遺伝子を破壊した後で様々な修飾を行うことが出来る可変型遺伝子トラップ法により作製したマウスES細胞のデータベース
データ名 | README |
データ内容 | 「EGTC」のダウンロードデータについて説明したHTMLファイル。 |
ダウンロードファイル名 | README.html(日本語) |
データ名 | クローン |
データ内容の説明 | 可変型遺伝子トラップES細胞クローン |
データファイル | egtc.zip (46.7MB) |
項目名 | 主キー | 外部キー | 項目の説明 |
---|---|---|---|
EGTC ID | ○ | EGTCのID | |
Registered | データ登録日 | ||
Last Update | データ更新日 | ||
Gene Name | 遺伝子名 | ||
Gene Symbol | 遺伝子シンボル | ||
Chromosome | 染色体 | ||
Genomic Location | ゲノム上の位置 | ||
Mapping result (BLAT) | UCSC Genome BLATによるマッピング結果(画像) | ||
Synonyms | シノニム | ||
Link-UCSC Browser | トラップした遺伝子全体を示すUCSC Genome Mapへのリンク | ||
Link-NCBI Entrez Gene | 各遺伝子に関したNCBI Entrez Geneへのリンク | ||
Link-IGTC | 各遺伝子に関したIGTCへのリンク | ||
Link-UniGene | 各遺伝子に関したUniGeneへのリンク | ||
Link-Ensembl ContigView | 各遺伝子に関したEnsembl ContigViewへのリンク | ||
Link-MGI | 各遺伝子に関したMGIへのリンク | ||
Link-KEGG GENES | 各遺伝子に関したKEGG GENESへのリンク | ||
Link-EST Profile | 各遺伝子に関したUniGeneのEST Profileへのリンク | ||
Other clone traped this gene | 他のこの遺伝子をトラップしたクローン | ||
Trap vector | ○ | トラップベクター名 | |
Cell Line | ○ | クローン作製に用いたES細胞系統名 | |
Method | ○ | トラップした遺伝子の同定に用いた手法 | |
Accession | トラップ配列のアクセッション番号およびNCBI GSSへのリンク | ||
GSS Location | トラップ配列のゲノム上の位置 | ||
Size | トラップ配列の長さ | ||
Sequence | トラップ配列 | ||
Link (sequence) - UCSC Browser | トラップ配列を全長とするUCSC Genome Mapヘのリンク | ||
Link (sequence) - IGTC | IGTCに登録されているトラップクローンのページヘのリンク | ||
Homology Search Results | ホモロジー検索結果およびNCBI Nucleotideへのリンク | ||
Mouse Information - Card ID | CARD R-BASEに寄託しているマウス系統へのリンク | ||
Mouse Information - Strain Name | マウス系統名 | ||
Mouse Information - Internal Code | ニックネームあるいは通称 | ||
Mouse Information - Description | ES細胞およびマウス系統についての説明 | ||
Mouse Information - Links | 各遺伝子に関したIMSR(International Mouse Strain Resource)ヘのリンク |
データ名 | トラップベクター |
データ内容の説明 | トラップベクターとその説明 |
データファイル | egtc_trap_vector.zip (99KB) |
項目名 | 主キー | 外部キー | 項目の説明 |
---|---|---|---|
Trap Vector Name | ○ | トラップベクター名 | |
Description | トラップベクターの説明 | ||
Image | トラップベクターの構造の図 |
データ名 | セルライン |
データ内容の説明 | クローン作製に用いたES細胞系統とその説明 |
データファイル | egtc_cell_line.zip (1KB) |
項目名 | 主キー | 外部キー | 項目の説明 |
---|---|---|---|
Cell Line | ○ | ES細胞系統の名称 | |
Description | ES細胞系統の説明 |
データ名 | メソッド |
データ内容の説明 | トラップした遺伝子の同定に用いた方法とその説明 |
データファイル | egtc_method.zip (100KB) |
項目名 | 主キー | 外部キー | 項目の説明 |
---|---|---|---|
Method | ○ | 遺伝子同定法の名称 | |
Description | 遺伝子同定法の説明 | ||
Image | 遺伝子同定法の説明図 |
本データベースは、以下で定める標準利用許諾及び追加利用許諾に基づきご利用いただくことができます。 標準利用許諾は、本データベース利用における許諾内容、及び利用者が従うべき条件を定めています。 追加利用許諾は、標準利用許諾で原則として禁止されている事項の中で例外的に許諾される事項を定めています。
本データベースの標準利用許諾は、クリエイティブ・コモンズ 表示-継承2.1 日本の定める利用許諾です。
本データベースのクレジットは、
”EGTC, Copyright© 2010 荒木正健 (筑波大学) licensed under CC表示-継承2.1 日本”ですので、
利用にあたり必ず表示してください。
クリエイティブ・コモンズ 表示-継承2.1 日本の概要は
こちらです。
具体的な許諾条項は
こちらをご覧ください。
本データベースにおいて、標準利用許諾の下で以下の条件に従う限り許諾されている事項:
本データベースにおいて、標準利用許諾に基づいて利用する際に従うべき条件:
1.本データベースの全部または一部を利用して作成された二次的著作物を配布する場合には、標準利用許諾とともにこの追加利用許諾を表示しなければなりません。
2. 本データベースを利用して研究を行い、その成果を論文に記載する場合は、論文中に必ず本データベースを引用して、本データベース名称とURLを記載する必要があります。
3. 標準利用許諾及び上記の追加利用許諾で許諾されていない事項については、以下のデータベース作成者に連絡をとり、利用許諾を求める必要があります。
〒860-0811 熊本市本荘2-2-1
熊本大学 生命資源研究・支援センター
Tel: +81-96-373-6501
Fax: +81-96-373-6502
E-mail: egtc[at]gtc[dot]gtca[dot]kumamoto-u[dot]ac[dot]jp
本データベース内の全てのコンテンツに対しては、自由にリンクを貼ることができます。 ただし、コンテンツの内容は予告なく変更される場合があります。
更新日 | 更新内容 |
2010/03/19 | 生命科学系データベースアーカイブにてダウンロードデータ公開開始 |
2004/08 | EGTC(http://egtc.jp/)で公開開始 |
〒860-0811 熊本市本荘2-2-1
熊本大学 生命資源研究・支援センター
Tel: +81-96-373-6501
Fax: +81-96-373-6502
E-mail: egtc[at]gtc[dot]gtca[dot]kumamoto-u[dot]ac[dot]jp