KNApSAcK Core
2014/07/15Web Site: KNApSAcK Core
FTP Site: ftp://ftp.biosciencedbc.jp/archive/knapsack-core/
二次代謝物と生物種の関係についてのデータベース
README 目次
1. ダウンロードデータの構成
2. ダウンロードデータの説明
2.1 README
| データ名 | README |
| データ内容 | 「KNApSAcK Core」のダウンロードデータについて説明したHTMLファイル。 |
| ダウンロードファイル名 | README.html（日本語） |
2.2 生物種-代謝物関係データ
| データ名 | 生物種-代謝物関係データ |
| データ内容の説明 | 生物種とその生物における代謝物の関係について、研究者が多くの論文を読んで整理し、データベース化して収録した。 |
| データファイル | knapsack_core.zip (2.3 MB) |
| 項目名 | 項目の説明 |
|---|---|
| C_ID | 代謝物と生物種の対毎に付与されたID |
| CAS RN | CAS登録番号 |
| Metabolite | 代謝物の名称 |
| Molecular Formula | 代謝物の組成式 |
| Organism | 生物種名 |
| Kingdom | 生物種の界名 |
| Family | 生物種の科名 |
| Genus | 生物種の属名 |
| Reference | 参考 |
2.3 代謝物機能データ
| データ名 | 代謝物機能データ |
| データ内容の説明 | 代謝物において報告された機能について収録している。 |
| データファイル | knapsack_function.zip (121 KB) |
| 項目名 | 項目の説明 |
|---|---|
| Name | 代謝物名称 |
| Formula | 組成式 |
| C_ID | KNApSAcK ID |
| Function | 機能 |
| Target | 機能が対象とする生物 |
| Reference | 参考文献 |
3. 本データベースの利用許諾
利用許諾更新日: 2012/03/30
本データベースは、以下で定める利用許諾に基づきご利用いただくことができます。 本利用許諾は、本データベース利用における許諾内容、及び利用者が従うべき条件を定めています。
本データベースの利用許諾は、クリエイティブ・コモンズ 表示-継承2.1 日本の定める利用許諾です。
本データベースのクレジットは、
”KNApSAcK Family © 金谷 重彦 (奈良先端科学技術大学院大学) licensed under CC表示 継承2.1 日本”ですので、
利用にあたり必ず表示してください。
クリエイティブ・コモンズ 表示-継承2.1 日本の概要は
こちらです。
具体的な許諾条項は
こちらをご覧ください。
本データベースにおいて、標準利用許諾の下で以下の条件に従う限り許諾されている事項：
- 本データベースの全部または一部に自由にアクセスし、データを取得することができます。
- 本データベースの全部または一部のデータを自由に再配布することができます。
- 本データベースの全部または一部のデータを利用した、データベースなどの二次的著作物を自由に作成し、配布することができます。
本データベースにおいて、標準利用許諾に基づいて利用する際に従うべき条件：
- 本データベースの全部または一部、あるいは二次的著作物の配布に際しては、本データベースの作成者のクレジットを表示しなければなりません。
- 本データベースの全部または一部のデータを利用して作成された二次的著作物は、この利用許諾の下で配布されなければなりません。
- 本利用許諾で許諾されていない事項については、以下のデータベース作成者に連絡をとり、利用許諾を求める必要があります。
データベース作成者連絡先：
〒630-0192 奈良県生駒市高山町8916−5
奈良先端科学技術大学院大学 情報科学研究科 金谷重彦
Tel: (教授)0743-72-5952 (秘書)0743-72-5257
Fax: 0743-72-5258
E-mail: skanaya[at]gtc[dot]naist[dot]jp
4. 更新履歴
| 更新日 | 更新内容 |
| 2014/07/15 | 生物種-代謝物関係データの一部のデータを修正しました。修正したデータの詳細につきましては、下記のページをご覧ください。 |
| 2014/02/28 | KNApSAcK Family からKNApSAcK Core を選り抜いて公開 |
| 2013/03/12 | データベースの説明ページを更新。 「ジャム配合データ」および「ジャムハーブデータ」のデータ説明を更新。 下記4件のデータを追加。
|
| 2012/10/10 | データベースの説明ページに論文の書誌情報を1件追加 |
| 2012/03/30 | 生命科学系データベースアーカイブにてダウンロードデータ公開開始 |
| 2008/07/01 | KNApSAcK Family(http://kanaya.naist.jp/KNApSAcK_Family/)で公開開始 |
5. 参考文献
Farit Mochamad Afendi, Taketo Okada, Mami Yamazaki, Aki Hirai-Morita, Yukiko Nakamura, Kensuke Nakamura, Shun Ikeda, Hiroki Takahashi, Md. Altaf-Ul-Amin1, Latifah K. Darusman, Kazuki Saito and Shigehiko Kanaya.KNApSAcK Family Databases: Integrated Metabolite-Plant Species Databases for Multifaceted Plant Research
Plant Cell Physiol., 53,e1.1-11,(2012). doi:10.1093/pcp/pcr165
PMID:22123792
6. 連絡先
「KNApSAcK Core」についてのお問い合わせは、下記連絡先までご連絡ください。
〒630-0192
奈良県生駒市高山町8916−5
Tel: (教授)0743-72-5952 (秘書)0743-72-5257
Fax: 0743-72-5258
E-mail: skanaya[at]gtc[dot]naist[dot]jp