BodyParts3D(http://lifesciencedb.jp/ag/bp3d/)とは、解剖学用語が示す人体の部品 （臓器、器官）の位置と形状を３次元人体モデルで記述したデータベースです。 このディレクトリには、BodyParts3Dデータベースに登録されている解剖学用語に 対応する３次元人体モデルデータがあります。
| データ名 | README |
| データ内容 | BodyParts3Dのダウンロードデータについて説明したHTMLファイルです。 |
| ダウンロードファイル名 | README.txt （日本語） |
| データ名 | 3次元臓器モデルの座標系の説明図 |
| データ内容の説明 | BodyParts3Dで使用されいてる3次元データモデルの座標系についての説明図です。 |
| データファイル | coordinate_sytem.png (28KB) |
| データ名 | ３次元臓器モデルのＩＤと臓器名称等との対応表 |
| データ内容の説明 | ダウンロード可能な３次元臓器モデルのリストです。 3次元臓器モデルのＩＤと臓器名称等との対応について記述したタブ区切りテキストファイルです。 |
| データファイル | partsList_ja.txt
(日本語) (12KB) partsList.txt (English) (8KB) |
| 項目名 | 項目の説明 |
|---|---|
| id | 対応するFMA(Foundational Model of Anatomy)のＩＤ(FMAで始まる）。FMAに対応する概念が見当たらない場合は、BPで始まる独自ＩＤを付与 |
| en | 英語名。 主にFMAのpreferred nameを採用。 |
| kanji | 漢字 |
| kana | かな |
| phase_number | データの作成段階、すなわち、クオリティを表現する。原則、フェーズ１から３までの３段階 |
| last_updated | 最終更新日 |
| organ_system | 当該臓器が分類される器官系（神経系、循環器系等） |
| データ名 | 臓器、器官間の包含関係記述データ |
| データ内容の説明 | ダウンロード可能な3次元臓器モデルのうち、臓器、器官間の包含関係を持つものについて記述されたテキストファイル群をZIP形式で圧縮したものです。 ファイル名には親モデルのIDと拡張子（.txt）、ファイル内には、親モデルを構成する子モデルのIDが記載されています。 |
| データファイル | partsList_ja.txt
(日本語) (12KB) partsList.txt (English) (8KB) |
例えば、右心耳(FMA7218, right auricle)は、右心耳壁(FMA9539, wall of right auricle)と 右心耳腔(FMA9458, cavity of right auricle)で構成されていますので、３次元モデルも２つの 和として表現しています。したがいまして、ファイルhasPart/FMA7218.txtには、右心耳を構成する、 右心耳壁と右心耳腔が記入されています。
例：右心耳(FMA7218.txt)の場合ファイル名：FMA7218.txt
ファイル内容：
FMA9458 cavity of right auricle
FMA9539 wall of right auricle
| データ名 | 臓器ID毎のポリゴンデータ1(ポリゴン削減比= 1.0%) |
| データ内容の説明 | BodyParts3D Phase2以上の３次元臓器モデルデータで、ポリゴン削減比を10%にしたものです。 zip形式で圧縮されたダウンロードファイルには、各臓器ID毎のポリゴンデータが複数格納されています。 ポリゴンデータ名は3次元臓器モデルのＩＤ+拡張子(stl/vtk)になります。 |
| データファイル | BodyParts3D-stl-0.1.zip(55MB) BodyParts3D-vtk-0.1.zip(30MB) |
「ポリゴン削減比=削減後の三角形数/削減前の三角形数」ですので、
ポリゴン削減比の数字が小さいほどデータ量は少ないですが、形状が保存されていない可能性があります。
<参考>
| データ名 | 臓器ID毎のポリゴンデータ1(ポリゴン削減比= 1.0%) |
| データ内容の説明 | BodyParts3D Phase2以上の３次元臓器モデルデータで、ポリゴン削減比を1%にしたものです。 zip形式で圧縮されたダウンロードファイルには、各臓器ID毎のポリゴンデータが複数格納されています。 ポリゴンデータ名は3次元臓器モデルのＩＤ+拡張子(stl/vtk)になります。 |
| データファイル | BodyParts3D-stl-0.01.zip(11MB) BodyParts3D-vtk-0.01.zip(6MB) |
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| 更新日 | 更新内容 |
| 2008/08/12 | データ公開 |