Protein IDs Majority protein IDs Peptide counts (all) Peptide counts (razor+unique) Peptide counts (unique) Protein names Gene names Fasta headers Number of proteins Peptides Razor + unique peptides Unique peptides Peptides 1 Peptides 2 Peptides 3 Peptides 4 Razor + unique peptides 1 Razor + unique peptides 2 Razor + unique peptides 3 Razor + unique peptides 4 Unique peptides 1 Unique peptides 2 Unique peptides 3 Unique peptides 4 Sequence coverage [%] Unique + razor sequence coverage [%] Unique sequence coverage [%] Mol. weight [kDa] Sequence length Sequence lengths Q-value Score Identification type 1 Identification type 2 Identification type 3 Identification type 4 Sequence coverage 1 [%] Sequence coverage 2 [%] Sequence coverage 3 [%] Sequence coverage 4 [%] Intensity Intensity 1 Intensity 2 Intensity 3 Intensity 4 LFQ intensity 1-ShH9-FLAG LFQ intensity 2- ShHZ-FLAG LFQ intensity 3- ShH9-G LFQ intensity 4- ShZ-G MS/MS Count 1 MS/MS Count 2 MS/MS Count 3 MS/MS Count 4 MS/MS Count Only identified by site Reverse Potential contaminant id Peptide IDs Peptide is razor Mod. peptide IDs Evidence IDs MS/MS IDs Best MS/MS Oxidation (M) site IDs Oxidation (M) site positions Q8N2C9 Q8N2C9 1 1 1 Uncharacterized protein C21orf128 C21orf128 >sp|Q8N2C9|CU128_HUMAN Uncharacterized protein C21orf128 OS=Homo sapiens GN=C21orf128 PE=2 SV=3 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 1 0 1 1 14.2 14.2 14.2 18.019 162 162 0.0098522 5.7989 By MS/MS By matching By matching By MS/MS 14.2 0 14.2 14.2 248130000 86194000 0 11319000 150620000 86559000 0 0 200240000 1 0 0 1 2 401 151 TRUE 153 350;351;352;353;354 220;221 221 REV__Q8NI36 REV__Q8NI36 1 1 1 >sp|Q8NI36|WDR36_HUMAN WD repeat-containing protein 36 OS=Homo sapiens GN=WDR36 PE=1 SV=1 1 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 105.32 951 951 0.0052632 5.9156 By MS/MS By matching By matching By matching 0 0 0 0 12352000 12352000 0 0 0 12352000 0 0 0 1 0 0 0 1 + 437 404 TRUE 413 938 594 594 P61604;B8ZZ54;B8ZZL8;S4R3N1 P61604;B8ZZ54;B8ZZL8;S4R3N1 2;1;1;1 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class I histocompatibility antigen, A-32 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, Cw-14 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, Cw-12 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, Cw-4 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain" HLA-A;HLA-C;HLA-B ">sp|P01892|1A02_HUMAN HLA class I histocompatibility antigen, A-2 alpha chain OS=Homo sapiens GN=HLA-A PE=1 SV=1;>sp|P30455|1A36_HUMAN HLA class I histocompatibility antigen, A-36 alpha chain OS=Homo sapiens GN=HLA-A PE=1 SV=1;>sp|P04439|1A03_HUMAN HLA cla" 42 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 3.8 3.8 3.8 40.921 365 365;365;365;365;365;365;299;371;326;362;362;362;362;362;362;362;362;362;362;362;362;362;365;365;365;365;365;365;365;365;365;365;365;365;365;365;366;366;366;366;371;372 0 6.3708 By MS/MS By matching By matching By matching 3.8 0 0 0 597900 597900 0 0 0 597900 0 0 0 1 0 0 0 1 231 334 TRUE 342 772 489 489 Q08211 Q08211 1 1 1 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Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2 RPN2 >sp|P04844|RPN2_HUMAN Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2 OS=Homo sapiens GN=RPN2 PE=1 SV=3;>sp|P04844-2|RPN2_HUMAN Isoform 2 of Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2 OS=Homo sapiens G 5 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1.9 1.9 1.9 69.283 631 631;615;162;166;344 0.0029674 6.1091 By MS/MS By matching By matching By matching 1.9 0 0 0 477170 477170 0 0 0 477170 0 0 0 1 0 0 0 1 137 902 TRUE 929 2416 1563 1563 P25686;C9JRD2;C9JXB9;P25686-2;O75190;Q8NHS0;O75190-2;C9J1G2;E7ETU0;C9JX00;C9J2C4;O75190-4;O75190-3 P25686;C9JRD2;C9JXB9;P25686-2;O75190;Q8NHS0;O75190-2;C9J1G2;E7ETU0;C9JX00;C9J2C4;O75190-4;O75190-3 2;2;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1 2;2;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1 2;2;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1 DnaJ homolog subfamily B member 2;DnaJ homolog subfamily B member 6;DnaJ homolog subfamily B member 8 DNAJB2;DNAJB6;DNAJB8 >sp|P25686|DNJB2_HUMAN DnaJ homolog 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nuclear ribonucleoprotein R OS=Homo sapiens GN=HNRNPR PE=1 SV=1;>tr|E7ETM7|E7ETM7_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R OS=Homo sapiens GN=HNRNPR PE=1 SV=1;>tr|B4DT28|B4DT28_HUMAN Heterogeneous nuclear ribonuc 6 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2.1 2.1 2.1 70.942 633 633;473;494;535;595;636 0.009324 5.7489 By MS/MS By matching By matching By matching 2.1 0 0 0 403330 403330 0 0 0 403330 0 0 0 0 0 0 0 0 27 773 TRUE 796 2077 1334 1334 Q02790;H0YFG2 Q02790;H0YFG2 1;1 1;1 1;1 "Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, N-terminally processed" FKBP4 ">sp|Q02790|FKBP4_HUMAN Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4 OS=Homo sapiens GN=FKBP4 PE=1 SV=3;>tr|H0YFG2|H0YFG2_HUMAN Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, N-terminally processed (Fragment) OS=Homo sapiens GN=FKBP4 PE=1 SV=1" 2 1 1 1 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 2 2 51.804 459 459;84 0.0051546 5.882 By MS/MS By matching By matching By matching 2 0 0 0 401530 401530 0 0 0 401530 0 0 0 0 0 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>sp|P40227|TCPZ_HUMAN T-complex protein 1 subunit zeta OS=Homo sapiens GN=CCT6A PE=1 SV=3;>sp|P40227-2|TCPZ_HUMAN Isoform 2 of T-complex protein 1 subunit zeta OS=Homo sapiens GN=CCT6A;>tr|B4DPJ8|B4DPJ8_HUMAN T-complex protein 1 subunit zeta OS=Homo sapien 3 3 3 3 3 3 2 0 3 3 2 0 3 3 2 0 7.3 7.3 7.3 58.024 531 531;486;500 0 30.275 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching 7.3 7.3 5.6 0 5386200 3693600 1406300 286330 0 3511100 3224400 1283200 0 2 2 1 0 5 308 91;106;115 True;True;True 94;109;118 219;220;247;248;249;273;274;275;276 137;156;157;171;172;173 137;156;173 P05783;F8VZY9;CON__H-INV:HIT000015463 P05783;F8VZY9 4;4;1 4;4;1 4;4;1 "Keratin, type I cytoskeletal 18" KRT18 ">sp|P05783|K1C18_HUMAN Keratin, type I cytoskeletal 18 OS=Homo sapiens GN=KRT18 PE=1 SV=2;>tr|F8VZY9|F8VZY9_HUMAN Keratin, type I cytoskeletal 18 OS=Homo sapiens GN=KRT18 PE=1 SV=1" 3 4 4 4 4 2 0 2 4 2 0 2 4 2 0 2 14.9 14.9 14.9 48.057 430 430;391;295 0 30.299 By MS/MS By MS/MS By matching By MS/MS 14.9 9.1 0 9.1 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Annexin A2 OS=Homo sapiens GN=ANXA2;>tr|H0YN42|H0YN42_HUMAN Annexin (Fragment) OS=Homo sapiens GN=ANXA2 PE=1 SV=1;>sp|A6NMY6|AXA2L_HUMAN Putative ann 20 4 4 4 4 3 1 0 4 3 1 0 4 3 1 0 15.6 15.6 15.6 38.604 339 339;357;256;339;110;119;132;133;134;146;149;176;227;230;248;65;81;139;142;175 0 58.627 By MS/MS By MS/MS By matching By matching 15.6 12.1 3.5 0 13440000 11785000 1610700 44800 0 11421000 3978600 0 0 7 0 0 0 7 244 421;859;927;971 True;True;True;True 430;886;955;999 971;972;973;2286;2287;2288;2289;2479;2480;2589;2590 613;614;615;1470;1471;1472;1609;1683 613;1470;1609;1683 P63173;J3KT73;J3QL01;J3KSP2 P63173;J3KT73;J3QL01;J3KSP2 2;2;2;1 2;2;2;1 2;2;2;1 60S ribosomal protein L38 RPL38 >sp|P63173|RL38_HUMAN 60S ribosomal protein L38 OS=Homo sapiens GN=RPL38 PE=1 SV=2;>tr|J3KT73|J3KT73_HUMAN 60S ribosomal protein L38 OS=Homo sapiens GN=RPL38 PE=1 SV=1;>tr|J3QL01|J3QL01_HUMAN 60S ribosomal protein L38 OS=Homo sapiens GN=RPL38 PE=1 SV=1;>tr 4 2 2 2 2 2 0 0 2 2 0 0 2 2 0 0 31.4 31.4 31.4 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Peroxiredoxin-1 PRDX1 >sp|Q06830|PRDX1_HUMAN Peroxiredoxin-1 OS=Homo sapiens GN=PRDX1 PE=1 SV=1 3 4 4 4 4 3 2 0 4 3 2 0 4 3 2 0 19.6 19.6 19.6 22.11 199 199;271;161 0 38.455 By MS/MS By MS/MS By matching By matching 19.6 14.1 10.1 0 15078000 12395000 1968900 714180 0 11694000 5119300 0 0 3 0 0 0 3 364 133;397;714;995 True;True;True;True 136;406;733;1023 313;927;928;1920;1921;1922;2653;2654;2655 197;587;1236;1237;1726 197;587;1236;1726 52 21 O95816;B4DXE2 O95816;B4DXE2 5;4 5;4 5;4 BAG family molecular chaperone regulator 2 BAG2 >sp|O95816|BAG2_HUMAN BAG family molecular chaperone regulator 2 OS=Homo sapiens GN=BAG2 PE=1 SV=1;>tr|B4DXE2|B4DXE2_HUMAN BAG family molecular chaperone regulator 2 OS=Homo sapiens GN=BAG2 PE=1 SV=1 2 5 5 5 4 3 0 0 4 3 0 0 4 3 0 0 19.4 19.4 19.4 23.772 211 211;178 0 59.511 By MS/MS By MS/MS By matching By matching 16.1 12.8 0 0 8526900 6525800 2001000 0 0 5853100 5163600 0 0 2 3 0 0 5 228 250;363;668;841;1010 True;True;True;True;True 257;372;685;868;1039 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of Diablo homolog, mitochondrial OS=Homo sapiens GN=DIABLO;>sp|Q9NR28-3|DBLOH_HUMAN Isoform 3 of Diablo homolog, mitochondrial OS=Ho" 8 5 5 5 3 4 0 0 3 4 0 0 3 4 0 0 18 18 18 27.131 239 239;186;195;133;156;125;128;191 0 83.338 By MS/MS By MS/MS By matching By matching 11.7 18 0 0 9785100 7762000 2023100 0 0 5304400 6998100 0 0 3 4 0 0 7 421 36;37;762;763;870 True;True;True;True;True 36;37;785;786;897 84;85;2046;2047;2048;2049;2329 52;53;1319;1320;1321;1503;1504 52;53;1319;1321;1504 P09382;F8WEI7 P09382 4;1 4;1 4;1 Galectin-1 LGALS1 >sp|P09382|LEG1_HUMAN Galectin-1 OS=Homo sapiens GN=LGALS1 PE=1 SV=2 2 4 4 4 4 4 3 1 4 4 3 1 4 4 3 1 51.9 51.9 51.9 14.716 135 135;38 0 63.078 By MS/MS By matching By matching By MS/MS 51.9 51.9 44.4 7.4 24961000 20469000 3243200 1107800 141200 18408000 7156900 6705100 0 6 0 0 0 6 253 19;177;237;681 True;True;True;True 19;180;244;699 44;45;46;47;48;416;417;418;570;571;572;1833;1834;1835 30;31;263;264;357;358;1180 31;263;357;1180 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">sp|P06576|ATPB_HUMAN ATP synthase subunit beta, mitochondrial OS=Homo sapiens GN=ATP5B PE=1 SV=3;>tr|F8VPV9|F8VPV9_HUMAN ATP synthase subunit beta OS=Homo sapiens GN=ATP5B PE=1 SV=1;>tr|H0YH81|H0YH81_HUMAN ATP synthase subunit beta (Fragment) OS=Homo sapi" 7 9 9 9 8 5 4 1 8 5 4 1 8 5 4 1 27.6 27.6 27.6 56.559 529 529;518;362;270;284;133;218 0 288.77 By MS/MS By MS/MS By MS/MS By matching 22.1 15.5 15.1 4.5 30912000 22299000 7276900 346450 989420 25375000 9011500 2113600 0 7 3 1 0 11 239 55;258;355;488;548;921;1036;1048;1132 True;True;True;True;True;True;True;True;True 57;265;364;499;562;948;949;1065;1077;1162 137;138;610;611;818;819;1179;1344;2458;2459;2460;2461;2462;2463;2750;2751;2752;2778;2779;3092 86;389;521;738;845;1596;1597;1598;1599;1792;1807;1808;2066 86;389;521;738;845;1599;1792;1807;2066 17 443 P00338;P00338-3;P00338-2;P00338-5;F5GYU2;F5GXY2;P00338-4;F5GXH2;F5GZQ4;F5H5J4;F5H6W8;F5H8H6;F5GXC7;F5GWW2;F5GXU1 P00338;P00338-3;P00338-2;P00338-5;F5GYU2;F5GXY2;P00338-4;F5GXH2 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Pyruvate kinase PKM;Pyruvate kinase PKM;PKM2 >sp|P14618|KPYM_HUMAN Pyruvate kinase PKM OS=Homo sapiens GN=PKM PE=1 SV=4;>sp|P14618-3|KPYM_HUMAN Isoform 3 of Pyruvate kinase PKM OS=Homo sapiens GN=PKM;>sp|P14618-2|KPYM_HUMAN Isoform M1 of Pyruvate kinase PKM OS=Homo sapiens GN=PKM;>tr|H3BTN5|H3BTN5_HU 9 11 11 11 11 8 3 0 11 8 3 0 11 8 3 0 30.1 30.1 30.1 57.936 531 531;516;531;485;281;366;151;162;168 0 198.31 By MS/MS By MS/MS By matching By matching 30.1 25.2 11.1 0 25824000 18936000 6315200 572770 0 17293000 11288000 6866700 0 7 6 0 0 13 268 32;101;232;361;424;503;552;573;837;977;978 True;True;True;True;True;True;True;True;True;True;True 32;104;238;370;434;514;566;588;864;1005;1006 77;78;79;236;560;561;562;835;836;837;982;983;1216;1350;1351;1401;1402;2232;2233;2603;2604;2605 48;150;351;531;623;760;850;851;877;878;1437;1438;1693;1694 48;150;351;531;623;760;850;878;1438;1693;1694 Q03135;E9PCT5;C9JKI3;Q03135-2 Q03135 5;2;1;1 5;2;1;1 5;2;1;1 Caveolin-1 CAV1 >sp|Q03135|CAV1_HUMAN Caveolin-1 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