AOE

2019/05/20

Web Site: https://aoe.dbcls.jp/
FTP Site: ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/aoe/

AOEは、公共データベースに登録された遺伝子発現データについて、各種統計情報から検索・閲覧・比較することができるデータベースです。

README 目次

  1. ダウンロードデータの構成
  2. ダウンロードデータの説明
  3. 本データベースの利用許諾
  4. 更新履歴
  5. 参考文献
  6. 連絡先

1. ダウンロードデータの構成

  1. README
  2. 遺伝子発現データリスト
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2. ダウンロードデータの説明

2.1 README

データ名 README
データ内容 「AOE」のダウンロードデータについて説明したHTMLファイル。
ダウンロードファイル名 README.html (日本語)
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2.2 遺伝子発現データリスト

データ名 遺伝子発現データリスト
データ内容の説明

公共データベースに登録された遺伝子発現データについて、各種統計情報から検索・閲覧・比較することができる目次サイトです。

データファイル aoe_data_list.zip (9.2 MB)

データファイルの各列のデータは以下の通りです。
項目名項目の説明
PRJID データを取得した研究プロジェクトのBioProject ID
(簡易検索からはBioProjctにリンクします)
AEID データのArrayExpress ID
(簡易検索からはOmicsDIにリンクします)
GSE データのGEO Series ID
(簡易検索からはGEOにリンクします)
Description データの説明
Date データの登録日
ArrayType マイクロアレイの種類
ArrayGroup ArrayTypeのグループ
Technology 実験手法
Instrument 実験機器名またはそれについて記載したBioProjectエントリのID
NGSGroup NGSを使った実験の場合、Instrumentのグループ
Organisms データの生物種(複数の場合あり)
Rep_organism Organismsのうち、代表的な生物種
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3. 本データベースの利用許諾

利用許諾更新日: 2019/05/17

本データベースは、以下で定める利用許諾に基づきご利用いただくことができます。 本利用許諾は、本データベース利用における許諾内容、及び利用者が従うべき条件を定めています。


Creative Commons License

本データベースの利用許諾は、 クリエイティブ・コモンズ 表示4.0 国際の定める利用許諾です。
本データベースのクレジットは、 ” AOE © DBCLS licensed under CC表示4.0 国際”ですので、 利用にあたり必ず表示してください。

クリエイティブ・コモンズ 表示4.0 国際の概要は こちらです。 具体的な許諾条項は こちらをご覧ください。

本データベースにおいて、以下の条件に従う限り許諾されている事項:

  1. 本データベースの全部または一部に自由にアクセスし、データを取得することができます。
  2. 本データベースの全部または一部のデータを自由に再配布することができます。
  3. 本データベースの全部または一部のデータを利用した、データベースなどの翻案物を自由に作成し、配布することができます。

 

本利用許諾に基づいて利用する際に従うべき条件:

  1. 本データベースの全部または一部、あるいは翻案物の配布に際しては、本データベースの作成者のクレジットを表示しなければなりません。
  2. 本利用許諾で許諾されていない事項については、以下のデータベース作成者に連絡をとり、利用許諾を求める必要があります。

https://dbcls.rois.ac.jp/contact

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4. 更新履歴

更新日更新内容
2019/05/17 生命科学系データベースアーカイブにてダウンロードデータ公開開始
2014/10/01 AOE (https://aoe.dbcls.jp/) で公開開始
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5. 参考文献

Hidemasa Bono
All of gene expression (AOE): integrated index for public gene expression databases
bioRxiv https://doi.org/10.1101/626754

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6. 連絡先

「AOE」についてのお問い合わせは、下記連絡先までご連絡ください。

https://dbcls.rois.ac.jp/contact

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