質量分析法を主体としたプロテオミクスの手法で実験的に同定されたN結合型糖タンパク質のデータベース。 由来の生物種、試料組織、同定されたタンパク質のアミノ酸配列上の糖鎖付加位置、 当該部位を含む糖ペプチドと親和性を示すレクチンの種類、の他、 アミノ酸配列上の構造モチーフ(シグナル配列や膜貫通領域の予測データ)、 および同定された糖タンパク質の類縁分子についての外部データベースへのリンク、を含む。
データ名 | README |
データ内容 | GlycoProtDBのダウンロードデータについて説明したHTMLファイルです。 |
ダウンロードファイル名 | README-ja.html (日本語) |
項目名 | 項目の説明 |
---|---|
GPID | AISTの管理番号 |
TaxonomyID | Taxonomy ID |
Locus | Gene name+Gene description(改変) |
gi | NCBI GI番号 |
position | N-結合型糖鎖付加位置 |
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データベース作成者連絡先:
〒305-8568 茨城県つくば市梅園1-1-1 中央第2事業所 OSL
独立行政法人 産業技術総合研究所 糖鎖医工学研究センター
E-mail : jcggdb-ml[at]aist[dot]go[dot]jp
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更新日 | 更新内容 |
2015/01/21 | 連絡先のメールアドレス、オリジナルサイトのURLおよび統括サイトのURLを更新 |
2013/11/05 | 簡易検索サイトにおいて、GPIDのリンク先を修正 |
2009/05/22 | 生命科学系データベースアーカイブにてダウンロードデータの一部配布開始 |
2008/08/19 | GlycoProtDB(http://riodb.ibase.aist.go.jp/rcmg/glycodb/Glc_ResultSearch) で公開開始 |