BodyParts3D(http://lifesciencedb.jp/bp3d/)とは、解剖学用語が示す人体の部品 (臓器、器官)の位置と形状を3次元人体モデルで記述したデータベースです。 このディレクトリには、BodyParts3Dデータベースに登録されている解剖学用語に 対応する3次元人体モデルデータがあります。
データ名 | README |
データ内容 | BodyParts3Dのダウンロードデータについて説明したHTMLファイルです。 |
ダウンロードファイル名 | README.html (日本語) |
データ名 | リリースノート(Rel. 2.0) |
データ内容 | 前回リリース(Rel.1.0, 2009年2月9日リリース)からの主な変更点を記述したHTMLファイルです。 |
ダウンロードファイル名 | release_2.0.html (日本語) |
データ名 | 3次元臓器モデルのIDと臓器名称等との対応表 |
データ内容の説明 | ダウンロード可能な3次元臓器モデルのリストです。 3次元臓器モデルのIDと臓器名称等との対応について記述したタブ区切りテキストファイルです。 |
データファイル | parts_list.txt
(日本語) (111KB) parts_list_e.txt (English) (69KB) |
項目名 | 項目の説明 |
---|---|
id | 対応するFMA(Foundational Model of Anatomy)のID(FMAで始まる)。FMAに対応する概念が見当たらない場合は、BPで始まる独自IDを付与 |
en | 英語名。 主にFMAのpreferred nameを採用 |
kanji | 漢字 |
kana | かな |
phase_number | データの作成段階、すなわち、クオリティを表現する。原則、フェーズ1から3までの3段階 |
organ_system | 当該臓器が分類される器官系(神経系、循環器系等) |
データ名 | 臓器、器官間の包含関係記述データ |
データ内容の説明 |
ダウンロード可能な3次元臓器モデルの臓器、器官間の包含(part-of)関係を記述したファイルです。 「BP3D Viewer」(http://lifesciencedb.jp/bp3d)の「Tree」タブ上の「便宜的」タイプの階層です。 |
データファイル | conventional_part_of.txt (106KB) |
項目名 | 項目の説明 |
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id | 臓器ID |
name | 1列目の臓器の英語名 |
part id | 1, 2列目の臓器の一部である臓器ID |
part name | 3列目の臓器(Part ID)の英語名 |
データ名 | 複合臓器定義データ |
データ内容の説明 | BodyParts3Dでは最小単位のポリゴンデータのみを作成しており、これらの組み合わせによって複合的に定義される臓器のデータは 用意していません。このデータは、複合臓器がどの最小単位臓器の集合として構成されているかを上述の「便宜的」階層に基づいて記述しています。 |
データファイル | compound_parts.txt (256KB) |
項目名 | 項目の説明 |
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id | 複合臓器ID |
name | 1列目の臓器の英語名 |
primitive id | 1,2列目の臓器を構成する最小単位臓器ID |
primitive name | 3列目の臓器の英語名 |
データ名 | 臓器ID毎のポリゴンデータ1(ポリゴン削減率=95%) |
データ内容の説明 | zip形式で圧縮されたダウンロードファイルには、各臓器ID毎のポリゴンデータ(Wavefront OBJフォーマット)が複数格納されています。 ポリゴンデータ名は3次元臓器モデルのID+拡張子(.obj)(例:FMA20394.obj)になります。 |
データファイル | BodyParts3D_2.0_obj_95.zip (500MB) |
データ名 | 臓器ID毎のポリゴンデータ2(ポリゴン削減率=99%) |
データ内容の説明 | zip形式で圧縮されたダウンロードファイルには、各臓器ID毎のポリゴンデータ(Wavefront OBJフォーマット)が複数格納されています。 ポリゴンデータ名は3次元臓器モデルのID+拡張子(.obj)(例:FMA20394.obj)になります。 |
データファイル | BodyParts3D_2.0_obj_99.zip (121MB) |
<参考>
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データベース作成者連絡先:
大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター
E-mail :info [at] dbcls [dot] rois [dot] ac [dot] jp
更新日 | 更新内容 |
2011/08/25 | 利用許諾を更新 |
2010/08/16 | データ更新(release 2.0) |
2009/03/18 | データベースアーカイブにてダウンロードデータ公開開始 |
2009/02/09 | データ更新(release 1.0) |
2008/08/12 | BodyPart3D(http://lifesciencedb.jp/ag/bp3d/)で公開開始 |