS_tstring1.zip (1.8 GB)

データファイルの各列のデータは以下の通りです。

項目名	項目の説明
date	Date [YYYY/MM/DD]
time	Time [hh:mm:ss.sss]
T01	Temperature at layer 1
T02	Temperature at layer 2
T03	Temperature at layer 3
T04	Temperature at layer 4
T05	Temperature at layer 5
T06	Temperature at layer 6
T07	Temperature at layer 7
T08	Temperature at layer 8
T09	Temperature at layer 9
T10	Temperature at layer 10
T11	Temperature at layer 11
T12	Temperature at layer 12
T13	Temperature at layer 13
T14	Temperature at layer 14
T15	Temperature at layer 15
T16	Temperature at layer 16
T17	Temperature at layer 17
T18	Temperature at layer 18
T19	Temperature at layer 19
T20	Temperature at layer 20
D01	unknown

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2.11 波高データ

データ名	波高データ
データ内容の説明	水圧式メモリー波高計で計測された波高データ
データファイル	OCEANS_WaveHeight.zip (583 MB)

データファイルの各列のデータは以下の通りです。

項目名	項目の説明
Date	[YYYY/MM/DD]
Time	[hh:mm:ss.sss]
pval
Depth	[meter]
Temperature	[degrees C]
Power voltage	[V]

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2.12 水中画像ファイル

データ名	水中画像ファイル
データ内容の説明	ウェブカメラで収録された水中画像
データファイル	OCEANS_ webcam_2014.zip, OCEANS_ webcam_2015.zip, OCEANS_ webcam_2016.zip, OCEANS_ webcam_2017.zip (159 GB)

データファイルの各列のデータは以下の通りです。

項目名	項目の説明
JPG	画像ファイル（JPEGフォーマット）

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2.13 動植物プランクトンデータ

データ名	動植物プランクトンデータ
データ内容の説明	ウッズホール海洋研究所(WHOI)が開発したCPICS(連続プランクトン画像化および分類システム)により同定かつ検証済みの動植物プランクトン画像データセット
データファイル	OCEANS_CPICS_Validated.zip (21 GB)

データファイルの各列のデータは以下の通りです。

項目名	項目の説明
institutionCode	調査機関のコード
collectionCode	コレクションコード
catalogNumber	カタログ番号
occurrenceID	ID
occurrenceStatus	生物学的な在/不在
basisOfRecord	記録の原典
eventDate	ISO 8601形式の日付時刻 [yyyy-mm-ddThh:mm:ss+\|–hh:mm]
decimalLatitude	10進表記の緯度
decimalLongitude	10進表記の経度
minimumDepthInMeters	最も浅い水深のメートル表記
maximumDepthInMeters	最も深い水深のメートル表記
label	生物名称もしくは対象物の名称
associatedMedia	画像ファイル名

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3. 本データベースの利用許諾

利用許諾更新日: 2023/06/02

本データベースは、データによって利用許諾が異なります。
・多層海流
・乱流データ
・クロロフィル・濁度データ
・水温・塩分データ
・溶存酸素飽和度データ
・音響データ
・光合成有効放射量データ
・硝酸塩データ
・多層水温データ
・波高データ
・水中画像ファイル
本利用許諾は、本データベース利用における許諾内容、及び利用者が従うべき条件を定めています。

本データベースの利用許諾は、クリエイティブ・コモンズ　表示4.0　国際の定める利用許諾です。
本データベースのクレジットは、”JEDI System/OCEANS DB ©山崎秀勝 licensed under CC表示4.0 国際”ですので、利用にあたり必ず表示してください。

クリエイティブ・コモンズ　表示4.0　国際の概要はこちらです。具体的な許諾条項はこちらをご覧ください。

本データベースにおいて、以下の条件に従う限り許諾されている事項：

本データベースの全部または一部に自由にアクセスし、データを取得することができます。
本データベースの全部または一部のデータを自由に再配布することができます。
本データベースの全部または一部のデータを利用した、データベースなどの翻案物を自由に作成し、配布することができます。

本利用許諾に基づいて利用する際に従うべき条件：

本データベースの全部または一部、あるいは翻案物の配布に際しては、本データベースの作成者のクレジットを表示しなければなりません。
本利用許諾で許諾されていない事項については、以下のデータベース作成者に連絡をとり、利用許諾を求める必要があります。

データベース作成者連絡先：
E-mail: hide at_mark kaiyodai.ac.jp

・動植物プランクトンデータ
本利用許諾は、本データベース利用における許諾内容、及び利用者が従うべき条件を定めています。

本データベースの利用許諾は、クリエイティブ・コモンズ　表示-継承4.0　国際の定める利用許諾です。
本データベースのクレジットは、”JEDI System/OCEANS DB ©山崎秀勝 licensed under CC表示-継承4.0 国際”ですので、利用にあたり必ず表示してください。

クリエイティブ・コモンズ　表示-継承4.0　国際の概要はこちらです。具体的な許諾条項はこちらをご覧ください。

本データベースにおいて、以下の条件に従う限り許諾されている事項：

本データベースの全部または一部に自由にアクセスし、データを取得することができます。
本データベースの全部または一部のデータを自由に再配布することができます。
本データベースの全部または一部のデータを利用した、データベースなどの翻案物を自由に作成し、配布することができます。

本利用許諾に基づいて利用する際に従うべき条件：

本データベースの全部または一部、あるいは翻案物の配布に際しては、本データベースの作成者のクレジットを表示しなければなりません。
本データベースの全部または一部のデータを利用して作成された翻案物は、CC表示-継承4.0（もしくは、それ以降のバージョン）、またはCC表示-継承互換ライセンス（リストはこちら）の下で配布されなければなりません。
本利用許諾で許諾されていない事項については、以下のデータベース作成者に連絡をとり、利用許諾を求める必要があります。

データベース作成者連絡先：
E-mail: hide at_mark kaiyodai.ac.jp

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4. 更新履歴

更新日	更新内容
2023/06/12	生命科学系データベースアーカイブにてダウンロードデータ公開開始 (アーカイブ V1)

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5. 参考文献

Yamazaki, H., S. M. Gallager, M. Tanaka and K. Yamaguchi.
A cable observatory system for integrated long term, high-frequency biological, chemical, physical measurement for understanding planktonic ecosystem
IEEE Techno-Ocean’16 429-434. doi:10.1109/Techno-Ocean.2016.7890692

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6. 連絡先

「JEDI System/OCEANS DB」についてのお問い合わせは、下記連絡先までご連絡ください。

〒108-8477東京都港区港南4-5-7
東京海洋大学
山崎秀勝
hide at_mark kaiyodai.ac.jp

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