ClEST

2012/05/22

HTTPS Site: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/clest/

トコジラミのさまざまな器官や体全体に発現する遺伝子配列(EST)のデータベース

README 目次

  1. ダウンロードデータの構成
  2. ダウンロードデータの説明
  3. 本データベースの利用許諾
  4. 更新履歴
  5. 参考文献
  6. 連絡先

1. ダウンロードデータの構成

  1. README
  2. クローン
  3. クラスター
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2. ダウンロードデータの説明

2.1 README

データ名 README
データ内容 「ClEST」のダウンロードデータについて説明したHTMLファイル。
ダウンロードファイル名 README.html(日本語)
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2.2 クローン

データ名 クローン
データ内容の説明 トコジラミESTクローン情報
データファイル clest_clone.zip (660 KB)
データファイルの各列のデータは以下の通りです。
項目名 項目の説明
Clone ID クローンID
Library ライブラリの由来組織
Category 配列の分類
Cluster クラスタリング後のID
ACC No. of clone クローンのアクセッションナンバー
Length クローン配列長
Sequence 配列

2.3 クラスター

データ名 クラスター
データ内容の説明 Blastx相同性検索やGOアノテーションを含むクラスター情報
データファイル clest_cluster.zip (525 KB)
データファイルの各列のデータは以下の通りです。
項目名 項目の説明
Cluster ID クラスターID
Description 予測された遺伝子機能
Category 配列の分類
Length コンセンサス配列長
Sequence コンセンサス配列
Source 由来クローン
No. of clones 由来クローンの数
Top Blastx hit (E value < 1e-6) Blastx検索トップヒットの遺伝子名
ACC No. Blastx検索トップヒットのアクセッションナンバー
E-value Blastx検索トップヒットのE-value
GO GOアノテーション
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3. 本データベースの利用許諾

利用許諾更新日: 2012/05/22

本データベースは、以下で定める利用許諾に基づきご利用いただくことができます。 本利用許諾は、本データベース利用における許諾内容、及び利用者が従うべき条件を定めています。

Creative Commons License

本データベースの利用許諾は、クリエイティブ・コモンズ 表示-継承2.1 日本の定める利用許諾です。
本データベースのクレジットは、 ”ClEST © 森山実 (産業技術総合研究所) licensed under CC表示 継承2.1 日本”ですので、 利用にあたり必ず表示してください。

クリエイティブ・コモンズ 表示-継承2.1 日本の概要は こちらです。 具体的な許諾条項は こちらをご覧ください。

本データベースにおいて、標準利用許諾の下で以下の条件に従う限り許諾されている事項:

  1. 本データベースの全部または一部に自由にアクセスし、データを取得することができます。
  2. 本データベースの全部または一部のデータを自由に再配布することができます。
  3. 本データベースの全部または一部のデータを利用した、データベースなどの二次的著作物を自由に作成し、配布することができます。

本データベースにおいて、標準利用許諾に基づいて利用する際に従うべき条件:

  1. 本データベースの全部または一部、あるいは二次的著作物の配布に際しては、本データベースの作成者のクレジットを表示しなければなりません。
  2. 本データベースの全部または一部のデータを利用して作成された二次的著作物は、この利用許諾の下で配布されなければなりません。
  3. 本利用許諾で許諾されていない事項については、以下のデータベース作成者に連絡をとり、利用許諾を求める必要があります。

データベース作成者連絡先:
〒305-8566
茨城県つくば市東1-1-1 中央第6
産業技術総合研究所 生物プロセス研究部門 生物共生進化機構研究グループ
E-mail: m-moriyama[at]aist[dot]go[dot]jp

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4. 更新履歴

更新日 更新内容
2012/05/22 生命科学系データベースアーカイブにてダウンロードデータ公開開始
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5. 参考文献

Minoru Moriyama, Ryuichi Koga, Takahiro Hosokawa, Naruo Nikoh, Ryo Futahashi, Takema Fukatsu.
Comparative transcriptomics of the bacteriome and spermalege of the bedbug Cimex lectularius (Hemiptera: Cimicidae)

6. 連絡先

「ClEST」についてのお問い合わせは、下記連絡先までご連絡ください。

〒305-8566
茨城県つくば市東1-1-1 中央第6
Tel: 029-861-6812 (ext.222-36812)
Fax: 029-861-6812
E-mail: m-moriyama[at]aist[dot]go[dot]jp

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