ChemTHEATRE
2020/08/25Web Site: https://chem-theatre.com/
HTTPS Site: https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/chemtheatre/
ChemTHEATREは、環境中の化学物質のモニタリング結果を集めたデータベースです。
README 目次
1. ダウンロードデータの構成
2. ダウンロードデータの説明
2.1 README
| データ名 | README |
|---|---|
| データ内容 | 「ChemTHEATRE」のダウンロードデータについて説明したHTMLファイル。 |
| ダウンロードファイル名 | README.html (日本語) |
2.2 プロジェクト情報
| データ名 | プロジェクト情報 |
|---|---|
| データ内容の説明 | 化学物質のモニタリングを行った研究および研究者の情報です。 |
| データファイル | ct_project.zip (47 KB) |
データファイルの各列のデータは以下の通りです。
| 項目名 | 項目の説明 |
|---|---|
| Project ID | プロジェクトID |
| Link | このプロジェクトで取得したSample及びMeasured Dataへのリンク（簡易検索のみ） |
| Submitter Name | データ提供者名 |
| Submitter Affiliation | データ提供者所属機関 |
| Submitter Department | データ提供者所属部署 |
| Submetter City | データ提供者所属機関のある都市 |
| Submetter Country | データ提供者所属機関のある国 |
| Corresponding Author Name | 代表研究者名 |
| Corresponding Author Affiliation | 代表研究者所属機関 |
| Corresponding Author Department | 代表研究者所属部署 |
| Corresponding Author City | 代表研究者所属機関のある都市 |
| Corresponding Author Country | 代表研究者所属機関のある国 |
| Release Date | データの公開日 |
| Title | 研究を発表した論文名 |
| Publication | 論文のID(DOI) |
| Grant | 研究助成金 |
2.3 サンプル情報
| データ名 | サンプル情報 |
|---|---|
| データ内容の説明 | 環境中から取得したサンプルの情報です。 |
| データファイル | ct_sample.zip (206 KB) |
データファイルの各列のデータは以下の通りです。
| 項目名 | 項目の説明 |
|---|---|
| Sample ID | サンプルID |
| Link | このサンプルから測定されたMeasured Dataへのリンク（簡易検索のみ） |
| Project ID | このサンプルを取得したプロジェクトのID |
| Sample Type 1 | サンプルタイプ |
| Sample Type 2 | サンプルタイプ |
| Sample Type 3 | サンプルタイプ |
| Sample Type 4 | サンプルタイプ |
| Sample Type 5 | サンプルタイプ |
| Taxonomy ID | サンプルが生物である場合、そのTaxonomy ID |
| es-BANK ID | 生物環境試料バンク（es-BANK）におけるID |
| Sample Name | サンプル名 |
| Scientific Name | サンプルの学名 |
| Common Name | サンプルの一般名称 |
| Sampling Time | 採取日時 |
| Weather | 採取時の天候 |
| Region | 採取した地域（広域） |
| Country | 採取した国 |
| Area | 採取した地域（国の中で） |
| Latitude From | 採取範囲の緯度下限 |
| Latitude To | 採取範囲の緯度上限 |
| Longitude From | 採取範囲の経度下限 |
| Longitude To | 採取範囲の経度上限 |
| Sex | サンプルが生物である場合、その性別 |
| Tissue Organ | サンプルが生物である場合、その臓器 |
| Tissue Lipid | サンプルが生物である場合、その脂質の重量 |
| Tissue Moist | サンプルが生物である場合、その水分の重量 |
| Weight | サンプルの重量 |
| Weight Unit | 重量の単位 |
| Length | サンプルの長さ |
| Length Unit | 長さの単位 |
| Length Type | 長さのタイプ |
| Growth Stage | サンプルが生物である場合、その成長段階 |
| Age | サンプルが生物である場合、その年齢 |
| Disease | サンプルが生物である場合、その疾患 |
| Temperature | サンプルの温度 |
| Water Temperature | 採取場所の水温 |
| pH | サンプルが水である場合、そのpH |
| DO | サンプルが水である場合、その溶存酸素量 |
| EC | サンプルが水である場合、その電気伝導率 |
| Salinity | サンプルが水である場合、その塩分濃度 |
| SS | サンプルが水である場合、その浮遊物質含有量 |
| Water Depth | 採取場所の水深 |
| Transparency | サンプルが水である場合、その透明度 |
| Water Color | サンプルが水である場合、その色 |
| Sediment Temperature | サンプルが堆積物である場合、その温度 |
| Sediment Depth | サンプルが堆積物である場合、採取した水深 |
| Sediment Appearance | サンプルが堆積物である場合、その形状 |
| Sediment Color | サンプルが堆積物である場合、その色 |
| Sediment Surface Color | サンプルが堆積物である場合、採取した水面の色 |
| Sediment Odor | サンプルが堆積物である場合、その臭い |
| Sediment Impurities | サンプルが堆積物である場合、そこに含まれる不純物 |
| Sediment Moisture Onsite Analysis | サンプルが堆積物である場合、分析時に計測した重量 |
| Ignition Loss Onsite Analysis | サンプルが堆積物である場合、分析時の強熱減量 |
| Soil Depth | サンプルが土壌である場合、採取した深さ |
| Flow Rate | サンプルが大気である場合、採取場所の流量 |
| Mean PM10 | サンプルが大気である場合、粒子状物質PM10の平均採取量 |
| Mean Total Suspended Particles | サンプルが大気である場合、総浮遊粒子状物質の平均採取量 |
| Humidity | サンプルが大気である場合、採取時の湿度 |
| Wind Direction | サンプルが大気である場合、採取時の風向き |
| Wind Speed MS | サンプルが大気である場合、採取時の風速(m/sec) |
| Amount of Collected Air | サンプルが大気である場合、その採取量 |
2.4 化学物質情報
| データ名 | 化学物質情報 |
|---|---|
| データ内容の説明 | サンプルに含まれる化学物質の情報です。 |
| データファイル | ct_chemical.zip (28 KB) |
データファイルの各列のデータは以下の通りです。
| 項目名 | 項目の説明 |
|---|---|
| Chemical ID | 化学物質ID |
| Chemical Name | 化学物質名 |
| IUPAC | IUPAC命名法による表記 |
| Synonyms | 別表記 |
| PubChem | PubChem ID |
| CAS | CAS番号 |
| Link | この化学物質を含むMeasured Dataへのリンク（簡易検索のみ） |
2.5 計測データ
| データ名 | 計測データ |
|---|---|
| データ内容の説明 | サンプルに含まれる化学物質の計測を行って得られたデータです。 |
| データファイル | ct_measured_data.zip (746 KB) |
データファイルの各列のデータは以下の通りです。
| 項目名 | 項目の説明 |
|---|---|
| Measured ID | 測定ID |
| Project ID | この測定を行ったプロジェクトのID |
| Sample ID | 測定を行ったサンプルのID |
| Instrument Group | 測定機器グループ名 |
| Instrument | 測定機器名 |
| Method Extraction | 抽出手法 |
| Method Cleanup | 洗浄手法 |
| Derivatization | 誘導体化手法 |
| Recovery Correction | 回収率補正手法 |
| LOD | 測定機器の検出限界 |
| Repeatability | 繰り返し精度 |
| Standard | 分析に使用する標準品 |
| Chemical ID | 検出された化学物質のID |
| Measured Value | 測定値 |
| Alternative Value | 測定値の別表記 |
| Unit | 測定値の単位 |
3. 本データベースの利用許諾
利用許諾更新日: 2019/01/29
本データベースは、以下で定める利用許諾に基づきご利用いただくことができます。 本利用許諾は、本データベース利用における許諾内容、及び利用者が従うべき条件を定めています。
本データベースの利用許諾は、 クリエイティブ・コモンズ 表示-継承4.0 国際の定める利用許諾です。
本データベースのクレジットは、 ” © ChemTHEATRE licensed under CC表示-継承4.0 国際”ですので、 利用にあたり必ず表示してください。
クリエイティブ・コモンズ 表示-継承4.0 国際の概要は こちらです。 具体的な許諾条項は こちらをご覧ください。
本データベースにおいて、以下の条件に従う限り許諾されている事項：
- 本データベースの全部または一部に自由にアクセスし、データを取得することができます。
- 本データベースの全部または一部のデータを自由に再配布することができます。
- 本データベースの全部または一部のデータを利用した、データベースなどの翻案物を自由に作成し、配布することができます。
本利用許諾に基づいて利用する際に従うべき条件：
- 本データベースの全部または一部、あるいは翻案物の配布に際しては、本データベースの作成者のクレジットを表示しなければなりません。
- 本データベースの全部または一部のデータを利用して作成された翻案物は、CC表示-継承4.0（もしくは、それ以降のバージョン）、またはCC表示-継承互換ライセンス（リストはこちら）の下で配布されなければなりません。
- 本利用許諾で許諾されていない事項については、以下のデータベース作成者に連絡をとり、利用許諾を求める必要があります。
4. 更新履歴
| 更新日 | 更新内容 |
|---|---|
| 2020/08/25 | アーカイブV2をリリース |
| 2019/01/29 | 生命科学系データベースアーカイブにてダウンロードデータ公開開始 |
| 2016/05/31 | ChemTHEATRE (https://chem-theatre.com/) で公開開始 |
5. 参考文献
-6. 連絡先
「ChemTHEATRE」についてのお問い合わせは、下記連絡先までご連絡ください。