The Rice Growth Monitoring for the Phenotypic Functional Analysis

2013/12/17

Web Site: The Rice Growth Monitoring for the Phenotypic Functional Analysis
HTTPS Site: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/agritogo-rice-phenome/

イネの発芽から開花までの生育画像を数分から数時間間隔で継続的に取得できる システムによる、表現型の網羅的解析結果のデータベース

README 目次

  1. ダウンロードデータの構成
  2. ダウンロードデータの説明
  3. 本データベースの利用許諾
  4. 更新履歴
  5. 参考文献
  6. 連絡先

1. ダウンロードデータの構成

  1. README
  2. 系統および生育条件の一覧
  3. 生育画像ファイルリスト
  4. 生育データのグラフ
  5. イネの生育画像ファイル
  6. プロジェクトの説明
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2. ダウンロードデータの説明

2.1 README

データ名 README
データ内容 「The Rice Growth Monitoring for the Phenotypic Functional Analysis」のダウンロードデータについて説明したHTMLファイル。
ダウンロードファイル名 README.html（日本語）
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2.2 系統および生育条件の一覧

データ名 系統および生育条件の一覧
データ内容の説明 サンプル毎の系統および生育条件の一覧。
データファイル phenome_data.zip (1KB)
データファイルの各列のデータは以下の通りです。
項目名 項目の説明
ID 試験ID
Type 計測機器型式
Species 種名（Oryza sativa）
Material 系統
Light condition 光条件
Temperature 温度
Humidity 湿度
Medium 培地
Growth Chamber グロースチャンパー
Soil 培土
Imaging system 撮影システム
Camera カメラ
Induction of germination / Period 計測開始日時
Duration of observation 観察期間
Intervals of imaging 計測間隔
Growth data 生育データ
Image list 画像名リスト
Large image 画像（大）
Small image 画像（小）

2.3 生育画像ファイルリスト

データ名 生育画像ファイルリスト
データ内容の説明 サンプル毎に生育画像ファイル名を縦一列に並べたリスト。
データファイル images_list.zip (16KB)

2.4 生育データのグラフ

データ名 生育データのグラフ
データ内容の説明 種子根、子葉鞘、第一葉、第二葉の生育の経時変化を表すグラフ。
データファイル growth_data_graph.zip (36KB)

2.5 イネの生育画像ファイル

データ名 イネの生育画像ファイル
データ内容の説明 サンプルと大小サイズ毎にまとめたイネの生育画像ファイル。
データファイル 画像ファイルディレクトリ (233MB)

2.6 プロジェクトの説明

データ名 プロジェクトの説明
データ内容の説明 オリジナルサイトのトップページを起点として、静的なWebページをまとめたもの。 プロジェクトの説明が記述されている。
データファイル phenome_outline.zip (377KB)
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3. 本データベースの利用許諾

利用許諾更新日: 2011/11/08

本データベースは、以下で定める利用許諾に基づきご利用いただくことができます。 本利用許諾は、本データベース利用における許諾内容、及び利用者が従うべき条件を定めています。

Creative Commons License

本データベースの利用許諾は、クリエイティブ・コモンズ　表示-継承2.1　日本の定める利用許諾です。
本データベースのクレジットは、 ”The Rice Growth Monitoring for the Phenotypic Functional Analysis © 株式会社日立製作所 中央研究所 licensed under CC表示 継承2.1 日本”ですので、 利用にあたり必ず表示してください。

クリエイティブ・コモンズ　表示-継承2.1　日本の概要は こちらです。 具体的な許諾条項は こちらをご覧ください。

本データベースにおいて、標準利用許諾の下で以下の条件に従う限り許諾されている事項：

  1. 本データベースの全部または一部に自由にアクセスし、データを取得することができます。
  2. 本データベースの全部または一部のデータを自由に再配布することができます。
  3. 本データベースの全部または一部のデータを利用した、データベースなどの二次的著作物を自由に作成し、配布することができます。

本データベースにおいて、標準利用許諾に基づいて利用する際に従うべき条件：

  1. 本データベースの全部または一部、あるいは二次的著作物の配布に際しては、本データベースの作成者のクレジットを表示しなければなりません。
  2. 本データベースの全部または一部のデータを利用して作成された二次的著作物は、この利用許諾の下で配布されなければなりません。
  3. 本利用許諾で許諾されていない事項については、以下の連絡先に連絡をとり、利用許諾を求める必要があります。

利用許諾に関する連絡先:
以下の２ヶ所の連絡先に連絡をお願いします。
〒320-8551 栃木県宇都宮市豊郷台1-1
帝京大学　理工学部
バイオサイエンス学科
篠村 知子
E-mail : shinomura[at]nasu[dot]bio[dot]teikyo-u[dot]ac[dot]jp
〒185-0014 東京都国分寺市東恋ヶ窪一丁目280番地
株式会社日立製作所　中央研究所
企画室 研究アライアンスユニット
ユニットリーダ　　五島 滋雄
E-mail : shigeo[dot]goto[dot]gk[at]hitachi[dot]com

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4. 更新履歴

更新日 更新内容
2013/12/17 統括サイトのURLを変更
2011/11/08 生命科学系データベースアーカイブにてダウンロードデータ公開開始
2003/10/01 The Rice Growth Monitoring System for the Phenotypic Functional Analysis ( http://www.gs.dna.affrc.go.jp/SY-1108/ )で公開開始
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5. 参考文献

6.連絡先

「The Rice Growth Monitoring for the Phenotypic Functional Analysis」についてのお問い合わせは、下記連絡先までご連絡ください。

〒320-8551 栃木県宇都宮市豊郷台1-1
帝京大学　理工学部
バイオサイエンス学科
篠村 知子
E-mail : shinomura[at]nasu[dot]bio[dot]teikyo-u[dot]ac[dot]jp

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