SKIP幹細胞情報データベース
2017/03/13Web Site: https://www.skip.med.keio.ac.jp/SKIPSearch/
HTTPS Site: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/skip/
各研究機関が保有するヒト幹細胞サンプルに関する情報を集約したデータベース
README 目次
1. ダウンロードデータの構成
2. ダウンロードデータの説明
2.1 README
| データ名 | README |
|---|---|
| データ内容 | 「SKIP幹細胞情報データベース」のダウンロードデータについて説明したHTMLファイル。 |
| ダウンロードファイル名 | README.html (日本語) |
2.2 幹細胞情報
| データ名 | 幹細胞情報 |
|---|---|
| データ内容の説明 | 理研BRC、医薬基盤研、Coriell、ATCCなどに登録されている細胞情報や、大学の研究室で作製された細胞情報 |
| データファイル | skip_stemcell_data.ttl.zip (190 KB) |
データファイルの各列のデータは以下の通りです。
| 項目名 | 項目の説明 |
|---|---|
| SKIP ID | SKIP ID |
| Organism(En) | 細胞の生物種（英語） |
| Organism(Ja) | 細胞の生物種（日本語） |
| Cell Type(En) | 細胞の種類（英語） |
| Cell Type(Ja) | 細胞の種類（日本語） |
| Cell Tissue(En) | 細胞の由来組織（英語） |
| Cell Tissue(Ja) | 細胞の由来組織（日本語） |
| Cell Origin | 由来組織の状態 |
| Cell Name 1(En) | 細胞名1（英語） |
| Cell Name 1(Ja) | 細胞名1（日本語） |
| Cell Name 2(En) | 細胞名2（英語） |
| Cell Name 2(Ja) | 細胞名2（日本語） |
| Disease Name 1(Ja) | 正式病名1(日本語) |
| ICD Code 1 | ICD Code 1 |
| Disease Name 1(En) | 病名1(英語) |
| OMIM1 | OMIM ID 1 |
| Disease Name 2(Ja) | 正式病名2(日本語) |
| ICD Code 2 | ICD Code 2 |
| Disease Name 2(En) | 病名2(英語) |
| OMIM 2 | OMIM ID 2 |
| Disease Name 3(Ja) | 正式病名3(日本語) |
| ICD Code 3 | ICD Code 3 |
| Disease Name 3(En) | 病名3(英語) |
| OMIM 3 | OMIM ID 3 |
| Age | ドナーの年齢 |
| Age Range | ドナーの年代 |
| Sex | ドナーの性別 |
| Race(En) | ドナーの人種(英語) |
| Race(Ja) | ドナーの人種(日本語) |
| Genetic Diagnosis | 遺伝子診断実施の有無 |
| Not Detected | 遺伝子診断で検出なし |
| Description(En) | 細胞の説明(英語) |
| Description(Ja) | 細胞の説明(日本語) |
| Cell Morphology | 細胞の形態 |
| Grade | 細胞の入手方法：研究または臨床 |
| Vector | 細胞培養に使用したベクター |
| Transgene | 細胞に導入した外来遺伝子 |
| Adhesiveness | 細胞の接着性 |
| Feeder | 細胞培養時のFeeder細胞の有無 |
| Feeder Cell | Feeder細胞名 |
| Medium | 細胞の培地 |
| Genome Editing | 細胞培養時のゲノム編集方法 |
| CO2 | 細胞培養時のCO2濃度 |
| Mycoplasma | Mycoplasma検出実施の有無 |
| Detection of Contaminants Mycoplasma | Mycoplasma検出方法 |
| Pluripotent Markers | 多能性マーカー試験の有無 |
| Pluripotent Markers Assay | 多能性マーカー試験法 |
| in vitro Differentiation | in vitro分化試験の有無 |
| in vitro Differentiation Assay | in vitro分化試験法 |
| in vivo Differentiation | in vivo分化試験の有無 |
| in vivo Differentiation Assay | in vivo分化試験法 |
| Other 1 Assay | その他試験1の有無 |
| Other 1 Assay Method | その他試験1 試験法 |
| Other 2 Assay | その他試験2の有無 |
| Other 2 Assay Method | その他試験2 試験法 |
| Other 3 Assay | その他試験3の有無 |
| Other 3 Assay Method | その他試験3 試験法 |
| Karyotype | 核型解析の有無 |
| Karyotype Assay | 核型解析法 |
| Remaining Vector Detection | ベクター残存試験の有無 |
| Remaining Vector Detection Assay | ベクター残存試験法 |
| STR | STR多型解析の有無 |
| HLA | HLAタイピングの有無 |
| Stem Cell Transcriptome analysis | 細胞株転写因子解析の有無 |
| Stem Cell Transcriptome analysis Assay | 転写因子解析法 |
| Author Name(En) | 樹立者名（英語） |
| Author Name(Ja) | 樹立者名（日本語） |
| Author Organization(En) | 樹立者所属機関名（英語） |
| Author Organization(Ja) | 樹立者所属機関名（日本語） |
| Author Contact Email | 樹立者担当メールアドレス |
| PI Organization(En) | 研究代表者所属機関名（英語） |
| PI Organization(Ja) | 研究代表者所属機関名（日本語） |
| PI Name(En) | 研究代表者名（英語） |
| PI Name(Ja) | 研究代表者名（日本語） |
| PI Contact Email | 研究代表者担当メールアドレス |
| Availability | 細胞株提供状況 |
| Provider Organization(En) | 提供機関名（英語） |
| Provider Organization(Ja) | 提供機関名（日本語） |
| Provider Email | 提供機関担当メールアドレス |
| Provider URL | 提供サイトのURL |
| Ethical Statement(En) | 細胞株樹立に関する倫理的声明(英語) |
| Ethical Statement(Ja) | 細胞株樹立に関する倫理的声明(日本語) |
| Terms of Use(En) | 利用許諾(英語) |
| Terms of Use(Ja) | 利用許諾(日本語) |
| PubMed ID | 文献のPubMed ID |
| DOI | 文献のDOI(Digital Object Identifier) |
| Title | 文献のタイトル |
| Authors | 文献の著書名 |
| Journal | 文献を発表したジャーナル名 |
| Year | 文献の出版年 |
| Volume | ジャーナルの巻 |
| Issue | ジャーナルの号 |
| Pages | ジャーナルのページ |
| URL | 文献のURL |
| Free input | その他文献情報 |
| Note | 備考欄 |
3. 本データベースの利用許諾
利用許諾更新日: 2017/03/13
本データベースは、以下で定める利用許諾に基づきご利用いただくことができます。 本利用許諾は、本データベース利用における許諾内容、及び利用者が従うべき条件を定めています。
本データベースの利用許諾は、 クリエイティブ・コモンズ 表示-継承4.0 国際の定める利用許諾です。
本データベースのクレジットは、 ”SKIP幹細胞情報データベース © 小崎 健次郎 (慶應義塾大学) licensed under CC表示-継承4.0 国際”ですので、 利用にあたり必ず表示してください。
クリエイティブ・コモンズ 表示-継承4.0 国際の概要は こちらです。 具体的な許諾条項は こちらをご覧ください。
本データベースにおいて、以下の条件に従う限り許諾されている事項：
- 本データベースの全部または一部に自由にアクセスし、データを取得することができます。
- 本データベースの全部または一部のデータを自由に再配布することができます。
- 本データベースの全部または一部のデータを利用した、データベースなどの翻案物を自由に作成し、配布することができます。
本利用許諾に基づいて利用する際に従うべき条件：
- 本データベースの全部または一部、あるいは翻案物の配布に際しては、本データベースの作成者のクレジットを表示しなければなりません。
- 本データベースの全部または一部のデータを利用して作成された翻案物は、CC表示-継承4.0（もしくは、それ以降のバージョン）、またはCC表示-継承互換ライセンス（リストはこちら）の下で配布されなければなりません。
- 本利用許諾で許諾されていない事項については、以下のデータベース作成者に連絡をとり、利用許諾を求める必要があります。
データベース作成者連絡先：
慶應義塾大学医学部 幹細胞情報室内
厚生労働省「ヒト幹細胞情報化推進事業」SKIP事務局
https://www.skip.med.keio.ac.jp/contact/
〒160-8582 東京都新宿区信濃町35
4. 更新履歴
| 更新日 | 更新内容 |
|---|---|
| 2017/03/13 | 生命科学系データベースアーカイブにてダウンロードデータ公開開始 |
| 2013/03/29 | SKIP幹細胞情報データベース (https://www.skip.med.keio.ac.jp/SKIPSearch/)で公開開始 |
5. 参考文献
-6. 連絡先
「SKIP幹細胞情報データベース」についてのお問い合わせは、下記連絡先までご連絡ください。慶應義塾大学医学部 幹細胞情報室内
厚生労働省「ヒト幹細胞情報化推進事業」SKIP事務局
https://www.skip.med.keio.ac.jp/contact/
〒160-8582 東京都新宿区信濃町35