得られたマイクロアレイデータの
公開方法と利用方法について


得られたマイクロアレイデータの公開方法と利用方法について
			農業生物資源研究所遺伝子発現研究チーム 菊池尚志


 或る研究グループがマイクロアレイセンター(農業生物資源研究所(NIAS)遺
伝子発現研究チームと農林水産先端技術研究所(STAFF研)マイクロアレイグル
ープ の共同運営組織)のマイクロアレイ実験システムを利用し始めた時点にお
いて、農業生物資源研究所は、その実験で得られたマイクロアレイデータをイ
ネ遺伝子発現データベース (Rice Expression Database;以下、REDと略記する)
に格納する権利、その後、公開する権利を有します。(公開方法については後述
します。)なお、マイクロアレイセンターでは、当センターで行われたマイクロ
アレイ実験に関する情報,並びに、アレイ実験結果のコピーを、少なくとも1
セット保管致します。
 アレイ実験システム利用者は、アレイ実験データ一般公開に先立ち、一年間
の「アレイ実験データ共同閲覧・共同利用権限」を希望することが出来ます。
これについては、別紙誓約書の内容に同意して頂ける方のみ、データの閲覧・
利用を可能と致します(詳細については、別紙の誓約書を御覧下さい)。尚、こ
の「アレイ実験データ共同閲覧・共同利用権限」の希望に関してですが、アレ
イ実験申込みの際に、「マイクロアレイシステム利用フォーム」の「Researcher 
Registration」のページにあるセレクトポックスから、御自身のデータ公開方
法に関する条件について、次の3つのうち1つを選択して頂きます。

   a. 実験終了後直ちに公開する。
   b.実験終了後、RED内において、或るアレイ実験システム利用者自身    
    が自らのアレイデータを、他のアレイ実験システム利用者のデータ  
    と共に、共同閲覧・共同利用し、1年経過後に一般公開とする。
   c.  実験終了後1年間は非公開にし、1年経過後に一般公開とする。

 また、データの公開は、以下の様に実施します。
公開時期: 或るアレイ実験結果1セットに関しては、その実験を申込んだ研
究グループがその実験成果を公表した日(学会講演・論文による発表日、また
は特許申請の公開日)、あるいは、当該研究グループがそのアレイ実験結果1セ
ットをマイクロアレイセンターから受け取った日の、いずれかのうち、早い方
の日付から1年後に一般公開する。
公開する情報: (1)マイクロアレイ実験システムを利用した研究グループ
代表者及び担当者の所属・氏名;(2)アレイ実験データ;(3)実験に供した
RNAサンプルに関する情報 [即ち、サンプルRNA調製用植物の育成・処理条件、
RNA調製に用いた組織・細胞など、アレイ実験申込みの際に「マイクロアレイシ
ステム利用フォーム」に記入して頂いた情報すべて]。
公開方法: 農業生物資源研究所にあるイネ遺伝子発現データベース (Rice 
Expression Database: RED) を介して、全世界に一般公開する。
或るマイクロアレイ実験の結果に基づいて特許申請を行う場合、申請前に、
実験発案者やNIAS・STAFF研を含む"当該実験の関係者"の間で、当該実験結
果や特許申請書類の内容について話し合いを持つこととします。なお、特許の
出願費用、維持費用の点で、実験発案者が出費に耐えられない場合は、特許に
関する全権利を農業生物資源研究所に譲渡できます。
 その他の詳細につきましては、下記のリンクから、直接、「独立行政法人農業
生物資源研究所 共同研究実施規程」(共同研究者の方々のみ)、並びに、「デー
タベース利用に関する誓約書」の内容をご覧ください(ダウンロードも出来ま
す)。

   「独立行政法人農業生物資源研究所 共同研究実施規程」( pdfファイル 92KB)
   「データベース利用に関する誓約書」( pdfファイル 5KB)

また、マイクロアレイ実験で得られた結果を学会発表・論文発表して頂く際に、 
マイクロアレイ実験関係者を共著者として頂いております。
これは、マイクロアレイの作成、解析等に関わった人々の貢献
を認めて頂くためばかりではなく、
アレイデータやアレイ上のクローンに関する責任の所在を
明らかにするためにも必須のことである、と私共が考えているからです。
御理解のほど、よろしく御願い申し上げます。
共著者として記載して頂くマイクロアレイ関係者氏名につきましては、
下記のリンクに従って御記載頂きますよう御願い申し上げます。


「アレイデータの学会発表・論文発表に際して共著者として頂くためのアレイ実験関係者氏名一覧 」


マイクロアレイ実験システム利用のための必須事項: マイクロアレイ実験シ
ステム利用希望者は、必ず「データベース利用に関する誓約書」を(共同研究
者の方々は、更に「独立行政法人農業生物資源研究所 共同研究実施規程」も)
御記入の後、郵便で下記アドレス宛に送付して下さい。

送付先
〒305-8602 茨城県つくば市観音台2-1-2 
国立研究開発法人 農業生物資源研究所分子遺伝グループ遺伝子発現研究チーム
菊池尚志(マイクロアレイセンター)宛