H-InvDB

2016/08/17

Web Site: http://www.h-invitational.jp/hinv/ahg-db/index.jsp
HTTPS Site: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/h-inv/

ヒトのすべての転写産物を対象とし、ヒト遺伝子の構造、選択的スプライシングバリアントなどの精査されたアノテーション情報を提供する統合データベース

README 目次

  1. ダウンロードデータの構成
  2. ダウンロードデータの説明
  3. 本データベースの利用許諾
  4. 更新履歴
  5. 参考文献
  6. 連絡先

1. ダウンロードデータの構成

  1. README
  2. H-Invitational IDリスト
  3. クラスターデータセット
  4. cDNAデータセット
  5. HIPデータセット
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2. ダウンロードデータの説明

2.1 README

データ名 README
データ内容 「H-InvDB」のダウンロードデータについて説明したHTMLファイル。
ダウンロードファイル名 README.html（日本語）
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2.2 H-Invitational IDリスト

データ名 H-Invitational IDリスト
データ内容の説明 データベースのIDリスト
データファイル acc2hinv_id.txt.gz (3.0 MB)
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2.3 クラスターデータセット

データ名 クラスターデータセット
データ内容の説明 遺伝子座のアノテーションデータ
データファイル FLOCUS.gz (51.4 MB)
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2.4 cDNAデータセット

データ名 cDNAデータセット
データ内容の説明 トランスクリプトームのアノテーションデータ
データファイル FCDNA.gz (546 MB)
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2.5 HIPデータセット

データ名 HIPデータセット
データ内容の説明 タンパク質のアノテーションデータ
データファイル FPROTEIN.gz (310 MB)
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3. 本データベースの利用許諾

利用許諾更新日: 2016//08/17

本データベースは、以下で定める利用許諾に基づきご利用いただくことができます。 本利用許諾は、本データベース利用における許諾内容、及び利用者が従うべき条件を定めています。

Creative Commons License

本データベースの利用許諾は、 クリエイティブ・コモンズ　表示-継承4.0　国際の定める利用許諾です。
本データベースのクレジットは、 ”H-InvDB © 今西 規(東海大学) licensed under CC表示-継承4.0 国際”ですので、 利用にあたり必ず表示してください。

クリエイティブ・コモンズ　表示-継承4.0　国際の概要は こちらです。 具体的な許諾条項は こちらをご覧ください。

本データベースにおいて、以下の条件に従う限り許諾されている事項：

  1. 本データベースの全部または一部に自由にアクセスし、データを取得することができます。
  2. 本データベースの全部または一部のデータを自由に再配布することができます。
  3. 本データベースの全部または一部のデータを利用した、データベースなどの翻案物を自由に作成し、配布することができます。

 

本利用許諾に基づいて利用する際に従うべき条件：

  1. 本データベースの全部または一部、あるいは翻案物の配布に際しては、本データベースの作成者のクレジットを表示しなければなりません。
  2. 本データベースの全部または一部のデータを利用して作成された翻案物は、CC表示-継承4.0（もしくは、それ以降のバージョン）、またはCC表示-継承互換ライセンス（リストはこちら）の下で配布されなければなりません。
  3. 本利用許諾で許諾されていない事項については、以下のデータベース作成者に連絡をとり、利用許諾を求める必要があります。

データベース作成者連絡先：
〒259-1193 神奈川県伊勢原市下糟屋143
東海大学伊勢原キャンパス　医学部1号館7階
今西 規
E-mail: imanishi[at]tokai[dot]ac[dot]jp

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4. 更新履歴

更新日 更新内容
2016/08/17 生命科学系データベースアーカイブにてダウンロードデータ公開開始
2004/04/20 H-InvDB (http://www.h-invitational.jp/) で公開開始
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5. 参考文献

Takeda J, et al.
H-InvDB in 2013: an omics study platform for human functional gene and transcript discovery.
Nucleic Acids Research, 2013, Jan; 41 (Database issue): D915-9.
PMID: 23197657

Yamasaki C, et al.
H-InvDB in 2009: extended database and data mining resources for human genes and transcripts.
Nucleic Acids Research, 2010, Jan;38 (Database issue): D626-32.
PMID: 19933760

Yamasaki C, et al.
The H-Invitational Database (H-InvDB), a comprehensive annotation resource for human genes and transcripts.
Nucleic Acids Research, 2008, 36, Database issue D793-D799.
PMID: 18089548

T. Imanishi et al.
Integrative Annotation of 21,037 Human Genes Validated by Full-Length cDNA Clones.
PLoS Biology (2004) 2 (6), 856-875.
PMID: 15103394

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6. 連絡先

「H-InvDB」についてのお問い合わせは、下記連絡先までご連絡ください。

〒259-1193 神奈川県伊勢原市下糟屋143
東海大学伊勢原キャンパス　医学部1号館7階
E-mail: imanishi[at]tokai[dot]ac[dot]jp

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