Webリソースポータルサイトの使い方

Webリソースポータルサイトの概要

このサイトでは、目的のバイオインフォマティクス解析を実現するための解析ツールや、解析ツールを組合せたワークフロー(サンプル)を見つけることができます。
見つけ方は、リソース検索か(画面左)、リソース分類ツリー(画面右)の組合せで行います。

リソース検索

解析ツールやワークフローの名前や解説文、分類名などに対し、任意のキーワードで検索を行うことができます。
(例: "BLAST"、"blastp"、"ホモロジー検索"、"データベース"、"チンパンジー"など)
検索結果は、リソース分類ツリーの中で該当リソースが展開された状態で表示されます。

リソース分類表示

解析ツールやワークフローは、「処理要素別」「(研究)分野別」「文献別」の3種類の分類がされています。
「処理要素別」分類では、「比較する」「分類する」「探索する」「同定/予測する」「ルールを発見する」など、解析ツールの 処理概念をもとに分類しています。
「分野別」分類では、ワークフローが「ゲノム解析」「発現制御解析」「進化系統解析」など研究分野別に分類されています。
「文献別」分類では、文献から読み取った「シロイヌナズナゲノム解読(遺伝子領域予測)」などのワークフローを文献別に分類しています。
ご自分が探しやすい分類方法を選択して、+マークによってツリーを展開して目的のリソースを探し出して下さい。

分類ツリー上の各カテゴリー名左の記号は次のような意味があります。
より分解された処理要素
解析ツール/ワークフロー
解説
別名
解析ツールの入力データ
解析ツールの出力データ
解析ツールで利用するデータベース
解析ツールの実行条件
(記号無し)分類関係

解析ツール/ワークフロー名右のマークを クリックすると、解析ツール/ワークフローのリソース詳細が表示されます。

リソース詳細表示

解析ツールとワークフローの詳細表示は異なります。
解析ツールの詳細表示には、リソース名、リソースの別名、解説、キーワード、リソース分類カテゴリ、提供サイト、参考/引用文献、入出力データ情報がまとめられています。
ワークフローの詳細表示には、そのワークフローが記載されている論文のタイトル、雑誌名、全文へのリンクなどとともに、ワークフローの構成が表及びグラフで表示されます。

リソース引用論文のハイライト表示