Heterozygosity of the Microsatellite Markers in the Japanese Population

2010/09/09

WebSite: Heterozygosity of the Microsatellite Markers in the Japanese Population
HTTPS Site: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/heterozygosity_jp

日本人におけるマイクロサテライトマーカーへテロ接合度のデータベース。日本人集団を対象とした連鎖解析や相関解析に有用なマーカー選択の基盤を整備した。

README 目次

  1. ダウンロードデータの構成
  2. ダウンロードデータの説明
  3. 本データベースの利用許諾
  4. 更新履歴
  5. 参考文献
  6. 連絡先

1. ダウンロードデータの構成

  1. README
  2. 日本人におけるマイクロサテライトマーカーのヘテロ接合度
  3. summary
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2. ダウンロードデータの説明

2.1 README

データ名 README
データ内容 「Heterozygosity of the Microsatellite Markers in the Japanese Population」のダウンロードデータについて説明したHTMLファイル。
ダウンロードファイル名 README.html(日本語)
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2.2 日本人におけるマイクロサテライトマーカーのヘテロ接合度

データ名 日本人におけるマイクロサテライトマーカーのヘテロ接合度
データ内容の説明 Kong A et al. Nat. Genet. 2002 Jul;31(3):241-7.に記載された4,868マイクロサテライトマーカーについて,日本人32検体の遺伝子型を取得し,アレル頻度よりヘテロ接合度を算出した。
データファイル heterozygosity_jp.zip (113KB)
データファイルの各列のデータは以下の通りです。
項目名 項目の説明
Marker name マーカー名。 簡易検索ではNCBI UniSTSへのリンク。
Marker name (Also known as) マーカー名 (別称)。簡易検索ではNCBI UniSTSへのリンク。
Chromosome 染色体の番号
Position 染色体上の位置
Position (bp) UCSC 2006 Mar, 2004 Jul*, 2003 May** UCSCによる染色体上の位置 (bp) *は2004 Jul.、**は2003 May、それ以外は2006 Mar.のバージョン。
No. of Alleles (observed) アレル数
Het ヘテロ接合度
Position (cM) Genethon Genethon社による染色体上の位置 (cM)
Position (cM) Marshfield Marshfield社による染色体上の位置 (cM)
Position (cM) deCODE deCODE Genetics社による染色体上の位置 (cM)
Repeat Unit リピート長
Gene (markers in intron or UTR) 遺伝子記号 (イントロンもしくはUTRにマーカーが存在する場合)
Linkage set 連鎖解析のために選ばれたマーカーに*を付与している。
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2.3 summary

データ名 summary
データ内容の説明 -
データファイル summary.pdf (8KB)
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3. 本データベースの利用許諾

利用許諾更新日: 2010/08/10

本データベースは、以下で定める標準利用許諾及び追加利用許諾に基づきご利用いただくことができます。 標準利用許諾は、本データベース利用における許諾内容、及び利用者が従うべき条件を定めています。 追加利用許諾は、標準利用許諾で原則として禁止されている事項の中で例外的に許諾される事項を定めています。

3.1 標準利用許諾

Creative Commons License

本データベースの標準利用許諾は、クリエイティブ・コモンズ 表示-継承2.1 日本の定める利用許諾です。
本データベースのクレジットは、 ”Heterozygosity of the Microsatellite Markers in the Japanese Population, Copyright© 2010 山本 健 (九州大学) licensed under CC表示-継承2.1 日本”ですので、 利用にあたり必ず表示してください。

クリエイティブ・コモンズ 表示-継承2.1 日本の概要は こちらです。 具体的な許諾条項は こちらをご覧ください。

本データベースにおいて、標準利用許諾の下で以下の条件に従う限り許諾されている事項:

  1. 本データベースの全部または一部に自由にアクセスし、データを取得することができます。
  2. 本データベースの全部または一部のデータを自由に再配布することができます。
  3. 本データベースの全部または一部のデータを利用した、データベースなどの二次的著作物を自由に作成し、配布することができます。

本データベースにおいて、標準利用許諾に基づいて利用する際に従うべき条件:

  1. 本データベースの全部または一部、あるいは二次的著作物の配布に際しては、本データベースの作成者のクレジットを表示しなければなりません。
  2. 本データベースの全部または一部のデータを利用して作成された二次的著作物は、この利用許諾の下で配布されなければなりません。

3.2 追加利用許諾

1.本データベースの全部または一部を利用して作成された二次的著作物を配布する場合には、標準利用許諾とともにこの追加利用許諾を表示しなければなりません。

2. 本データベースを利用して研究を行い、その成果を論文に記載する場合は、論文中に必ず本データベースを引用して、本データベース名称とURLを記載する必要があります。

3. 標準利用許諾及び上記の追加利用許諾で許諾されていない事項については、以下のデータベース作成者に連絡をとり、利用許諾を求める必要があります。

〒812-8582
福岡市東区馬出3-1-1
九州大学 生体防御医学研究所付属遺伝情報実験センター ゲノム構造学分野
山本 健
E-Mail: kyama[at]bioreg[dot]kyushu-u[dot]ac[dot]jp

3.3 本データベースへのリンクについて

本データベース内の全てのコンテンツに対しては、自由にリンクを貼ることができます。 ただし、コンテンツの内容は予告なく変更される場合があります。

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4. 更新履歴

更新日 更新内容
2010/09/09 生命科学系データベースアーカイブにてダウンロードデータ公開開始
2010/08/25 データ更新
2005/07/23 Heterozygosity of the Microsatellite Markers in the Japanese Population(http://www002.upp.so-net.ne.jp/kyama-Q/MS.html)で公開開始
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5. 参考文献

6.連絡先

「Heterozygosity of the Microsatellite Markers in the Japanese Population」についてのお問い合わせは、下記連絡先までご連絡ください。

〒812-8582
福岡市東区馬出3-1-1
九州大学 生体防御医学研究所付属遺伝情報実験センター ゲノム構造学分野
山本 健
E-Mail: kyama[at]bioreg[dot]kyushu-u[dot]ac[dot]jp

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