日本人におけるマイクロサテライトマーカーへテロ接合度のデータベース。日本人集団を対象とした連鎖解析や相関解析に有用なマーカー選択の基盤を整備した。
データ名 | README |
データ内容 | 「Heterozygosity of the Microsatellite Markers in the Japanese Population」のダウンロードデータについて説明したHTMLファイル。 |
ダウンロードファイル名 | README.html(日本語) |
データ名 | 日本人におけるマイクロサテライトマーカーのヘテロ接合度 |
データ内容の説明 | Kong A et al. Nat. Genet. 2002 Jul;31(3):241-7.に記載された4,868マイクロサテライトマーカーについて,日本人32検体の遺伝子型を取得し,アレル頻度よりヘテロ接合度を算出した。 |
データファイル | heterozygosity_jp.zip (113KB) |
項目名 | 項目の説明 |
---|---|
Marker name | マーカー名。 簡易検索ではNCBI UniSTSへのリンク。 |
Marker name (Also known as) | マーカー名 (別称)。簡易検索ではNCBI UniSTSへのリンク。 |
Chromosome | 染色体の番号 |
Position | 染色体上の位置 |
Position (bp) UCSC 2006 Mar, 2004 Jul*, 2003 May** | UCSCによる染色体上の位置 (bp) *は2004 Jul.、**は2003 May、それ以外は2006 Mar.のバージョン。 |
No. of Alleles (observed) | アレル数 |
Het | ヘテロ接合度 |
Position (cM) Genethon | Genethon社による染色体上の位置 (cM) |
Position (cM) Marshfield | Marshfield社による染色体上の位置 (cM) |
Position (cM) deCODE | deCODE Genetics社による染色体上の位置 (cM) |
Repeat Unit | リピート長 |
Gene (markers in intron or UTR) | 遺伝子記号 (イントロンもしくはUTRにマーカーが存在する場合) |
Linkage set | 連鎖解析のために選ばれたマーカーに*を付与している。 |
データ名 | summary |
データ内容の説明 | - |
データファイル | summary.pdf (8KB) |
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”Heterozygosity of the Microsatellite Markers in the Japanese Population, Copyright© 2010 山本 健 (九州大学) licensed under CC表示-継承2.1 日本”ですので、
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〒812-8582
福岡市東区馬出3-1-1
九州大学 生体防御医学研究所付属遺伝情報実験センター ゲノム構造学分野
山本 健
E-Mail: kyama[at]bioreg[dot]kyushu-u[dot]ac[dot]jp
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更新日 | 更新内容 |
2010/09/09 | 生命科学系データベースアーカイブにてダウンロードデータ公開開始 |
2010/08/25 | データ更新 |
2005/07/23 | Heterozygosity of the Microsatellite Markers in the Japanese Population(http://www002.upp.so-net.ne.jp/kyama-Q/MS.html)で公開開始 |
〒812-8582
福岡市東区馬出3-1-1
九州大学 生体防御医学研究所付属遺伝情報実験センター ゲノム構造学分野
山本 健
E-Mail: kyama[at]bioreg[dot]kyushu-u[dot]ac[dot]jp