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Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform OS=Homo sapiens GN=PPP2R1A PE=1 SV=4;>tr|B3KQV6|B3KQV6_HUMAN Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform OS=Homo s 3 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.7 2.7 2.7 65.308 589 589;410;534 0.0018349 2.3804 By matching By MS/MS By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching 0 2.7 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 20 493 True 501 4622 5158 5158 O00303;H0YDT6;B4DEW9;B3KSH1 O00303;H0YDT6;B4DEW9;B3KSH1 2;2;2;2 2;2;2;2 2;2;2;2 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F EIF3F >sp|O00303|EIF3F_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F OS=Homo sapiens GN=EIF3F PE=1 SV=1;>tr|H0YDT6|H0YDT6_HUMAN Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F (Fragment) OS=Homo sapiens 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lyticus. 1 13 13 13 11 11 9 12 12 9 11 13 12 9 9 10 11 11 9 12 12 9 11 13 12 9 9 10 11 11 9 12 12 9 11 13 12 9 9 10 21.3 21.3 21.3 68.124 653 653 0 323.31 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 21.1 21.1 18.2 21.1 21.3 15 19.6 21.3 19.6 15 15 19.4 8207300 963740 423160 907130 728920 319020 395100 599260 1080300 1133200 623360 544790 489320 400100 459070 537330 570510 603950 338210 476270 467650 619110 327460 465930 242200 40 41 46 56 29 23 54 50 50 44 64 66 563 + 106 224;304;305;435;509;510;2300;2301;2330;2392;2393;2824;2899 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 227;228;309;310;441;517;518;519;2346;2347;2376;2442;2443;2876;2952 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Ubiquitin thioesterase OTUB1 OTUB1 >sp|Q96FW1|OTUB1_HUMAN Ubiquitin thioesterase OTUB1 OS=Homo sapiens GN=OTUB1 PE=1 SV=2;>tr|F5GYN4|F5GYN4_HUMAN Ubiquitin thioesterase OTUB1 OS=Homo sapiens GN=OTUB1 PE=1 SV=1;>tr|F5H6Q1|F5H6Q1_HUMAN Ubiquitin thioesterase OTUB1 OS=Homo sapiens GN=OTUB1 PE= 5 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 5.5 5.5 5.5 31.284 271 271;241;280;286;308 0.0094637 1.6862 By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By matching By MS/MS By matching By matching 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5.5 5.5 0 2909.7 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2316.8 592.88 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 592.43 189.29 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 163 86 True 87 763;764 742 742 P61421;H3BUQ0;H3BTB5;H3BQB4;H3BSG7;F5GYQ1 P61421;H3BUQ0;H3BTB5;H3BQB4;H3BSG7;F5GYQ1 1;1;1;1;1;1 1;1;1;1;1;1 1;1;1;1;1;1 V-type proton ATPase subunit d 1 ATP6V0D1 >sp|P61421|VA0D1_HUMAN V-type proton ATPase subunit d 1 OS=Homo sapiens GN=ATP6V0D1 PE=1 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ligase;Proline--tRNA ligase EPRS >sp|P07814|SYEP_HUMAN Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase OS=Homo sapiens GN=EPRS PE=1 SV=5;>tr|V9GYZ6|V9GYZ6_HUMAN Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase (Fragment) OS=Homo sapiens GN=EPRS PE=1 SV=1 2 4 4 4 2 1 1 0 0 0 1 1 0 0 1 1 2 1 1 0 0 0 1 1 0 0 1 1 2 1 1 0 0 0 1 1 0 0 1 1 3.9 3.9 3.9 170.59 1512 1512;968 0 5.2866 By MS/MS By matching By matching By matching By matching By matching By MS/MS By MS/MS By matching By matching By MS/MS By matching 1.9 0.5 0.5 0 0 0 0.5 0.9 0 0 1.2 0.5 3608.5 1881 413.78 336.62 0 0 0 691.93 0 0 0 0 285.17 699.22 637.65 597.49 0 0 0 1026.6 0 0 0 0 302.75 1 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 0 4 340 24;2431;2692;3134 True;True;True;True 24;2481;2743;3189 180;22845;25462;30032;30033;30034;30035;30036 173;24674;27722;33042 173;24674;27722;33042 P07900;P07900-2;Q86U12;Q14568;G3V2J8;Q58FG0;Q58FF6;Q58FG1 P07900;P07900-2;Q86U12 19;19;14;4;4;3;3;1 11;11;8;1;2;2;0;0 11;11;8;1;2;2;0;0 Heat shock protein HSP 90-alpha HSP90AA1 >sp|P07900|HS90A_HUMAN Heat shock protein HSP 90-alpha OS=Homo sapiens GN=HSP90AA1 PE=1 SV=5;>sp|P07900-2|HS90A_HUMAN Isoform 2 of Heat shock protein HSP 90-alpha OS=Homo sapiens GN=HSP90AA1;>tr|Q86U12|Q86U12_HUMAN Full-length cDNA clone CS0CAP007YF18 of T 8 19 11 11 11 12 10 15 12 13 12 13 11 13 13 15 5 7 3 8 5 5 6 6 5 5 5 7 5 7 3 8 5 5 6 6 5 5 5 7 31.7 19.1 19.1 84.659 732 732;854;413;343;174;334;505;418 0 107.17 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 17.8 19.1 15.6 26.5 19.1 19.7 20.8 20.5 19.4 20.8 19.7 23.1 165300 11023 9374.7 10103 25023 14653 18541 8199.6 12504 11620 22532 7545.7 14181 2685.3 8336.4 15205 10824 6099.1 3032.8 7293 6850.3 6519.6 11545 1306.7 3191.8 4 9 5 6 5 5 6 7 7 9 5 6 74 341 51;189;218;351;483;512;611;647;711;955;1162;1186;1204;1206;1227;1437;2091;2444;3082 False;True;True;True;True;True;False;False;True;True;False;False;True;True;True;False;True;False;False 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MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 35.6 33.7 35.3 38.4 22.1 27.7 33.9 34.1 35.4 29.9 29.1 32.2 2089400 116190 135320 128220 146950 77330 173830 182720 214930 209890 275860 231910 196230 110360 112690 138190 82548 80665 56929 137330 134950 129220 61739 68747 46386 42 44 41 25 24 46 37 44 50 50 59 62 524 356 257;353;366;492;658;861;1095;1131;1347;1461;1783;1994;2106;2111;2280;2404;2475;2498;2642;2703;2726 True;True;True;True;True;True;True;True;False;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 261;358;371;500;671;879;1116;1152;1369;1487;1812;2036;2037;2150;2155;2325;2454;2525;2548;2693;2754;2777 2350;2351;2352;2353;2354;2355;2356;2357;2358;2359;2360;2361;2362;2363;2364;2365;2366;2367;2368;2369;2370;2371;2372;2373;2374;3312;3313;3420;3421;3422;3423;3424;3425;3426;3427;3428;3429;3430;3431;3432;3433;3434;3435;3436;3437;3438;3439;3440;3441;3442;3443;3444;3445;3446;3447;4621;6155;6156;6157;6158;6159;6160;6161;6162;6163;6164;6165;6166;6167;6168;7839;7840;7841;7842;7843;7844;7845;7846;7847;7848;7849;7850;7851;7852;7853;7854;7855;7856;7857;7858;7859;7860;7861;7862;7863;7864;7865;7866;10121;10122;10123;10124;10125;10126;10417;10418;10419;10420;10421;12708;12709;12710;12711;12712;12713;12714;12715;12716;12717;12718;12719;12720;12721;12722;12723;12724;12725;12726;12727;12728;12729;12730;12731;12732;12733;12734;12735;12736;12737;12738;12739;12740;12741;12742;12743;12744;12745;12746;12747;12748;12749;12750;12751;12752;12753;12754;12755;12756;12757;12758;12759;12760;13915;13916;13917;13918;13919;17039;17040;17041;17042;17043;17044;17045;17046;17047;17048;17049;17050;17051;17052;17053;17054;17055;17056;17057;17058;17059;17060;17061;17062;17063;17064;17065;17066;17067;17068;17069;17070;17071;17072;17073;18998;18999;19000;19001;19002;19003;19004;19005;19006;19007;19008;19009;19010;19011;19012;19013;20045;20046;20047;20048;20049;20094;21551;21552;21553;21554;21555;21556;21557;21558;21559;21560;21561;21562;21563;21564;21565;21566;22536;22537;22538;22539;22540;22541;22542;22543;22544;22545;22546;22547;22548;22549;22550;22551;22552;22553;22554;22555;22556;22557;22558;22559;22560;22561;22562;22563;22564;22565;22566;22567;22568;22569;22570;23206;23207;23208;23209;23210;23211;23212;23213;23214;23215;23216;23217;23218;23219;23220;23221;23222;23223;23224;23225;23226;23227;23228;23229;23230;23231;23232;23233;23486;23487;23488;23489;23490;23491;23492;23493;23494;23495;23496;23497;23498;23499;23500;23501;23502;23503;25052;25053;25054;25055;25056;25057;25058;25059;25060;25061;25062;25063;25064;25065;25066;25067;25603;25604;25605;25606;25607;25608;25609;25610;25611;25612;25613;25614;25615;25616;25617;25618;25619;25620;25621;25622;25623;25624;25625;25626;25627;25628;25629;25630;25631;25632;25633;25780;25781;25782;25783;25784;25785;25786;25787;25788;25789;25790;25791;25792;25793;25794;25795;25796;25797;25798;25799;25800;25801;25802;25803;25804;25805;25806;25807;25808;25809;25810;25811;25812;25813;25814;25815;25816;25817;25818;25819;25820;25821;25822;25823;25824;25825;25826;25827;25828;25829;25830;25831;25832;25833;25834 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Elongation factor 1-gamma OS=Homo sapiens GN=EEF1G PE=1 SV=3;>tr|B4DTG2|B4DTG2_HUMAN Elongation factor 1-gamma OS=Homo sapiens GN=EEF1G PE=1 SV=1 2 12 12 12 6 5 5 6 4 4 8 7 6 7 4 2 6 5 5 6 4 4 8 7 6 7 4 2 6 5 5 6 4 4 8 7 6 7 4 2 30.2 30.2 30.2 50.118 437 437;487 0 33.921 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 16.7 13.7 11.9 17.2 11.7 10.5 25.4 16.9 16 16.7 10.5 5.3 171420 16991 9883.4 7934.9 10604 2868.4 11926 30028 27688 18256 29805 3800.8 1632.9 15225 11427 5744.6 5975.2 5591.9 2761.4 14526 16484 15451 5106.2 1058.8 2902.3 7 8 3 6 3 5 10 10 7 8 3 3 73 417 17;178;825;1369;1519;1598;1999;2502;2503;2580;2919;3031 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 17;181;843;1392;1545;1626;2042;2552;2553;2631;2972;3085 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aminopeptidase OS=Homo sapiens GN=LAP3 4 3 3 3 1 0 1 0 0 0 1 2 1 2 1 0 1 0 1 0 0 0 1 2 1 2 1 0 1 0 1 0 0 0 1 2 1 2 1 0 6.4 6.4 6.4 56.166 519 519;488;119;208 0 4.9069 By MS/MS By matching By matching By matching By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching 2.3 0 2.5 0 0 0 2.5 3.9 1.5 4.8 2.3 0 6239 0 0 565.21 0 0 0 536.74 2071.3 2105.5 960.3 0 0 0 0 523.22 0 0 0 400.29 0 0 327.89 0 0 1 0 0 0 0 0 1 2 1 1 1 0 7 421 1147;1863;2630 True;True;True 1168;1892;2681 10488;10489;10490;10491;17753;17754;17755;24971;24972 11420;11421;11422;11423;19455;27185;27186 11420;19455;27186 P29692;P29692-2;E9PRY8;P29692-3;E9PK01;E9PMW7;E9PPR1;E9PL12;E9PQ49;E9PI39;E9PQZ1;P29692-4;E9PN91;E9PIZ1;H0YE72;E9PL71;H0YCK7;H0YE58;E9PJD0;E9PNW6;E9PQC9;E9PKK3;E9PK72;E9PK06 P29692;P29692-2;E9PRY8;P29692-3;E9PK01;E9PMW7;E9PPR1;E9PL12;E9PQ49;E9PI39;E9PQZ1;P29692-4 7;6;6;6;5;4;4;4;4;4;4;4;3;3;3;3;3;2;1;1;1;1;1;1 7;6;6;6;5;4;4;4;4;4;4;4;3;3;3;3;3;2;1;1;1;1;1;1 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T-complex protein 1 subunit theta CCT8 >sp|P50990|TCPQ_HUMAN T-complex protein 1 subunit theta OS=Homo sapiens GN=CCT8 PE=1 SV=4;>sp|P50990-2|TCPQ_HUMAN Isoform 2 of T-complex protein 1 subunit theta OS=Homo sapiens GN=CCT8;>sp|P50990-3|TCPQ_HUMAN Isoform 3 of T-complex protein 1 subunit theta 5 11 11 11 5 8 4 5 7 10 9 5 6 8 5 7 5 8 4 5 7 10 9 5 6 8 5 7 5 8 4 5 7 10 9 5 6 8 5 7 22.4 22.4 22.4 59.62 548 548;529;475;323;107 0 76.013 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 10.9 16.6 8.4 11.9 14.1 19.7 18.1 10.4 11.9 17.7 10.8 14.4 157470 4122.8 13051 3010 5161.5 12073 23114 18264 9039.6 9230.4 29593 12186 18621 4384.3 11620 2089.4 2965.5 9392.4 6037.9 13412 6402.3 4635.3 6074.9 8143.5 4687.4 3 5 2 3 4 11 5 4 2 10 8 8 65 469 130;311;428;600;833;1578;1661;1935;2126;2710;2925 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 131;316;434;610;851;1604;1689;1965;2170;2761;2978 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8;8;5;4;3;2;2;2;2 8;8;5;4;3;2;2;2;2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M HNRNPM >sp|P52272|HNRPM_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M OS=Homo sapiens GN=HNRNPM PE=1 SV=3;>sp|P52272-2|HNRPM_HUMAN Isoform 2 of Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M OS=Homo sapiens GN=HNRNPM;>tr|M0R019|M0R019_HUMAN Heterogeneous nuclear rib 9 8 8 8 4 2 4 6 5 5 6 3 4 5 5 6 4 2 4 6 5 5 6 3 4 5 5 6 4 2 4 6 5 5 6 3 4 5 5 6 14.5 14.5 14.5 77.515 730 730;691;352;357;219;99;116;214;275 0 58.375 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 6.8 3.4 6.7 11.2 9.5 9.7 11.2 4.9 6.3 10 8.1 11.8 152330 5143.3 7772.1 12443 13943 13706 20909 4318.7 6475.9 19589 25729 8678.9 13625 4584.1 14699 8388.9 9738.4 5641.7 8861.3 5422 2955.9 8000.1 4983 1673.2 6684.6 4 4 2 7 3 6 5 3 4 10 4 11 63 471 18;89;867;1090;1402;1698;2065;2213 True;True;True;True;True;True;True;True 18;90;886;1111;1427;1726;2108;2257 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nuclear ribonucleoprotein Sm D1 SNRPD1 >sp|P62314|SMD1_HUMAN Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 OS=Homo sapiens GN=SNRPD1 PE=1 SV=1;>tr|J3QLI9|J3QLI9_HUMAN Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 OS=Homo sapiens GN=SNRPD1 PE=1 SV=1 3 3 3 3 2 2 3 3 1 2 3 3 3 2 2 2 2 2 3 3 1 2 3 3 3 2 2 2 2 2 3 3 1 2 3 3 3 2 2 2 37 37 37 13.281 119 119;75;44 0 27.113 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 27.7 27.7 37 37 9.2 20.2 37 37 37 20.2 27.7 20.2 116250 3418.5 11918 9219.4 11943 2245.9 11940 4834.4 18215 16012 14247 4717.7 7536.5 5546.7 5552.7 5566.7 11201 3726 4680.3 2823.1 4101.9 6156.3 6536.7 961.98 3567.7 1 4 2 7 0 4 2 4 6 3 4 1 38 506 1878;2107;3063 True;True;True 1908;2151;3117 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Interleukin enhancer-binding factor 3 ILF3 >sp|Q12906|ILF3_HUMAN Interleukin enhancer-binding factor 3 OS=Homo sapiens GN=ILF3 PE=1 SV=3;>sp|Q12906-4|ILF3_HUMAN Isoform 4 of Interleukin enhancer-binding factor 3 OS=Homo sapiens GN=ILF3;>sp|Q12906-5|ILF3_HUMAN Isoform 5 of Interleukin enhancer-bindi 19 12 12 12 4 3 5 8 5 10 3 3 3 8 10 10 4 3 5 8 5 10 3 3 3 8 10 10 4 3 5 8 5 10 3 3 3 8 10 10 17.2 17.2 17.2 95.337 894 894;698;690;702;706;764;898;254;180;158;161;672;55;73;77;79;99;122;658 0 45.091 By matching By matching By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS By MS/MS 5.6 3.8 7.3 11.4 6.5 14.7 4.1 3.8 3.6 11.2 14.8 14.3 138540 1902.9 1188.7 2583.3 18946 2897.1 29470 2862.1 1340.3 1431.7 34912 25229 15778 1666.1 1433.7 1981.8 10515 3176.5 10121 1570.3 838.59 1521.4 9718.9 8309.1 3533.4 0 0 1 5 2 17 2 2 2 13 14 14 72 553 333;341;593;603;750;1652;1821;2737;2873;2955;3054;3058 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 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